tokens
sequencelengths
1
179
ner_tags
sequencelengths
1
179
[ "Post", "-", "prandial", "hyperlipidemia", "has", "emerged", "as", "a", "cardiovascular", "risk", "factor", "with", "limited", "therapeutic", "options", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-T038", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "B-T033", "I-T033", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "O" ]
[ "The", "Liver", "X", "receptors", "(", "Lxrs", ")", "are", "nuclear", "hormone", "receptors", "that", "regulate", "cholesterol", "elimination", "." ]
[ "O", "B-T103", "I-T103", "I-T103", "O", "B-T103", "O", "O", "B-T103", "I-T103", "I-T103", "O", "B-T038", "B-T103", "B-T038", "O" ]
[ "Knowledge", "of", "their", "role", "in", "regulating", "the", "absorption", "and", "handling", "of", "dietary", "fats", "is", "incomplete", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "O", "B-T038", "O", "B-T033", "O", "B-T103", "I-T103", "O", "O", "O" ]
[ "The", "purpose", "of", "this", "study", "was", "to", "determine", "the", "role", "of", "intestinal", "Lxrα", "in", "post", "-", "prandial", "intestinal", "lipid", "transport", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T017", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "B-T017", "B-T103", "B-T038", "O" ]
[ "Using", "Lxrα", "knockout", "(", "nr1h3(-/-", ")", ")", "and", "intestine", "-", "limited", "Lxrα", "over", "-", "expressing", "[", "Tg(fabp2a", ":", "EGFP", "-", "nr1h3", ")", "]", "zebrafish", "strains", ",", "we", "measured", "post", "-", "prandial", "lipid", "excursion", "with", "live", "imaging", "in", "larvae", "and", "physiological", "methods", "in", "adults", "." ]
[ "O", "B-T017", "B-T038", "O", "B-T017", "I-T017", "O", "O", "B-T017", "O", "O", "B-T017", "B-T038", "I-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "B-T017", "O", "B-T017", "O", "O", "B-T204", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "O", "B-T204", "O", "O", "B-T170", "O", "O", "O" ]
[ "We", "also", "conducted", "a", "long", "-", "term", "high", "-", "cholesterol", "dietary", "challenge", "in", "adults", "to", "examine", "the", "chronic", "effect", "of", "modulating", "nr1h3", "gene", "dose", "on", "the", "development", "of", "hypercholesterolemia", "and", "hepatic", "lipid", "accumulation", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T017", "I-T017", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "O", "B-T082", "B-T033", "I-T033", "O" ]
[ "Over", "-", "expression", "of", "Lxrα", "in", "the", "intestine", "delays", "the", "transport", "of", "ingested", "lipids", "in", "larvae", ",", "while", "deletion", "of", "Lxrα", "increases", "the", "rate", "of", "lipid", "transport", "." ]
[ "B-T038", "I-T038", "I-T038", "O", "B-T017", "O", "O", "B-T017", "O", "O", "B-T038", "O", "O", "B-T103", "O", "B-T204", "O", "O", "B-T038", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "B-T038", "O" ]
[ "Pre", "-", "treating", "wildtype", "larvae", "with", "the", "liver", "-", "sparing", "Lxr", "agonist", "hyodeoxycholic", "acid", "also", "delayed", "the", "rate", "of", "intestinal", "lipid", "transport", "in", "larvae", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-T017", "B-T204", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "B-T103", "B-T103", "I-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T017", "B-T103", "B-T038", "O", "B-T204", "O" ]
[ "In", "adult", "males", ",", "deletion", "of", "Lxrα", "accelerates", "intestinal", "transport", "of", "ingested", "lipids", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-T038", "O", "B-T017", "O", "B-T017", "B-T038", "O", "O", "B-T103", "O" ]
[ "Adult", "females", "showed", "higher", "plasma", "Lipoprotein", "lipase", "(", "Lpl", ")", "activity", "compared", "to", "males", ",", "and", "lower", "post", "-", "gavage", "blood", "triacylglycerol", "(", "TAG", ")", "excursion", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "I-T103", "O", "B-T103", "O", "B-T038", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "B-T103", "O", "O", "O" ]
[ "Despite", "the", "sexually", "dimorphic", "effect", "on", "acute", "intestinal", "lipid", "handling", ",", "Tg(fabp2a", ":", "EGFP", "-", "nr1h3", ")", "adults", "of", "both", "sexes", "are", "protected", "from", "high", "cholesterol", "diet", "(", "HCD)-", "induced", "hepatic", "lipid", "accumulation", ",", "while", "nr1h3(-/-", ")", "mutants", "are", "sensitive", "to", "the", "effects", "of", "HCD", "challenge", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T017", "B-T103", "B-T033", "O", "O", "O", "B-T017", "O", "B-T017", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "B-T033", "I-T033", "O", "O", "B-T017", "I-T017", "B-T038", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O" ]
[ "These", "data", "indicate", "that", "intestinal", "Lxr", "activity", "dampens", "the", "pace", "of", "intestinal", "lipid", "transport", "cell", "-", "autonomously", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-T017", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T017", "B-T103", "B-T038", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Selective", "activation", "of", "intestinal", "Lxrα", "holds", "therapeutic", "promise", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-T017", "B-T103", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Proline", "-rich", "antimicrobial", "peptides", "targeting", "protein", "synthesis" ]
[ "B-T103", "O", "B-T103", "I-T103", "O", "B-T038", "I-T038" ]
[ "Covering", ":", "up", "to", "2017The", "innate", "immune", "system", "employs", "a", "broad", "array", "of", "antimicrobial", "peptides", "(", "AMPs", ")", "to", "attack", "invading", "microorganisms", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "O", "B-T103", "I-T103", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "While", "most", "AMPs", "act", "by", "permeabilizing", "the", "bacterial", "membrane", ",", "specific", "subclasses", "of", "AMPs", "have", "been", "identified", "that", "pass", "through", "membranes", "and", "inhibit", "bacterial", "growth", "by", "targeting", "fundamental", "intracellular", "processes", "." ]
[ "O", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T017", "O", "O", "B-T170", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T017", "O", "O", "O", "B-T038", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O" ]
[ "One", "such", "subclass", "is", "the", "proline", "-rich", "antimicrobial", "peptides", "(", "PrAMPs", ")", "that", "bind", "to", "the", "ribosome", "and", "interfere", "with", "the", "process", "of", "protein", "synthesis", "." ]
[ "O", "O", "B-T170", "O", "O", "B-T103", "O", "B-T103", "I-T103", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T017", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O" ]
[ "A", "diverse", "range", "of", "PrAMPs", "have", "been", "identified", "in", "insects", ",", "such", "as", "bees", ",", "wasps", "and", "beetles", ",", "and", "crustaceans", ",", "such", "as", "crabs", ",", "as", "well", "as", "in", "mammals", ",", "such", "as", "cows", ",", "sheep", ",", "goats", "and", "pigs", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "B-T204", "O", "O", "O", "B-T204", "O", "B-T204", "O", "B-T204", "O", "O", "B-T204", "O", "O", "O", "B-T204", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T204", "O", "O", "O", "B-T204", "O", "B-T204", "O", "B-T204", "O", "B-T204", "O" ]
[ "Mechanistically", ",", "the", "best", "-", "characterized", "PrAMPs", "are", "the", "insect", "oncocins", ",", "such", "as", "Onc112", ",", "and", "bovine", "bactenecins", ",", "such", "as", "Bac7", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "B-T204", "B-T103", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "B-T204", "B-T103", "O", "O", "O", "B-T103", "O" ]
[ "Biochemical", "and", "structural", "studies", "have", "revealed", "that", "these", "PrAMPs", "bind", "within", "the", "ribosomal", "exit", "tunnel", "with", "a", "reverse", "orientation", "compared", "to", "a", "nascent", "polypeptide", "chain", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "B-T017", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "I-T103", "O" ]
[ "The", "PrAMPs", "allow", "initiation", "but", "prevent", "the", "transition", "into", "the", "elongation", "phase", "of", "translation", "." ]
[ "O", "B-T103", "O", "B-T038", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "O", "O", "B-T038", "O" ]
[ "Insight", "into", "the", "interactions", "of", "PrAMPs", "with", "their", "ribosomal", "target", "provides", "the", "opportunity", "to", "further", "develop", "these", "peptides", "as", "novel", "antimicrobial", "agents", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "B-T017", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "B-T103", "I-T103", "O" ]
[ "Organophosphate", "Esters", "in", "Air", ",", "Snow", "and", "Seawater", "in", "the", "North", "Atlantic", "and", "the", "Arctic" ]
[ "B-T103", "I-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "I-T082", "O", "O", "B-T082" ]
[ "The", "concentrations", "of", "eight", "organophosphate", "esters", "(", "OPEs", ")", "have", "been", "investigated", "in", "air", ",", "snow", "and", "seawater", "samples", "collected", "during", "the", "cruise", "of", "ARK", "-", "XXVIII/2", "from", "6th", "June", "to", "3rd", "July", "2014", "across", "the", "North", "Atlantic", "and", "the", "Arctic", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-T103", "I-T103", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "I-T082", "O", "O", "B-T082", "O" ]
[ "The", "sum", "of", "gaseous", "and", "particle", "concentrations", "(", "∑OPE", ")", "ranged", "from", "35", "to", "343", "pg", "/", "m3", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-T103", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "three", "chlorinated", "OPEs", "accounted", "for", "88", "±", "5", "%", "of", "the", "∑OPE", "." ]
[ "O", "O", "B-T103", "I-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "most", "abundant", "OPE", "was", "tris-(2", "-", "chloroethyl", ")", "phosphate", "(", "TCEP", ")", ",", "with", "concentrations", "ranging", "from", "30", "to", "227", "pg", "/", "m3", ",", "followed", "by", "three", "major", "OPEs", ",", "such", "as", "tris-(1", "-", "chloro-2", "-", "propyl", ")", "phosphate", "(", "TCPP", ",", "0.8", "to", "82", "pg", "/", "m3", ")", ",", "tri", "-", "n", "-", "butyl", "phosphate", "(", "TnBP", ",", "2", "to", "19", "pg", "/", "m3", ")", "and", "tri", "-", "iso", "-", "butyl", "phosphate", "(", "TiBP", ",", "0.3", "to", "14", "pg", "/", "m3", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-T103", "O", "B-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "B-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "atmospheric", "particle", "-bound", "dry", "depositions", "of", "TCEP", "ranged", "from", "2", "to", "12", "ng", "/", "m2", "/", "day", "." ]
[ "O", "B-T103", "I-T103", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "air", "-", "seawater", "gas", "exchange", "fluxes", "were", "dominated", "by", "net", "volatilization", "from", "seawater", "to", "air", "for", "TCEP", "(", "mean", ",", "146", "±", "239", "ng", "/", "m2", "/", "day", ")", ",", "TCPP", "(", "mean", ",", "1670", "±", "3031", "ng", "/", "m2", "/", "day", ")", ",", "TiBP", "(", "mean", ",", "537", "±", "581", "ng", "/", "m2", "/", "day", ")", "and", "TnBP", "(", "mean", ",", "230", "±", "254", "ng", "/", "m2", "/", "day", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "study", "highlighted", "that", "OPEs", "are", "subject", "to", "long", "-", "range", "transport", "via", "both", "air", "and", "seawater", "from", "the", "European", "continent", "and", "seas", "to", "the", "North", "Atlantic", "and", "the", "Arctic", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "B-T082", "O", "B-T082", "O", "O", "B-T082", "I-T082", "O", "O", "B-T082", "O" ]
[ "Ghrelin", "Protects", "the", "Thymic", "Epithelium", "From", "Conditioning", "-", "Regimen", "-", "Induced", "Damage", "and", "Promotes", "the", "Restoration", "of", "CD4", "+", "T", "Cells", "in", "Mice", "After", "Bone", "Marrow", "Transplantation" ]
[ "B-T103", "O", "O", "B-T017", "I-T017", "O", "B-T058", "I-T058", "I-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O", "B-T017", "I-T017", "I-T017", "I-T017", "O", "B-T204", "O", "B-T058", "I-T058", "I-T058" ]
[ "The", "delay", "in", "immune", "reconstitution", "after", "hematopoietic", "stem", "cell", "transplantation", "(", "HSCT", ")", ",", "especially", "a", "delay", "in", "central", "immune", "reconstitution", ",", "leads", "to", "opportunistic", "infections", "and", "disease", "relapse", "after", "transplantation", "and", "affects", "the", "long", "-", "term", "outcome", "of", "HSCT", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-T033", "I-T033", "O", "B-T058", "I-T058", "I-T058", "I-T058", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O" ]
[ "This", "delay", "is", "mainly", "attributable", "to", "thymic", "damage", "after", "myeloablative", "chemotherapy", "and", "radiotherapy", "METHODS", ":", "We", "established", "a", "model", "of", "allogeneic", "bone", "marrow", "transplantation", "(", "BMT", ")", "in", "mice", "and", "administered", "ghrelin", "(", "GRL", ")", "7", "days", "before", "the", "conditioning", "regimen", "or", "the", "day", "after", "BMT", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "I-T058", "O", "B-T058", "O", "O", "B-T204", "O", "O", "B-T103", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O" ]
[ "All", "the", "GRL", "-", "treated", "mice", ",", "especially", "those", "administered", "GRL", "prior", "to", "the", "conditioning", "regimen", ",", "exhibited", "more", "intact", "thymic", "architecture", "and", "a", "more", "rapid", "restoration", "of", "CD4", "T", "lymphocytes", "after", "BMT", "than", "those", "of", "the", "corresponding", "control", "mice", "." ]
[ "O", "O", "B-T103", "O", "O", "B-T204", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "O", "O", "O", "O", "B-T017", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O", "B-T017", "I-T017", "I-T017", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T204", "O" ]
[ "Moreover", ",", "the", "levels", "of", "T", "cell", "receptor", "excision", "circles", "(", "TRECs", ")", "were", "significantly", "higher", "in", "the", "mice", "treated", "with", "GRL", "prior", "to", "the", "conditioning", "regimen", "than", "in", "the", "control", "mice", "at", "28", "days", "after", "BMT", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T204", "B-T058", "I-T058", "B-T103", "O", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "O", "O", "O", "O", "B-T204", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O" ]
[ "Our", "finding", "s", "suggest", "that", "GRL", "may", "be", "a", "novel", "potential", "therapeutic", "approach", "to", "protecting", "the", "thymic", "epithelium", "from", "conditioning", "-", "regimen", "-", "induced", "damage", "and", "promoting", "rapid", "and", "durable", "thymic", "and", "peripheral", "CD4", "T", "cell", "recovery", "after", "HSCT", "." ]
[ "O", "B-T033", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T017", "B-T017", "O", "B-T058", "I-T058", "I-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T017", "O", "B-T082", "B-T017", "I-T017", "I-T017", "B-T038", "O", "B-T058", "O" ]
[ "The", "regulation", "and", "adoption", "of", "health", "technologies", "under", "Brazil", "'s", "Unified", "Health", "System", ":", "barriers", "to", "access", "to", "medicines", "for", "diseases", "of", "poverty", "?" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "O", "B-T082", "I-T082", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "B-T038", "O", "O", "O" ]
[ "The", "study", "aimed", "to", "examine", "the", "regulation", "and", "adoption", "of", "health", "technologies", "for", "the", "diseases", "of", "poverty", "in", "the", "Brazil", "'s", "Unified", "Health", "System", "(", "SUS", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "O", "O", "B-T038", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "I-T082", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "exploratory", ",", "descriptive", "study", "was", "conducted", "between", "January", "and", "May", "2016", "consisting", "of", "the", "search", "and", "analysis", "of", "relevant", "documents", "on", "the", "websites", "of", "Brazil", "'s", "National", "Health", "Surveillance", "Agency", ",", "the", "U.S.", "Food", "and", "Drug", "Administration", "(", "FDA", ")", ",", "the", "European", "Medicines", "Agency", "(", "EMA", ")", ",", "the", "National", "Commission", "for", "the", "Adoption", "of", "Technologies", "by", "the", "SUS", ",", "and", "Saúde", "Legis", "(", "the", "Ministry", "of", "Health", "'s", "Legislation", "System", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "I-T082", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "2014", "version", "of", "the", "Brazilian", "National", "List", "of", "Essential", "Medicines", "(", "RENAME", ",", "acronym", "in", "Portuguese", ")", "contained", "132", "medicines", "for", "diseases", "of", "poverty", "." ]
[ "O", "O", "B-T170", "O", "O", "O", "B-T170", "I-T170", "I-T170", "I-T170", "I-T170", "O", "B-T170", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "B-T038", "O", "O", "O" ]
[ "Over", "one", "-", "third", "of", "these", "(", "49", ")", "had", "only", "one", "national", "producer", ",", "while", "24", "were", "not", "registered", "in", "the", "country", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T098", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "O" ]
[ "The", "number", "of", "medicines", "contained", "in", "the", "RENAME", "dedicated", "to", "this", "group", "of", "diseases", "increased", "by", "46", "%", "between", "2006", "and", "2014", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "B-T170", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Despite", "advances", "in", "the", "regulation", "and", "incorporation", "of", "technologies", "by", "the", "SUS", ",", "given", "the", "lack", "of", "market", "interest", "and", "neglect", "of", "diseases", "of", "poverty", ",", "the", "government", "has", "a", "vital", "role", "to", "play", "in", "ensuring", "access", "to", "the", "best", "available", "therapies", "in", "order", "to", "reduce", "health", "inequalities", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "therefore", "follows", "that", "Brazil", "needs", "to", "improve", "the", "regulation", "of", "medicines", "that", "do", "not", "attract", "market", "interest", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-T082", "O", "O", "B-T033", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fatigue", "in", "multiple", "sclerosis", ":", "Associations", "with", "clinical", ",", "MRI", "and", "CSF", "parameters" ]
[ "B-T033", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O", "O", "O" ]
[ "Damage", "of", "different", "brain", "structures", "has", "been", "related", "to", "fatigue", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-T017", "I-T017", "O", "O", "O", "O", "B-T033", "O" ]
[ "Alternatively", ",", "functional", "alterations", "of", "central", "nervous", "system", "(", "CNS", ")", "cells", "by", "the", "inflammatory", "milieu", "within", "the", "CNS", "may", "be", "responsible", "for", "the", "development", "of", "fatigue", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T017", "O", "O", "O", "B-T082", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T033", "O" ]
[ "To", "investigate", "the", "effect", "of", "structural", "brain", "damage", "and", "inflammatory", "cerebrospinal", "fluid", "(", "CSF", ")", "changes", "on", "fatigue", "in", "multiple", "sclerosis", "(", "MS", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T033", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "B-T038", "O", "O" ]
[ "We", "determined", "the", "association", "of", "different", "clinical", ",", "CSF", "and", "magnetic", "resonance", "imaging", "(", "MRI", ")", "parameters", "with", "prevalence", "and", "severity", "of", "fatigue", ",", "as", "measured", "by", "the", "Fatigue", "Scale", "for", "Motor", "and", "Cognitive", "Functions", "in", "68", "early", "MS", "patients", "(", "discovery", "cohort", ")", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "I-T058", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T033", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T170", "I-T170", "I-T170", "I-T170", "I-T170", "I-T170", "I-T170", "O", "O", "O", "B-T038", "O", "O", "B-T098", "I-T098", "O", "O" ]
[ "We", "validated", "our", "findings", "in", "two", "MS", "cohorts", ":", "the", "MRI", "validation", "cohort", "(", "N", "=", "233", ")", "for", "the", "clinical", "and", "MRI", "parameters", ",", "and", "the", "CSF", "validation", "cohort", "(", "N", "=", "81", ")", "for", "the", "clinical", "and", "CSF", "parameters", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-T033", "O", "O", "B-T038", "B-T098", "O", "O", "B-T058", "B-T098", "I-T098", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T098", "I-T098", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fatigue", "was", "associated", "with", "clinical", "disability", "." ]
[ "B-T033", "O", "O", "O", "O", "B-T033", "O" ]
[ "Fatigue", "did", "not", "correlate", "with", "any", "CSF", "parameter", "but", "correlated", "negatively", "with", "total", "and", "cortical", "grey", "matter", "volume", "." ]
[ "B-T033", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T033", "O", "O", "O", "B-T017", "B-T017", "I-T017", "O", "O" ]
[ "However", ",", "when", "controlling", "for", "Expanded", "Disability", "Status", "Scale", "(", "EDSS", ")", "in", "a", "multivariate", "model", ",", "these", "associations", "lost", "significance", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-T170", "I-T170", "I-T170", "I-T170", "O", "B-T170", "O", "O", "O", "O", "B-T170", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Disability", "and", "disease", "duration", "best", "explain", "fatigue", "severity", "but", "none", "of", "the", "tested", "MRI", "or", "CSF", "parameter", "was", "reliably", "associated", "with", "fatigue", "." ]
[ "B-T033", "O", "B-T038", "O", "O", "O", "B-T033", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T033", "O" ]
[ "Intranasal", "Insulin", "Prevents", "Anesthesia", "-", "Induced", "Cognitive", "Impairment", "and", "Chronic", "Neurobehavioral", "Changes" ]
[ "B-T058", "B-T103", "O", "B-T058", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "O" ]
[ "General", "anesthesia", "increases", "the", "risk", "for", "cognitive", "impairment", "post", "operation", ",", "especially", "in", "the", "elderly", "and", "vulnerable", "individuals", "." ]
[ "B-T058", "I-T058", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T098", "O", "B-T098", "I-T098", "O" ]
[ "Recent", "animal", "studies", "on", "the", "impact", "of", "anesthesia", "on", "postoperative", "cognitive", "impairment", "have", "provided", "some", "valuable", "insights", ",", "but", "much", "remains", "to", "be", "understood", "." ]
[ "O", "B-T204", "I-T204", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "by", "using", "mice", "of", "various", "ages", "and", "conditions", ",", "we", "found", "that", "anesthesia", "with", "propofol", "and", "sevoflurane", "caused", "significant", "deficits", "in", "spatial", "learning", "and", "memory", ",", "as", "tested", "using", "Morris", "Water", "Maze", "(", "MWM", ")", "2", "-", "6", "days", "after", "anesthesia", "exposure", ",", "in", "aged", "(", "17", "-", "18", "months", "old", ")", "wild", "-", "type", "(", "WT", ")", "mice", "and", "in", "adult", "(", "7", "-", "8", "months", "old", ")", "3xTg", "-", "AD", "mice", "(", "a", "triple", "transgenic", "mouse", "model", "of", "Alzheimer", "'s", "disease", "(", "AD", ")", ")", ",", "but", "not", "in", "adult", "WT", "mice", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-T204", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O", "B-T103", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "I-T058", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T204", "I-T204", "I-T204", "I-T204", "I-T204", "I-T204", "I-T204", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T204", "I-T204", "I-T204", "I-T204", "O", "O", "B-T204", "I-T204", "I-T204", "B-T038", "O", "B-T038", "I-T038", "I-T038", "O", "B-T038", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T204", "I-T204", "O" ]
[ "Anesthesia", "resulted", "in", "long", "-", "term", "neurobehavioral", "changes", "in", "the", "fear", "conditioning", "task", "carried", "out", "65", "days", "after", "exposure", "to", "anesthesia", "in", "3xTg", "-", "AD", "mice", "." ]
[ "B-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T204", "I-T204", "I-T204", "I-T204", "O" ]
[ "Importantly", ",", "daily", "intranasal", "administration", "of", "insulin", "(", "1.75", "U/", "mouse", "/", "day", ")", "for", "only", "3", "days", "prior", "to", "anesthesia", "completely", "prevented", "the", "anesthesia", "-", "induced", "deficits", "in", "spatial", "learning", "and", "memory", "and", "the", "long", "-", "term", "neurobehavioral", "changes", "tested", "65", "days", "after", "exposure", "to", "anesthesia", "in", "3xTg", "-", "AD", "mice", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "B-T204", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T204", "I-T204", "I-T204", "I-T204", "O" ]
[ "These", "results", "indicate", "that", "aging", "and", "AD", "-like", "brain", "pathology", "increase", "the", "vulnerability", "to", "cognitive", "impairment", "after", "anesthesia", "and", "that", "intranasal", "treatment", "with", "insulin", "can", "prevent", "anesthesia", "-", "induced", "cognitive", "impairment", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-T038", "O", "B-T038", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "B-T058", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "O", "B-T103", "O", "O", "B-T058", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O" ]
[ "Effects", "of", "robot", "-", "assisted", "upper", "limb", "rehabilitation", "in", "stroke", "patients", ":", "a", "systematic", "review", "with", "meta", "-", "analysis" ]
[ "O", "O", "B-T058", "I-T058", "I-T058", "I-T058", "I-T058", "I-T058", "O", "B-T038", "O", "O", "O", "B-T170", "I-T170", "O", "B-T170", "I-T170", "I-T170" ]
[ "Technology", "-", "supported", "training", "is", "emerging", "as", "a", "solution", "to", "support", "therapists", "in", "their", "efforts", "providing", "high", "-", "intensity", ",", "repetitive", ",", "and", "task", "-", "specific", "treatment", ",", "in", "order", "to", "enhance", "the", "recovery", "process", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T170", "I-T170", "I-T170", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "I-T058", "I-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O" ]
[ "The", "aim", "of", "this", "review", "is", "to", "assess", "the", "effectiveness", "of", "different", "robotic", "devices", "(", "end", "-", "effector", "and", "exoskeleton", "robots", ")", "in", "comparison", "with", "any", "other", "type", "of", "intervention", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "we", "aim", "to", "assess", "whether", "or", "not", "better", "improvements", "are", "obtained", "in", "the", "sub", "-", "acute", "phase", "after", "stroke", "onset", "than", "in", "the", "chronic", "phase", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "research", "was", "conducted", "in", "the", "electronic", "bibliographic", "databases", "Cochrane", ",", "MEDLINE", ",", "and", "EMBASE", "." ]
[ "O", "B-T062", "O", "O", "O", "O", "B-T170", "I-T170", "I-T170", "B-T170", "O", "B-T170", "O", "O", "B-T170", "O" ]
[ "A", "total", "of", "17", "studies", "were", "included", ":", "14", "randomized", "controlled", "trials", ",", "2", "systematic", "reviews", ",", "and", "one", "meta", "-", "analysis", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-T062", "O", "O", "O", "O", "B-T062", "I-T062", "I-T062", "O", "O", "B-T170", "I-T170", "O", "O", "O", "B-T170", "I-T170", "I-T170", "O" ]
[ "Fugl", "-", "Meyer", "and", "modified", "Ashworth", "scale", "were", "selected", "to", "measure", "primary", "outcomes", ",", "i.e.", ",", "motor", "function", "and", "muscle", "tone", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "B-T170", "I-T170", "I-T170", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "B-T038", "I-T038", "O" ]
[ "Functional", "independence", "measure", "and", "motor", "activity", "log", "were", "selected", "to", "measure", "secondary", "outcomes", ",", "i.e.", ",", "activities", "of", "daily", "living", "." ]
[ "B-T170", "I-T170", "I-T170", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "comparison", "with", "conventional", "therapy", ",", "the", "robot", "-", "assisted", "rehabilitation", "is", "more", "effective", "in", "improving", "upper", "limb", "motor", "function", "recovery", ",", "especially", "in", "chronic", "stroke", "patients", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "O", "O", "B-T058", "I-T058", "I-T058", "I-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T017", "I-T017", "B-T038", "I-T038", "B-T038", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O" ]
[ "No", "significant", "improvements", "are", "observed", "in", "the", "reduction", "of", "muscle", "tone", "or", "daily", "living", "activities", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "present", "systematic", "review", "shows", "that", "the", "use", "of", "robotic", "devices", "can", "positively", "affect", "the", "recovery", "of", "arm", "function", "in", "patients", "with", "stroke", "." ]
[ "O", "O", "B-T170", "I-T170", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "B-T038", "O" ]
[ "Daily", "stressors", ",", "trauma", "exposure", ",", "and", "mental", "health", "among", "stateless", "Rohingya", "refugees", "in", "Bangladesh" ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "B-T098", "I-T098", "I-T098", "O", "B-T082" ]
[ "The", "Rohingya", "of", "Myanmar", "are", "a", "severely", "persecuted", "minority", "who", "form", "one", "of", "the", "largest", "groups", "of", "stateless", "people", ";", "thousands", "of", "them", "reside", "in", "refugee", "camps", "in", "southeastern", "Bangladesh", "." ]
[ "O", "B-T098", "O", "B-T082", "O", "O", "O", "O", "B-T098", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T098", "O", "B-T098", "I-T098", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "I-T082", "O", "B-T082", "B-T082", "O" ]
[ "There", "has", "been", "little", "research", "into", "the", "mental", "health", "consequences", "of", "persecution", ",", "war", ",", "and", "other", "historical", "trauma", "endured", "by", "the", "Rohingya", ";", "nor", "has", "the", "role", "of", "daily", "environmental", "stressors", "associated", "with", "continued", "displacement", ",", "statelessness", ",", "and", "life", "in", "the", "refugee", "camps", ",", "been", "thoroughly", "researched", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T098", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "I-T082", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "cross", "-", "sectional", "study", "examined", ":", "trauma", "history", ",", "daily", "environmental", "stressors", ",", "and", "mental", "health", "outcomes", "for", "148", "Rohingya", "adults", "residing", "in", "Kutupalong", "and", "Nayapara", "refugee", "camps", "in", "Bangladesh", "." ]
[ "O", "B-T062", "I-T062", "I-T062", "I-T062", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "B-T098", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "I-T082", "O", "B-T082", "O" ]
[ "Results", "indicated", "high", "levels", "of", "mental", "health", "concerns", ":", "posttraumatic", "stress", "disorder", "(", "PTSD", ")", ",", "depression", ",", "somatic", "complaints", ",", "and", "associated", "functional", "impairment", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "I-T038", "O", "B-T038", "O", "O", "B-T038", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Participants", "also", "endorsed", "local", "idioms", "of", "distress", ",", "including", "somatic", "complaints", "and", "concerns", "associated", "with", "spirit", "possession", "." ]
[ "B-T098", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T033", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "study", "also", "found", "very", "high", "levels", "of", "daily", "environmental", "stressors", "associated", "with", "life", "in", "the", "camps", ",", "including", "problems", "with", "food", ",", "lack", "of", "freedom", "of", "movement", ",", "and", "concerns", "regarding", "safety", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T033", "I-T033", "I-T033", "I-T033", "I-T033", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Regression", "and", "associated", "mediation", "analyses", "indicated", "that", ",", "while", "there", "was", "a", "direct", "effect", "of", "trauma", "exposure", "on", "mental", "health", "outcomes", "(", "PTSD", "symptoms", ")", ",", "daily", "environmental", "stressors", "partially", "mediated", "this", "relationship", "." ]
[ "B-T170", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "B-T038", "B-T033", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Depression", "symptoms", "were", "associated", "with", "daily", "stressors", ",", "but", "not", "prior", "trauma", "exposure", "." ]
[ "B-T033", "I-T033", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "indicate", "that", "daily", "stressors", "play", "a", "pivotal", "role", "in", "mental", "health", "outcomes", "of", "populations", "affected", "by", "collective", "violence", "and", "statelessness", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "B-T098", "O", "O", "O", "B-T038", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", ",", "therefore", ",", "important", "to", "consider", "the", "role", "and", "effects", "of", "environmental", "stressors", "associated", "with", "life", "in", "refugee", "camps", "on", "the", "mental", "health", "and", "psychosocial", "well", "-", "being", "of", "stateless", "populations", "such", "as", "the", "Rohingya", ",", "living", "in", "protracted", "humanitarian", "environment", "s." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "I-T082", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T098", "I-T098", "O", "O", "O", "B-T098", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "I-T082", "O" ]
[ "Long", "-", "range", "allosteric", "regulation", "of", "the", "human", "26S", "proteasome", "by", "20S", "proteasome", "-", "targeting", "cancer", "drugs" ]
[ "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "B-T103", "I-T103", "I-T103", "O", "B-T103", "I-T103", "O", "O", "B-T103", "I-T103" ]
[ "The", "proteasome", "holoenzyme", "is", "the", "major", "non", "-", "lysosomal", "protease", ";", "its", "proteolytic", "activity", "is", "essential", "for", "cellular", "homeostasis", "." ]
[ "O", "B-T103", "B-T103", "O", "O", "O", "B-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O" ]
[ "Thus", ",", "it", "is", "an", "attractive", "target", "for", "the", "development", "of", "chemotherapeutics", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O" ]
[ "While", "the", "structural", "basis", "of", "core", "particle", "(", "CP", ")", "inhibitors", "is", "largely", "understood", ",", "their", "structural", "impact", "on", "the", "proteasome", "holoenzyme", "remains", "entirely", "elusive", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "I-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "B-T103", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "determined", "the", "structure", "of", "the", "26S", "proteasome", "with", "and", "without", "the", "inhibitor", "Oprozomib", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "I-T103", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "B-T103", "O" ]
[ "Drug", "binding", "modifies", "the", "energy", "landscape", "of", "conformational", "motion", "in", "the", "proteasome", "regulatory", "particle", "(", "RP", ")", "." ]
[ "B-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "B-T082", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "B-T103", "B-T017", "I-T017", "O", "B-T017", "O", "O" ]
[ "Structurally", ",", "the", "energy", "barrier", "created", "by", "Oprozomib", "triggers", "a", "long", "-", "range", "allosteric", "regulation", ",", "resulting", "in", "the", "stabilization", "of", "a", "non", "-", "productive", "state", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T103", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thereby", ",", "the", "chemical", "drug", "-", "binding", "signal", "is", "converted", ",", "propagated", "and", "amplified", "into", "structural", "changes", "over", "a", "distance", "of", "more", "than", "150", "Å", "from", "the", "proteolytic", "site", "to", "the", "ubiquitin", "receptor", "Rpn10", "." ]
[ "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "I-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "O", "O", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T082", "I-T082", "O", "O", "B-T103", "I-T103", "B-T103", "O" ]
[ "The", "direct", "visualization", "of", "changes", "in", "conformational", "dynamics", "upon", "drug", "binding", "allows", "new", "ways", "to", "screen", "and", "develop", "future", "allosteric", "proteasome", "inhibitors", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "B-T038", "I-T038", "O", "O", "O", "O", "B-T058", "O", "O", "O", "B-T038", "B-T103", "I-T103", "O" ]
[ "Statistical", "algorithms", "improve", "accuracy", "of", "gene", "fusion", "detection" ]
[ "B-T170", "I-T170", "O", "O", "O", "B-T062", "I-T062", "B-T033" ]
[ "Gene", "fusions", "are", "known", "to", "play", "critical", "roles", "in", "tumor", "pathogenesis", "." ]
[ "B-T062", "I-T062", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T038", "B-T038", "O" ]
[ "Yet", ",", "sensitive", "and", "specific", "algorithms", "to", "detect", "gene", "fusions", "in", "cancer", "do", "not", "currently", "exist", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-T170", "O", "B-T033", "B-T062", "I-T062", "O", "B-T038", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "paper", ",", "we", "present", "a", "new", "statistical", "algorithm", ",", "MACHETE", "(", "Mismatched", "Alignment", "CHimEra", "Tracking", "Engine", ")", ",", "which", "achieves", "highly", "sensitive", "and", "specific", "detection", "of", "gene", "fusions", "from", "RNA", "-", "Seq", "data", ",", "including", "the", "highest", "Positive", "Predictive", "Value", "(", "PPV", ")", "compared", "to", "the", "current", "state", "-", "of", "-", "the", "-", "art", ",", "as", "assessed", "in", "simulated", "data", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T170", "I-T170", "O", "B-T170", "O", "B-T170", "I-T170", "I-T170", "I-T170", "I-T170", "I-T170", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T033", "O", "B-T062", "I-T062", "O", "B-T170", "I-T170", "I-T170", "I-T170", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "show", "that", "the", "best", "performing", "published", "algorithms", "either", "find", "large", "numbers", "of", "fusions", "in", "negative", "control", "data", "or", "suffer", "from", "low", "sensitivity", "detecting", "known", "driving", "fusions", "in", "gold", "standard", "settings", ",", "such", "as", "EWSR1", "-", "FLI1", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T170", "B-T170", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T062", "O", "B-T033", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T033", "O", "O", "B-T062", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T017", "I-T017", "I-T017", "O" ]
[ "As", "proof", "of", "principle", "that", "MACHETE", "discovers", "novel", "gene", "fusions", "with", "high", "accuracy", "in", "vivo", ",", "we", "mined", "public", "data", "to", "discover", "and", "subsequently", "PCR", "validate", "novel", "gene", "fusions", "missed", "by", "other", "algorithms", "in", "the", "ovarian", "cancer", "cell", "line", "OVCAR3", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-T170", "O", "O", "B-T062", "I-T062", "O", "O", "O", "B-T082", "I-T082", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T062", "B-T062", "O", "B-T062", "I-T062", "O", "O", "O", "B-T170", "O", "O", "B-T038", "I-T038", "B-T017", "I-T017", "B-T017", "O" ]
[ "These", "results", "highlight", "the", "gains", "in", "accuracy", "achieved", "by", "introducing", "statistical", "models", "into", "fusion", "detection", ",", "and", "pave", "the", "way", "for", "unbiased", "discovery", "of", "potentially", "driving", "and", "druggable", "gene", "fusions", "in", "primary", "tumors", "." ]
[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T170", "I-T170", "O", "B-T062", "B-T033", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-T062", "I-T062", "O", "B-T038", "I-T038", "O" ]
[ "Palmoplantar", "pustulosis", "-", "a", "cross", "-", "sectional", "analysis", "in", "Germany" ]
[ "B-T038", "I-T038", "O", "O", "B-T062", "I-T062", "I-T062", "I-T062", "O", "B-T082" ]