Datasets:

---

Praise2112

/

LivingNER

like 1

[ "A", "23-month-old", "male", "patient", "with", "a", "20-day", "clinical", "picture", "of", "upper", "respiratory", "symptoms", "such", "as", "hyaline", "rhinorrhoea", ",", "nasal", "obstruction", ",", "mild", "odynophagia", "and", "coryza", ",", "which", "subsided", "spontaneously", "but", "with", "the", "appearance", "and", "persistence", "of", "asthenia", ",", "adynamia", "and", "intermittent", "febrile", "peaks", "of", "up", "to", "39C", "°", ".", "She", "was", "admitted", "to", "the", "emergency", "department", "for", "the", "appearance", "of", "visible", "multiple", "lymphadenopathies", ",", "predominantly", "cervical", ".", "Five", "days", "before", "admission", "he", "presented", "marked", "hyporexia", "and", "progressive", "asthenia", "and", "adynamia", ".", "He", "was", "hospitalised", "on", "suspicion", "of", "mononucleoside", "syndrome", "and", "on", "the", "second", "day", "developed", "sudden", "right", "peripheral", "facial", "paralysis", ",", "for", "which", "he", "was", "referred", "to", "the", "Otorhinolaryngology", "department", ".", "This", "was", "a", "previously", "healthy", "patient", "with", "no", "known", "pathological", "history", ";", "his", "relatives", "denied", "any", "history", "of", "otitis", ",", "otological", "disease", "or", "otic", "symptoms", "before", "or", "during", "the", "current", "illness", ".", "The", "father", "reported", "contact", "with", "ticks", "and", "deer", "in", "Mesitas", "del", "Colegio", "-", "rural", "area", "of", "Cundinamarca", "-", "one", "month", "prior", "to", "the", "consultation", ".", "On", "physical", "examination", "on", "admission", "he", "was", "tachycardic", ",", "febrile", ",", "with", "House-Brackmann", "VI", "right", "facial", "paralysis", ",", "bilateral", "otoscopy", "with", "opaque", "hypomobile", "opaque", "membranes", "with", "erythema", ",", "without", "inflammatory", "retroauricular", "signs", ".", "No", "visceromegaly", "and", "the", "rest", "within", "normal", "limits", ".", "The", "paraclinical", "report", "showed", "rapid", "tests", "for", ":", "EBV", "negative", ",", "CMG", "negative", ",", "Toxoplasma", "IgG", "negative", ".", "The", "haemogram", "showed", ":", "leukocytes", "(", "19000", ")", ",", "neutrophils", "(", "54", "%", ")", ",", "CRP", "(", "165", ")", "and", "normal", "CSF", ".", "It", "was", "decided", "to", "perform", "an", "ear", "CT", "scan", "which", "showed", "hypertrophy", "of", "the", "tympanic", "and", "mastoid", "cavity", "mucosa", "due", "to", "soft", "tissue", "density", "material", "without", "other", "apparent", "alterations", ",", "auditory", "evoked", "potentials", "with", "bilateral", "conductive", "hypoacusis", "responses", "to", "35db", ",", "so", "electroneuronography", "was", "performed", "which", "reported", "a", "total", "absence", "of", "right", "NC", "VII", "response", "on", "the", "fourth", "day", "after", "the", "onset", "of", "facial", "paralysis", ".", "With", "suspicion", "of", "Lyme", "disease", ",", "IV", "ceftriaxone", "at", "100mg", "/", "kg", "/", "day", "and", "prednisolone", "at", "1mg", "/", "kg", "/", "day", "were", "started", ".", "Due", "to", "the", "clinical", "history", ",", "she", "presented", "physical", "examination", "with", "complete", "facial", "paralysis", "and", "electroneuronography", "with", "evidence", "of", "denervation", "greater", "than", "98", "%", ",", "on", "the", "seventh", "day", "it", "was", "decided", "to", "perform", "an", "upward", "wall", "mastoidectomy", "with", "decompression", "of", "the", "second", "and", "third", "facial", "nerve", "and", "placement", "of", "an", "ipsilateral", "ventilation", "tube", ".", "Intraoperatively", ",", "the", "mastoid", "mucosa", "and", "tympanic", "cavity", "were", "found", "to", "be", "severely", "diseased", "with", "no", "purulent", "content", ".", "Satisfactory", "decompression", "was", "achieved", "and", "samples", "were", "sent", "for", "pathology", "and", "culture", ".", "The", "patient", "had", "a", "favourable", "evolution", ":", "febrile", "episodes", "ceased", "within", "24", "hours", "of", "surgery", ",", "there", "was", "a", "noticeable", "improvement", "in", "general", "condition", "with", "return", "of", "appetite", ",", "on", "the", "fifth", "postoperative", "day", "there", "was", "a", "slight", "improvement", "in", "the", "pattern", "of", "facial", "mobility", "given", "by", "slight", "movement", "of", "the", "labial", "commissure", "and", ",", "subsequently", ",", "by", "the", "eleventh", "day", ",", "complete", "ocular", "closure", ".", "Borrelia", "IgG", "was", "positive", "in", "38", "dilutions", "(", "normal", "value", "<", "5", ")", "and", "the", "patient", "was", "discharged", "on", "completion", "of", "14", "days", "of", "inpatient", "treatment", "with", "electromyography", "showing", "5-10", "%", "recovery", "of", "buccal", "branch", "innervation", "and", "subsequently", "on", "outpatient", "control", ".", "After", "15", "days", "the", "patient", "showed", "marked", "clinical", "improvement", "House-Brackmann", "III-IV", "/", "VI", ".", "Three", "months", "after", "the", "onset", "of", "the", "condition", ",", "the", "patient", "presented", "complete", "ocular", "closure", ",", "movement", "of", "the", "lower", "third", "with", "asymmetry", "only", "at", "maximum", "effort", "and", "the", "onset", "of", "frontal", "mobilisation", "." ]

[ 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "male patient", "label": "HUMAN", "start": 15, "end": 27 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 20, "end": 27 }, { "text": "Toxoplasma", "label": "SPECIES", "start": 1414, "end": 1424 }, { "text": "EBV", "label": "SPECIES", "start": 1386, "end": 1389 }, { "text": "relatives", "label": "HUMAN", "start": 804, "end": 813 }, { "text": "ticks", "label": "SPECIES", "start": 951, "end": 956 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 756, "end": 763 }, { "text": "father", "label": "HUMAN", "start": 922, "end": 928 }, { "text": "deer", "label": "SPECIES", "start": 961, "end": 965 }, { "text": "CMG", "label": "SPECIES", "start": 1400, "end": 1403 }, { "text": "Borrelia", "label": "SPECIES", "start": 2988, "end": 2996 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2608, "end": 2615 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3056, "end": 3063 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3259, "end": 3266 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3380, "end": 3387 } ]

[ "Anamnesis", "A", "75-year-old", "man", "with", "a", "history", "of", "Paget", "'", "s", "disease", ",", "gastric", "ulcer", ",", "upper", "gastrointestinal", "haemorrhage", "due", "to", "duodenal", "perforation", "managed", "with", "conservative", "treatment", "about", "5", "months", "before", "the", "current", "episode", "and", "bilateral", "hypoacusis", ",", "who", "came", "to", "the", "emergency", "department", "with", "binocular", "diplopia", "in", "extreme", "gaze", "in", "both", "directions", "of", "horizontal", "gaze", ",", "greater", "in", "distant", "vision", ",", "at", "first", "fluctuating", ",", "accompanied", "by", "a", "subjective", "sensation", "of", "dizziness", ".", "Given", "that", "the", "first", "examination", "showed", "sustained", "diplopia", "in", "lateral", "gaze", "(", "after", "about", "30", "seconds", "of", "fixation", ")", "with", "no", "other", "clinical", ",", "analytical", "or", "CT", "scan", "alterations", ",", "ocular", "myasthenia", "was", "suspected", ",", "and", "treatment", "was", "started", "with", "pyridostigmine", "with", "review", "in", "Neuromuscular", "consultations", ".", "Over", "the", "following", "15", "days", ",", "the", "patient", "presented", "a", "progressive", "worsening", "of", "diplopia", ",", "also", "associated", "with", "dysarthria", ",", "gait", "instability", ",", "nystagmus", "and", ",", "finally", ",", "disorientation", ",", "for", "which", "he", "returned", "to", "the", "Emergency", "Department", "and", "was", "admitted", "to", "the", "Neurology", "ward", ".", "During", "the", "period", "of", "worsening", ",", "a", "cranial", "MRI", "was", "performed", "at", "a", "private", "centre", "and", "was", "reported", "as", "normal", ".", "The", "patient", "had", "no", "fever", "or", "other", "accompanying", "systemic", "symptoms", ".", "Of", "note", ",", "the", "patient", "reported", "vomiting", ",", "probably", "related", "to", "contact", "with", "an", "agricultural", "antifungal", "drug", "in", "the", "days", "prior", "to", "the", "onset", "of", "symptoms", ".", "Physical", "examination", "Afebrile", ",", "blood", "pressure", "and", "heart", "rate", "normal", ".", "General", "examination", "without", "relevant", "alterations", ".", "Neurological", "examination", ".", "Higher", "functions", ":", "conscious", ",", "alert", "during", "the", "examination", ",", "although", "tending", "to", "somnolence", ";", "attentive", ",", "cooperative", ",", "bradypsychic", ",", "with", "fluent", ",", "coherent", ",", "well-articulated", "language", ",", "with", "good", "articulation", ",", "nominative", ",", "calculating", ",", "partially", "disorientated", "in", "time", ",", "oriented", "in", "space", ",", "normal", ",", "recent", "remote", "memory", "and", "preserved", "learning", "capacity", "(", "remembers", "two", "out", "of", "three", ",", "three", "out", "of", "three", "with", "semantic", "clues", ")", ",", "abstraction", ",", "judgement", "and", "reasoning", "slightly", "altered", ",", "no", "apraxia", ".", "Cranial", "nerves", ":", "II", ":", "FO", "without", "alterations", ";", "normal", "confrontation", "campimetry", ".", "III-IV-VI", ":", "severe", "restriction", "for", "dextroversion", "and", "levoversion", "of", "conjugate", "gaze", ",", "greater", "in", "OI", ";", "mild", "restriction", "for", "infraversion", "of", "conjugate", "gaze", ",", "greater", "in", "OI", ";", "moderate", "restriction", "for", "supraversion", "of", "gaze", ",", "greater", "in", "OD", ".", "Bilateral", "nystagmus", ",", "with", "rapid", "phase", "towards", "the", "direction", "of", "gaze", ".", "No", "reports", "of", "diplopia", ".", "V", ":", "sensory", "and", "motor", "without", "alterations", ".", "VII", ":", "no", "facial", "paresis", ".", "Lower", "cranial", "nerves", "preserved", ".", "Motor", ":", "5", "/", "5", "strength", "by", "muscle", "groups", "in", "all", "four", "limbs", ".", "REM", ":", "upper", "limbs", "present", "and", "symmetrical", "(", "+", "+", "/", "+", "+", "+", "+", ")", ";", "bilateral", "patellar", "areflexia", ";", "hypoactive", "Achilles", "reflexes", "present", "(", "+", "/", "+", "+", "+", "+", ")", ".", "CPR", ":", "bilateral", "flexor", ".", "Sensibility", ":", "thermoalgesic", "hypoaesthesia", "in", "lower", "limbs", ",", "rest", "normal", ".", "Cerebellum", ":", "no", "dysmetria", "or", "dysdiadochokinesia", ".", "Gait", ":", "gait", "ataxia", "with", "increased", "base", "of", "support", "and", "impossible", "tandem", ".", "Extrapyramidal", ":", "mild", "postural", "action", "tremor", ".", "Complementary", "tests", "-", "Laboratory", "tests", ":", "complete", "blood", "count", ",", "biochemistry", ",", "coagulation", ",", "thyroid", "profile", ",", "lipid", "profile", ",", "folic", "acid", ",", "vitamin", "B12", ",", "vitamin", "D", ",", "PTH", ",", "autoimmunity", ",", "RF", ",", "complement", "and", "tumour", "markers", "were", "normal", ".", "-", "Lumbar", "puncture", ":", "normal", "outflow", "pressure", "and", "cytobiochemistry", ".", "-", "Microbiology", ":", "negative", "serology", "for", "HIV", ",", "syphilis", ",", "Borrelia", "and", "Brucella", ".", "Study", "of", "bacteria", "and", "mycobacteria", "in", "CSF", "negative", ".", "-", "ECG", ":", "no", "alterations", ".", "-", "Cranial", "CT", "scan", ":", "chronic", "lacunar", "infarcts", "in", "the", "basal", "ganglia", ",", "with", "no", "other", "significant", "alterations", "for", "the", "patient", "'", "s", "age", ".", "-", "Cranial", "MRI", ":", "T2", "and", "FLAIR", "sequences", "show", "signal", "hyperintensity", "affecting", "the", "mesencephalic", "tectum", "region", "and", "surrounding", "the", "periaqueductal", "grey", "matter", ".", "There", "is", "also", "involvement", "of", "the", "mammillary", "bodies", "of", "the", "hypothalamus", ",", "both", "fornices", ",", "as", "well", "as", "the", "medial", "region", "of", "both", "thalami", ",", "on", "both", "sides", "of", "the", "third", "ventricle", "and", "focal", "areas", "of", "uptake", "surrounding", "the", "periaqueductal", "grey", "matter", ",", "the", "bilateral", "thalamus", "and", "in", "the", "region", "of", "the", "mammillary", "bodies", ".", "Diagnosis", "Clinical", "impression", ":", "a", "75-year-old", "man", "with", "a", "history", "of", "gastric", "ulcer", "and", "duodenal", "perforation", "who", ",", "after", "a", "mild", "intoxication", "by", "agricultural", "antifungals", ",", "with", "vomiting", "and", "anorexia", ",", "presented", "with", "ophthalmoplegia", ",", "ataxia", ",", "nystagmus", ",", "hyporeflexia", "and", "confusion", ",", "rapidly", "progressive", "over", "20", "days", ".", "Analytical", "and", "microbiological", "studies", "of", "blood", "and", "CSF", "showed", "no", "data", "of", "interest", ",", "while", "cranial", "MRI", "showed", "a", "lesion", "pattern", "suggestive", "of", "thiamine", "deficiency", "encephalopathy", ".", "Clinical", "judgement", ":", "Wernicke", "'", "s", "encephalopathy", "secondary", "to", "malabsorption", "at", "the", "duodenal", "level", ",", "triggered", "by", "antifungal", "intoxication", ".", "Treatment", "Treatment", "was", "started", "with", "thiamine", "at", "a", "dose", "of", "500", "mg", "intravenous", "every", "8", "hours", "for", "3", "days", ",", "500", "mg", "intravenous", "daily", "for", "the", "next", "4", "days", "and", "then", "300", "mg", "daily", "orally", ".", "Evolution", "Following", "treatment", ",", "the", "patient", "showed", "progressive", "improvement", ",", "with", "mild", "inattention", ",", "bilateral", "nystagmus", "and", "difficulty", "in", "tandem", "gait", "at", "discharge", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "antifungal", "label": "SPECIES", "start": 1287, "end": 1297 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 788, "end": 795 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1136, "end": 1143 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1211, "end": 1218 }, { "text": "Borrelia", "label": "SPECIES", "start": 3252, "end": 3260 }, { "text": "Brucella", "label": "SPECIES", "start": 3265, "end": 3273 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 3237, "end": 3240 }, { "text": "bacteria", "label": "SPECIES", "start": 3284, "end": 3292 }, { "text": "mycobacteria", "label": "SPECIES", "start": 3297, "end": 3309 }, { "text": "syphilis", "label": "SPECIES", "start": 3242, "end": 3250 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3462, "end": 3469 }, { "text": "antifungal", "label": "SPECIES", "start": 4532, "end": 4542 }, { "text": "antifungals", "label": "SPECIES", "start": 4093, "end": 4104 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4773, "end": 4780 } ]

[ "1", ".", "Patient", "'", "s", "problem", "A", "52", "year", "old", "female", "patient", "came", "to", "the", "clinic", "because", "of", "swollen", "gums", "and", "dental", "mobility", ".", "She", "smoked", "2", "cigarettes", "/", "day", "(", "in", "the", "first", "10", "years", "of", "smoking", "she", "smoked", "20", "cigarettes", "/", "day", ")", ".", "She", "was", "diagnosed", "and", "treated", "for", "breast", "cancer", "10", "years", "ago", ".", "She", "currently", "reports", "controlled", "hypertension", ".", "She", "takes", "daily", "medication", "with", "an", "anti-estrogen", "(", "Tamoxifen", "20", "mg", ")", "and", "a", "beta-blocker", "(", "Atenolol", "50", "mg", ")", ".", "She", "has", "received", "numerous", "restorative", "dental", "treatments", "and", "has", "absent", "teeth", ".", "She", "has", "a", "family", "history", "of", "periodontal", "disease", ".", "2", ".", "Diagnosis", "Clinical", "inspection", "revealed", "a", "thick", "biotype", "with", "erythematous", "and", "oedematous", "gingival", "margins", "and", "generalised", "recession", ".", "A", "plaque", "index", "(", "PI", ")", "of", "83", "%", "and", "a", "bleeding", "index", "(", "BI", ")", "of", "78", ".", "67", "%", "were", "quantified", ".", "Probing", "depths", "(", "PS", ")", "of", "7-15", "mm", "in", "the", "four", "sextants", ".", "On", "radiographic", "examination", "he", "reported", "generalised", "moderate", "horizontal", "bone", "loss", "with", "severe", "vertical", "bone", "defects", "located", "in", "several", "teeth", ".", "Microbiological", "analysis", "indicated", "high", "loads", "of", "T", ".", "forsythia", ",", "F", ".", "nucleatum", ",", "P", ".", "gingivalis", "and", "T", ".", "denticola", ".", "At", "the", "dental", "level", ",", "a", "fractured", "restoration", "was", "noted", "in", "4", ".", "5", "and", "a", "vertical", "fracture", "in", "2", ".", "5", ",", "as", "well", "as", "the", "absence", "of", "multiple", "teeth", "in", "posterior", "sextants", ".", "He", "reported", "a", "posterior", "bite", "collapse", ",", "bruxism", ",", "fremitus", "type", "II", "in", "1", ".", "2", ",", "as", "well", "as", "dental", "interferences", ".", "He", "was", "diagnosed", "with", "advanced", "chronic", "generalised", "periodontitis", "(", "Stage", "III", "generalised", ",", "Grade", "C", ")", "and", "periodontitis", "associated", "with", "endodontic", "lesion", "at", "1", ".", "4", "(", "combined", "periodontal", "endodontic", "lesion", ")", ".", "There", "were", "clinical", "and", "radiographic", "signs", "indicating", "the", "presence", "of", "secondary", "occlusal", "trauma", ".", "3", ".", "Aim", "of", "treatment", "In", "view", "of", "the", "patient", "'", "s", "reason", "for", "consultation", ",", "the", "main", "objective", "was", "to", "restore", "the", "patient", "'", "s", "oral", "health", ".", "Also", ",", "a", "treatment", "objective", "was", "the", "replacement", "of", "missing", "teeth", "in", "order", "to", "improve", "her", "masticatory", "function", ".", "4", ".", "Modifying", "factors", "The", "main", "aetiological", "factor", "of", "periodontitis", "in", "this", "patient", "is", "bacterial", "biofilm", ".", "The", "time", "and", "amount", "of", "exposure", "to", "smoking", "can", "be", "considered", "one", "of", "the", "risk", "factors", "in", "the", "development", "of", "periodontal", "disease", ".", "Dental", "malocclusion", "and", "malposition", ",", "secondary", "occlusal", "trauma", "and", "other", "local", "factors", "such", "as", "open", "contacts", ",", "root", "proximity", "and", "anatomical", "concavities", "are", "contributing", "factors", "to", "the", "development", "of", "periodontal", "disease", ".", "5", ".", "Prognosis", "A", "prognosis", "of", "unreasonable", "to", "treat", "was", "obtained", "for", "1", ".", "7", ",", "1", ".", "4", ",", "1", ".", "2", ",", "4", ".", "8", "and", "2", ".", "5", ";", "doubtful", "for", "1", ".", "1", ",", "2", ".", "3", ",", "2", ".", "6", ",", "3", ".", "7", ",", "3", ".", "1", ",", "3", ".", "2", "and", "4", ".", "5", ";", "and", "a", "good", "prognosis", "for", "the", "remaining", "teeth", ".", "6", ".", "Treatment", "plan", "6", ".", "1", "Systemic", "phase", "First", "of", "all", ",", "the", "patient", "was", "motivated", "to", "stop", "smoking", "and", "to", "monitor", "her", "hypertension", "in", "coordination", "with", "her", "general", "practitioner", ".", "6", ".", "2", "Periodontal", "hygiene", "phase", "Oral", "hygiene", "instructions", "were", "given", "and", "supragingival", "hygiene", "was", "performed", ".", "RAR", "of", "the", "four", "quadrants", "was", "performed", ",", "together", "with", "administration", "of", "Metronidazole", "500", "mg", "every", "8", "hours", "for", "seven", "days", "starting", "after", "the", "last", "RAR", "session", ".", "In", "addition", ",", "0", ".", "12", "%", "chlorhexidine", "rinses", "were", "recommended", "for", "15", "days", ".", "Selective", "occlusal", "adjustments", "were", "carried", "out", "and", "an", "upper", "discharge", "splint", "was", "provided", ".", "Root", "canal", "treatment", "was", "performed", "on", "tooth", "1", ".", "4", ".", "6", ".", "3", "Revaluation", "At", "periodontal", "revaluation", "a", "PI", "of", "27", "%", "and", "an", "IS", "of", "16", "%", "was", "recorded", ".", "A", "reduction", "in", "PS", "was", "obtained", "across", "the", "board", ",", "with", "residual", "periodontal", "pockets", "of", "4", "to", "11", "mm", "still", "present", ".", "The", "patient", "was", "re-instructed", "in", "oral", "hygiene", "habits", ".", "Another", "RAR", "session", "was", "performed", "before", "starting", "the", "surgical", "phase", ".", "6", ".", "4", "Periodontal", "surgical", "phase", "The", "planning", "of", "the", "surgical", "phase", "was", ":", "-", "Periodontal", "regeneration", "of", "1", ".", "4", ",", "1", ".", "3", ",", "1", ".", "2", ",", "1", ".", "1", "and", "extraction", "of", "1", ".", "7", ".", "-", "Extraction", "of", "4", ".", "8", ".", "-", "Guided", "tissue", "regeneration", "in", "2", ".", "3", "and", "2", ".", "4", "and", "alveolar", "preservation", "in", "2", ".", "5", ".", "The", "periodontogram", "of", "the", "2nd", "and", "3rd", "sextants", "shows", "pockets", "of", "4", "to", "8", "mm", ".", "Papilla", "and", "intrasulcular", "preservation", "incisions", "were", "made", "vestibular", "and", "palatal", "from", "1", ".", "1", "to", "2", ".", "6", "and", "distal", "rectangular", "to", "distal", "wedge", "of", "2", ".", "6", ".", "A", "full", "thickness", "flap", "was", "raised", "and", "tooth", "2", ".", "5", "was", "extracted", ",", "removing", "all", "granulation", "tissue", "in", "the", "area", ".", "The", "socket", "was", "filled", "with", "mineralised", "allograft", "and", "a", "collagen", "membrane", "was", "placed", ".", "Subsequently", ",", "the", "infraosseous", "defects", "were", "filled", "with", "enamel", "matrix-derived", "proteins", "in", "combination", "with", "a", "mineralised", "allograft", ".", "Sutures", "were", "made", "with", "polytetrafluoroethylene", "using", "an", "internal", "vertical", "mattress", "and", "single", "stitches", ".", "-", "Periodontal", "regeneration", "in", "3", ".", "1", "and", "3", ".", "2", ".", "The", "teeth", "were", "splinted", "lingually", ".", "The", "periodontogram", "of", "the", "5th", "sextant", "shows", "periodontal", "pockets", "of", "4", "to", "12", "mm", ".", "The", "initial", "surgical", "approach", "consisted", "of", "a", "modified", "papilla", "preservation", ",", "a", "full", "thickness", "vestibular", "and", "lingual", "flap", "detachment", "and", "removal", "of", "granulation", "tissue", "(", "Figure", "9", ")", ".", "The", "infrabony", "defects", "were", "filled", "with", "a", "combination", "of", "enamel", "matrix-derived", "proteins", "(", "Emdogain", "®", ")", "and", "a", "mineralised", "allograft", ".", "Sutures", "were", "made", "with", "6", "/", "0", "polypropylene", "with", "modified", "internal", "vertical", "mattress", "pads", "and", "single", "stitches", ".", "6", ".", "5", "Revaluation", "(", "II", ")", "At", "6", "months", "after", "the", "last", "periodontal", "regeneration", "surgery", "a", "complete", "periodontogram", "was", "performed", ",", "showing", "stability", "and", "clinical", "improvement", "of", "the", "periodontal", "tissues", ".", "In", "each", "of", "the", "regenerative", "surgeries", ",", "a", "reduction", "in", "PS", "was", "observed", "at", "the", "expense", "of", "a", "remarkable", "attachment", "gain", ",", "as", "well", "as", "a", "remarkable", "radiographic", "bone", "filling", ".", "6", ".", "6", "Rehabilitation", "phase", "The", "patient", "was", "rehabilitated", "by", "the", "placement", "of", "dental", "implants", "in", "positions", "2", ".", "5", ",", "3", ".", "6", ",", "4", ".", "5", "y", "4", ".", "6", ".", "7", ".", "Maintenance", "The", "periodontal", "risk", "assessment", "of", "the", "patient", "indicated", "a", "high", "risk", ",", "advising", "an", "interval", "of", "maintenance", "visits", "every", "3", "months", ".", "At", "two", "years", "follow-up", ",", "together", "with", "regular", "maintenance", ",", "clinical", "and", "radiographic", "stability", "of", "the", "patient", "'", "s", "periodontal", "status", "can", "be", "observed", "." ]

[ 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Patient", "label": "HUMAN", "start": 3, "end": 10 }, { "text": "female patient", "label": "HUMAN", "start": 35, "end": 49 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 508, "end": 514 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 42, "end": 49 }, { "text": "T. forsythia", "label": "SPECIES", "start": 1009, "end": 1021 }, { "text": "F. nucleatum", "label": "SPECIES", "start": 1023, "end": 1035 }, { "text": "P. gingivalis", "label": "SPECIES", "start": 1037, "end": 1050 }, { "text": "T. denticola", "label": "SPECIES", "start": 1055, "end": 1067 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1665, "end": 1672 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1738, "end": 1745 }, { "text": "bacterial biofilm", "label": "SPECIES", "start": 1959, "end": 1976 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1948, "end": 1955 }, { "text": "general practitioner", "label": "HUMAN", "start": 2670, "end": 2690 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2575, "end": 2582 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3377, "end": 3384 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5354, "end": 5361 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5505, "end": 5512 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5697, "end": 5704 } ]

[ "A", "64", "year", "old", "man", "was", "transferred", "to", "the", "Internal", "Medicine", "Department", "from", "the", "Cardiology", "Department", "due", "to", "a", "fever", "of", "over", "38", ".", "3", "°", "C", ",", "of", "more", "than", "3", "weeks", "'", "evolution", "with", "no", "source", "of", "origin", "after", "5", "weeks", "of", "studies", ".", "On", "admission", ",", "the", "patient", "was", "being", "treated", "with", "gliclazide", "(", "1-1-1", ")", "and", "acarbose", "(", "1-1-1", ")", "to", "control", "type", "2", "diabetes", "mellitus", ",", "Atorvastatin", "(", "0-0-20", "mg", ")", "to", "control", "hypercholesterolemia", ",", "quinapril", "(", "5", "mg-0-5", "mg", ")", "to", "control", "arterial", "hypertension", "and", ",", "finally", ",", "acetylsalicylic", "acid", "(", "0-150", "mg-0", ")", "for", "vascular", "accident", "prophylaxis", ".", "In", "addition", "to", "these", "pathologies", ",", "the", "patient", "had", "severe", "aortic", "valve", "stenosis", "together", "with", "moderate", "aortic", "insufficiency", ",", "which", "required", "valve", "replacement", "with", "Mitroflow", "bioprosthesis", "no", ".", "23", "in", "March", "of", "the", "year", "of", "admission", ".", "When", "the", "patient", "was", "admitted", "to", "the", "Cardiology", "Department", ",", "a", "five-week", "febrile", "condition", "was", "detected", "in", "a", "patient", "with", "a", "prosthetic", "valve", ";", "a", "transesophageal", "echocardiography", "ruled", "out", "the", "presence", "of", "endocarditis", "or", "functional", "valvular", "alterations", ",", "and", "empirical", "intravenous", "treatment", "with", "Vancomycin", "was", "started", "(", "given", "the", "existence", "of", "a", "prosthetic", "valve", "despite", "not", "clearly", "demonstrating", "vegetation", ")", ",", "improving", "until", "the", "patient", "was", "asymptomatic", "and", "afebrile", "on", "discharge", "from", "Cardiology", "a", "week", "later", ".", "During", "discharge", ",", "the", "patient", "underwent", "periodic", "body", "temperature", "checks", ",", "and", "4", "weeks", "later", "a", "new", "elevation", "was", "detected", ",", "which", "led", "him", "to", "our", "hospital", "and", "he", "was", "admitted", "for", "the", "second", "time", "to", "the", "Cardiology", "Department", ",", "where", "endocarditis", "was", "again", "ruled", "out", "by", "transesophageal", "echocardiography", ",", "and", "he", "was", "transferred", "to", "the", "Internal", "Medicine", "Department", ",", "with", "a", "diagnosis", "of", "Classical", "fever", "of", "unknown", "origin", "to", "be", "studied", ".", "After", "admission", ",", "fever", "of", "over", "38", ".", "3", "°", "C", ",", "with", "peaks", "of", "up", "to", "39", "°", "C", ",", "blood", "pressure", "of", "150", "/", "70", "mm", "of", "mercury", ",", "and", "a", "heart", "rate", "of", "104", "beats", "per", "minute", "were", "confirmed", ".", "On", "physical", "examination", "the", "patient", "was", "normal", "colour", "and", "normal", "depth", ",", "cardiac", "auscultation", "showed", "no", "murmurs", ",", "pulmonary", "auscultation", "showed", "preserved", "vesicular", "murmur", "with", "no", "evidence", "of", "rhonchi", ",", "crackles", "or", "wheezing", ";", "the", "abdomen", "was", "not", "painful", "and", "there", "was", "no", "evidence", "of", "splenomegaly", ";", "ENT", "examination", "showed", "no", "evidence", "of", "infectious", "foci", ";", "neurological", "examination", "showed", "no", "evidence", "of", "meningismus", ",", "strength", "or", "sensitivity", "deficit", ",", "or", "alteration", "of", "cranial", "nerves", "or", "osteotendinous", "reflexes", ";", "the", "examination", "also", "showed", "no", "evidence", "of", "lymphadenopathy", ".", "Complementary", "tests", "were", "performed", "for", "the", "study", "of", "fever", "of", "unknown", "origin", "according", "to", "protocol7", "with", "a", "haemogram", "showing", "14", ",", "000", "leukocytes", "(", "70", "%", "neutrophils", "and", "5", "%", "cayates", ")", "and", "1371", "g", "/", "dl", "haemoglobin", ".", "Biochemistry", "showed", "normal", "renal", "and", "hepatic", "function", "with", "normal", "glycaemia", ".", "A", "peripheral", "blood", "smear", "was", "performed", "which", "confirmed", "the", "haemogram", "data", "with", "no", "other", "pathological", "findings", ".", "Chest", "X-ray", "showed", "no", "pathological", "findings", "or", "changes", "with", "respect", "to", "previous", "admissions", ".", "A", "paranasal", "sinus", "X-ray", "showed", "hypoplasia", "of", "the", "left", "frontal", "sinus", ".", "The", "transesophageal", "echocardiogram", "showed", "no", "evidence", "of", "endocarditis", ",", "abscesses", "or", "fistulas", ",", "together", "with", "a", "normofunctioning", "aortic", "prosthesis", ".", "Subsequently", ",", "a", "Ga67", "scintigraphy", "was", "performed", ",", "with", "no", "tracer", "deposits", "in", "the", "thoracoabdominal", "region", ".", "To", "complete", "the", "study", "of", "fever", "of", "unknown", "origin", ",", "tumour", "markers", "(", "alpha-fetoprotein", ",", "CEA-II", ",", "Ca", "19", ".", "9n", "Ca", "125II", ",", "BR", "27", ".", "29", ",", "total", "PSA", ",", "Ca", "15", ".", "3", ",", "specific", "neutrophil", "enolase", ",", "Ca", "72", ".", "4", ")", "which", "were", "normal", "and", "the", "study", "of", "immunological", "markers", "(", "ENA", "antinuclear", "antibodies", ",", "rheumatoid", "factor", ",", "C-reactive", "protein", ",", "ASLO", ",", "anti-DNA", "antibodies", ",", "ANCA", ",", "anticardiolipin", "antibodies", ",", "anti-smooth", "muscle", "antibodies", ",", "antimitochondrial", "antibodies", ",", "ANA", "and", "LKM", ")", "which", "were", "negative", ".", "On", "admission", ",", "blood", "cultures", "were", "taken", "after", "taking", "body", "temperature", "above", "37", ".", "5", "°", "C", ",", "and", "all", "four", "were", "positive", "for", "Leuconostoc", "spp", ".", "and", "the", "antibiogram", "showed", "sensitivity", "to", "amoxicillin-clavulanic", "acid", "and", "tobramycin", ",", "antibiotherapy", "that", "was", "started", "from", "that", "moment", "onwards", ".", "Due", "to", "the", "existence", "of", "the", "bioprosthesis", ",", "the", "patient", "was", "treated", "for", "8", "weeks", "as", "if", "it", "were", "endocarditis", ",", "despite", "there", "being", "no", "evident", "lesions", "on", "transesophageal", "echocardiography", ".", "Periodic", "check-ups", "were", "carried", "out", "for", "1", "year", "after", "discharge", "without", "any", "febrile", "or", "clinical", "findings", "that", "would", "lead", "to", "any", "new", "suspicion", "of", "complications", "or", "valve", "complications", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 233, "end": 240 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 577, "end": 584 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 776, "end": 783 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 875, "end": 882 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1192, "end": 1199 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1295, "end": 1302 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1890, "end": 1897 }, { "text": "Leuconostoc spp", "label": "SPECIES", "start": 3801, "end": 3816 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4009, "end": 4016 } ]

[ "", "The", "patient", "is", "a", "6-month-old", "girl", ",", "born", "at", "term", ",", "previously", "healthy", "and", "with", "a", "complete", "vaccination", "schedule", ",", "who", "was", "brought", "to", "the", "paediatric", "emergency", "department", "with", "fever", ",", "dizziness", "and", "refusal", "of", "breastfeeding", "of", "one", "day", "'", "s", "duration", ".", "She", "had", "no", "cough", ",", "congestion", "or", "rhinorrhoea", ".", "Examination", "showed", "a", "girl", "with", "dizziness", ",", "a", "temperature", "of", "38", ".", "8", "°", "C", "and", "no", "focal", "signs", "of", "infection", ".", "Laboratory", "tests", "included", "a", "rapid", "influenza", "smear", "and", "a", "catheter-based", "urinalysis", ";", "all", "results", "were", "negative", ".", "He", "was", "diagnosed", "with", "a", "viral", "infection", ".", "On", "day", "2", "of", "fever", ",", "he", "presented", "with", "a", "rash", "with", "erythematous", "patches", ",", "apparently", "non-pruritic", ".", "He", "returned", "to", "the", "emergency", "department", "on", "day", "4", "of", "fever", "with", "persistent", "exanthema", ".", "Although", "he", "still", "had", "no", "cough", ",", "he", "appeared", "to", "have", "mild", "congestion", ".", "Vital", "signs", "were", ":", "temperature", "38", ".", "3", "°", "C", ",", "sinus", "tachycardia", "(", "200", "bpm", ")", "and", "tachypnoea", "with", "an", "oxygen", "saturation", "of", "100", "%", ".", "Examination", "revealed", "irritability", ",", "conjunctivitis", "without", "limbal", "involvement", "and", "dry", ",", "cracked", "lips", ".", "There", "was", "no", "lymphadenopathy", "and", "the", "extremities", "were", "normal", ".", "There", "was", "mild", "subcostal", "retraction", ",", "but", "respiratory", "sounds", "were", "normal", ".", "Laboratory", "tests", "revealed", "leukocytosis", "with", "left", "shift", ",", "normocytic", "anaemia", ",", "normal", "thrombocytes", ",", "clearly", "elevated", "C-reactive", "protein", "(", "13", ".", "3", "mg", "/", "dL", ")", "and", "erythrocyte", "sedimentation", "rate", "118", "mm", "/", "h", ".", "He", "had", "hyponatraemia", "(", "sodium", "133", "mEq", "/", "L", ")", "and", "hypoalbuminaemia", "(", "albumin", "2", ".", "8", "g", "/", "dL", ")", ",", "with", "all", "other", "values", "normal", ",", "including", "liver", "function", "tests", ".", "Respiratory", "pathogen", "testing", "by", "RT-PCR", "and", "blood", "cultures", "were", "negative", ".", "A", "chest", "X-ray", "showed", "a", "mild", "opacity", "in", "the", "left", "medial", "area", ".", "During", "this", "period", "of", "illness", "she", "had", "no", "contact", "with", "other", "sick", "people", ".", "His", "9-year-old", "brother", "had", "had", "upper", "respiratory", "tract", "respiratory", "symptoms", "3", "weeks", "earlier", ".", "The", "family", "had", "been", "self-confined", "because", "of", "the", "COVID-19", "pandemic", "for", "the", "previous", "week", ",", "not", "going", "out", "for", "school", "or", "work", ".", "There", "was", "no", "history", "of", "recent", "travel", ".", "The", "patient", "was", "referred", "for", "admission", "and", "evaluation", "for", "possible", "Kawasaki", ".", "Given", "her", "fever", ",", "possible", "mild", "congestion", "and", "radiological", "findings", ",", "she", "was", "transferred", "to", "the", "emergency", "department", "for", "COVID-19", "testing", "prior", "to", "admission", "to", "the", "paediatric", "ward", ".", "On", "admission", ",", "the", "patient", "had", "a", "5-day", "fever", ",", "conjunctivitis", "without", "limbal", "involvement", ",", "prominent", "taste", "buds", ",", "polymorphic", "pale", "maculopapular", "exanthema", "and", "swelling", "of", "the", "hands", "and", "lower", "extremities", ",", "manifestations", "consistent", "with", "classic", "Kawasaki", "disease", "criteria", ".", "He", "was", "treated", "with", "a", "single", "dose", "of", "2", "g", "/", "kg", "i", ".", "v", ".", "immunoglobulin", "and", "a", "high", "dose", "of", "acetylsalicylic", "acid", "(", "ASA", "20", "mg", "/", "kg", "four", "times", "daily", ")", "according", "to", "the", "treatment", "protocol", ".", "His", "last", "temperature", "just", "after", "completing", "the", "administration", "of", "IV", "IG", "was", "38", ".", "3", "°", "C", ".", "An", "echocardiogram", "was", "normal", ",", "with", "no", "evidence", "of", "coronary", "dilatation", "or", "aneurysm", "or", "pericardial", "effusion", ",", "and", "normal", "valvular", "and", "ventricular", "activity", ".", "The", "night", "before", "discharge", ",", "the", "RT-PCR", "test", "for", "COVID-19", "was", "positive", ",", "performed", "at", "the", "Stanford", "Clinical", "Virology", "Laboratory", ".", "The", "public", "health", "department", "was", "notified", "and", "the", "family", "was", "instructed", "to", "quarantine", "for", "14", "days", "from", "the", "date", "of", "the", "positive", "test", ".", "The", "patient", "was", "discharged", "on", "low-dose", "ASA", "(", "3", "mg", "/", "kg", "per", "day", ")", "and", "followed", "by", "the", "paediatric", "cardiology", "service", "for", "echocardiographic", "evaluation", "two", "weeks", "after", "discharge", ",", "scheduled", "after", "the", "mandatory", "14-day", "quarantine", "." ]

[ 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5, "end": 12 }, { "text": "sick", "label": "HUMAN", "start": 1664, "end": 1668 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 1774, "end": 1780 }, { "text": "girl", "label": "HUMAN", "start": 30, "end": 34 }, { "text": "girl", "label": "HUMAN", "start": 306, "end": 310 }, { "text": "Respiratory pathogen", "label": "SPECIES", "start": 1470, "end": 1490 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 518, "end": 523 }, { "text": "vaccination", "label": "SPECIES", "start": 89, "end": 100 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1938, "end": 1945 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2210, "end": 2217 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3133, "end": 3140 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 3045, "end": 3051 }, { "text": "Virology", "label": "SPECIES", "start": 2974, "end": 2982 } ]

[ "A", "55-year-old", "woman", ",", "with", "no", "past", "history", "of", "interest", ",", "presented", "in", "the", "last", "10", "days", "with", "maculo-papular", "exanthema", ",", "non-pruritic", ",", "associated", "with", "polyarthritis", ";", "5", "days", "later", "she", "began", "with", "fever", "up", "to", "39oC", ",", "occipital", "headache", "and", "cervicalgia", "associated", "with", "photophobia", ",", "myodesopsia", "and", "loss", "of", "visual", "acuity", ",", "starting", "with", "genital", "pain", "and", "odynophagia", "secondary", "to", "the", "appearance", "of", "aphthous", "lesions", "both", "at", "genital", "and", "oral", "level", ".", "The", "patient", "reported", "contact", "with", "a", "patient", "with", "chickenpox", ",", "although", "she", "reported", "having", "had", "the", "infection", "in", "adolescence", ".", "Examination", "revealed", "nuchal", "rigidity", "in", "the", "last", "degrees", "of", "flexion", ",", "and", "polyarthritis", "in", "the", "lower", "limbs", ",", "with", "the", "rest", "of", "the", "examination", "being", "unremarkable", ".", "He", "was", "admitted", "to", "Internal", "Medicine", "with", "suspicion", "of", "complicated", "chickenpox", ".", "The", "examination", "revealed", "nuchal", "rigidity", "in", "the", "last", "degrees", "of", "flexion", ",", "as", "well", "as", "polyarthritis", "in", "the", "lower", "limbs", ",", "with", "the", "rest", "of", "the", "examination", "being", "unremarkable", ".", "A", "lumbar", "puncture", "was", "performed", "which", "revealed", "acute", "lymphocytic", "meningitis", ",", "so", "a", "sample", "was", "sent", "to", "microbiology", ",", "requesting", "PCR", "for", "viruses", ",", "which", "were", "negative", ".", "In", "the", "analysis", ",", "serology", "was", "determined", "to", "be", "positive", "for", "CMV", "IgG", "and", "VVZ", "IgG", ",", "the", "rest", "being", "negative", ",", "as", "well", "as", "autoimmunity", ",", "with", "positive", "HLA", "B51", ".", "A", "genital", "biopsy", "was", "performed", "and", "reported", "as", "\"", "chronic", "and", "acute", "infectious", "infiltrate", "\"", ".", "On", "the", "other", "hand", ",", "the", "patient", "consulted", "an", "ophthalmologist", "who", "diagnosed", "anterior", "uveitis", ".", "In", "view", "of", "these", "findings", ",", "a", "differential", "diagnosis", "was", "made", "between", "2", "entities", ".", "Varicella", "infection", ":", "-", "In", "favour", ":", "Contact", "with", "chickenpox", ".", "Fever", ".", "-", "Against", ":", "Past", "chickenpox", "infection", ".", "Positive", "Ig", "G", "serology", ".", "Aseptic", "meningitis", ".", "Anterior", "uveitis", ".", "Non-pruritic", "papular", "lesions", ".", "Genital", "aphthosis", ".", "-", "Outbreak", "of", "Behçet", "'", "s", "disease", ":", "-", "In", "favour", ":", "oral", "and", "genital", "aphthous", "ulcers", ".", "Anterior", "uveitis", ".", "Aseptic", "meningitis", ".", "Papular", "skin", "lesions", ".", "HLA", "B51", "positive", ".", "-", "Against", ":", "More", "frequent", "between", "20-30", "years", "of", "age", ".", "The", "patient", "fulfilled", "the", "criteria", "for", "Behçet", "'", "s", "disease", "and", "was", "diagnosed", "with", "\"", "aseptic", "meningitis", "secondary", "to", "Neurobehçet", "'", "s", "\"", ",", "starting", "treatment", "with", "systemic", "steroids", ",", "with", "resolution", "of", "the", "symptoms", "." ]

[ 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 14, "end": 19 }, { "text": "adolescence", "label": "HUMAN", "start": 544, "end": 555 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 437, "end": 444 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 469, "end": 476 }, { "text": "CMV", "label": "SPECIES", "start": 1191, "end": 1194 }, { "text": "VVZ", "label": "SPECIES", "start": 1203, "end": 1206 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1398, "end": 1405 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1977, "end": 1984 } ]

[ "55-year-old", "patient", "with", "a", "history", "of", "type", "2", "diabetes", "mellitus", ",", "hypertension", "and", "dyslipidaemia", "under", "treatment", ",", "presented", "with", "progressive", "dyspnoea", "of", "several", "weeks", "'", "evolution", ",", "asthenia", ",", "hyporexia", "and", "unquantified", "weight", "loss", ".", "No", "clinical", "findings", "in", "the", "anamnesis", "by", "systems", ".", "Physical", "examination", ":", "mucocutaneous", "pallor", ",", "the", "rest", "of", "the", "patient", "was", "unremarkable", ".", "Complementary", "examinations", "revealed", "1", ".", "Iron", "deficiency", "anaemia", "(", "haemoglobin", "4", ".", "5", "g", "/", "dL", ",", "MCV", "59", "fL", ",", "MCH", "15", "pg", "/", "cell", ",", "iron", "10", "μg", "/", "dL", "and", "ferritin", "<", "10", "ng", "/", "mL", ")", ".", "De", "novo", "cardiomegaly", "on", "chest", "X-ray", ".", "Initially", "the", "study", "is", "extended", "with", ":", "-", "Gastro-Colonoscopy", ":", "Candida", "albicans", "infectious", "oesophagitis", "(", "microbiological", "confirmation", ")", "and", "internal", "haemorrhoids", ".", "-", "Transthoracic", "echocardiography", ":", "severe", "pericardial", "effusion", "with", "partial", "systolic", "collapse", "of", "the", "right", "atrium", ".", "Complete", "with", ":", "-", "Extensive", "serological", "study", ":", "Negative", "-", "Antinuclear", "antibodies", "(", "ANA", ")", "1", ".", "6", "(", "0", ".", "0-1", ".", "0", ")", ",", "other", "autoimmunity", "negative", ".", "-", "Pericardial", "fluid", "study", ":", "serohematic", "aspect", "compatible", "with", "exudate", ".", "Bacteriological", "study", ",", "including", "mycobacteria", ",", "and", "pathological", "anatomy", "negative", ".", "-", "Mantoux", "test", ":", "positive", ",", "with", "no", "evidence", "of", "mycobacterial", "infection", "(", "sputum", ",", "gastric", "juice", ",", "pericardial", "fluid", ")", ".", "-", "Thoracic-abdominal-pelvic", "CT", "scan", ":", "right", "cervical", "nodule", ",", "heterogeneous", ",", "with", "areas", "of", "high", "density", "suggesting", "hypervascular", "character", "and", "does", "not", "allow", "pheochromocytoma", "or", "glomus", "tumour", "to", "be", "ruled", "out", ".", "Calcified", "nodule", "in", "the", "right", "thyroid", "lobe", ".", "-", "Catecholamines", "in", "blood", "and", "urine", "24", "hours", ":", "Normal", ".", "-", "Bilateral", "mammography", ":", "No", "significant", "alterations", "-", "PET-CT", "scan", ":", "Right", "laterocervical", "adenopathic", "conglomerate", "with", "moderate", "increase", "in", "metabolism", ".", "She", "underwent", "exploratory", "cervicotomy", ",", "the", "intraoperative", "lymph", "node", "biopsy", "showed", "infiltration", "by", "papillary", "thyroid", "carcinoma", "of", "the", "follicular", "type", ",", "and", "total", "thyroidectomy", "was", "performed", "(", "multicentric", "papillary", "carcinoma", ")", "and", "central", "cervical", "emptying", "." ]

[ 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 12, "end": 19 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 338, "end": 345 }, { "text": "Candida albicans", "label": "SPECIES", "start": 615, "end": 631 }, { "text": "Bacteriological", "label": "SPECIES", "start": 1029, "end": 1044 }, { "text": "mycobacteria", "label": "SPECIES", "start": 1062, "end": 1074 } ]

[ "42-year-old", "woman", "with", "end-stage", "chronic", "kidney", "disease", ",", "secondary", "to", "lupus", "nephropathy", ",", "and", "on", "peritoneal", "dialysis", ".", "History", "of", "four", "episodes", "of", "bacterial", "peritonitis", "and", "change", "of", "Tenckhoff", "catheter", "six", "months", "prior", "to", "admission", "due", "to", "catheter", "dysfunction", ".", "She", "was", "admitted", "for", "abdominal", "pain", "(", "with", "insidious", "onset", ",", "colicky", ",", "predominantly", "epigastric", "and", "mild", "intensity", ")", "and", "peritoneal", "fluid", "examination", "showed", "3600", "leukocytes", "/", "mm3", "and", "80", "%", "polymorphonuclear", "cells", ".", "Antibiotics", "(", "ceftazidime", ",", "amikacin", "and", "vancomycin", ")", "were", "started", "and", "she", "was", "discharged", "with", "apparent", "improvement", ",", "but", "due", "to", "persistent", "symptoms", "she", "was", "readmitted", ".", "Three", "peritoneal", "fluid", "samples", "during", "her", "hospitalisation", "tested", "positive", "for", "Fusarium", "spp", ".", "The", "Tenckhoff", "catheter", "was", "removed", "and", "amphotericin", "B", "deoxycholate", "was", "started", "for", "three", "days", ",", "followed", "by", "voriconazole", ".", "The", "patient", "responded", "favourably", "and", "continued", "outpatient", "treatment", "with", "voriconazole", "(", "4mg", "/", "kg", "every", "12", "hours", "orally", ")", ".", "Microbiological", "isolation", "and", "initial", "identification", "were", "performed", "at", "the", "Microbiology", "Service", "of", "the", "Guillermo", "Almenara", "National", "Hospital", ".", "The", "isolates", "were", "then", "sent", "to", "the", "Clinical", "Mycology", "Laboratory", "of", "the", "Alexander", "von", "Humboldt", "Institute", "of", "Tropical", "Medicine", "(", "Universidad", "Peruana", "Cayetano", "Heredia", ")", "for", "molecular", "typing", "with", "amplification", "of", "the", "ITS1", "and", "ITS2", "regions", "of", "the", "ribosomal", "DNA", "and", "comparison", "of", "the", "sequences", "obtained", "with", "those", "of", "the", "GenBank", "or", "International", "Society", "for", "Human", "and", "Animal", "Mycology", "databases", ".", "All", "three", "isolates", "were", "identified", "as", "species", "of", "the", "Fusarium", "solani", "complex", ".", "In", "vitro", "susceptibility", "to", "itraconazole", ",", "voriconazole", "and", "posaconazole", ",", "according", "to", "Clinical", "and", "Laboratory", "Standards", "Institute", "-", "CLSI", "(", "M38-A", ")", "methodology", ",", "showed", "a", "minimum", "inhibitory", "concentration", "(", "MIC", ")", "in", "all", "three", "isolates", "and", "for", "all", "three", "antifungals", "of", ">", "16", "μg", "/", "mL", "." ]

[ 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 12, "end": 17 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 847, "end": 854 }, { "text": "Fusarium spp", "label": "SPECIES", "start": 708, "end": 720 }, { "text": "bacterial", "label": "SPECIES", "start": 145, "end": 154 }, { "text": "Animal", "label": "SPECIES", "start": 1463, "end": 1469 }, { "text": "Human", "label": "HUMAN", "start": 1453, "end": 1458 }, { "text": "Microbiological isolation", "label": "SPECIES", "start": 962, "end": 987 }, { "text": "antifungals", "label": "SPECIES", "start": 1813, "end": 1824 }, { "text": "Mycology", "label": "SPECIES", "start": 1147, "end": 1155 }, { "text": "Mycology", "label": "SPECIES", "start": 1470, "end": 1478 } ]

[ "Reason", "for", "consultation", ":", "46", "year", "old", "patient", "who", "consulted", "the", "emergency", "department", "for", "12", "hours", "of", "clinical", "evolution", "of", "behavioural", "disorder", ",", "disorientation", "and", "tendency", "to", "somnolence", ",", "24", "hours", "earlier", ",", "diagnosed", "as", "an", "outpatient", "with", "varicella", "(", "epidemiological", "antecedent", "of", "a", "daughter", "diagnosed", "10", "days", "earlier", ")", "and", "prescribed", "symptomatic", "treatment", ".", "Pathological", "history", ":", "High", "blood", "pressure", "treated", "with", "amlodipine", ",", "cognitively", "preserved", ".", "Evolution", ":", "Patient", "admitted", "to", "the", "emergency", "department", "with", "a", "12-hour", "clinical", "picture", "of", "behavioural", "disorder", "without", "fever", ".", "Vitals", "within", "the", "normal", "range", ",", "but", "GCS", "of", "14", "(", "at", "the", "expense", "of", "no", "spontaneous", "ocular", "opening", ")", ".", "On", "physical", "examination", ",", "cardiorespiratory", "examination", "was", "normal", ";", "abdominal", "examination", "was", "unremarkable", ";", "neurological", "examination", "showed", "spatio-temporal", "disorientation", ",", "no", "meningismus", "and", "a", "tendency", "to", "somnolence", ",", "with", "isochoric", "and", "normoreactive", "pupils", ".", "The", "skin", "showed", "several", "lesions", "of", "varying", "degrees", "of", "evolution", "compatible", "with", "chickenpox", ";", "mucous", "membranes", "were", "preserved", ".", "An", "analytical", "control", "was", "requested", "which", "only", "showed", "PCR", "of", "10", "mg", "/", "L", ".", "A", "sample", "was", "collected", "for", "Tzanck", "staining", "(", "which", "was", "finally", "positive", "for", "VZV", ")", ".", "Chest", "X-ray", "was", "normal", ".", "A", "non-contrast", "cranial", "CT", "scan", "was", "performed", ",", "which", "showed", "no", "abnormalities", ",", "and", "finally", "the", "lumbar", "puncture", "showed", "26", "leukocytes", "/", "microlitre", ",", "with", "proteins", "of", "0", ".", "75", "g", "/", "L", "and", "normal", "glucose", ".", "The", "HIV", "test", "was", "negative", "and", "finally", "the", "CSF", "PCR", "for", "VZV", "was", "positive", ".", "He", "was", "initially", "treated", "in", "the", "emergency", "department", "with", "parenteral", "acyclovir", "adjusted", "to", "weight", ",", "with", "a", "spectacular", "improvement", "in", "sensorium", "12-14", "hours", "after", "starting", "treatment", ".", "He", "was", "admitted", "to", "the", "ward", "to", "complete", "treatment", ".", "Diagnosis", ":", "Cutaneous", "varicella", "zoster", "with", "dissemination", "to", "the", "CNS", "causing", "meningoencephalitis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 37, "end": 44 }, { "text": "daughter", "label": "HUMAN", "start": 280, "end": 288 }, { "text": "Patient", "label": "HUMAN", "start": 456, "end": 463 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 1418, "end": 1421 }, { "text": "VZV", "label": "SPECIES", "start": 1196, "end": 1199 }, { "text": "VZV", "label": "SPECIES", "start": 1468, "end": 1471 } ]

[ "Personal", "History", "39-year-old", "male", "ex-consumer", "of", "cocaine", ",", "alcohol", "and", "tobacco", ",", "ischaemic", "heart", "disease", ",", "cerebral", "vascular", "disease", ",", "aortic", "atheromatosis", ",", "monorenal", "(", "left", "renal", "atrophy", "due", "to", "renal", "infarctions", ")", ".", "Atrophic", "gastritis", ".", "Current", "Disease", "Sudden", "decrease", "of", "vision", "of", "48", "h", "of", "evolution", ".", "She", "does", "not", "distinguish", "faces", "or", "colours", ".", "No", "headache", ",", "no", "neurological", "focality", ".", "No", "fever", ".", "Physical", "examination", "Haemodynamically", "stable", ".", "Afebrile", ".", "Cardiopulmonary", "and", "abdominal", "examination", "normal", ".", "Neurological", ":", "VA", ":", "<", "0", ".", "05", ",", "ocular", "movements", "preserved", ",", "no", "facial", "asymmetry", ",", "no", "language", "alterations", ",", "mobility", "and", "sensitivity", "preserved", ".", "Complementary", "tests", "Fundus", ":", "exudative", "lifting", "of", "both", "maculae", ",", "with", "some", "haemorrhagic", "image", "and", "associated", "vitritis", ".", "OCT", ":", "bilateral", "exudative", "lifting", "of", "the", "neuroepithelium", "of", "both", "eyes", ".", "Blood", "tests", ":", "blood", "system", ",", "coagulation", ",", "biochemistry", "with", "normal", "renal", "and", "hepatic", "profile", ".", "TSH", "1", ".", "16", ".", "Autoimmunity", "study", ":", "ANCA", ",", "ANA", ",", "citrullinated", "peptide", ",", "cardiolipin", ",", "lupus", "anticoagulant", "and", "b2", "glycoprotein", "negative", ".", "Immunoglobulins", "normal", ".", "Lumbar", "puncture", ":", "normal", ".", "PCR", "TBC", "and", "herpes", "negative", ".", "Serology", ":", "Bartonella", "Henselae", ",", "Borrelia", ",", "LUES", ",", "Mycoplasma", ",", "Coxiella", "Burnetti", "IgM", ",", "Chlamydia", ",", "Rickettsia", ",", "Brucella", ",", "Toxoplasma", "IgM", ",", "VZV", "IgM", ",", "HBV", ",", "HCV", ",", "HIV", ",", "CMV", "IgM", "negative", ".", "Quantiferon", "positive", "with", "sputum", "culture", "and", "urine", "study", "negative", "for", "tuberculosis", ".", "Chest", "X-ray", "normal", ".", "Brain", "MRI", ":", "chronic", "ischaemic", "lesions", ".", "Diagnosis", "Bilateral", "panuveitis", ",", "the", "most", "probable", "etiology", "being", "Votg", "Koyanagi", "Harada", ".", "Evolution", "Patient", "with", "severe", "acute", "bilateral", "uveitis", ".", "He", "had", "severe", "comorbidities", "and", "laboratory", "data", "of", "latent", "tuberculosis", ",", "as", "well", "as", "retinal", "images", "suggestive", "of", "Vogtk-Koyanagi-Harada", ".", "Tuberculostatic", "treatment", "was", "started", "with", "4", "glucocorticoids", "in", "peribulbar", "injection", "(", "up", "to", "3", "injections", ")", ".", "On", "review", "after", "fundus", "treatment", ",", "there", "was", "a", "clear", "improvement", "with", "disappearance", "of", "exudative", "lifting", ",", "only", "in", "the", "left", "eye", "a", "small", "detached", "area", ",", "disappearance", "of", "haemorrhage", "." ]

[ 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Personal", "label": "HUMAN", "start": 0, "end": 8 }, { "text": "male", "label": "HUMAN", "start": 29, "end": 33 }, { "text": "tobacco", "label": "SPECIES", "start": 70, "end": 77 }, { "text": "Bartonella Henselae", "label": "SPECIES", "start": 1124, "end": 1143 }, { "text": "Borrelia", "label": "SPECIES", "start": 1145, "end": 1153 }, { "text": "Brucella", "label": "SPECIES", "start": 1219, "end": 1227 }, { "text": "CMV", "label": "SPECIES", "start": 1269, "end": 1272 }, { "text": "Chlamydia", "label": "SPECIES", "start": 1196, "end": 1205 }, { "text": "Coxiella Burnetti", "label": "SPECIES", "start": 1173, "end": 1190 }, { "text": "LUES", "label": "SPECIES", "start": 1155, "end": 1159 }, { "text": "Mycoplasma", "label": "SPECIES", "start": 1161, "end": 1171 }, { "text": "Rickettsia", "label": "SPECIES", "start": 1207, "end": 1217 }, { "text": "Toxoplasma", "label": "SPECIES", "start": 1229, "end": 1239 }, { "text": "HBV", "label": "SPECIES", "start": 1254, "end": 1257 }, { "text": "HCV", "label": "SPECIES", "start": 1259, "end": 1262 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 1264, "end": 1267 }, { "text": "VZV", "label": "SPECIES", "start": 1245, "end": 1248 }, { "text": "Patient", "label": "HUMAN", "start": 1528, "end": 1535 }, { "text": "Tuberculostatic", "label": "SPECIES", "start": 1708, "end": 1723 } ]

[ "A", "63-year-old", "man", "came", "to", "the", "hospital", "with", "a", "brownish", "cough", "of", "6", "months", "'", "duration", ",", "which", "had", "become", "haemoptotic", "in", "the", "last", "three", "weeks", ".", "His", "medical", "history", "included", "ex-smoker", "(", "40", "packs", "/", "year", ")", ",", "alcoholism", "of", "60", "g", "/", "day", ":", "hemp", "worker", "for", "15", "years", ":", "he", "fulfilled", "the", "criteria", "for", "chronic", "bronchitis", "with", "20", "years", "of", "evolution", ";", "arterial", "hypertension", "with", "2", "years", "of", "evolution", ",", "treated", "with", "alpha-methyl", "dopa", ".", "He", "has", "a", "dog", "and", "a", "cat", "at", "home", ",", "which", "he", "takes", "care", "of", "himself", ".", "His", "illness", "started", "about", "6", "months", "earlier", ",", "with", "an", "increase", "in", "his", "basal", "cough", "accompanied", "by", "brownish", "expectoration", "and", "increased", "dyspnoea", ",", "and", "he", "also", "reported", "occasional", "afternoon", "febrile", "fever", ".", "No", "chest", "pain", ",", "haemoptysis", ",", "anorexia", "or", "weight", "loss", ".", "He", "had", "been", "treated", "with", "various", "antibiotics", "without", "improvement", ".", "Three", "weeks", "before", "admission", ",", "his", "expectoration", "became", "haemoptotic", ",", "prompting", "him", "to", "consult", "the", "hospital", ".", "Physical", "examination", "on", "admission", "showed", "a", "patient", "in", "good", "general", "condition", ",", "without", "fever", ",", "and", "pulmonary", "auscultation", "showed", "bilateral", "inspiratory", "crackles", ".", "Blood", "tests", "showed", "7", ",", "400", "leukocytes", "with", "normal", "formula", ".", "Baseline", "arterial", "blood", "gas", "showed", "a", "pH", "of", "7", ".", "37", ",", "a", "pCO2", "of", "47", "and", "a", "p02", "of", "61", "mmHg", ".", "Urine", "sediment", "was", "normal", ".", "Chest", "X-ray", "showed", "a", "bilateral", "interstitial", "pattern", "with", "areas", "of", "alveolar", "confluence", "in", "the", "left", "lower", "lobe", ".", "Mantoux", "with", "5", "UT", "was", "positive", "at", "15", "mm", "at", "48", "hours", ".", "Serial", "sputum", "smears", "were", "negative", ",", "as", "were", "Lowenstein", "cultures", ".", "Sputum", "gram", "on", "admission", "was", "reported", "as", "mixed", "flora", ",", "although", "it", "met", "the", "characteristics", "for", "culture", ".", "On", "admission", ",", "antibiotic", "treatment", "was", "started", "with", "erythromycin", "at", "a", "dose", "of", "500", "mg", "/", "6", "hours", "orally", ",", "together", "with", "bronchodilators", "and", "oxygen", ".", "As", "there", "was", "no", "clinical", "or", "radiological", "improvement", "after", "72", "hours", ",", "it", "was", "decided", "to", "perform", "bronchoscopy", "and", "LBA", ".", "Bronchoscopy", "showed", "a", "bilateral", "inflammatory", "process", "predominantly", "in", "the", "left", "base", "with", "no", "endobronchial", "lesions", "or", "haematic", "debris", ";", "the", "LBA", "recovered", "a", "yellowish", "liquid", "with", "84", "%", "neutrophils", "and", "the", "lymphocyte", "populations", "in", "the", "LBA", "showed", ":", "CD40", ".", "1", "%", ",", "CD8", "58", ".", "4", "%", "with", "a", "CD4", "/", "CD8", "ratio", "of", "0", ".", "002", ".", "Pasteurella", "multocida", "grew", "in", "pure", "culture", "in", "the", "cultures", "of", "the", "three", "portions", "of", "the", "ABL", ".", "A", "lung", "scan", "with", "gallium", "67", "was", "also", "performed", "and", "showed", "no", "uptake", ".", "In", "view", "of", "the", "patient", "'", "s", "antibiogram", ",", "treatment", "was", "continued", "with", "amoxicillin", "with", "good", "clinical", "evolution", "and", "complete", "radiological", "resolution", "by", "the", "fifth", "month", "after", "discharge", ".", "In", "order", "to", "rule", "out", "bronchiectasis", ",", "a", "thoracic", "computerised", "tomography", "(", "CT", ")", "scan", "was", "performed", "which", "confirmed", "the", "existence", "of", "bilateral", "bronchiectasis", "in", "the", "lower", "lobes", ",", "as", "well", "as", "residual", "fibrotic", "lesions", "in", "both", "vertexes", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "mixed flora", "label": "SPECIES", "start": 1487, "end": 1498 }, { "text": "cat", "label": "SPECIES", "start": 421, "end": 424 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 934, "end": 941 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2281, "end": 2288 }, { "text": "dog", "label": "SPECIES", "start": 411, "end": 414 }, { "text": "hemp worker", "label": "HUMAN", "start": 218, "end": 229 }, { "text": "hemp", "label": "SPECIES", "start": 218, "end": 222 }, { "text": "Pasteurella multocida", "label": "SPECIES", "start": 2104, "end": 2125 } ]

[ "A", "43-year-old", "man", ",", "with", "no", "clinical", "history", "of", "interest", ",", "who", "2", "months", "prior", "to", "his", "diagnosis", "had", "a", "subacute", "onset", "of", "a", "peak", "fever", "of", "39", "°", "C", ",", "predominantly", "in", "the", "evening", ",", "and", "pain", ",", "swelling", "and", "functional", "impotence", "in", "the", "right", "hand", "and", "left", "ankle", ".", "Physical", "examination", "revealed", "pain", "on", "palpation", "and", "inflammatory", "signs", "at", "the", "level", "of", "the", "carpus", ",", "second", ",", "third", ",", "fourth", "and", "fifth", "right", "metacarpophalangeal", "joints", "and", "left", "ankle", "with", "painful", "limitation", "of", "mobility", "in", "the", "first", "degrees", "in", "all", "arcs", "of", "movement", ",", "as", "well", "as", "auscultation", "of", "a", "diastolic", "murmur", "in", "the", "aortic", "focus", ".", "The", "rest", "of", "the", "examination", "was", "normal", ".", "Laboratory", "tests", "showed", ":", "leukocytosis", "(", "16", ",", "000", ")", "with", "neutrophilia", "(", "85", "%", ")", ";", "ESR", ",", "52", "mm", "/", "h", ",", "and", "CRP", ",", "4", ".", "6", "mg", "/", "dl", ".", "Haemostasis", "and", "biochemistry", "were", "normal", ".", "In", "the", "immunological", "study", ",", "rheumatoid", "factor", ",", "antinuclear", "antibodies", ",", "anti-DNA", "antibodies", ",", "immunoglobulins", "and", "complement", "were", "negative", ",", "as", "were", "serology", "for", "viruses", "and", "bacteria", ".", "Blood", "cultures", "were", "performed", "after", "the", "first", "febrile", "peak", "and", "before", "initiation", "of", "antibiotic", "therapy", "and", "were", "positive", "for", "Enterococcus", "faecalis", ".", "Chest", "X-ray", "showed", "a", "discrete", "bilateral", "pleural", "effusion", "and", "echocardiography", "showed", "severe", "aortic", "insufficiency", "with", "thickening", "of", "the", "valvular", "leaflets", ".", "With", "the", "diagnosis", "of", "bacterial", "endocarditis", "due", "to", "E", ".", "faecalis", ",", "intravenous", "antibiotherapy", "with", "ampicillin", "and", "gentamicin", "was", "started", ",", "with", "progressive", "improvement", "of", "joint", "symptoms", "and", "fever", "and", "imaging", "findings", ",", "until", "the", "patient", "became", "asymptomatic", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Enterococcus faecalis", "label": "SPECIES", "start": 1069, "end": 1090 }, { "text": "bacterial", "label": "SPECIES", "start": 1269, "end": 1278 }, { "text": "bacteria", "label": "SPECIES", "start": 934, "end": 942 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1472, "end": 1479 }, { "text": "E. faecalis", "label": "SPECIES", "start": 1299, "end": 1310 } ]

[ "We", "present", "the", "case", "of", "a", "51-year-old", "male", "with", "no", "medical", "history", "of", "interest", "who", "came", "to", "the", "emergency", "department", "with", "a", "dry", "cough", "and", "dyspnoea", "on", "moderate", "exertion", "of", "7", "days", "'", "duration", ".", "On", "physical", "examination", "the", "patient", "was", "eupneic", ",", "afebrile", "and", "pulmonary", "auscultation", "was", "normal", ".", "Chest", "X-ray", "showed", "peripheral", "and", "bilateral", "pulmonary", "opacities", ",", "predominantly", "in", "the", "lower", "lobes", ",", "which", ",", "in", "the", "epidemiological", "context", "in", "Spain", "in", "March", "2020", ",", "was", "compatible", "with", "COVID-19", ".", "The", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "PCR", ")", "test", "for", "SARS-CoV-2", "coronavirus", "was", "positive", ".", "He", "was", "treated", "with", "hydroxychloroquine", "for", "5", "days", "and", "lopinavir", "/", "ritonavir", "for", "10", "days", ".", "He", "remained", "in", "hospital", "for", "15", "days", "until", "clinical", "improvement", ",", "with", "negative", "PCR", "for", "SARS-CoV-2", "coronavirus", ".", "Two", "days", "after", "discharge", ",", "he", "presented", "with", "an", "abrupt", "onset", "of", "an", "erythematous", "maculopapular", "rash", "on", "the", "trunk", "with", "islets", "of", "healthy", ",", "slightly", "pruritic", "skin", ".", "Topical", "betamethasone", "dipropionate", "and", "20mg", "of", "oral", "bilastin", "were", "prescribed", ",", "but", "after", "24h", "the", "lesions", "spread", "to", "the", "cervical", "region", ",", "face", "and", "proximal", "region", "of", "the", "upper", "limbs", ",", "so", "30", "mg", "of", "oral", "prednisone", "was", "added", ".", "The", "clinical", "response", "was", "favourable", ",", "with", "disappearance", "of", "the", "lesions", "in", "a", "few", "days", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 215, "end": 222 }, { "text": "male", "label": "HUMAN", "start": 37, "end": 41 } ]

[ "A", "48-year-old", "patient", ",", "resident", "of", "Zamora", ",", "with", "a", "history", "of", "monocytic", "ascites", "of", "unidentified", "aetiology", "despite", "two", "exploratory", "laparoscopies", ",", "with", "peritoneal", "sampling", "reported", "as", "reactive", "mesothelial", "hyperplasia", ".", "In", "one", "of", "the", "multiple", "evacuating", "paracentesis", ",", "ADA", "(", "adenosine", "deaminase", ")", "was", "found", "positive", "in", "the", "ascitic", "fluid", ".", "The", "Mantoux", "test", "was", "also", "positive", "and", "anti-tuberculosis", "treatment", "was", "started", ".", "Months", "later", ",", "haematology", "follow-up", "was", "started", "due", "to", "severe", "thrombopenia", ".", "A", "bone", "marrow", "biopsy", "was", "performed", ",", "compatible", "with", "ITP", ".", "Despite", "treatment", ",", "the", "patient", "continued", "with", "plateletopenia", ",", "presenting", "epistaxis", "that", "did", "not", "cease", "after", "tamponade", ",", "and", "urgent", "splenectomy", "was", "indicated", ".", "On", "admission", ",", "a", "biopsy", "of", "the", "peritoneum", "and", "a", "palpable", "axillary", "lymph", "node", "was", "obtained", ",", "showing", "intense", "peritoneal", "mesothelial", "hyperplasia", "associated", "with", "intense", "and", "diffuse", "reactive", "lymphoid", "follicular", "hyperplasia", ".", "The", "patient", "was", "readmitted", "for", "acute", "bilateral", "PTE", "and", "left", "humeral", "DVT", ",", "so", "LMWH", "was", "started", "at", "therapeutic", "doses", ".", "The", "case", "was", "referred", "to", "Hospital", "La", "Paz", "in", "Madrid", "for", "further", "investigation", ".", "She", "reported", "fever", ",", "evening", "sweating", ",", "intense", "asthenia", "with", "arthromyalgia", ",", "left", "basal", "pleuritic", "pain", "with", "dyspnoea", "and", "frequent", "dry", "cough", ".", "During", "his", "admission", ",", "paracentesis", "was", "performed", "to", "diagnose", "dense", ",", "yellowish", "liquid", ",", "with", "the", "same", "biochemical", "profile", "as", "that", "analysed", "in", "Zamora", ",", "and", "the", "culture", "was", "sterile", "and", "B", ".", "A", ".", "A", ".", "R", ".", "negative", ".", "Chest", "CT", "angiography", "showed", "repletion", "defects", "related", "to", "acute", "pulmonary", "thromboembolism", ".", "Massive", "left", "pleural", "effusion", "with", "compressive", "atelectasis", "of", "LII", ",", "pathological", "mediastinal", "adenopathies", "of", "prevascular", "location", ".", "The", "lymph", "node", "sample", "obtained", "in", "Zamora", "was", "reviewed", "and", "reported", "as", "a", "castlemanoid", "process", ",", "with", "reactive", "mesothelial", "hyperplasia", ",", "with", "no", "evidence", "of", "malignancy", ".", "The", "cytokine", "profile", ",", "with", "high", "levels", "of", "IL-6", ",", "supports", "the", "diagnosis", "of", "Castelman", "'", "s", "disease", "(", "MCD", ")", ";", "and", "although", "serology", "for", "VHV8", "and", "IHV", "was", "negative", ",", "serology", "for", "VHV6", "was", "positive", "(", "1", "/", "640", ")", ".", "After", "starting", "steroids", ",", "immunoglobulins", "and", "Rituximab", ",", "he", "showed", "clinical", ",", "analytical", "and", "radiological", "improvement", ".", "She", "was", "readmitted", "a", "few", "months", "later", "for", "acute", "obstructive", "thrombosis", "of", "the", "right", "jugular", "vein", "and", "partial", "obstruction", "of", "the", "right", "subclavian", "vein", ".", "In", "view", "of", "the", "progression", "of", "the", "disease", "with", "Rituximab", ",", "treatment", "was", "started", "with", "Tocilizumab", "on", "a", "fortnightly", "basis", "associated", "with", "corticotherapy", "." ]

[ 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 14, "end": 21 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 566, "end": 573 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 923, "end": 930 }, { "text": "B.A.A.R", "label": "SPECIES", "start": 1431, "end": 1438 } ]

[ "A", "77-year-old", "patient", "attended", "the", "emergency", "department", "5", "days", "ago", "with", "a", "rice", "grain-shaped", "skin", "lesion", "on", "the", "left", "forearm", ",", "afebrile", ".", "Personal", "history", "of", "hypertension", ",", "hyperuricaemia", ",", "low", "back", "pain", ",", "obstructive", "sleep", "apnoea", ",", "acute", "confusional", "syndrome", "2o", "to", "severe", "hyponatraemia", "resolved", ".", "In", "the", "anamnesis", "the", "patient", "refers", "that", "a", "pruritic", "millimetric", "papular", "lesion", "of", "the", "same", "characteristics", "appeared", "on", "the", "scrotum", "1", "year", "ago", ".", "Examination", "and", "complementary", "tests", ":", "on", "the", "external", "surface", "of", "the", "left", "forearm", "there", "was", "an", "ulcerated", "lesion", "measuring", "3", ".", "5-4", "cm", "in", "maximum", "diameter", ",", "with", "poorly", "defined", "borders", ",", "mameloned", ",", "friable", ",", "easily", "bleeding", ",", "with", "no", "purulent", "exudate", ".", "Tumefactive", "periphery", "with", "no", "evidence", "of", "associated", "lymphangitis", ".", "No", "palpable", "associated", "lymphadenopathy", ".", "Laboratory", "tests", ":", "normocytic-hypochromic", "anaemia", "with", "neutrophilia", "(", "71", "%", ")", "with", "CRP", "3", ".", "23", ",", "negative", "Epstein-Barr", "serology", ",", "negative", "cytomegalovirus", "serology", ",", "negative", "LUES", "serology", "(", "0", ".", "21", ")", ",", "negative", "toxoplasma", "AIAIgM", "serology", "(", "0", ".", "30", ")", ".", "Ulcer", "exudate", "1st", "sample", ":", "Staphylococcus", "aureus", ".", "Ulcer", "exudate", "2nd", "sample", ":", "no", "bacterial", "growth", ",", "negative", "fungi", ",", "no", "BAAR", "observed", ".", "Biopsy", ":", "skin", "(", "dorsum", "of", "left", "forearm", "/", "b", ".", "punch", ")", ":", "Skin", "sample", "showing", "an", "epidermis", "with", "a", "crust", "consisting", "of", "fibrin", ",", "inflammatory", "cells", "and", "cellular", "debris", ",", "underlying", "which", "there", "is", "acanthosis", "and", "horny", "pseudoglobus", ",", "being", "at", "all", "times", "well", "demarcated", "from", "the", "underlying", "dermal", "connective", "tissue", "where", "there", "is", "a", "proliferation", "of", "capillary", "buds", "similar", "to", "those", "of", "the", "stasis", "dermis", ",", "accompanied", "by", "superficial", "and", "deep", "chronic", "inflammatory", "infiltrate", "with", "lymphocytes", "and", "some", "eosinophils", ",", "where", "no", "granulomatous", "formations", ",", "not", "fungi", ",", "are", "observed", ".", "Differential", "diagnosis", ":", "localised", "lesions", ":", "ulcer", "2o", "to", "underlying", "infection", ",", "folliculitis", ",", "Sweet", "'", "s", "disease", ",", "warfarin-induced", "necrosis", ",", "ulcer", "2o", "to", "underlying", "neoplasm", ",", "arthropod", "bite", ",", "vasculitis", "(", "e", ".", "g", ".", "Wegwner", "'", "s", "granulomatosis", ")", ".", "Associated", "such", "as", "hepatitis", ",", "rheumatoid", "arthritis", ",", "inflammatory", "bowel", "disease", ",", "myeloma", ",", "polycythaemia", "vera", ",", "BehÇet", "'", "s", "disease", ",", "leukaemia", ".", "Clinical", "judgement", ":", "probable", "pyoderma", "gangrenosum", "." ]

[ 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "BAAR", "label": "SPECIES", "start": 1128, "end": 1132 }, { "text": "Epstein-Barr", "label": "SPECIES", "start": 880, "end": 892 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 14, "end": 21 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 311, "end": 318 }, { "text": "Staphylococcus aureus", "label": "SPECIES", "start": 1039, "end": 1060 }, { "text": "cytomegalovirus", "label": "SPECIES", "start": 912, "end": 927 }, { "text": "fungi", "label": "SPECIES", "start": 1118, "end": 1123 }, { "text": "fungi", "label": "SPECIES", "start": 1674, "end": 1679 }, { "text": "Personal", "label": "HUMAN", "start": 135, "end": 143 }, { "text": "toxoplasma", "label": "SPECIES", "start": 978, "end": 988 }, { "text": "arthropod", "label": "SPECIES", "start": 1863, "end": 1872 }, { "text": "rice", "label": "SPECIES", "start": 74, "end": 78 }, { "text": "LUES", "label": "SPECIES", "start": 947, "end": 951 }, { "text": "bacterial", "label": "SPECIES", "start": 1091, "end": 1100 } ]

[ "AMO", ",", "46", "years", "old", ",", "male", ",", "from", "the", "municipality", "of", "Anamã", "(", "AM", ")", ".", "In", "October", "2007", ",", "he", "presented", "with", "fever", "and", "palpitations", "and", "was", "diagnosed", "with", "RCT", "by", "thick", "blood", "test", "positive", "for", "T", ".", "cruzi", ".", "The", "epidemiological", "history", "did", "not", "allow", "for", "suspicion", "of", "the", "mode", "of", "transmission", "of", "CD", ".", "The", "electrocardiogram", "showed", "atrial", "fibrillation", "(", "AF", ")", "rhythm", "with", "an", "average", "ventricular", "rate", "of", "110", "bpm", ".", "The", "transthoracic", "echocardiogram", "was", "normal", ".", "Aetiological", "treatment", "for", "Chagas", "disease", "was", "started", "with", "benzonidazole", ".", "With", "regard", "to", "AF", ",", "heart", "rate", "control", "was", "started", "with", "beta-blockers", ",", "anticoagulation", "and", "a", "transesophageal", "echocardiogram", "was", "scheduled", "for", "subsequent", "cardioversion", ".", "After", "approximately", "two", "weeks", "of", "aetiological", "treatment", "for", "CAD", ",", "there", "was", "reversion", "to", "sinus", "rhythm", ",", "without", "the", "need", "for", "cardioversion", "of", "atrial", "fibrillation", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "male", "label": "HUMAN", "start": 19, "end": 23 }, { "text": "T. cruzi", "label": "SPECIES", "start": 180, "end": 188 } ]

[ "Anamnesis", "Male", "patient", "aged", "41", "years", ".", "Bank", "manager", ".", "Personal", "history", "-", "Dyslipidaemia", ",", "asymptomatic", "hyperuricaemia", "and", "impaired", "fasting", "glucose", ".", "-", "Probable", "NASH", "(", "2006", ")", ".", "Negative", "serology", "for", "virus", "B", "and", "C", ".", "-", "Atypical", "chest", "pain", "studied", "in", "2006", "with", "negative", "echocardiogram", "(", "left", "ventricular", "hypertrophy", "with", "normal", "systolic", "function", "(", "EF", "=", "0", ".", "72", ")", ",", "diastolic", "dysfunction", ")", "and", "stress", "test", ".", "-", "Anxiety", "syndrome", "since", "1998", ".", "Family", "history", "No", "relevant", "family", "history", ".", "Toxic", "habits", ":", "Smoker", "of", "10", "cigarettes", "/", "day", "(", "cumulative", "consumption", "of", "20", "packs", "/", "year", ")", ".", "Sporadic", "moderate", "alcohol", "consumption", ".", "Treatment", ":", "Escitalopram", "20", "mg", "(", "1-0-0", ")", ".", "Lorazepam", "2", ".", "5", "mg", "(", "1-0-2", ")", ".", "Bisoprolol", "5", "mg", "(", "1", "-", "0-0-0", ")", ".", "Gemfibrozil", "600", "mg", "(", "0-0-1", ")", ".", "Current", "history", "Patient", "attended", "the", "Emergency", "Department", "of", "our", "centre", "with", "sudden", "onset", "of", "intense", "muscular", "pain", "in", "the", "right", "arm", "of", "4", "hours", "'", "duration", ",", "with", "no", "apparent", "triggers", ".", "She", "was", "very", "worried", "and", "anxious", "about", "the", "possible", "cardiological", "origin", "of", "the", "symptoms", ".", "She", "does", "not", "report", "dyspnoea", ",", "orthopnoea", "or", "paroxysmal", "nocturnal", "dyspnoea", ".", "She", "had", "no", "previous", "presyncopal", "episodes", "or", "syncope", "or", "other", "accompanying", "respiratory", "symptoms", ".", "Although", "he", "comments", "that", "the", "pain", "has", "different", "characteristics", ",", "the", "patient", "had", "previously", "been", "studied", "by", "Cardiology", "in", "2006", "when", "he", "presented", "with", "an", "episode", "of", "chest", "pain", "with", "atypical", "characteristics", "apparently", "related", "to", "excessive", "alcohol", "consumption", ".", "The", "study", "performed", "showed", "elevated", "CPK", "levels", ",", "with", "an", "echocardiogram", "and", "a", "stress", "test", "with", "no", "abnormalities", ",", "ruling", "out", "a", "cardiological", "origin", "for", "both", "the", "symptoms", "and", "the", "analytical", "alterations", "(", "no", "report", "of", "the", "tests", "performed", "is", "attached", ")", ".", "On", "the", "basis", "of", "these", "data", ",", "an", "ECG", "(", "no", "signs", "of", "acute", "ischaemia", ")", "and", "basic", "laboratory", "tests", "were", "performed", "in", "the", "emergency", "department", ",", "highlighting", "an", "increase", "in", "GOT", "/", "GPT", "31", "/", "71", "IU", "/", "L", "(", "n", ":", "0-37", "/", "0-41", ")", "with", "other", "normal", "liver", "tests", ",", "CPK", "of", "252", "IU", "/", "L", "(", "n", ":", "0-170", "IU", "/", "L", ")", "and", "aldolase", "of", "7", ".", "9", "IU", "/", "L", "(", "n", ":", "0-7", ".", "6", "IU", "/", "L", ")", ".", "Inflammatory", "parameters", "(", "ESR", "and", "CRP", ")", "within", "normality", ",", "with", "renal", "normofunction", "without", "hydroelectrolytic", "alteration", ",", "Hb", "15", ".", "4", "g", "/", "dl", ",", "Platelets", "263", "10E9", "/", "L", ",", "Leukocytes", "6", ".", "2", "10E9", "/", "L", ".", "Coagulation", "normal", ".", "Abnormal", "and", "Sediment", "without", "alteration", ".", "In", "view", "of", "these", "results", ",", "the", "pain", "was", "attributed", "to", "a", "probable", "osteo-muscular", "origin", "and", "the", "patient", "was", "referred", "to", "the", "Internal", "Medicine", "department", "to", "check", "the", "evolution", "and", "complete", "the", "study", "of", "mild", "analytical", "alterations", ".", "At", "the", "Internal", "Medicine", "consultation", ",", "the", "patient", "was", "re-interviewed", ",", "describing", "exercise", "intolerance", "since", "childhood", "in", "the", "form", "of", "asthenia", "and", "generalised", "myalgias", ",", "both", "proximal", "and", "distal", "extremities", ",", "without", "arthritis", "or", "new", "onset", "cutaneous-mucosal", "lesions", ".", "Anamnesis", "by", "apparatus", "No", "fever", "or", "cramps", ".", "No", "loss", "of", "muscle", "mass", ".", "No", "fasciculations", "or", "sensory", "symptoms", ".", "He", "leads", "a", "relatively", "normal", "life", ",", "with", "the", "limitation", "described", "for", "the", "practice", "of", "some", "sport", "and", "which", "conditions", "him", "to", "lead", "a", "relatively", "sedentary", "life", ".", "No", "cough", "or", "phlegm", ".", "No", "recent", "infectious", "conditions", ".", "No", "abdominal", "pain", ".", "Bowel", "habits", "preserved", "with", "1", "bowel", "movement", "per", "day", "without", "pathological", "products", ".", "The", "patient", "provided", "previous", "analyses", "showing", "significant", "variations", "in", "CPK", "levels", "in", "recent", "years", ",", "apparently", "coinciding", "with", "the", "use", "of", "statins", "and", "concomitant", "moderate", "alcohol", "consumption", ".", "He", "also", "presented", "chronic", "and", "fluctuating", "hypertransaminasemia", "without", "episodes", "of", "jaundice", "or", "other", "signs", "suggestive", "of", "hepatic", "decompensation", ",", "which", "were", "attributed", "to", "possible", "non-alcoholic", "steatohepatitis", "with", "negative", "viral", "serologies", ".", "Various", "tests", "had", "previously", "been", "performed", "(", "whole", "body", "MRI", ",", "electrophysiological", "study", ",", "liver", "biopsy", ")", "without", "finding", "any", "alterations", ".", "Physical", "examination", "T", ".", "A", ".", ":", "110", "/", "70", "mmHg", ".", "HR", ":", "79", "/", "minute", ".", "Afebrile", ".", "Sat", ".", "02", ":", "96", "%", ".", "BMI", ":", "28", "kg", "/", "m2", ".", "Good", "general", "condition", ".", "Good", "colour", "of", "skin", "and", "mucous", "membranes", ".", "Pharynx", ":", "normal", ".", "Cardiac", "auscultation", ":", "no", "alterations", ".", "Pulmonary", "auscultation", ":", "normal", ".", "Abdomen", ":", "soft", ",", "depressible", ",", "without", "pain", "or", "megaliths", ".", "Extremities", ":", "peripheral", "pulses", ",", "no", "oedema", ".", "No", "pain", "on", "palpation", ".", "No", "signs", "of", "arthritis", ".", "Neurological", "examination", "was", "unremarkable", ".", "Evolution", "and", "discussion", "of", "the", "clinical", "case", "After", "reviewing", "the", "tests", "already", "available", "and", "re-historying", "the", "patient", ",", "we", "orientated", "the", "studies", "towards", "a", "picture", "of", "exercise", "intolerance", "in", "the", "form", "of", "asthenia", "and", "myalgias", "accompanied", "by", "oscillating", "CPK", "levels", "and", "mild", "hypertransaminasemia", ",", "without", "elevation", "of", "inflammatory", "parameters", "or", "signs", "suggestive", "of", "first", "or", "second", "motor", "neuron", "disease", ".", "Furthermore", ",", "in", "the", "absence", "of", "compatible", "skin", "lesions", "and", "characteristic", "muscle", "weakness", ",", "we", "reasonably", "ruled", "out", "the", "diagnoses", "of", "polymyositis", "and", "/", "or", "dermatomyositis", ".", "The", "diagnostic", "approach", "we", "followed", "was", "as", "follows", ":", "1", ".", "given", "the", "possibility", "of", "an", "adverse", "drug", "reaction", ",", "we", "reviewed", "and", "withdrew", "the", "potentially", "implicated", "drugs", "(", "Gemfibrocil", "/", "Benzodiazepines", "/", "Escitalopram", ")", ".", "2", ".", "serologies", "were", "requested", "for", "CMV", ",", "Epstein", "barr", ",", "Herpes", "virus", "and", "HIV", ",", "which", "were", "negative", ",", "and", "a", "study", "of", "hypertransaminasemia", "was", "completed", "with", "serologies", "for", "HAV", ",", "B", "and", "C", ".", "We", "added", "an", "autoimmunity", "study", "(", "ANA", ",", "AMA", ",", "ASMA", "and", "Anti-LKM", ")", ",", "obtaining", "ANA", "nucleolar", "pattern", "1", ":", "320", "and", "ASMA", "1", ":", "80", ".", "3", ".", "We", "completed", "the", "study", "with", "an", "abdominal", "Doppler", "ultrasound", "scan", "showing", "diffuse", "hepatic", "steatosis", "with", "an", "area", "of", "perivesicular", "preservation", ",", "with", "no", "evidence", "of", "solid", "focal", "lesions", ".", "Multiple", "vesicular", "polyps", "(", "probably", "cholesterol", ")", "with", "a", "bile", "duct", "of", "normal", "calibre", ".", "Once", "the", "possible", "acquired", "aetiologies", "of", "CPK", "elevation", "had", "been", "ruled", "out", ",", "the", "case", "was", "oriented", "towards", "a", "possible", "hereditary", "myopathy", ".", "We", "therefore", "delved", "into", "the", "family", "history", "and", "the", "characteristics", "of", "the", "patient", "'", "s", "symptoms", ".", "No", "one", "in", "the", "patient", "'", "s", "family", "had", "a", "similar", "clinical", "picture", ",", "and", "as", "for", "the", "symptoms", ",", "the", "patient", "reported", "early", "fatigue", "and", "myalgia", "with", "improvement", "in", "exercise", "tolerance", "after", "several", "minutes", "from", "the", "onset", ".", "A", "review", "of", "the", "literature", "revealed", "three", "main", "groups", "of", "hereditary", "myopathies", ":", "-", "Glycogenoses", ",", "-", "Lipid", "metabolism", "disorders", "-", "Mitochondrial", "diseases", ".", "In", "order", "of", "frequency", ",", "encompassing", "the", "three", "groups", ",", "three", "entities", "stand", "out", ":", "-", "Carnitine", "palmitoyl", "transferase", "II", "(", "CPT", "II", ")", "deficiency", ",", "-", "Myophosphorylase", "deficiency", "(", "McArdle", "'", "s", "disease", "(", "V", ")", ")", ".", "-", "Phosphorylase", "kinase", "deficiency", "(", "VIII", ")", ".", "According", "to", "the", "diagnostic", "algorithm", "-", "-", "-", "-", ",", "elevated", "CPK", "levels", "together", "with", "severe", "exercise", "intolerance", "(", "in", "the", "form", "of", "asthenia", "and", "myalgia", ")", "from", "the", "onset", "of", "exercise", "but", "which", "improves", "significantly", "after", "5-10", "minutes", ",", "are", "highly", "suggestive", "of", "McArdle", "'", "s", "disease", ".", "We", "therefore", "performed", "an", "ischaemia", "test", "which", "confirmed", "a", "discrete", "elevation", "of", "lactate", "compatible", "with", "difficulty", "in", "glycogen", "metabolism", ".", "A", "muscle", "biopsy", "was", "performed", "and", "showed", "the", "presence", "of", "striated", "skeletal", "muscle", "tissue", "with", "structural", "preservation", "and", "a", "relative", "increase", "in", "the", "amount", "of", "glycogen", "in", "the", "muscle", "fibres", ".", "In", "the", "immunohistochemical", "study", "carried", "out", ",", "the", "absence", "of", "historeactivity", "against", "myophosphorylase", "stood", "out", ",", "with", "normality", "of", "the", "rest", "of", "the", "historeactive", "patterns", ",", "confirming", "the", "existence", "of", "a", "myopathy", "due", "to", "myophosphorylase", "deficiency", "corresponding", "to", "McArdle", "'", "s", "disease", "." ]

[ 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 15, "end": 22 }, { "text": "Male patient", "label": "HUMAN", "start": 10, "end": 22 }, { "text": "Bank manager", "label": "HUMAN", "start": 38, "end": 50 }, { "text": "Personal", "label": "HUMAN", "start": 53, "end": 61 }, { "text": "virus B", "label": "SPECIES", "start": 191, "end": 198 }, { "text": "Family", "label": "HUMAN", "start": 417, "end": 423 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 444, "end": 450 }, { "text": "Patient", "label": "HUMAN", "start": 722, "end": 729 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1218, "end": 1225 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2291, "end": 2298 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2469, "end": 2476 }, { "text": "childhood", "label": "HUMAN", "start": 2535, "end": 2544 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3116, "end": 3123 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 3528, "end": 3533 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4228, "end": 4235 }, { "text": "CMV", "label": "SPECIES", "start": 4927, "end": 4930 }, { "text": "Herpes virus", "label": "SPECIES", "start": 4946, "end": 4958 }, { "text": "HAV", "label": "SPECIES", "start": 5059, "end": 5062 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 4963, "end": 4966 }, { "text": "Epstein barr", "label": "SPECIES", "start": 4932, "end": 4944 }, { "text": "HAV, B", "label": "SPECIES", "start": 5059, "end": 5065 }, { "text": "HAV, B and C", "label": "SPECIES", "start": 5059, "end": 5071 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5673, "end": 5680 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5707, "end": 5714 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5785, "end": 5792 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 5627, "end": 5633 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 5717, "end": 5723 }, { "text": "relative", "label": "HUMAN", "start": 6823, "end": 6831 } ]

[ "A", "35", "year", "old", "man", "came", "to", "the", "emergency", "department", "for", "abdominal", "pain", ",", "vomiting", "and", "general", "malaise", ".", "Analyses", "showed", "CRP", "1", ".", "34", "mg", "/", "dl", "and", "leucocytes", "14", ",", "400", ".", "Chest", "X-ray", "showed", "bilateral", "nodular", "opacities", "predominantly", "in", "the", "upper", "lobes", ".", "The", "abdomino-pelvic", "CT", "scan", "showed", "an", "irregular", "parietal", "thickening", "in", "the", "proximal", "ileum", "with", "obstruction", ",", "without", "lymphadenopathy", ".", "There", "are", "isolated", "pulmonary", "nodules", "with", "irregular", "borders", "in", "the", "lung", "bases", ".", "Small", "bowel", "neoplasia", "with", "pulmonary", "metastases", "is", "reported", ".", "At", "the", "time", "of", "diagnosis", "the", "tests", "were", "unknown", ".", "Urgent", "surgery", "was", "performed", "with", "resection", "of", "a", "non-tumourous", "mass", "in", "the", "proximal", "ileum", "with", "anatomopathological", "findings", "of", "granulomatous", "enteritis", ".", "A", "few", "days", "later", ",", "a", "CT", "scan", "of", "the", "chest", "showed", "bilateral", "pulmonary", "nodules", ",", "predominantly", "in", "the", "upper", "lobes", ",", "with", "irregular", "borders", ",", "some", "of", "them", "cavitated", ",", "and", "pulmonary", "areas", "with", "a", "tree-shaped", "pattern", ".", "Bronchoalveolar", "lavage", "revealed", "M", ".", "tubercolysis", "with", "the", "final", "diagnosis", "of", "disseminated", "pulmonary", "and", "gastrointestinal", "tuberculosis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "M. tubercolysis", "label": "SPECIES", "start": 950, "end": 965 }, { "text": "tree", "label": "SPECIES", "start": 897, "end": 901 } ]

[ "A", "34-year-old", "man", "from", "Spain", ",", "with", "no", "epidemiological", "history", "of", "visits", "to", "endemic", "areas", "of", "Chagas", "disease", "(", "American", "trypanosomiasis", ")", ",", "bone", "marrow", "transplant", "due", "to", "idiopathic", "bone", "marrow", "aplasia", "after", "HBV", "hepatitis", ".", "The", "patient", "showed", "poor", "response", "to", "treatment", "with", "frequent", "transfusion", "requirements", "and", "21", "days", "post-transplant", "developed", "acute", "skin", "symptoms", "characterised", "by", "erythematous", "plaques", "with", "geographic", "borders", "and", "multiple", "hyperpigmented", "papules", "on", "the", "face", ",", "posterior", "cervical", "region", "and", "back", ".", "A", "punch", "skin", "biopsy", "was", "submitted", "with", "suspicion", "of", "GVHD", ".", "Histopathology", "of", "the", "skin", "biopsy", "revealed", "abundant", "intra", "-", "and", "extracellular", "spherical", "parasites", "(", "amastigotes", ")", ",", "which", "were", "initially", "interpreted", "as", "Leishmania", "or", "a", "related", "parasite", ".", "Fresh", "peripheral", "blood", "smear", "and", "bone", "marrow", "aspirate", "demonstrate", "the", "presence", "of", "abundant", "flagellated", "pyriform", "forms", "(", "trypomastigotes", ")", "characteristic", "of", "Trypanosoma", "cruzi", ".", "A", "bone", "marrow", "cylinder", "biopsy", "was", "performed", "including", "a", "small", "fragment", "of", "skeletal", "muscle", ",", "with", "marrow", "hypoplasia", "and", "intracellular", "muscle", "parasitism", "by", "T", ".", "cruzi", "amastigotes", ".", "On", "day", "35", "post-transplant", ",", "the", "patient", "presented", "retinal", "haemorrhages", "with", "soft", "exudates", "within", "the", "clinical", "picture", "of", "trypanosomiasis", ".", "After", "serological", "and", "PCR", "confirmation", "of", "T", ".", "cruzi", "infection", ",", "treatment", "with", "benznidazole", "was", "started", "with", "progressive", "clinical", "improvement", ".", "The", "patient", "underwent", "an", "exhaustive", "epidemiological", "study", "and", "it", "was", "concluded", "that", "the", "route", "of", "transmission", "of", "the", "infection", "must", "have", "been", "one", "of", "the", "multiple", "transfusions", "received", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Leishmania", "label": "SPECIES", "start": 713, "end": 723 }, { "text": "Trypanosoma cruzi", "label": "SPECIES", "start": 901, "end": 918 }, { "text": "HBV", "label": "SPECIES", "start": 202, "end": 205 }, { "text": "amastigotes", "label": "SPECIES", "start": 663, "end": 674 }, { "text": "amastigotes", "label": "SPECIES", "start": 1082, "end": 1093 }, { "text": "T. cruzi amastigotes", "label": "SPECIES", "start": 1073, "end": 1093 } ]

[ "A", "43-year-old", "man", "whose", "only", "medical", "history", "was", "admission", "to", "the", "Intensive", "Care", "Unit", "(", "ICU", ")", "in", "December", "2014", ",", "lasting", "2", "months", ",", "for", "septic", "shock", "of", "non-filarial", "origin", "with", "multi-organ", "failure", ",", "in", "the", "context", "of", "catarrhal", "symptoms", ",", "associated", "with", "polyserositis", "and", "rhabdomyolysis", ".", "During", "subsequent", "follow-up", "in", "outpatient", "Internal", "Medicine", "(", "IM", ")", "consultations", ",", "the", "only", "finding", "of", "interest", "was", "the", "presence", "in", "serum", "and", "urine", "of", "a", "monoclonal", "component", "in", "the", "gamma", "zone", ";", "in", "immunoelectrophoresis", ",", "IgG", "kappa", "paraprotein", "IgG", ".", "In", "December", "2015", ",", "she", "attended", "the", "emergency", "department", "reporting", "a", "24-hour", "history", "of", "fever", "of", "38", "°", "C", ",", "cough", ",", "asthenia", "and", "generalised", "arthromyalgia", ".", "On", "arrival", "he", "was", "haemodynamically", "stable", ",", "presenting", "after", "24", "hours", "with", "hypotension", "(", "BP", "90", "/", "54", ")", ",", "oedema", "in", "the", "lower", "limbs", "and", "oliguria", ";", "the", "rest", "of", "the", "physical", "examination", "was", "unremarkable", ".", "Blood", "tests", ":", "Hb", "20", "g", "/", "dL", ",", "Ht", "56", ".", "5", "%", ",", "leukocytes", "16900", "(", "14400", "neutrophils", ")", ",", "creatinine", "1", ".", "46", "mg", "/", "dL", ",", "CRP", "5", ".", "1", "mg", "/", "dL", ",", "rest", "normal", ".", "After", "12", "hours", ",", "the", "clinical", "evolution", "remained", "poor", ",", "with", "generalised", "oedema", ",", "anuria", "and", "a", "marked", "decrease", "in", "blood", "pressure", "(", "BP", "63", "/", "54", ")", ",", "tachycardia", "(", "115", "bpm", ")", "and", "hypothermia", "(", "To", "35oC", ")", ",", "with", "very", "similar", "laboratory", "findings", "except", "for", "an", "increase", "in", "leukocytosis", "(", "19000", ")", ",", "lactate", "6", ".", "6", "mmol", "/", "L", "(", "previously", "normal", ")", ",", "total", "protein", "2", ".", "6", "g", "/", "dL", "and", "albumin", "1", ".", "5", "g", "/", "dL", ".", "For", "this", "reason", ",", "he", "was", "admitted", "to", "the", "ICU", ",", "where", ",", "after", "failing", "to", "respond", "to", "diuretic", "treatment", ",", "haemofiltration", "was", "started", ",", "which", "could", "be", "withdrawn", "after", "3", "days", "following", "a", "good", "evolution", ".", "During", "his", "stay", "in", "the", "ICU", ",", "bilateral", "patchy", "infiltrates", "secondary", "to", "adult", "respiratory", "distress", "were", "observed", "on", "chest", "CT", ",", "as", "well", "as", "mild", "bilateral", "pleural", "effusion", "and", "minimal", "pericardial", "effusion", "on", "transthoracic", "echocardiography", ".", "In", "addition", ",", "various", "cultures", "were", "taken", "for", "microbiological", "analysis", ",", "all", "of", "which", "were", "negative", ",", "with", "only", "isolation", "of", "Influenza", "A", "virus", "in", "nasopharyngeal", "exudate", ".", "Once", "the", "patient", "was", "stabilised", ",", "he", "returned", "to", "the", "IM", "ward", "with", "adequate", "diuresis", "and", "normalisation", "of", "analytical", "parameters", ".", "We", "then", "reviewed", "the", "previous", "admission", "to", "the", "ICU", "in", "December", "2014", "and", "found", "that", "the", "triad", "of", "haemoconcentration", ",", "hypoalbuminaemia", "and", "hypotension", "was", "also", "present", "at", "that", "time", ".", "All", "this", ",", "together", "with", "the", "already", "known", "presence", "of", "IgG-type", "paraprotein", ",", "supported", "the", "diagnostic", "suspicion", "of", "Systemic", "Capillary", "Leakage", "Syndrome", ",", "on", "this", "occasion", "secondary", "to", "Influenza", "A", "virus", "infection", ".", "Treatment", "was", "started", "with", "theophylline", "until", "serum", "concentrations", "of", "10", "to", "20", "mcg", "/", "mL", "and", "intravenous", "immunoglobulins", "on", "a", "monthly", "basis", "at", "high", "doses", "(", "initially", "2", "g", "/", "kg", ")", "with", "a", "gradual", "decrease", "thereafter", ",", "achieving", "clear", "symptomatic", "improvement", "during", "follow-up", "and", "no", "new", "outbreaks", "since", "then", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "adult", "label": "HUMAN", "start": 1614, "end": 1619 }, { "text": "Influenza A virus", "label": "SPECIES", "start": 1901, "end": 1918 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1955, "end": 1962 }, { "text": "Influenza A virus", "label": "SPECIES", "start": 2434, "end": 2451 } ]

[ "", "An", "otherwise", "healthy", "8-year-old", "boy", "of", "African", "origin", "(", "height", "130", "cm", ",", "weight", "29", "kg", ")", "came", "to", "our", "hospital", "with", "fever", ",", "cough", ",", "thinness", "and", "extreme", "tiredness", "of", "4", "days", "'", "duration", ".", "On", "physical", "examination", ",", "he", "had", "a", "fever", "(", "39", ".", "6", "°", "C", ")", "and", "presented", "with", "a", "painful", ",", "swollen", ",", "warm", "erythema", "with", "lymphadenopathy", "on", "the", "right", "side", "of", "the", "neck", ".", "Cellulitis", "was", "diagnosed", "and", "confirmed", "by", "ultrasound", ";", "he", "was", "hospitalised", "for", "i", ".", "v", ".", "antibiotics", ".", "A", "few", "hours", "after", "admission", "he", "presented", "tachycardia", "(", "138", "bpm", ")", ",", "hypotension", "(", "94", "/", "40", "mmHg", ")", "resistant", "to", "i", ".", "v", ".", "fluid", "injection", "and", "associated", "with", "a", "presentation", "of", "hepatomegaly", "and", "oliguria", ".", "Blood", "tests", "showed", "increased", "C-reactive", "protein", "(", "73", "mg", "/", "L", ")", ",", "leukocytopenia", "(", "4260", "/", "mm3", ")", "with", "lymphocytopenia", "(", "400", "/", "mm3", ")", ",", "thrombocytopenia", "(", "118", ".", "000", "/", "mm3", ")", ",", "impaired", "renal", "activity", "(", "urea", ":", "37", "mg", "/", "dL", ",", "serum", "creatinine", ":", "0", ".", "62", "mg", "/", "dL", ")", ",", "hepatic", "cytolysis", "(", "glutamic", "oxaloacetic", "transaminase", ":", "88", "IU", "/", "L", ",", "glutamic", "pyruvic", "transaminase", ":", "50", "IU", "/", "L", ")", ",", "myocardial", "necrosis", "(", "high-sensitivity", "troponin", "T", "values", ":", "0", ".", "044", "ng", "/", "mL", ",", "N-terminal", "prohormone", "of", "brain", "natriuretic", "peptide", ":", "5112", "pg", "/", "mL", ")", "as", "well", "as", "high", "values", "of", "D-dimer", "(", ">", "4", ".", "40", "μg", "/", "mL", ")", "and", "interleukin", "6", "(", "IL-6", ",", "377", ".", "8", "pg", "/", "mL", ")", ".", "A", "two-dimensional", "echocardiogram", "revealed", "normal", "cardiac", "anatomical", "features", ",", "with", "left", "ventricular", "dysfunction", "(", "fractional", "shortening", ":", "21", "%", ")", "and", "evidence", "of", "mitral", "insufficiency", "and", "a", "small", "pericardial", "effusion", ",", "without", "evidence", "of", "left", "ventricular", "dilatation", ",", "myocardial", "hypertrophy", "or", "significant", "pulmonary", "hypertension", ".", "The", "electrocardiogram", "was", "relevant", "for", "a", "mild", "ST", "elevation", "in", "V3", ",", "consistent", "with", "pericarditis", ".", "The", "patient", "was", "admitted", "to", "the", "intensive", "care", "unit", ",", "given", "anticoagulants", ",", "with", "enoxaparin", ",", "and", "treated", "with", "dobutamine", ",", "which", "rapidly", "normalised", "his", "blood", "pressure", "and", "restored", "diuresis", ".", "He", "also", "received", "oxygen", "to", "support", "cardiac", "activity", ".", "Follow-up", "tests", "showed", "a", "rapid", "increase", "in", "inflammatory", "markers", "(", "CRP", "max", ":", "151", "mg", "/", "L", ",", "interleukin", "6", "max", ":", "1023", "pg", "/", "mL", ",", "ferritin", "max", ":", "2869", "ng", "/", "mL", ")", ",", "progression", "of", "liver", "cytolysis", "(", "TOG", "max", ":", "100", "U", "/", "L", ",", "TPG", "max", ":", "70", "U", "/", "L", ")", "and", "renal", "failure", "(", "creatinine", "max", ":", "0", ".", "75", "mg", "/", "dL", ")", ".", "A", "cardiac", "MRI", "performed", "on", "day", "3", "confirmed", "biventricular", "systolic", "dysfunction", "(", "LV", "ejection", "fraction", ":", "41", "%", ",", "RV", "ejection", "fraction", ":", "46", "%", ")", "with", "mild", "pericardial", "effusion", ",", "mild", "subepicardial", "gadolinium", "enhancement", "of", "the", "lateral", "septum", "and", "signs", "of", "diffuse", "oedema", ".", "His", "day", "3", "chest", "X-ray", "showed", "bilateral", "lower", "lobe", "pneumopathy", "with", "bilateral", "pleural", "effusion", ",", "without", "ground-glass", "opacities", ".", "A", "nasopharyngeal", "swab", "obtained", "on", "admission", "was", "positive", "for", "SARS-CoV-2", "by", "real-time", "RT-PCR", ".", "In", "addition", ",", "a", "PCR", "of", "stool", ",", "collected", "on", "day", "6", ",", "was", "also", "positive", "(", "N1", "gene", "at", "39", "CT", "and", "RdPR", "gene", "at", "39", "CT", ")", ".", "The", "patient", "had", "high", "Ig", "A", "and", "Ig", "G", "values", "in", "serum", "samples", "on", "day", "6", "(", "Ig", "A", ":", "8", ".", "39", ";", "Ig", "G", ":", "10", ".", "90", ",", "using", "an", "enzyme", "immunoadsorption", "assay", "kit", ")", ".", "Tests", "for", "other", "cardiotropic", "pathogens", "were", "negative", "(", "nasopharyngeal", "swab", "PCR", "for", "adenovirus", ",", "coronavirus", "NL63", ",", "229E", ",", "OC43", "and", "HKU1", ",", "enterovirus", ",", "parainfluenza", "virus", ",", "influenza", "virus", "and", "Mycoplasma", "pneumoniae", ";", "pharyngeal", "exudate", ";", "serological", "tests", "for", "parvovirus", "B19", ";", "blood", "cultures", ")", ".", "He", "received", "i", ".", "v", ".", "immunoglobulins", ".", "(", "2", "g", "/", "kg", "over", "two", "days", ")", ".", "Dobutamine", "(", "max", ":", "8", ".", "5", "μg", "/", "kg", "/", "min", ")", "was", "withdrawn", "on", "day", "two", ",", "replaced", "by", "milrinone", "(", "max", ":", "0", ".", "6", "μg", "/", "kg", "/", "min", ")", "until", "day", "3", ".", "As", "COVID-19", "was", "rapidly", "confirmed", "and", "the", "patient", "had", "a", "life-threatening", "condition", "associated", "with", "a", "massive", "inflammatory", "crisis", "considering", "the", "IL-6", "value", ",", "tocilizumab", "(", "2", "doses", "of", "8", "mg", "/", "kg2", ")", "was", "administered", "according", "to", "national", "guidelines", "for", "COVID-19", ".", "Surprisingly", ",", "the", "cervical", "cellulitis", "disappeared", "after", "the", "first", "dose", "of", "tocilizumab", ",", "which", "was", "well", "tolerated", "with", "no", "adverse", "effects", "until", "discharge", ".", "It", "could", "be", "that", "the", "cellulitis", "was", "a", "dermatological", "feature", "of", "COVID-19", ".", "A", "follow-up", "cardiac", "MRI", "performed", "one", "week", "later", "showed", "normal", "systolic", "activity", "and", "regression", "of", "myocardial", "oedema", ".", "The", "patient", "was", "discharged", "on", "day", "10", "with", "normal", "cardiac", "activity", "and", "normalisation", "of", "haematic", "abnormalities", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Mycoplasma pneumoniae", "label": "SPECIES", "start": 2994, "end": 3015 }, { "text": "adenovirus", "label": "SPECIES", "start": 2889, "end": 2899 }, { "text": "coronavirus NL63", "label": "SPECIES", "start": 2901, "end": 2917 }, { "text": "enterovirus", "label": "SPECIES", "start": 2940, "end": 2951 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1586, "end": 1593 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2672, "end": 2679 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3306, "end": 3313 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3868, "end": 3875 }, { "text": "cardiotropic pathogens", "label": "SPECIES", "start": 2823, "end": 2845 }, { "text": "parainfluenza virus", "label": "SPECIES", "start": 2953, "end": 2972 }, { "text": "SARS-CoV-2", "label": "SPECIES", "start": 2526, "end": 2536 }, { "text": "influenza virus", "label": "SPECIES", "start": 2974, "end": 2989 }, { "text": "parvovirus B19", "label": "SPECIES", "start": 3059, "end": 3073 }, { "text": "coronavirus NL63, 229E", "label": "SPECIES", "start": 2901, "end": 2923 }, { "text": "coronavirus NL63, 229E, OC43", "label": "SPECIES", "start": 2901, "end": 2929 } ]

[ "This", "is", "a", "63-year-old", "female", "patient", "from", "a", "rural", "area", "in", "Mayabeque", "province", ".", "She", "had", "a", "personal", "history", "of", "bronchial", "asthma", ",", "for", "which", "she", "was", "prescribed", "prednisone", "during", "crises", ";", "however", ",", "she", "sometimes", "self-medicated", "herself", "and", "had", "been", "taking", "this", "drug", "regularly", "for", "the", "last", "10", "years", ".", "The", "patient", "went", "to", "the", "Emergency", "Department", "of", "the", "General", "Hospital", "'", "Calixto", "García", "'", ",", "presenting", "vomiting", ",", "intermittent", "diarrhoea", "alternating", "with", "constipation", ",", "pain", "in", "the", "epigastrium", ",", "asthenia", "and", "weight", "loss", "of", "more", "than", "20", "pounds", "in", "the", "last", "2", "months", ".", "He", "also", "reported", "episodes", "of", "pruritic", "maculopapular", "lesions", "on", "the", "feet", ",", "groin", "and", "hands", "for", "the", "past", "5", "years", ",", "which", "he", "said", "lasted", "about", "15", "days", "and", "generally", "improved", "with", "steroid", "creams", ".", "Physical", "examination", "revealed", "only", "pain", "on", "deep", "palpation", "in", "the", "epigastrium", ".", "Complementary", "examinations", "showed", "the", "following", "results", ":", "haemoglobin", "12", ".", "3", "g", "/", "L", ",", "leucocytes", ":", "11", ".", "9", "x", "109", ",", "polymorphonuclear", ":", "71", ".", "9", "x109", ",", "lymphocytes", "17", ".", "4", ",", "platelets", "329", "x109", ",", "eosinophil", "count", "0", ".", "79", "x109", ",", "HIV", ":", "negative", ".", "Panendoscopy", ":", "duodenitis", "and", "erythematous", "pangastritis", ",", "hiatal", "hernia", "and", "mild", "biliary", "reflux", ".", "Chest", "X-ray", ":", "signs", "of", "pulmonary", "emphysema", "without", "other", "alterations", ".", "Parasitological", "examination", "of", "stool", ":", "the", "first", "examination", "was", "negative", ";", "the", "second", "and", "third", "examination", "showed", "rhabditoid", "larvae", "of", "S", ".", "stercoralis", ",", "4", "per", "field", "at", "400X", "magnification", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 29, "end": 36 }, { "text": "female patient", "label": "HUMAN", "start": 22, "end": 36 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 88, "end": 96 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 1016, "end": 1019 }, { "text": "rhabditoid larvae of S. stercoralis", "label": "SPECIES", "start": 1309, "end": 1344 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 295, "end": 302 }, { "text": "Parasitological", "label": "SPECIES", "start": 1195, "end": 1210 } ]

[ "A", "25", "year", "old", "Colombian", "woman", "was", "admitted", "to", "our", "Obstetrics", "Department", "for", "presenting", "with", "rupture", "of", "membranes", "at", "24", "weeks", "and", "5", "days", "gestation", ".", "She", "had", "no", "family", "or", "personal", "history", "of", "interest", ".", "Gynaecological", "history", ":", "menarche", "at", "14", "years", "of", "age", ";", "M", ".", "F", ".", ":", "3-4", "/", "32", ".", "In", "a", "routine", "pregnancy", "examination", "performed", "at", "20", "weeks", "'", "gestation", ",", "she", "was", "diagnosed", "with", "vaginal", "condylomatosis", ".", "Examination", "on", "admission", ":", "apyretic", "patient", ".", "Inspection", "of", "the", "external", "genitalia", "revealed", "multiple", "vulvoperineal", "condylomas", ".", "TV", ":", "cervix", "formed", ",", "posterior", "and", "closed", ".", "There", "was", "abundant", "clear", "water", "flowing", ".", "Ultrasound", ":", "foetus", "in", "cephalic", "longitudinal", ".", "Posterior", "placenta", ",", "ILA", "8", "(", "amniotic", "fluid", "index", ")", ".", "F", ".", "C", ".", "F", ".", "positive", ".", "Estimated", "foetal", "weight", ":", "641", "g", ".", "Treatment", "with", "intravenous", "antibiotics", "was", "started", "and", "a", "series", "of", "complementary", "tests", "were", "performed", "(", "complete", "CBC", ",", "serology", ",", "vaginal", ",", "rectal", "and", "amniotic", "fluid", "cultures", ",", "and", "hybridisation", "test", "for", "HPV", ")", ",", "the", "results", "of", "which", "are", "shown", "in", "table", "1", ",", "and", "which", "led", "to", "the", "diagnosis", "of", "chorioamnionitis", ".", "Labour", "was", "triggered", "one", "week", "later", "and", "due", "to", "the", "presence", "of", "chorioamnionitis", "and", "foetal", "immaturity", "was", "allowed", "to", "progress", ".", "Delivery", "was", "spontaneous", ",", "with", "a", "live", "male", "foetus", "of", "690", "g", ",", "pH", "of", "artery", "7", ".", "24", "and", "pH", "of", "vein", "7", ".", "48", ".", "Apgar", "test", "at", "1", "and", "5", ".", "5", ".", "Placenta", "of", "167", "g", ",", "hypermature", "with", "signs", "of", "chorioamnionitis", ".", "After", "delivery", ",", "biopsies", "of", "the", "vagina", "and", "perineum", "were", "performed", ",", "the", "results", "of", "which", "were", ":", "condyloma", "acuminatum", "of", "the", "vagina", "and", "condyloma", "acuminatum", "of", "the", "perineum", "respecting", "the", "edges", ".", "The", "neonate", "died", "at", "40", "days", "of", "life", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 416, "end": 423 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 158, "end": 164 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 168, "end": 176 }, { "text": "HPV", "label": "SPECIES", "start": 931, "end": 934 }, { "text": "male", "label": "HUMAN", "start": 1198, "end": 1202 } ]

[ "We", "present", "the", "case", "of", "a", "53-year-old", "male", "smoker", "with", "HIV", "and", "HCV", "infection", ".", "The", "patient", "'", "s", "immunovirological", "status", "was", "140", "CD4", "/", "μL", "and", "6", ",", "892", ",", "470", "viral", "RNA", "copies", "/", "ml", ".", "He", "had", "started", "antiretroviral", "treatment", "one", "week", "earlier", "with", "darunavir", ",", "cobicistat", ",", "tenofovir", "disoproxil", "fumarate", "and", "emtricitabine", ".", "He", "had", "not", "received", "treatment", "for", "HCV", "infection", ",", "whose", "last", "detected", "viral", "load", "(", "four", "years", "earlier", ")", "was", "14", ",", "261", ",", "452", "viral", "RNA", "copies", "/", "ml", ".", "She", "consulted", "the", "emergency", "department", "because", "she", "had", "been", "suffering", "from", "a", "feeling", "of", "dystrophy", "for", "a", "month", ",", "which", "had", "increased", "in", "recent", "weeks", ",", "with", "daily", "fever", "and", "profuse", "sweating", ".", "She", "also", "reported", "epigastralgia", "and", "heartburn", "after", "eating", ",", "a", "feeling", "of", "fullness", "postprandially", ",", "early", "satiety", "and", "occasional", "diarrhoeal", "stools", "with", "red", "blood", ",", "all", "of", "which", "had", "also", "been", "going", "on", "for", "a", "month", ".", "Finally", ",", "he", "reported", "cough", "and", "whitish", "expectoration", ".", "On", "examination", ",", "the", "patient", "showed", "muco-cutaneous", "pallor", "and", "was", "eupneic", "at", "rest", ",", "conscious", ",", "oriented", "and", "cooperative", ".", "He", "was", "febrile", "(", "39", ".", "7", "oC", ")", ",", "with", "a", "blood", "pressure", "of", "93", "/", "64", "mmHg", ",", "a", "heart", "rate", "of", "104", "beats", "per", "minute", "and", "an", "oxygen", "saturation", "of", "96", "%", "while", "breathing", "room", "air", ".", "Auscultation", "showed", "rhythmic", "tones", "without", "audible", "murmurs", "and", "a", "preserved", "vesicular", "murmur", ".", "At", "the", "lymph", "node", "level", ",", "there", "were", "palpable", "smooth", "and", "rounded", "laterocervical", "lymph", "nodes", "measuring", "approximately", "1", "cm", ",", "with", "no", "lymph", "nodes", "at", "other", "levels", ".", "On", "abdominal", "palpation", ",", "the", "abdomen", "was", "soft", "and", "depressible", ",", "not", "painful", "on", "palpation", ",", "with", "no", "signs", "of", "peritonism", ",", "with", "hydro-aerial", "sounds", "present", ",", "and", "hepatomegaly", "measuring", "2", "fingerbreadths", "was", "observed", ".", "The", "rest", "of", "the", "examination", "showed", "no", "other", "alterations", ".", "Chest", "and", "abdominal", "X-rays", "showed", "no", "significant", "findings", ".", "The", "haemogram", "showed", "hypochromic", "microcytic", "anaemia", "with", "haemoglobin", "of", "9", ".", "9", "g", "/", "dL", ",", "7", ",", "000", "leukocytes", "/", "μL", "(", "85", ".", "60", "%", "neutrophils", ")", "and", "190", ",", "000", "platelets", "/", "μL", ".", "Biochemistry", "showed", ":", "GOT", "65", "U", "/", "L", ",", "GPT", "30", "U", "/", "L", ",", "alkaline", "phosphatase", "239", "U", "/", "L", ",", "GGT", "341", "U", "/", "L", ",", "calcium", "7", ".", "5", "mg", "/", "dl", "and", "sodium", "125", "mmol", "/", "L", ".", "Renal", "function", ",", "bilirubin", ",", "lipase", "and", "urinalysis", "were", "normal", ".", "Blood", "cultures", "in", "aerobic", "and", "anaerobic", "medium", "obtained", "from", "the", "ED", "during", "the", "fever", "peak", "were", "negative", ".", "Serology", "for", "syphilis", "and", "Toxoplasma", "gondii", "were", "negative", ".", "Detection", "of", "Clostridium", "difficile", "toxin", "and", "parasites", "in", "stool", "was", "requested", ",", "as", "well", "as", "stool", "culture", ",", "all", "of", "which", "were", "negative", ".", "In", "view", "of", "the", "symptoms", "presented", ",", "it", "was", "decided", "to", "perform", "an", "abdominal", "computed", "tomography", "(", "CT", ")", "scan", ",", "upper", "gastrointestinal", "endoscopy", "and", "colonoscopy", ".", "The", "abdominal", "CT", "scan", "showed", "hepatosplenomegaly", ",", "multiple", "hypodense", "lesions", "in", "the", "spleen", "compatible", "with", "microabscesses", ",", "intra", "-", "and", "retroperitoneal", "abdominal", "lymphadenopathy", ",", "small", "free", "ascites", "and", "segmental", "thickening", "of", "the", "cecum", ",", "non-specific", ",", "with", "no", "other", "findings", "of", "interest", ".", "Gastroscopy", "revealed", "a", "non-specific", "thickening", "of", "the", "gastric", "body", "compatible", "with", "chronic", "gastritis", ".", "Colonoscopy", "explored", "the", "entire", "colon", "in", "good", "preparation", "conditions", ",", "with", "no", "alterations", ",", "except", "for", "congestive", "internal", "haemorrhoids", "and", "anal", "fissure", ".", "A", "diagnostic", "test", "was", "performed", ".", "Differential", "diagnosis", "For", "the", "differential", "diagnosis", "we", "must", "take", "into", "account", "those", "processes", "with", "hepatosplenomegaly", ",", "lesions", "compatible", "with", "splenic", "microabscesses", "as", "well", "as", "multiple", "intra-abdominal", "and", "retroperitoneal", "adenopathies", ".", "Sarcoidosis", "may", "be", "the", "cause", "of", "sterile", "splenic", "microabscesses", ",", "but", "it", "is", "not", "typical", "in", "a", "state", "of", "cellular", "immunosuppression", "such", "as", "that", "of", "our", "patient", ".", "As", "for", "neoplasms", ",", "Kaposi", "'", "s", "sarcoma", "may", "present", "with", "adenopathy", "and", "lesions", "resembling", "microabscesses", ",", "but", "this", "would", "be", "unlikely", "in", "our", "case", "given", "the", "absence", "of", "typical", "skin", "lesions", ".", "On", "the", "other", "hand", ",", "metastatic", "lesions", "should", "also", "be", "considered", ",", "but", "the", "radiological", "behaviour", "is", "different", ",", "and", "the", "absence", "of", "liver", "lesions", "and", "primary", "tumour", ",", "together", "with", "the", "normal", "colonoscopy", ",", "militate", "against", "this", "diagnosis", ",", "as", "well", "as", "the", "presence", "of", "high", "fever", "above", "39o", "C", ".", "It", "is", "more", "likely", "that", "the", "patient", "has", "lymphoma", ",", "as", "it", "sometimes", "causes", "lesions", "in", "the", "spleen", "that", "can", "simulate", "microabscesses", ",", "which", "cannot", "be", "ruled", "out", "until", "a", "histological", "diagnosis", "is", "made", "if", "the", "microbiological", "studies", "are", "negative", ".", "The", "microorganisms", "that", "can", "produce", "splenic", "microabscesses", "are", ":", "-", "Histoplasma", "capsulatum", "-", "Leishmania", "-", "Candida", "albicans", "-", "Salmonella", "-", "Shigella", "-", "Campylobacter", "jejuni", "-", "Pneumocystis", "jirovecii", "-", "Coccidioides", "-", "Toxoplasmagondii", "-", "Aspergillus", "-", "Mycobacterium", "tuberculosis", "-", "Mycobacterium", "avium", "complex", "With", "regard", "to", "fungal", "infections", ",", "we", "could", "rule", "out", "histoplasmosis", "and", "coccidioidomycosis", "from", "the", "outset", ",", "as", "they", "are", "not", "endemic", "in", "our", "environment", ".", "Moreover", ",", "when", "these", "infections", "produce", "microabscesses", ",", "they", "do", "so", "in", "the", "context", "of", "disseminated", "infection", "with", "pulmonary", "involvement", ".", "Aspergillus", "spp", "is", "also", "a", "cause", "of", "splenic", "microabscesses", ",", "but", "it", "usually", "occurs", "in", "patients", "with", "CD4", "counts", "below", "100", "cells", "/", "μL", ",", "and", "who", "also", "have", "neutropenia", "or", "steroid", "treatment", ",", "which", "was", "not", "the", "case", "in", "our", "patient", ".", "We", "should", "also", "mention", "hepato-splenic", "candidiasis", ",", "which", "would", "be", "ruled", "out", "as", "it", "is", "typical", "of", "haematological", "patients", "in", "the", "recovery", "phase", "of", "neutropenia", ".", "Extrapulmonary", "infection", "by", "Pneumocystis", "jirovecii", "is", "also", "a", "cause", "of", "splenic", ",", "liver", "and", "kidney", "abscesses", ";", "however", ",", "it", "is", "mainly", "described", "in", "the", "context", "of", "severe", "pulmonary", "disease", "caused", "by", "this", "microorganism", "or", "in", "patients", "undergoing", "prophylaxis", "with", "pentamidine", "aerosols", ",", "data", "absent", "in", "our", "case", ".", "On", "the", "other", "hand", ",", "splenic", "microabscesses", "have", "been", "described", "in", "the", "context", "of", "Salmonella", "spp", ".", ",", "Shigella", "spp", ".", "and", "Campylobacter", "spp", ".", "bacteraemia", ",", "but", "negative", "blood", "cultures", "make", "their", "diagnosis", "very", "unlikely", ".", "Bacillary", "angiomatosis", ",", "another", "cause", "of", "splenic", "abscesses", ",", "is", "far", "from", "our", "diagnosis", "as", "it", "is", "characterised", "by", "typical", "skin", "lesions", "and", "lower", "CD4", "counts", "than", "those", "shown", "by", "our", "patient", ".", "Extracerebral", "toxoplasmosis", "has", "been", "described", "as", "a", "rare", "cause", "of", "splenic", "abscesses", ".", "Generally", ",", "the", "most", "affected", "organs", "in", "case", "of", "extracerebral", "toxoplasmosis", "are", "the", "heart", "and", "lungs", ".", "It", "requires", "a", "high", "degree", "of", "immunosuppression", ",", "with", "less", "than", "100", "CD4", "/", "μL", ".", "The", "negative", "serology", "for", "T", ".", "gondii", "in", "our", "patient", "would", "rule", "out", "this", "entity", ".", "Disseminated", "leishmaniasis", "has", "been", "documented", "as", "a", "cause", "of", "nodular", "splenic", "lesions", ".", "However", ",", "its", "typical", "presentation", "is", "with", "pancytopenia", ",", "which", "was", "absent", "in", "our", "case", ".", "Finally", ",", "mycobacteria", ",", "especially", "Mycobacterium", "tuberculosis", "and", "Mycobacterium", "avium", "complex", ",", "can", "cause", "liver", "and", "splenic", "abscesses", "with", "negative", "bacterial", "cultures", ".", "M", ".", "avium", "infection", "would", "be", "less", "likely", "because", "it", "usually", "appears", "in", "patients", "with", "CD4", "counts", "below", "50", "cells", "/", "μL", ",", "on", "the", "contrary", "the", "whole", "clinical", "picture", "of", "fever", ",", "lymphadenopathy", ",", "hepatosplenomegaly", "with", "ascites", ",", "microabscesses", "and", "dissociated", "cholestasis", ",", "in", "a", "patient", "with", "HIV", "infection", "with", "more", "than", "100", "CD4", "/", "μL", ",", "makes", "M", ".", "tuberculosis", "infection", "the", "first", "diagnosis", "to", "be", "considered", "in", "our", "patient", ".", "Evolution", "Given", "the", "high", "suspicion", "of", "disseminated", "tuberculosis", ",", "a", "blood", "culture", "for", "mycobacteria", "and", "urine", "samples", "for", "smear", "microscopy", "and", "culture", "of", "these", "microorganisms", "were", "obtained", ",", "and", "empirical", "treatment", "with", "isoniazid", ",", "rifampicin", ",", "pyrazinamide", "and", "ethambutol", "was", "started", ".", "During", "the", "first", "days", "of", "treatment", ",", "the", "fever", "disappeared", "and", "the", "patient", "'", "s", "general", "condition", "improved", ".", "However", ",", "on", "the", "fourth", "day", ",", "fever", "and", "asthenia", "reappeared", ",", "and", "he", "developed", "jaundiced", "skin", "and", "mucous", "membranes", ".", "Bilirubin", "increased", "to", "6", ".", "45", "mg", "/", "dL", ",", "with", "an", "increase", "in", "alkaline", "phosphatase", "and", "GGT", ",", "but", "no", "increase", "in", "cytolysis", "enzymes", ".", "Suspicion", "of", "rifampicin", "toxicity", "led", "to", "discontinuation", "of", "the", "tuberculostatics", ".", "After", "that", ",", "the", "patient", "continued", "with", "a", "persistent", "but", "well-tolerated", "fever", "of", "around", "38oC", ",", "and", "with", "an", "analytical", "improvement", "in", "liver", "function", "parameters", ",", "with", "a", "progressive", "decrease", "in", "cholestasis", "parameters", ".", "Several", "days", "later", ",", "once", "the", "analytical", "parameters", "had", "normalised", ",", "it", "was", "decided", "to", "restart", "the", "tuberculostatic", "treatment", ",", "progressively", "introducing", "the", "drugs", ",", "without", "using", "rifampicin", "this", "time", ".", "Treatment", "was", "started", "with", "isoniazid", ",", "which", "was", "well", "tolerated", ",", "so", "pyrazinamide", ",", "ethambutol", "and", "streptomycin", "were", "added", "a", "week", "later", ".", "Despite", "treatment", ",", "the", "patient", "continued", "in", "a", "similar", "situation", ",", "with", "daily", "fever", "and", "night", "sweats", ",", "although", "well", "tolerated", ",", "without", "any", "device", "symptoms", ".", "Therefore", ",", "naproxen", "was", "added", "to", "the", "treatment", ",", "after", "which", "the", "fever", "disappeared", ",", "and", "the", "patient", "was", "discharged", "for", "follow-up", "consultations", ".", "After", "discharge", ",", "M", ".", "tuberculosis", "was", "found", "to", "grow", "in", "blood", "cultures", "for", "mycobacteria", ",", "resistant", "only", "to", "streptomycin", ",", "which", "was", "withdrawn", "from", "treatment", ".", "The", "patient", "was", "treated", "with", "tuberculostatics", "for", "one", "year", "with", "complete", "resolution", "of", "the", "clinical", "picture", ".", "Final", "diagnosis", "Disseminated", "tuberculosis", "in", "a", "patient", "with", "HIV", "infection", "with", "splenic", "microabscess", "formation", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "HCV", "label": "SPECIES", "start": 62, "end": 65 }, { "text": "HCV", "label": "SPECIES", "start": 334, "end": 337 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 54, "end": 57 }, { "text": "antiretroviral", "label": "SPECIES", "start": 181, "end": 195 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 81, "end": 88 }, { "text": "male", "label": "HUMAN", "start": 37, "end": 41 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 145, "end": 150 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 369, "end": 374 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 416, "end": 421 }, { "text": "immunovirological", "label": "SPECIES", "start": 91, "end": 108 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 908, "end": 915 }, { "text": "Clostridium difficile", "label": "SPECIES", "start": 2258, "end": 2279 }, { "text": "Toxoplasma gondii", "label": "SPECIES", "start": 2212, "end": 2229 }, { "text": "parasites", "label": "SPECIES", "start": 2290, "end": 2299 }, { "text": "syphilis", "label": "SPECIES", "start": 2199, "end": 2207 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3491, "end": 3498 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3996, "end": 4003 }, { "text": "microorganisms", "label": "SPECIES", "start": 4212, "end": 4226 }, { "text": "Histoplasma capsulatum", "label": "SPECIES", "start": 4274, "end": 4296 }, { "text": "Leishmania", "label": "SPECIES", "start": 4299, "end": 4309 }, { "text": "Candida albicans", "label": "SPECIES", "start": 4312, "end": 4328 }, { "text": "Salmonella", "label": "SPECIES", "start": 4331, "end": 4341 }, { "text": "Shigella", "label": "SPECIES", "start": 4344, "end": 4352 }, { "text": "Campylobacter jejuni", "label": "SPECIES", "start": 4355, "end": 4375 }, { "text": "Campylobacter", "label": "SPECIES", "start": 4355, "end": 4368 }, { "text": "Pneumocystis jirovecii", "label": "SPECIES", "start": 4378, "end": 4400 }, { "text": "Coccidioides", "label": "SPECIES", "start": 4403, "end": 4415 }, { "text": "Toxoplasmagondii", "label": "SPECIES", "start": 4418, "end": 4434 }, { "text": "Aspergillus", "label": "SPECIES", "start": 4437, "end": 4448 }, { "text": "Mycobacterium tuberculosis", "label": "SPECIES", "start": 4451, "end": 4477 }, { "text": "Mycobacterium avium complex", "label": "SPECIES", "start": 4480, "end": 4507 }, { "text": "bacterial", "label": "SPECIES", "start": 6530, "end": 6539 }, { "text": "mycobacteria", "label": "SPECIES", "start": 6393, "end": 6405 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 6816, "end": 6823 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 6946, "end": 6953 }, { "text": "patients", "label": "HUMAN", "start": 6620, "end": 6628 }, { "text": "M. avium", "label": "SPECIES", "start": 6550, "end": 6558 }, { "text": "M. tuberculosis", "label": "SPECIES", "start": 6876, "end": 6891 }, { "text": "smear microscopy", "label": "SPECIES", "start": 7076, "end": 7092 }, { "text": "mycobacteria", "label": "SPECIES", "start": 7041, "end": 7053 }, { "text": "microorganisms", "label": "SPECIES", "start": 7114, "end": 7128 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 7303, "end": 7310 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 7674, "end": 7681 }, { "text": "tuberculostatic", "label": "SPECIES", "start": 7968, "end": 7983 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 8225, "end": 8232 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 8447, "end": 8454 }, { "text": "mycobacteria", "label": "SPECIES", "start": 8572, "end": 8584 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 8658, "end": 8665 }, { "text": "M. tuberculosis", "label": "SPECIES", "start": 8516, "end": 8531 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 8824, "end": 8827 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 8811, "end": 8818 } ]

[ "We", "present", "the", "case", "of", "a", "50-year-old", "man", "from", "Guinea", "Conakry", ",", "resident", "for", "nine", "years", "in", "Spain", ",", "HIV-positive", "and", "on", "antiretroviral", "treatment", "(", "TDF", "/", "FTC", "/", "EFV", ")", ".", "He", "had", "travelled", "to", "his", "country", "for", "four", "months", ",", "where", "he", "developed", "diarrhoea", "and", "abdominal", "pain", "that", "required", "hospital", "admission", ".", "He", "presented", "with", "CD4", "77", "/", "μL", ",", "Hb", "7", ".", "2", "g", "/", "dL", ",", "normal", "abdominal", "ultrasound", ",", "negative", "stool", "culture", "and", "parasites", ".", "He", "received", "empirical", "treatment", "with", "clarithromycin", ",", "amoxicillin", ",", "fluconazole", ",", "cotrimoxazole", "and", "omeprazole", "with", "improvement", ".", "ART", "was", "changed", "to", "AZT", "/", "3TC", "and", "LPV", "/", "r", ".", "Three", "months", "after", "his", "return", "to", "Spain", ",", "he", "started", "a", "new", "two-week", "course", "of", "symptoms", "with", "4-8", "liquid", "stools", "without", "pathological", "products", ",", "nausea", ",", "epi-mesogastric", "pain", ",", "prostration", "and", "loss", "of", "10", "kg", ".", "On", "admission", "he", "had", "hypotension", ",", "creatinine", "1", ".", "7", "mg", "/", "dl", ",", "eosinophils", "5", ",", "260", "/", "μL", ",", "CD4", "211", "/", "μL", "and", "HIV", "viraemia", "1100", "/", "ml", ".", "Stool", "cultures", ",", "Giardia", "and", "Entamoeba", "histolytica", "antigens", ",", "parasites", "and", "Cryptosporidium", "stain", "in", "stool", ",", "thick", "drop", ",", "microfilariae", "in", "blood", "and", "multiple", "serologies", "were", "negative", ".", "Sequential", "empirical", "treatment", "with", "ceftriaxone", ",", "metronidazole", ",", "cotrimoxazole", ",", "albendazole", ",", "praziquantel", "and", "ivermectin", "was", "started", ",", "with", "clinical", "improvement", ".", "Gastroscopy", "and", "colonoscopy", "were", "performed", "with", "biopsies", "without", "alterations", ".", "On", "discharge", ",", "ART", "was", "changed", "to", "DTG", "/", "ABC", "/", "3TC", "and", "prophylactic", "daily", "cotrimoxazole", "was", "maintained", ".", "As", "eosinophilia", "persisted", ",", "the", "dose", "of", "cotrimoxazole", "was", "reduced", "and", "two", "weeks", "later", "he", "was", "admitted", "again", "for", "the", "same", "symptoms", "as", "before", ".", "This", "time", "Cystoisospora", "belli", "oocysts", "were", "visualised", "in", "the", "stool", ",", "and", "the", "condition", "improved", "rapidly", "after", "a", "new", "course", "of", "cotrimoxazole", "and", "prolonged", "secondary", "prophylaxis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "ART", "label": "SPECIES", "start": 523, "end": 526 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 96, "end": 99 }, { "text": "antiretroviral", "label": "SPECIES", "start": 116, "end": 130 }, { "text": "parasites", "label": "SPECIES", "start": 386, "end": 395 }, { "text": "Cryptosporidium", "label": "SPECIES", "start": 949, "end": 964 }, { "text": "Entamoeba histolytica", "label": "SPECIES", "start": 903, "end": 924 }, { "text": "Giardia", "label": "SPECIES", "start": 891, "end": 898 }, { "text": "ART", "label": "SPECIES", "start": 1307, "end": 1310 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 853, "end": 856 }, { "text": "microfilariae", "label": "SPECIES", "start": 993, "end": 1006 }, { "text": "parasites", "label": "SPECIES", "start": 935, "end": 944 }, { "text": "viraemia", "label": "SPECIES", "start": 857, "end": 865 }, { "text": "Cystoisospora belli oocysts", "label": "SPECIES", "start": 1541, "end": 1568 } ]

[ "Reason", "for", "consultation", "Weakness", "in", "the", "lower", "limbs", ".", "Individual", "approach", "(", "anamnesis", ",", "examination", ",", "complementary", "tests", ")", ".", "Male", ",", "27", "years", "old", ".", "Chronic", "renal", "disease", "and", "malignant", "hypertension", ".", "Living", "donor", "renal", "transplant", ".", "Anamnesis", ":", "patient", "attended", "the", "primary", "care", "emergency", "department", "due", "to", "a", "progressive", "decrease", "in", "muscle", "strength", "in", "the", "lower", "limbs", ",", "especially", "when", "standing", "upright", ",", "accompanied", "by", "intermittent", "myalgias", ".", "At", "the", "beginning", "of", "this", "clinical", "picture", ",", "the", "patient", "relates", "it", "to", "stiffness", "due", "to", "physical", "exercise", ".", "Progressively", ",", "the", "weakness", "progresses", "towards", "the", "proximal", "area", "producing", "weakness", "in", "the", "hands", ".", "Currently", "with", "weakness", "on", "ambulation", ",", "he", "is", "unable", "to", "stand", "on", "his", "own", ".", "Three", "weeks", "ago", "she", "had", "gastroenteritis", "with", "diarrhoea", "and", "fever", "of", "38oC", "for", "two", "days", ",", "which", "self-limited", ".", "No", "traumatic", "history", ".", "No", "loss", "of", "sensibility", ".", "Afebrile", ".", "Physical", "examination", ":", "Glasgow", "15", "/", "15", ".", "PINLA", ".", "No", "campimetric", "alterations", "by", "confrontation", ".", "EOMs", "present", ",", "rest", "of", "cranial", "nerves", "preserved", ".", "No", "sensory", "alterations", ".", "Not", "able", "to", "get", "up", "from", "the", "chair", ",", "even", "with", "support", ",", "requires", "help", ".", "Walking", "possible", "with", "assistance", ",", "although", "hampered", "by", "bilateral", "steppage", ".", "He", "does", "not", "stand", "on", "heels", "or", "tiptoes", ".", "Muscle", "balance", "(", "D", "/", "I", ")", ":", "deltoid", "4", "/", "4", ",", "biceps", "+", "4", "/", "+", "4", ",", "triceps", "4", "/", "4", ",", "carpal", "extensors", "4", "+", "/", "4", "+", ",", "carpal", "flexors", "4", "/", "4", ",", "interosseus", "3", "/", "3", ".", "In", "lower", "limbs", "(", "D", "/", "I", ")", ":", "Psoas", "4", "+", "/", "4", "+", ",", "biceps", "femoris", "3", "+", "/", "3", "+", ",", "quadriceps", "does", "not", "reach", "full", "range", "of", "motion", "(", "2", "/", "2", ")", ",", "tibialis", "anterior", "2", "/", "1", ",", "plantar", "flexion", "2", "/", "2", ",", "extensor", "digitorum", "longus", "first", "toe", "2", "/", "2", ".", "No", "hoffman", "or", "clonus", ".", "Bilateral", "flexor", "PCR", ".", "Bicipitals", "present", "normally", ".", "Radialis", "hypoactive", ".", "Patellar", "normal", ".", "I", "do", "not", "obtain", "Achilles", ".", "Family", "and", "community", "approach", "Independent", "for", "basic", "activities", "of", "daily", "living", ".", "Teacher", "studying", "for", "competitive", "examinations", "and", "doing", "a", "master", "'", "s", "degree", "in", "languages", ".", "Lives", "with", "parents", ".", "Medium-high", "socio-cultural", "level", ".", "Clinical", "judgement", "(", "list", "of", "problems", ",", "differential", "diagnosis", ")", "Acute", "inflammatory", "demyelinating", "demyelinating", "polyradiculoneuropathy", "(", "Guillain", "Barré", "Syndrome", ")", ".", "Action", "plan", "and", "evolution", "Given", "the", "history", "of", "acute", "gastroenteritis", "and", "the", "current", "neurological", "symptoms", ",", "Guillain", "Barré", "Syndrome", "was", "suspected", "and", "the", "patient", "was", "referred", "to", "the", "emergency", "department", ".", "Cranial", "CT", "scan", "was", "performed", "and", "found", "to", "be", "normal", ".", "CSF", ":", "Biochemistry", ":", "cells", "1", ",", "proteins", "47", ",", "micro", "CSF", ":", "normal", ".", "CBC", ":", "Cr", "1", ".", "1", ",", "urea", "60", ",", "K", "3", ".", "4", ",", "syphilis", "serology", "negative", ",", "Anti-HBs", ",", "Anti", "HSV", "1", "and", "CMV", "positive", "Ig", "G", ",", "thyroid", "normal", ".", "Normal", "iron", ",", "b12", "and", "folic", "acid", ".", "ENG", ":", "predominantly", "motor", "and", "demyelinating", "polyneuropathy", ".", "The", "patient", "underwent", "a", "course", "of", "gamma", "globulins", "with", "improvement", ".", "At", "present", "he", "continues", "to", "undergo", "rehabilitation", "and", "functional", "limitation", "persists", "with", "alterations", "in", "gait", "and", "limitation", "in", "both", "hands", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Male", "label": "HUMAN", "start": 121, "end": 125 }, { "text": "donor", "label": "HUMAN", "start": 198, "end": 203 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 234, "end": 241 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 477, "end": 484 }, { "text": "Family", "label": "HUMAN", "start": 1671, "end": 1677 }, { "text": "parents", "label": "HUMAN", "start": 1850, "end": 1857 }, { "text": "Teacher", "label": "HUMAN", "start": 1751, "end": 1758 }, { "text": "Anti-HBs", "label": "SPECIES", "start": 2429, "end": 2437 }, { "text": "CMV", "label": "SPECIES", "start": 2454, "end": 2457 }, { "text": "HSV 1", "label": "SPECIES", "start": 2444, "end": 2449 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2208, "end": 2215 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2585, "end": 2592 }, { "text": "syphilis", "label": "SPECIES", "start": 2401, "end": 2409 } ]

[ "We", "present", "the", "case", "of", "a", "37-year-old", "woman", ",", "with", "the", "only", "clinical", "history", "of", "anxious-depressive", "syndrome", "treated", "with", "lorazepam", "and", "fluoxetine", ",", "who", "consulted", "the", "emergency", "department", "a", "week", "after", "suffering", "a", "tonsillar", "process", "manifested", "with", "odynophagia", "and", "treated", "with", "antibiotherapy", "by", "her", "primary", "care", "physician", ",", "with", "a", "sensation", "of", "numbness", "in", "the", "left", "hemibody", ",", "diplopia", "and", "gait", "instability", ".", "In", "view", "of", "these", "symptoms", ",", "a", "cranial", "CAT", "scan", "was", "performed", ",", "which", "was", "normal", ",", "and", "the", "patient", "was", "discharged", ".", "However", ",", "at", "home", "there", "was", "a", "progressive", "worsening", "of", "the", "symptoms", ",", "with", "a", "generalised", "sensation", "of", "numbness", ",", "inability", "to", "ambulate", "and", "diplopia", ",", "for", "which", "reason", "she", "was", "admitted", "to", "the", "hospital", "ward", ".", "After", "24", "hours", "of", "admission", "she", "continued", "to", "worsen", ",", "with", "the", "appearance", "of", "intense", "somnolence", ",", "disorientation", ",", "bilateral", "ophthalmoparesis", "(", "with", "ptosis", "and", "limitation", "of", "all", "eye", "movements", ")", "and", "predominantly", "crural", "tetraparesis", ",", "with", "bilateral", "Babinski", ";", "in", "this", "situation", "the", "patient", "was", "transferred", "to", "the", "Intensive", "Care", "Unit", ",", "requiring", "orotracheal", "intubation", ".", "Complementary", "tests", "-", "Haemogram", "and", "biochemistry", "with", "no", "significant", "alterations", ".", "Anti-NMDA", "and", "anti-acetylcholine", "receptor", "negative", ".", "Negative", "antiganglioside", "antibodies", "(", "including", "antiGQ1B", ")", ".", "-", "CSF", ":", "normal", "biochemistry", ".", "PCR", "of", "enterovirus", ",", "Herpes", "virus", "and", "Varicella", "Zoster", "negative", ".", "Bacterial", "and", "fungal", "cultures", "negative", ".", "BAAR", "negative", ".", "-", "Cranial", "CT", "scan", ":", "normal", ".", "-", "Cranial", "MRI", ":", "normal", ".", "-", "Control", "cranial", "MRI", "(", "performed", "2", "weeks", "after", "admission", ")", ":", "no", "significant", "alterations", "in", "the", "trunk", "or", "cerebellum", ".", "Faint", "symmetrical", "focal", "images", "of", "increased", "signal", "in", "Flair", "can", "be", "seen", "at", "the", "level", "of", "both", "internal", "capsules", ",", "without", "restriction", "in", "diffusion", ",", "as", "well", "as", "other", "subcortical", "images", "at", "the", "parietooccipital", "level", "of", "similar", "characteristics", ",", "of", "a", "non-specific", "nature", ".", "-", "Cervical", "spine", "MRI", ":", "discrete", "posterior", "disc", "protrusions", "at", "the", "level", "of", "C5-C6", "and", "C6-C7", ".", "-", "Electrophysiological", "study", ":", "normal", ".", "-", "Control", "electrophysiological", "study", ":", "sensory", ",", "motor", "and", "F-response", "conduction", "of", "both", "MMII", "normal", ".", "F", "of", "both", "MMII", "normal", ".", "EEG", ":", "slowed", "bioelectrical", "activity", "of", "medium", "voltage", "without", "other", "superimposed", "anomalies", ".", "Single", "fibre", "EMG", ":", "normal", "study", ".", "VEPs", ":", "normal", "study", ".", "Calculation", "of", "VA", "of", "OI", ":", "1", ".", "Evolution", "The", "patient", "was", "admitted", "to", "the", "ICU", "for", "2", "weeks", ",", "where", "she", "evolved", "favourably", "in", "relation", "to", "the", "clinical", "picture", "described", "above", ".", "When", "she", "returned", "to", "the", "conventional", "hospital", "ward", ",", "she", "was", "conscious", "and", "alert", ",", "with", "complete", "ophthalmoparesis", "and", "left", "ptosis", ",", "limitation", "of", "bilateral", "horizontal", "and", "vertical", "gaze", "in", "the", "left", "eye", ",", "without", "nystagmus", ".", "In", "addition", ",", "tetraparesis", "of", "intensity", "4", "/", "5", "in", "upper", "limbs", "and", "3", "/", "5", "in", "lower", "limbs", ",", "ROT", "somewhat", "alive", "in", "upper", "limbs", ",", "weak", "patellar", "and", "conserved", "Achilles", ",", "right", "Babinski", ",", "and", "indifferent", "left", "plantar", "cutaneous", "reflex", ".", "In", "the", "following", "days", "he", "continued", "to", "progress", "favourably", ",", "and", "the", "tracheostomy", "was", "closed", "without", "incident", ",", "with", "progressive", "recovery", "of", "the", "motor", "deficit", ",", "returning", "to", "being", "able", "to", "ambulate", ",", "and", "with", "slow", "improvement", "of", "the", "ophthalmoplegia", ",", "but", "with", "persistent", "left", "palpebral", "ptosis", "and", "limitation", "of", "the", "upper", "vertical", "gaze", "in", "the", "left", "eye", ".", "Diagnosis", "Bickerstaff", "'", "s", "encephalitis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 37, "end": 42 }, { "text": "primary care physician", "label": "HUMAN", "start": 294, "end": 316 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 487, "end": 494 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 988, "end": 995 }, { "text": "BAAR", "label": "SPECIES", "start": 1399, "end": 1403 }, { "text": "Varicella Zoster", "label": "SPECIES", "start": 1332, "end": 1348 }, { "text": "Herpes virus", "label": "SPECIES", "start": 1315, "end": 1327 }, { "text": "enterovirus", "label": "SPECIES", "start": 1302, "end": 1313 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2281, "end": 2288 } ]

[ "This", "is", "a", "25", "year", "old", "woman", ",", "born", "and", "resident", "in", "Barcelona", ",", "single", ",", "who", "is", "admitted", "to", "the", "Dual", "Pathology", "Unit", "referred", "by", "her", "referral", "psychiatrist", "(", "CAS", ")", ",", "to", "stop", "the", "consumption", "of", "cannabis", "and", "alcohol", "and", "for", "psychopathological", "stabilisation", ".", "REASON", "FOR", "CONSULTATION", "Somatic", ":", "No", "AMC", ".", "Burn", "injuries", "in", "the", "internal", "area", "of", "both", "EESS", "(", "boiling", "water", ")", ".", "One", "miscarriage", "at", "the", "age", "of", "21", "(", "ectopic", "pregnancy", ")", ".", "Psychiatric", "history", ":", "First", "contact", "with", "mental", "health", "at", "age", "18", "for", "anxious", "symptomatology", "in", "relation", "to", "difficulties", "in", "fulfilling", "household", "chores", ".", "Diagnosed", "with", "OCD", "and", "major", "depressive", "disorder", "three", "years", "ago", ",", "following", "the", "death", "of", "her", "brother", ".", "Paroxetine", "60", "mg", "/", "day", ",", "pregabalin", "300mg", "/", "day", "and", "benzodiazepines", ".", "He", "stopped", "treatment", "due", "to", "improvement", ".", "One", "admission", "in", "November", "2009", "for", "suicidal", "ideation", "and", "obsessive", "thoughts", "(", "two", "months", "ago", ")", ".", "PERSONAL", "HISTORY", "Tobacco", ":", "At", "the", "age", "of", "11", ".", "Current", "consumption", "12", "cigarettes", "/", "day", ".", "Cannabis", ":", "Beginning", "at", "the", "age", "of", "12", ",", "pattern", "of", "abuse", ",", "without", "interruption", "and", "progressive", "up", "to", "the", "current", "consumption", "of", "20", "joints", "/", "day", ".", "Alcohol", ":", "From", "age", "14", ",", "high", "alcoholic", "drinks", ".", "Weekends", "(", "heavy", "binge", "drinking", ")", ",", "irregular", "pattern", "of", "consumption", "with", "periods", "of", "higher", "/", "lower", "consumption", ".", "Maximum", "abstinence", "interval", "2", "months", "last", "summer", ".", "Since", "then", "daily", "consumption", "of", "1", "litre", "of", "wine", "/", "day", ".", "Cocaine", ":", "at", "the", "age", "of", "18", ",", "endonasally", ".", "Period", "of", "abstinence", "of", "1", "year", "following", "the", "death", "of", "her", "brother", ".", "Relapsed", "a", "year", "and", "a", "half", "ago", ",", "with", "6", "months", "abstinence", "before", "current", "admission", ".", "LSD", ":", "occasional", ",", "at", "the", "age", "of", "18", ".", "GHB", "(", "liquid", "ecstasy", ")", ":", "at", "the", "age", "of", "18", ",", "weekend", "use", ",", "remission", "5", "years", "ago", ".", "TOXICOLOGICAL", "HISTORY", "Polydrug", "addict", "brother", "(", "heroin", "and", "cocaine", "by", "parenteral", "route", ",", "BZD", ",", "alcohol", ")", ",", "died", "at", "27", "years", "of", "age", "from", "cardiorespiratory", "arrest", "in", "the", "presence", "of", "the", "patient", ".", "Probable", "co-morbid", "affective", "disorder", ".", "Paternal", "uncle", "with", "a", "history", "of", "cocaine", "and", "heroin", "use", ",", "currently", "in", "sustained", "remission", ".", "Father", "with", "alcohol", "dependence", "disorder", ".", "Bipolar", "disorder", "in", "paternal", "aunt", ".", "FAMILY", "HISTORY", "Coinciding", "with", "the", "abandonment", "of", "the", "pharmacological", "treatment", "she", "had", "started", "a", "year", "and", "a", "half", "earlier", ",", "she", "presented", "an", "increase", "in", "compulsive", "checking", "behaviours", "(", "gas", ",", "cleaning", ")", ",", "and", "a", "need", "for", "order", "and", "symmetry", ",", "accompanied", "by", "a", "decrease", "in", "mood", ",", "episodes", "of", "crying", "and", "thoughts", "related", "to", "the", "death", "of", "her", "brother", ",", "her", "own", "death", "and", "unstructured", "suicidal", "ideation", ",", "all", "of", "this", "progressively", "over", "the", "course", "of", "two", "months", ".", "Her", "psychiatrist", "at", "the", "CAS", "referred", "her", "to", "stop", "the", "use", "of", "cannabis", "and", "alcohol", "and", "for", "psychopathological", "stabilisation", ".", "CURRENT", "ILLNESS", "She", "is", "the", "fifth", "of", "6", "siblings", ",", "all", "boys", ".", "yChildhood", ":", "Normal", "psychomotor", "development", ",", "at", "school", "she", "was", "\"", "restless", "\"", ".", "Conflictual", "family", "environment", "(", "alcoholic", "father", ")", ".", "Tendency", "to", "ruminative", "thinking", ".", "Low", "academic", "performance", ".", "Low", "level", "of", "schooling", ".", "Sociability", ".", "Adolescence", ":", "On", "two", "occasions", "he", "has", "lived", "outside", "the", "original", "family", "nucleus", ".", "Began", "cocaine", "use", "with", "first", "partner", "at", "18", "years", "of", "age", ".", "First", "contact", "with", "mental", "health", ".", "Met", "current", "boyfriend", "5", "years", "ago", ".", "Occasional", "low-skilled", "work", ".", "Currently", "lives", "with", "her", "mother", ",", "brother", "and", "his", "partner", ".", "Death", "of", "brother", "in", "2007", ",", "at", "home", "(", "addicted", "to", "heroin", "and", "cocaine", ",", "joints", ".", "Possible", "co-morbid", "affective", "disorder", ".", "PSYCHOBIOGRAPHY", "Physical", "examination", ":", "Skin", "lesions", "in", "EESS", ".", "No", "other", "noteworthy", "findings", ".", "Psychopathological", "examination", ":", "Conscious", "and", "self", "and", "allopsychically", "oriented", ".", "Physical", "appearance", "preserved", ".", "Spontaneous", ",", "coherent", "speech", ".", "Subjectively", "and", "objectively", "calm", ".", "Ruminative", "thoughts", "about", "the", "death", "of", "her", "brother", ".", "Rituals", "of", "checking", "(", "gas", ",", "under", "the", "bed", ")", "and", "cleanliness", "and", "symmetry", ".", "No", "delusional", "ideation", "of", "any", "kind", ".", "Denies", "thoughts", "of", "death", "or", "suicidal", "ideation", "at", "admission", ".", "Reactive", "mood", ",", "mixed", "mood", ",", "with", "oscillations", "ranging", "from", "sadness", "and", "crying", "to", "irritability", ",", "described", "as", "\"", "depression", "\"", ".", "Floating", "anxiety", ".", "Impulsivity", ".", "Sleep", "and", "appetite", "preserved", ".", "No", "alterations", "in", "psychomotor", "skills", "or", "sensory", "perception", ".", "PSYCHOPATHOLOGICAL", "EXAMINATION", "General", "analyses", ":", "No", "biochemical", "or", "hydroelectrolytic", "alterations", "of", "note", ".", "Negative", "serologies", ".", "Millon", "Clinical", "Multiaxial", "Inventory-II", ":", "High", "scores", "in", "phobic", "/", "avoidant", ",", "dependent", ",", "compulsive", "/", "rigid", "traits", ".", "SCID-II", ":", "High", "score", "for", "obsessive", "and", "dependent", "traits", ".", "Borderline", "traits", ".", "OCI-R", ":", "High", "score", "for", "hoarding", "behaviours", ",", "need", "for", "order", ",", "checking", ".", "E", ".", "COMPLEMENTARY", "Diagnostic", "orientation", ":", "Cannabis", "dependence", "disorder", ".", "Alcohol", "dependence", "disorder", ".", "Obsessive", "compulsive", "disorder", "?", "Treatment", ":", "Clomipramine", "75mg", "/", "day", "(", "in", "ascending", "doses", ")", ".", "B-complex", "vitamin", "supplements", "Clonazepam", "1", ".", "5mg", "/", "day", "Quetiapine", "100mg", "/", "day", "DIAGNOSIS", "AND", "TREATMENT", "During", "admission", ",", "inappropriate", "behaviour", ",", "excessive", "familiarity", "and", "\"", "compassionate", "\"", "attitude", "towards", "other", "patients", ".", "Inappropriate", "affection", "\"", "cries", "for", "other", "sick", "people", "\"", ".", "He", "presents", "paroxysms", "of", "psychophysical", "anxiety", "(", "feeling", "of", "suffocation", ",", "palpitations", ")", "which", "sometimes", "subside", "with", "verbal", "restraint", ".", "As", "the", "days", "go", "by", ",", "he", "mobilises", "the", "other", "patients", "(", "they", "come", "to", "the", "infirmary", "to", "say", "that", "\"", "he", "is", "crying", "in", "the", "courtyard", "\"", ")", ".", "Affective", "ambivalence", ",", "incontinence", ".", "Changes", "in", "treatment", "with", "introduction", "of", "valproate", "but", "clomipramine", "is", "maintained", ".", "Quetiapine", ".", "Begins", "behaviour", "of", "excessive", "familiarity", "and", "sexual", "approaches", "with", "another", "patient", ".", "Persists", "in", "puerile", "behaviour", ",", "teasing", ",", "unmotivated", "laughter", ".", "She", "asks", "to", "be", "left", "in", "bed", "because", "she", "has", "a", "fever", "(", "36o", ")", ".", "Frank", "manic", "picture", "with", "pseudomania", "and", "disjointed", "speech", ",", "bizarre", "behaviour", ",", "laughter", ",", "insults", ",", "facial", "tics", ",", "muscular", "rigidity", ".", "Mechanical", "and", "pharmacological", "containment", "with", "olanzapine", "IM", ".", "Treatment", "with", "clomipramine", "was", "discontinued", ".", "COURSE", "AND", "EVOLUTION", "Discontinuation", "of", "clomipramine", "and", "adjustment", "of", "the", "dose", "of", "valproate", "to", "1", ",", "200mg", "/", "day", ".", "Explains", "progressive", "insomnia", "until", "the", "moment", "of", "decompensation", ".", "Feeling", "of", "irritability", "and", "verbal", "aggressiveness", "towards", "peers", ".", "Episodes", "that", "had", "happened", "before", ",", "always", "with", "previous", "sensation", "of", "fever", ".", "Progressive", "improvement", "until", "reaching", "euthymia", ".", "Psychopathological", "stabilisation", "Discharge", "Alcohol", "dependence", "disorder", "Cannabis", "dependence", "disorder", "Obsessive", "compulsive", "disorder", "Bipolar", "disorder", "most", "recent", "manic", "episode", "Personality", "disorder", "(", "obsessive", ",", "histrionic", ",", "borderline", ",", "dependent", ")", "DIFFERENTIAL", "DIAGNOSIS", "Cannabis", "dependence", "disorder", "Alcohol", "dependence", "disorder", "Bipolar", "disorder", "type", "I", ",", "most", "recent", "manic", "episode", "Obsessive", "personality", "disorder", "Treatment", "at", "discharge", ":", "Valproate", "1", ",", "200mg", "/", "day", "Olanzapine", "10mg", "Antabus", "1c", ".", "/", "day", "DISCHARGE", "DIAGNOSES" ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "cannabis", "label": "SPECIES", "start": 184, "end": 192 }, { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 22, "end": 27 }, { "text": "psychiatrist", "label": "HUMAN", "start": 137, "end": 149 }, { "text": "brother", "label": "HUMAN", "start": 653, "end": 660 }, { "text": "PERSONAL", "label": "HUMAN", "start": 862, "end": 870 }, { "text": "Tobacco", "label": "SPECIES", "start": 879, "end": 886 }, { "text": "Cannabis", "label": "SPECIES", "start": 945, "end": 953 }, { "text": "brother", "label": "HUMAN", "start": 1440, "end": 1447 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1823, "end": 1830 }, { "text": "brother", "label": "HUMAN", "start": 1682, "end": 1689 }, { "text": "Paternal uncle", "label": "HUMAN", "start": 1871, "end": 1885 }, { "text": "Father", "label": "HUMAN", "start": 1962, "end": 1968 }, { "text": "paternal aunt", "label": "HUMAN", "start": 2023, "end": 2036 }, { "text": "FAMILY", "label": "HUMAN", "start": 2039, "end": 2045 }, { "text": "cannabis", "label": "SPECIES", "start": 2545, "end": 2553 }, { "text": "brother", "label": "HUMAN", "start": 2369, "end": 2376 }, { "text": "psychiatrist", "label": "HUMAN", "start": 2489, "end": 2501 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 2753, "end": 2759 }, { "text": "father", "label": "HUMAN", "start": 2783, "end": 2789 }, { "text": "siblings", "label": "HUMAN", "start": 2647, "end": 2655 }, { "text": "Adolescence", "label": "HUMAN", "start": 2888, "end": 2899 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 2952, "end": 2958 }, { "text": "partner", "label": "HUMAN", "start": 2997, "end": 3004 }, { "text": "partner", "label": "HUMAN", "start": 3172, "end": 3179 }, { "text": "brother", "label": "HUMAN", "start": 3156, "end": 3163 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 3148, "end": 3154 }, { "text": "boyfriend", "label": "HUMAN", "start": 3071, "end": 3080 }, { "text": "brother", "label": "HUMAN", "start": 3190, "end": 3197 }, { "text": "brother", "label": "HUMAN", "start": 3606, "end": 3613 }, { "text": "Cannabis", "label": "SPECIES", "start": 4449, "end": 4457 }, { "text": "patients", "label": "HUMAN", "start": 4800, "end": 4808 }, { "text": "sick", "label": "HUMAN", "start": 4851, "end": 4855 }, { "text": "patients", "label": "HUMAN", "start": 5041, "end": 5049 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5335, "end": 5342 }, { "text": "Cannabis", "label": "SPECIES", "start": 6140, "end": 6148 }, { "text": "Cannabis", "label": "SPECIES", "start": 6334, "end": 6342 } ]

[ "HISTORY", ",", "CURRENT", "ILLNESS", "AND", "PHYSICAL", "EXAMINATION", "A", "26-year-old", "man", "was", "admitted", "with", "chest", "pain", "and", "elevated", "markers", "of", "myocardial", "damage", ".", "PERSONAL", "HISTORY", "Baseline", ":", "native", "of", "Colombia", ".", "Resident", "in", "Spain", "for", "the", "last", "month", ".", "Works", "as", "a", "gardener", ".", "No", "known", "drug", "allergies", ".", "No", "cardiovascular", "risk", "factors", ".", "No", "toxic", "habits", ".", "No", "personal", "or", "family", "cardiological", "history", ".", "Surgical", "interventions", ":", "splenectomy", "after", "traffic", "accident", ".", "Previous", "medication", ":", "none", ".", "CURRENT", "DISEASE", "Asymptomatic", "patient", "from", "the", "cardiovascular", "point", "of", "view", ",", "who", "two", "weeks", "before", "admission", "started", "episodes", "of", "oppressive", "central", "thoracic", "pain", "radiating", "to", "both", "jaws", ",", "unrelated", "to", "exercise", "or", "respiratory", "movements", ".", "No", "vegetative", "cortex", "associated", ".", "Self-limited", "cessation", "of", "these", "episodes", "within", "a", "few", "minutes", ".", "He", "also", "reported", "non-specific", "dizziness", "and", "occasional", "dystrophic", "sensation", ",", "without", "thermometric", "fever", ".", "No", "palpitations", ",", "dyspnoea", "or", "syncopal", "symptoms", ".", "No", "previous", "infectious", "clinical", "manifestations", ".", "PHYSICAL", "EXAMINATION", "Afebrile", ",", "blood", "pressure", "106", "/", "62", "mmHg", ",", "heart", "rate", "60", "bpm", ",", "baseline", "O2", "saturation", "98", "%", ",", "referred", "weight", "70", "kg", ".", "Conscious", ",", "oriented", "and", "cooperative", ".", "Well", "hydrated", "and", "perfused", ".", "Good", "general", "condition", ".", "Eupneic", "at", "rest", ".", "Jugular", "venous", "pressure", "normal", ".", "No", "palpable", "lymph", "nodes", ".", "Cardiac", "auscultation", ":", "rhythmic", "without", "murmurs", "or", "rubbing", ".", "Pulmonary", "auscultation", ":", "respiratory", "sounds", "were", "preserved", "with", "no", "over-additions", ".", "Abdomen", ":", "soft", ",", "depressible", "and", "non-painful", ".", "No", "masses", "or", "megaliths", "palpable", ".", "Peristalsis", "present", ".", "Lower", "extremities", ":", "no", "oedema", ".", "Distal", "pulses", "present", "and", "symmetrical", ".", "COMPLEMENTARY", "TESTS", "Electrocardiogram", ":", "sinus", "bradycardia", "at", "50", "bpm", ".", "Normal", "PR", ".", "Narrow", "QRS", ".", "Q", "wave", "at", "the", "limit", "of", "pathological", "significance", "and", "ST", "elevation", "0", ".", "5", "mm", "in", "the", "inferior", "face", ".", "Laboratory", "tests", "on", "admission", ":", "haemoglobin", "15", "g", "/", "dl", ",", "platelets", "350", ".", "000", "u", "/", "mm3", ",", "leukocytes", "11", ".", "3", "x103", "/", "mm3", "(", "neutrophils", "33", ".", "4", "%", "-", "3790", "u", "/", "l", ",", "lymphocytes", "31", ".", "4", "%", "-", "3560", "u", "/", "l", ",", "eosinophils", "27", ".", "7", "%", "-", "3150", "u", "/", "l", ")", ",", "basal", "glucose", "81", "mg", "/", "dl", ",", "urea", "23", "mg", "/", "dl", ",", "creatinine", "0", ".", "79", "mg", "/", "dl", ",", "sodium", "131", "mEq", "/", "l", ",", "potassium", "4", ".", "2", "mEq", "/", "l", ",", "conventional", "troponin", "I", "2", ".", "7", "ng", "/", "dl", "(", "normal", "<", "0", ".", "01", ")", ".", "Chest", "X-ray", ":", "normal", "cardio-thoracic", "index", ".", "No", "acute", "pleuroparenchymal", "lesions", ".", "Transthoracic", "echocardiogram", ":", "non-dilated", "left", "ventricle", ",", "normal", "thickness", ",", "no", "alterations", "in", "segmental", "contractility", ".", "Normal", "systolic", "function", "(", "biplane", "Simpson", "LVEF", "65", "%", ")", ".", "Hyperechogenic", "appearance", "of", "the", "inferolateral", "wall", "myocardium", "respecting", "the", "endocardium", ".", "Right", "ventricle", "of", "normal", "size", "with", "preserved", "systolic", "function", ".", "Mitral", "valve", "of", "normal", "appearance", "and", "function", ".", "Trivalve", "aortic", "valve", ",", "without", "insufficiency", "or", "stenosis", ".", "Tricuspid", "valve", "of", "normal", "appearance", ",", "with", "minimal", "insufficiency", ".", "Normal", "functioning", "pulmonary", "valve", ".", "Aortic", "root", "of", "normal", "size", ",", "no", "coarctation", ".", "No", "pericardial", "effusion", ".", "Cardio-MRI", ":", "ventricles", "of", "preserved", "size", "and", "function", ".", "Hypokinesia", ",", "oedema", "and", "late", "intramyocardial", "enhancement", "of", "subepicardial", "predominance", "in", "the", "inferolateral", "face", "are", "observed", ";", "findings", "that", "may", "be", "related", "to", "myocarditis", "in", "the", "appropriate", "clinical", "context", ".", "CT", "of", "coronary", "arteries", ":", "total", "calcium", "score", "according", "to", "Agatson", "index", "0", ".", "Coronary", "arteries", "without", "anatomical", "variants", ",", "with", "preserved", "patency", ",", "without", "thrombotic", "or", "stenotic", "images", ".", "CLINICAL", "EVOLUTION", "The", "patient", "was", "admitted", "to", "the", "coronary", "unit", "for", "monitoring", "and", "further", "complementary", "tests", ".", "As", "a", "specific", "cardiological", "test", ",", "a", "transthoracic", "echocardiogram", "was", "performed", ",", "which", "was", "normal", ",", "followed", "by", "cardiac", "magnetic", "resonance", "imaging", "(", "CMR", ")", ",", "which", "was", "found", "to", "be", "compatible", "with", "myocarditis", ".", "After", "48", "hours", "without", "development", "of", "arrhythmic", "complications", "or", "heart", "failure", ",", "he", "was", "transferred", "to", "the", "hospital", "ward", "for", "further", "care", "and", "to", "complete", "studies", ".", "The", "analysis", "on", "admission", "showed", "leukocytosis", "due", "to", "marked", "eosinophilia", "that", "persisted", "in", "subsequent", "analyses", ",", "so", "an", "assessment", "was", "requested", "by", "internal", "medicine", ",", "which", "expanded", "the", "battery", "of", "tests", "with", "autoimmunity", ",", "virus", "and", "infectious", "serology", ",", "which", "was", "positive", "for", "IgM", "Toxocara", "spp", ".", "Subsequently", ",", "a", "CT", "scan", "of", "the", "coronary", "arteries", "was", "requested", "to", "rule", "out", "embolisms", ",", "which", "was", "also", "normal", ".", "Suspicion", "of", "eosinophilic", "myocarditis", "secondary", "to", "Toxocara", "parasite", "infection", "led", "to", "treatment", "with", "albendazole", ".", "The", "patient", "had", "a", "good", "clinical", "evolution", "and", "was", "discharged", "from", "hospital", "after", "7", "days", "asymptomatic", ",", "with", "normalisation", "of", "myocardial", "damage", "markers", "and", "decreasing", "eosinophilia", ".", "DIAGNOSIS", "Eosinophilic", "myocarditis", "in", "the", "context", "of", "toxocariasis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "PERSONAL", "label": "HUMAN", "start": 141, "end": 149 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 324, "end": 332 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 336, "end": 342 }, { "text": "gardener", "label": "HUMAN", "start": 237, "end": 245 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 483, "end": 490 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3268, "end": 3275 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4243, "end": 4250 }, { "text": "virus", "label": "SPECIES", "start": 3944, "end": 3949 }, { "text": "Toxocara spp", "label": "SPECIES", "start": 4002, "end": 4014 }, { "text": "Toxocara", "label": "SPECIES", "start": 4002, "end": 4010 }, { "text": "Toxocara", "label": "SPECIES", "start": 4176, "end": 4184 } ]

[ "38", "year", "old", "patient", "from", "Luque", ",", "dressmaker", ",", "known", "hypertensive", "patient", "on", "irregular", "treatment", "with", "Losartan", "50", "mg", "/", "day", ".", "She", "has", "a", "gynaeco-obstetric", "history", "of", "three", "pregnancies", ",", "two", "births", ",", "one", "stillbirth", ",", "and", "refers", "that", "her", "mother", "has", "been", "a", "carrier", "of", "arthritis", "since", "the", "age", "of", "50", ".", "She", "reports", "a", "clinical", "picture", "of", "terebrante", "pain", "located", "in", "the", "interphalangeal", "joints", "radiating", "bilaterally", "and", "symmetrically", "to", "the", "wrist", "with", "signs", "of", "inflammation", "and", "functional", "impotence", ",", "predominantly", "in", "the", "morning", ",", "of", "11", "months", "of", "evolution", ";", "three", "months", "before", "admission", ",", "a", "feverish", "sensation", "was", "added", "to", "the", "picture", ",", "predominantly", "at", "night", ",", "with", "profuse", "sweating", "accompanied", "by", "progressive", "dyspnoea", ",", "first", "on", "moderate", "and", "then", "on", "mild", "exertion", ".", "Three", "weeks", "before", "admission", ",", "pain", "with", "the", "same", "characteristics", "migrated", "to", "the", "left", "ankle", "and", "became", "bilateral", "and", "symmetrical", ",", "and", "did", "not", "subside", "with", "common", "analgesics", ".", "Two", "weeks", "before", "admission", ",", "due", "to", "the", "persistence", "of", "the", "symptoms", ",", "she", "consulted", "a", "doctor", "who", "requested", "complementary", "studies", "and", "found", "a", "sudden", "drop", "in", "haemoglobin", "levels", ",", "and", "indicated", "referral", "to", "the", "Haematology", "Department", ".", "Two", "days", "before", "admission", "to", "the", "department", ",", "the", "symptoms", "(", "arthralgias", ",", "fever", "and", "dyspnoea", ")", "were", "exacerbated", "and", "the", "patient", "went", "to", "the", "emergency", "department", "where", "she", "was", "evaluated", "by", "a", "haematologist", "who", "requested", "additional", "tests", ".", "Subsequently", ",", "the", "patient", "was", "admitted", "to", "the", "ward", "with", "the", "following", "laboratory", "results", ".", "Data", "of", "value", "on", "physical", "examination", "were", ":", "On", "ectoscopy", ",", "dyspnoeic", "fascies", ",", "pallor", "of", "skin", "and", "mucous", "membranes", ";", "in", "the", "respiratory", "system", ",", "poor", "respiratory", "mechanics", ",", "tachypnoea", ",", "dyspnoea", ",", "on", "percussion", ",", "dullness", "in", "both", "bases", ",", "on", "auscultation", ",", "subcrepitant", "in", "both", "midfields", ",", "abolished", "in", "both", "bases", ";", "in", "the", "cardiovascular", "system", ",", "heart", "sounds", "with", "regular", "rhythm", ",", "tachycardia", ",", "R1", "and", "R2", "hypophonetic", ",", "no", "galloping", ",", "diastolic", "murmur", "in", "aortic", "focus", "and", "holosystolic", "in", "mitral", "focus", "with", "irradiation", "to", "the", "axilla", ";", "abdomen", "soft", ",", "depressible", ",", "not", "painful", ",", "slight", "splenomegaly", ",", "no", "palpable", "hepatomegaly", ";", "in", "the", "osteoarticular", "system", ",", "inflammatory", "signs", "at", "the", "level", "of", "the", "right", "knee", ".", "No", "inflammatory", "signs", "in", "other", "joints", ".", "Based", "on", "these", "data", ",", "the", "following", "diagnoses", "were", "proposed", ":", "left", "heart", "failure", ",", "mitroaortic", "insufficiency", ",", "collagenopathy", "to", "be", "confirmed", ",", "anaemic", "syndrome", ",", "controlled", "arterial", "hypertension", ".", "In", "the", "following", "days", "the", "patient", "presented", "febrile", "peaks", "and", "polycultures", "were", "performed", ".", "A", "volume", "of", "concentrated", "red", "blood", "cells", "was", "transfused", "and", "the", "patient", "'", "s", "dyspnoea", "worsened", ",", "having", "previously", "returned", "a", "negative", "direct", "Coombs", "'", "test", ".", "A", "simple", "CT", "scan", "of", "the", "chest", "showed", "a", "diffuse", "interstitial", "pattern", "with", "bilateral", "pleural", "effusion", "in", "both", "bases", ",", "and", "so", ",", "with", "the", "possibility", "of", "collagenopathy", ",", "boluses", "of", "methylprednisolone", "(", "5", "grams", ")", "were", "started", ",", "to", "which", "she", "responded", "favourably", ".", "Rheumatological", "profiles", "were", "requested", "(", "ANA", ",", "anti", "DNA", ",", "anti", "CCP", ",", "C3", ",", "C4", ",", "Anti", "B2", "glycoprotein", ",", "Antiphospholipid", ",", "Anticardiolipin", ",", "Lupus", "anticoagulant", ",", "Antithrombin", "III", ",", "Prot", ".", "C", "and", "S", ")", "which", "all", "returned", "in", "the", "normal", "range", "except", "FR", "in", "dilution", "1", "/", "512", ".", "A", "transthoracic", "echocardiogram", "was", "performed", ",", "showing", "vegetation", "on", "the", "aortic", "and", "mitral", "valves", ",", "with", "pseudoaneurysm", "of", "one", "aortic", "and", "one", "mitral", "leaflet", ",", "as", "well", "as", "perforation", "of", "one", "aortic", "leaflet", ",", "which", "led", "to", "the", "diagnosis", "of", "endocarditis", "and", "empirical", "antibiotic", "therapy", "was", "started", "immediately", ",", "even", "though", "the", "laboratory", "tests", "returned", "with", "few", "variations", ".", "Days", "later", ",", "blood", "cultures", "returned", "positive", "for", "Streptococcus", "alpha", "haemolyticus", "in", "3", "of", "8", "bottles", ".", "Subsequently", ",", "the", "patient", "underwent", "bivalvular", "replacement", "with", "mechanical", "valves", ",", "which", "was", "successful", ".", "She", "returns", "the", "results", "of", "the", "pathological", "anatomy", "of", "the", "vegetations", "which", "reports", "the", "following", ":", "\"", "Cardiac", "valves", "with", "marked", "degenerative", "changes", "(", "fibrosis", ",", "hyalinisation", "and", "myxoid", "changes", ")", ".", "Numerous", "reactive", "fibroblasts", "are", "also", "observed", ",", "some", "of", "them", "with", "changes", "suggestive", "of", "previous", "rheumatological", "pathology", ".", "On", "the", "surface", "there", "is", "a", "marked", "acute", "inflammatory", "infiltrate", "and", "fibrin", "deposits", "corresponding", "to", "vegetations", ".", "Histological", "findings", "are", "compatible", "with", "acute", "bacterial", "endocarditis", "\"", ".", "The", "definitive", "anatomopathological", "diagnosis", "is", "an", "Acute", "Bacterial", "Endocarditis", "due", "to", "the", "visualisation", "of", "Anitschkow", "cells", ",", "which", "due", "to", "the", "chronicity", "of", "the", "symptoms", ",", "clinically", "is", "presumed", "to", "be", "a", "Subacute", "Bacterial", "Endocarditis", ",", "suspecting", "as", "comorbidity", ",", "a", "collagenopathy", "to", "be", "confirmed", "with", "subsequent", "follow-up", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "bacterial", "label": "SPECIES", "start": 4182, "end": 4191 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 225, "end": 231 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 12, "end": 19 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 63, "end": 70 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1261, "end": 1268 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1395, "end": 1402 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2408, "end": 2415 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2537, "end": 2544 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3614, "end": 3621 }, { "text": "stillbirth", "label": "HUMAN", "start": 193, "end": 203 }, { "text": "Bacterial", "label": "SPECIES", "start": 4265, "end": 4274 }, { "text": "Bacterial", "label": "SPECIES", "start": 4419, "end": 4428 } ]

[ "We", "present", "the", "case", "of", "a", "6-year-old", "boy", "with", "a", "family", "history", "of", "a", "beekeeper", "father", "with", "hypersensitivity", "to", "Apis", "mellifera", "venom", ".", "In", "the", "summer", "of", "2016", ",", "following", "a", "bee", "sting", "on", "his", "hand", ",", "he", "reported", "immediate", "bilateral", "eyelid", "oedema", ",", "sneezing", ",", "rhinorrhoea", ",", "conjunctival", "injection", "and", "dyspnoea", ",", "requiring", "emergency", "care", "and", "treatment", "with", "Urbason", "®", "and", "Polaramine", "®", "with", "slow", "improvement", "of", "symptoms", ".", "He", "had", "previously", "received", "several", "bee", "and", "wasp", "stings", ",", "presenting", "only", "a", "local", "reaction", ".", "Complementary", "examinations", ":", "Blood", "tests", "and", "skin", "tests", "were", "performed", ".", "Results", ":", "Blood", "tests", ":", "Normal", "haemogram", ".", "Tryptase", "4", "ug", "/", "L", ".", "Total", "IgE", "14", ".", "0", "U", "/", "mL", ".", "Specific", "IgE", ":", "bee", "venom", "(", "Apis", "mellifera", ")", "1", ".", "88", "kU", "/", "L", ",", "rApi", "m1", "(", "phospholipase", "A2", ")", "1", ".", "25", "kU", "/", "L", ",", "rApi", "m10", "0", ".", "3", "kU", "/", "L", ",", "wasp", "venom", "(", "Vespula", "spp", ".", ")", "<", "0", ".", "1", "kU", "/", "L", ",", "wasp", "venom", "(", "Polistes", "spp", ".", ")", "<", "0", ".", "1", "kU", "/", "L", ",", "bumblebee", "venom", "(", "Vespa", "cabro", ")", "<", "0", ".", "1", "kU", "/", "L", ".", "Bee", "venom", "skin", "tests", ":", "pricktest", "1mcg", "/", "ml", "negative", ",", "intradermal", "reaction", "at", "0", ".", "001", "mcg", "/", "ml", "positive", "10mm", ".", "Conclusions", ":", "We", "present", "a", "case", "of", "grade", "II", "anaphylaxis", "due", "to", "sensitisation", "to", "bee", "venom", ",", "in", "a", "child", "at", "risk", "due", "to", "the", "parental", "profession", "and", "the", "rural", "environment", "to", "which", "he", "belongs", ",", "with", "a", "high", "degree", "of", "re-exposure", "to", "bee", "stings", ",", "which", "implies", "an", "increase", "in", "the", "prevalence", "of", "systemic", "allergic", "reactions", "of", "14", "-", "32", "%", ",", "compared", "to", "1", "-", "4", "%", "in", "the", "general", "population", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0 ]

[ { "text": "bee", "label": "SPECIES", "start": 166, "end": 169 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 47, "end": 53 }, { "text": "father", "label": "HUMAN", "start": 77, "end": 83 }, { "text": "Apis mellifera", "label": "SPECIES", "start": 109, "end": 123 }, { "text": "bee", "label": "SPECIES", "start": 436, "end": 439 }, { "text": "wasp", "label": "SPECIES", "start": 444, "end": 448 }, { "text": "bee", "label": "SPECIES", "start": 656, "end": 659 }, { "text": "wasp", "label": "SPECIES", "start": 751, "end": 755 }, { "text": "wasp", "label": "SPECIES", "start": 788, "end": 792 }, { "text": "Apis mellifera", "label": "SPECIES", "start": 667, "end": 681 }, { "text": "Vespula spp", "label": "SPECIES", "start": 763, "end": 774 }, { "text": "Polistes spp", "label": "SPECIES", "start": 800, "end": 812 }, { "text": "bumblebee", "label": "SPECIES", "start": 826, "end": 835 }, { "text": "Vespa cabro", "label": "SPECIES", "start": 843, "end": 854 }, { "text": "Bee", "label": "SPECIES", "start": 867, "end": 870 }, { "text": "bee", "label": "SPECIES", "start": 1049, "end": 1052 }, { "text": "bee", "label": "SPECIES", "start": 1194, "end": 1197 }, { "text": "child", "label": "HUMAN", "start": 1065, "end": 1070 }, { "text": "population", "label": "HUMAN", "start": 1328, "end": 1338 } ]

[ "We", "present", "the", "case", "of", "a", "73-year-old", "man", "with", "a", "skin", "lesion", "on", "his", "back", "attributed", "to", "a", "sting", ",", "10", "days", "earlier", ",", "while", "working", "in", "an", "orchard", "in", "the", "community", "of", "Madrid", "in", "August", ".", "A", "few", "days", "later", "he", "presented", "with", "fever", "of", "up", "to", "39", "°", "C", "and", "new", "skin", "lesions", "on", "the", "trunk", "and", "extremities", ",", "with", "no", "response", "to", "treatment", "with", "amoxicillin", "/", "clavulanic", "acid", ".", "On", "examination", "she", "presented", "black", "eschar", "on", "the", "left", "dorsal", "lumbar", "region", "and", "an", "erythematous", "papular", "rash", "on", "the", "trunk", "and", "extremities", ".", "The", "rest", "of", "the", "examination", "was", "normal", ".", "Blood", "tests", "revealed", "no", "findings", "of", "interest", ".", "With", "clinical", "suspicion", "of", "rickettsiosis", ",", "blood", "was", "drawn", "for", "serology", "and", "samples", "of", "the", "papular", "rash", "were", "taken", "for", "histological", "examination", "and", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "PCR", ")", "analysis", "at", "the", "reference", "laboratory", ".", "Treatment", "was", "prescribed", "with", "oral", "doxycycline", "(", "100mg", "/", "day", "for", "7", "days", ")", "with", "progressive", "improvement", "until", "complete", "resolution", "without", "sequelae", ".", "Acute", "phase", "serology", "by", "indirect", "immunofluorescence", "(", "IFA", ")", "showed", "low", "titres", "of", "immunoglobulin", "(", "Ig", ")", "G", "against", "Rickettsia", "conorii", ",", "and", "negative", "IgM", ".", "A", "new", "serology", "performed", "4", "weeks", "later", "showed", "no", "change", ".", "Skin", "biopsy", "showed", "a", "lymphohistiocytic", "infiltrate", "and", "vasculitis", "phenomena", ".", "PCR", "study", "of", "the", "skin", "biopsy", "detected", "the", "presence", "of", "Rickettsia", "sibirica", "mongolotimonae", ".", "We", "describe", "a", "new", "case", "of", "Rickettsiosis", "due", "to", "Rickettsia", "sibirica", "mongolotimonae", "in", "Spain", ",", "with", "the", "peculiarity", "that", "the", "diagnosis", "was", "made", "by", "PCR", "in", "skin", "biopsy", "of", "the", "exanthema", "and", "not", "of", "the", "inoculation", "eschar", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Rickettsia conorii", "label": "SPECIES", "start": 1041, "end": 1059 }, { "text": "Rickettsia sibirica mongolotimonae", "label": "SPECIES", "start": 1266, "end": 1300 }, { "text": "Rickettsia sibirica mongolotimonae", "label": "SPECIES", "start": 1350, "end": 1384 } ]

[ "We", "present", "the", "case", "of", "a", "40-year-old", "man", "from", "Romania", "who", "had", "been", "living", "in", "Spain", "for", "three", "months", "and", "had", "no", "known", "drug", "allergies", ".", "He", "was", "a", "smoker", ",", "with", "an", "accumulated", "consumption", "of", "20", "packets", "/", "year", "and", "a", "regular", "alcohol", "drinker", ".", "He", "was", "not", "taking", "medication", ",", "nor", "did", "he", "report", "any", "other", "personal", "or", "family", "history", "of", "interest", ".", "He", "was", "brought", "to", "the", "emergency", "department", "for", "vomiting", ",", "first", "of", "food", "content", "and", "later", "somewhat", "darker", ",", "together", "with", "marked", "general", "malaise", "and", "abdominal", "pain", ".", "On", "examination", "he", "showed", "a", "fair", "general", "condition", ",", "hypotension", "(", "BP", "97", "/", "56", "mmHg", ")", ",", "a", "heart", "rate", "of", "107", "beats", "per", "minute", ",", "98", "%", "SatO2", "without", "supplementary", "oxygen", "intake", "and", "a", "temperature", "of", "36", ".", "2oC", ".", "He", "had", "mild", "tachypnoea", ",", "skin", "pallor", "and", "conjunctival", "jaundice", ",", "with", "no", "asterixis", ".", "Cardiopulmonary", "auscultation", "showed", "rhythmic", "tones", ",", "tachycardic", "without", "murmurs", "and", "a", "preserved", "vesicular", "murmur", ".", "He", "showed", "generalised", "pain", "on", "abdominal", "palpation", "with", "no", "masses", "or", "megaliths", "and", "no", "signs", "of", "peritoneal", "irritation", ".", "The", "rest", "of", "the", "examination", "showed", "no", "other", "abnormalities", ",", "including", "digital", "rectal", "examination", ",", "which", "was", "negative", ".", "The", "emergency", "haemogram", "showed", "a", "leukocytosis", "of", "22", ",", "140", "cells", "/", "μL", "(", "93", ".", "5", "%", "neutrophils", "and", "4", ".", "5", "%", "lymphocytes", ")", ",", "platelets", "of", "84", ",", "000", "/", "μL", "and", "haemoglobin", "in", "the", "normal", "range", "(", "16", "g", "/", "dL", ")", ".", "Urgent", "biochemistry", "showed", "renal", "failure", "(", "Cr", "3", ".", "32", "mg", "/", "dL", ")", ",", "with", "normal", "urea", "and", "ions", ",", "total", "bilirubin", "7", ".", "32", "mg", "/", "dL", ",", "ALT", "6", ",", "278", "U", "/", "L", ",", "ammonium", "57", "μg", "/", "dL", ",", "procalcitonin", "11", ".", "87", "ng", "/", "mL", ",", "lactate", "212", ".", "72", "mg", "/", "dL", "and", "LDH", "15", ",", "545", "U", "/", "L", ".", "Arterial", "blood", "gases", "showed", "pH", "7", ".", "16", ",", "HCO3", "-", "8", "mmol", "/", "L", ",", "base", "excess", "-", "19", ".", "3", "mmol", "/", "L", "and", "pCO2", "21", "mmHg", ".", "He", "also", "showed", "signs", "of", "coagulopathy", "(", "PT", "INR", "8", ".", "1", "and", "APTT", "58", ".", "7", "seconds", ")", ".", "The", "chest", "X-ray", "was", "normal", "and", "the", "abdominal", "ultrasound", "showed", "an", "enlarged", "liver", "with", "smooth", "contours", "and", "homogeneous", "echogenicity", ",", "without", "lesions", ".", "Finally", ",", "he", "was", "admitted", "to", "the", "intensive", "care", "unit", "with", "suspected", "acute", "liver", "failure", ".", "Serology", "for", "HIV", ",", "HAV", "and", "HBV", ",", "including", "HBV", "DNA", ",", "were", "negative", ".", "Antibodies", "and", "RNA", "for", "HCV", "were", "also", "negative", ".", "In", "the", "following", "days", ",", "the", "patient", "presented", "with", "an", "episode", "of", "melena", ",", "as", "a", "manifestation", "of", "gastrointestinal", "bleeding", ".", "Differential", "diagnosis", "The", "aetiology", "of", "acute", "liver", "failure", "is", "diverse", ".", "Infectious", ",", "medicinal", ",", "toxic", ",", "ischaemic", ",", "metabolic", ",", "metabolic", ",", "malignant", "infiltration", "or", "autoimmune", "diseases", "are", "the", "main", "possibilities", ".", "Our", "patient", "and", "his", "relative", "denied", "taking", "any", "medication", ",", "including", "paracetamol", ",", "or", "herbal", "products", ",", "in", "recent", "times", ".", "He", "also", "denied", "having", "recently", "consumed", "mushrooms", ".", "Therefore", ",", "we", "could", "almost", "completely", "exclude", "drug", "and", "toxic", "aetiology", ",", "mainly", "Amanita", "phalloides", ",", "from", "the", "aetiological", "diagnosis", ".", "Our", "patient", "had", "a", "history", "of", "alcohol", "intake", ",", "which", "makes", "alcoholic", "hepatitis", "a", "probable", "cause", "of", "the", "picture", ".", "In", "contrast", ",", "hepatomegaly", "and", "ascites", ",", "which", "are", "usually", "present", "in", "hepatitis", "of", "alcoholic", "aetiology", ",", "were", "absent", "in", "our", "patient", "'", "s", "examination", ".", "In", "addition", ",", "in", "our", "case", ",", "very", "high", "ALT", "levels", "were", "present", ",", "whereas", "in", "alcoholic", "hepatitis", "ALT", "does", "not", "usually", "rise", "above", "500", "U", "/", "L", ".", "Therefore", ",", "this", "does", "not", "seem", "to", "be", "the", "most", "likely", "cause", ",", "although", "it", "cannot", "be", "completely", "ruled", "out", ".", "Our", "patient", "showed", "hypotension", ",", "which", "can", "lead", "to", "hypoperfusion", ",", "ischaemic", "hepatitis", "and", "acute", "liver", "failure", ".", "However", ",", "no", "other", "pathology", "other", "than", "liver", "damage", "that", "could", "have", "triggered", "ischaemic", "hepatitis", ",", "such", "as", "heart", "failure", ",", "an", "infectious", "source", "of", "sepsis", ",", "was", "observed", ".", "The", "patient", "presented", "abdominal", "pain", ",", "although", "without", "ascites", "or", "hepatomegaly", ",", "making", "Budd", "Chiari", "syndrome", "a", "cause", "that", "should", "be", "taken", "into", "account", ",", "although", "it", "does", "not", "seem", "likely", ".", "Copper", "deposition", "disease", "(", "Wilson", "'", "s", "disease", ")", "is", "usually", "diagnosed", "at", "an", "earlier", "age", "than", "in", "our", "patient", "and", "is", "characteristically", "accompanied", "by", "haemolytic", "anaemia", ",", "which", "is", "not", "present", ",", "and", "decreased", "alkaline", "phosphatase", "levels", ",", "with", "elevated", "bilirubin", ".", "It", "does", "not", "seem", ",", "therefore", ",", "to", "be", "the", "most", "likely", "aetiology", ".", "Another", "cause", "is", "Reye", "'", "s", "syndrome", ",", "which", "usually", "occurs", "in", "the", "paediatric", "population", "with", "a", "viral", "process", "and", "taking", "anti-inflammatory", "drugs", ",", "ruling", "out", "this", "possibility", "almost", "completely", ".", "Our", "patient", "had", "no", "history", ",", "no", "adenopathies", ",", "and", "no", "other", "exploratory", "data", "suggestive", "of", "malignant", "infiltration", ".", "In", "cases", "of", "liver", "failure", ",", "the", "most", "frequent", "primaries", "that", "should", "be", "considered", "are", "metastatic", "breast", "cancer", ",", "which", "is", "very", "rare", "in", "men", ",", "and", "lymphoma", ".", "This", "makes", "these", "two", "entities", "unlikely", "causes", ".", "Autoimmune", "hepatitis", "is", "also", "included", "in", "the", "aetiological", "diagnosis", "of", "our", "case", ".", "However", ",", "this", "usually", "has", "a", "more", "chronic", "subacute", "course", ",", "with", "fulminant", "hepatitis", "being", "rare", ".", "It", "is", "usually", "accompanied", "by", "other", "extrahepatic", "autoimmune", "disorders", ",", "which", "our", "patient", "does", "not", "present", ".", "Therefore", ",", "it", "is", "not", "a", "likely", "option", ".", "Among", "viral", "infections", "other", "than", "HAV", ",", "HBV", "and", "HCV", ",", "we", "must", "consider", "HEV", ",", "which", "has", "an", "increasing", "seroprevalence", "in", "developed", "countries", ".", "In", "Spain", ",", "the", "prevalence", "of", "antibodies", "is", "around", "10", "%", ".", "Therefore", ",", "it", "should", "be", "taken", "into", "account", "in", "cases", "of", "unaffiliated", "hepatitis", ",", "as", "in", "our", "patient", ",", "regardless", "of", "travel", "history", ".", "Other", "viruses", "and", "infectious", "agents", "described", "as", "causing", "hepatitis", ",", "but", "which", "have", "very", "occasionally", "been", "associated", "with", "fulminant", "liver", "failure", ",", "are", "cytomegalovirus", "(", "CMV", ")", ",", "Epstein-Barr", "virus", "(", "EBV", ")", ",", "varicella-zoster", "virus", "(", "VZV", ")", ",", "human", "herpesvirus", "type", "6", "(", "HHV", "6", ")", "and", "adenovirus", ",", "specifically", "serotype", "5", "of", "species", "C", "and", "Coxsackie", "B", "virus", "or", "Coxiella", "burnetti", ".", "Our", "patient", "presented", "with", "an", "episode", "of", "upper", "gastrointestinal", "bleeding", "in", "the", "context", "of", "liver", "failure", ".", "HSV", "is", "associated", "with", "involvement", "of", "the", "digestive", "mucosa", ",", "which", "could", "be", "related", "to", "the", "origin", "of", "the", "melenas", "that", "our", "patient", "presented", "with", ".", "However", ",", "HSV", "is", "a", "very", "infrequent", "cause", "of", "fulminant", "hepatitis", "in", "immunocompetent", "patients", "and", "neither", "did", "our", "patient", "present", "mucocutaneous", "rash", ";", "nevertheless", ",", "we", "should", "consider", "HSV", "as", "a", "probable", "cause", "in", "our", "differential", "diagnosis", ".", "Evolution", "Urgent", "oral", "endoscopy", "was", "performed", ",", "showing", ",", "from", "25", "mm", "from", "the", "dental", "arch", ",", "an", "erythematous", "mucosa", "that", "was", "very", "friable", "when", "rubbed", ",", "with", "some", "millimetre-sized", ",", "rounded", ",", "raised", ",", "crater-shaped", "ulcers", ".", "At", "the", "level", "of", "the", "distal", "oesophagus", ",", "there", "were", "wide", "and", "deep", "ulcerations", "with", "a", "geographic", "and", "fibrinous", "appearance", ",", "also", "affecting", "the", "cardia", ".", "These", "findings", "were", "interpreted", "as", "severe", "oesophagitis", "of", "dubious", "aetiology", ",", "with", "a", "viral", "cause", "being", "the", "most", "likely", "option", ".", "Serology", "was", "also", "expanded", "with", "HDV", ",", "HEV", ",", "HSV", ",", "CMV", ",", "EBV", ",", "Toxoplasma", "gondii", ",", "Rickettsia", "spp", "and", "Coxiella", "burnetti", ",", "all", "of", "which", "were", "negative", ",", "except", "for", "HSV", "IgG", "and", "IgM", ",", "which", "was", "positive", ".", "Autoimmunity", "was", "negative", ".", "Treatment", "was", "then", "started", "with", "intravenous", "acyclovir", "at", "a", "dose", "of", "750", "mg", "every", "8", "hours", ",", "with", "our", "patient", "showing", "clear", "improvement", "since", "its", "introduction", "and", "maintaining", "a", "satisfactory", "evolution", "until", "complete", "resolution", "of", "the", "disease", ".", "Finally", ",", "the", "study", "based", "on", "haematoxylin-eosin", "and", "immunohistochemistry", "of", "the", "oesophageal", "biopsy", "confirmed", "the", "herpetic", "aetiology", "of", "the", "oesophagitis", ",", "showing", "intense", "and", "extensive", "immunostaining", "for", "HSV", "-", ".", "Final", "diagnosis", "HSV-1", "infection", "with", "oesophagitis", "and", "acute", "hepatitis", ".", "Fulminant", "liver", "failure", "in", "this", "context", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 3, 3, 0, 3, 0, 0, 3, 3, 0, 3, 0, 0, 3, 3, 4, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 302, "end": 308 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 290, "end": 298 }, { "text": "HAV", "label": "SPECIES", "start": 1934, "end": 1937 }, { "text": "HBV", "label": "SPECIES", "start": 1942, "end": 1945 }, { "text": "HBV", "label": "SPECIES", "start": 1957, "end": 1960 }, { "text": "HCV", "label": "SPECIES", "start": 2004, "end": 2007 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 1929, "end": 1932 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2055, "end": 2062 }, { "text": "CMV", "label": "SPECIES", "start": 5238, "end": 5241 }, { "text": "Coxiella burnetti", "label": "SPECIES", "start": 5411, "end": 5428 }, { "text": "EBV", "label": "SPECIES", "start": 5264, "end": 5267 }, { "text": "HAV", "label": "SPECIES", "start": 4785, "end": 4788 }, { "text": "HBV", "label": "SPECIES", "start": 4790, "end": 4793 }, { "text": "HCV", "label": "SPECIES", "start": 4798, "end": 4801 }, { "text": "VZV", "label": "SPECIES", "start": 5294, "end": 5297 }, { "text": "infectious agents", "label": "SPECIES", "start": 5088, "end": 5105 }, { "text": "cytomegalovirus", "label": "SPECIES", "start": 5221, "end": 5236 }, { "text": "relative", "label": "HUMAN", "start": 2379, "end": 2387 }, { "text": "human herpesvirus type 6", "label": "SPECIES", "start": 5300, "end": 5324 }, { "text": "herpesvirus", "label": "SPECIES", "start": 5306, "end": 5317 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2363, "end": 2370 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2665, "end": 2672 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2892, "end": 2899 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3155, "end": 3162 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3433, "end": 3440 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3710, "end": 3717 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4123, "end": 4130 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4687, "end": 4694 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5031, "end": 5038 }, { "text": "population", "label": "HUMAN", "start": 4004, "end": 4014 }, { "text": "mushrooms", "label": "SPECIES", "start": 2518, "end": 2527 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 4022, "end": 4027 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 4757, "end": 4762 }, { "text": "virus", "label": "SPECIES", "start": 5257, "end": 5262 }, { "text": "virus", "label": "SPECIES", "start": 5287, "end": 5292 }, { "text": "virus", "label": "SPECIES", "start": 5402, "end": 5407 }, { "text": "Epstein-Barr virus", "label": "SPECIES", "start": 5244, "end": 5262 }, { "text": "varicella-zoster virus", "label": "SPECIES", "start": 5270, "end": 5292 }, { "text": "Amanita phalloides", "label": "SPECIES", "start": 2608, "end": 2626 }, { "text": "HHV 6", "label": "SPECIES", "start": 5326, "end": 5331 }, { "text": "HSV", "label": "SPECIES", "start": 5536, "end": 5539 }, { "text": "HSV", "label": "SPECIES", "start": 5690, "end": 5693 }, { "text": "HSV", "label": "SPECIES", "start": 5861, "end": 5864 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5434, "end": 5441 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5657, "end": 5664 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5792, "end": 5799 }, { "text": "CMV", "label": "SPECIES", "start": 6451, "end": 6454 }, { "text": "Coxiella burnetti", "label": "SPECIES", "start": 6499, "end": 6516 }, { "text": "Rickettsia spp", "label": "SPECIES", "start": 6480, "end": 6494 }, { "text": "Toxoplasma gondii", "label": "SPECIES", "start": 6461, "end": 6478 }, { "text": "EBV", "label": "SPECIES", "start": 6456, "end": 6459 }, { "text": "HDV", "label": "SPECIES", "start": 6436, "end": 6439 }, { "text": "HSV", "label": "SPECIES", "start": 6446, "end": 6449 }, { "text": "HSV", "label": "SPECIES", "start": 6557, "end": 6560 }, { "text": "HSV", "label": "SPECIES", "start": 7060, "end": 7063 }, { "text": "herpetic", "label": "SPECIES", "start": 6971, "end": 6979 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 6719, "end": 6726 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 6362, "end": 6367 }, { "text": "HSV", "label": "SPECIES", "start": 7083, "end": 7086 }, { "text": "HSV-1", "label": "SPECIES", "start": 7083, "end": 7088 } ]

[ "Anamnesis", "The", "patient", "presented", "is", "a", "42-year-old", "woman", ",", "with", "no", "known", "drug", "allergies", ",", "smoking", "since", "the", "age", "of", "18", ",", "with", "a", "daily", "consumption", "of", "20", "cigarettes", ",", "and", "no", "enolic", "habit", ".", "She", "is", "a", "housewife", "who", "lives", "with", "her", "partner", "and", "has", "had", "a", "child", "since", "the", "age", "of", "35", ".", "Her", "family", "history", "includes", "a", "history", "of", "her", "father", "diagnosed", "with", "a", "liver", "neoplasm", "at", "the", "age", "of", "77", ".", "Her", "medical", "history", "includes", "a", "tonsillectomy", "in", "childhood", "with", "no", "other", "data", "of", "interest", ".", "Her", "oncological", "history", "began", "in", "July", "2016", "when", "she", "consulted", "her", "family", "doctor", "for", "telorrhoea", "in", "the", "nipple", "of", "her", "left", "breast", ",", "and", "a", "bilateral", "mammogram", "was", "requested", "for", "study", ".", "Given", "the", "alteration", "of", "the", "mammography", ",", "she", "was", "referred", "to", "the", "Breast", "Pathology", "Unit", "of", "the", "Hospital", "Germans", "Trias", "i", "Pujol", "(", "ICO-Badalona", ")", ".", "Initially", ",", "the", "physical", "examination", "revealed", "eczema", "on", "the", "left", "nipple", ",", "and", "a", "mammogram", "of", "the", "left", "breast", "(", "in", "the", "lower", "left", "quadrant", "[", "CII", "]", ")", "showed", "a", "spiculated", "nodule", "approximately", "5", "cm", "in", "size", ",", "highly", "suspicious", "of", "malignancy", "(", "BI-RADS", "5", ")", ",", "which", "was", "biopsied", ".", "In", "addition", ",", "ultrasound", "of", "the", "left", "axillary", "nodes", "was", "performed", "in", "which", "one", "of", "them", "had", "a", "thickened", "cortical", "layer", "(", "3", ".", "9", "mm", ")", ",", "so", "FNA", "was", "performed", ".", "The", "biopsy", "of", "the", "IIC", "node", "was", "positive", "for", "infiltrating", "ductal", "carcinoma", ",", "with", "oestrogen", "receptors", "(", "ER", ")", "0", "%", ",", "progesterone", "receptors", "(", "PR", "0", "%", ")", ",", "HER-2", "amplified", ";", "and", "the", "cytology", "of", "the", "left", "axillary", "FNA", "was", "positive", "for", "carcinoma", "metastasis", ".", "After", "completing", "an", "extension", "study", "with", "bone", "scintigraphy", "and", "thoracoabdominal", "CT", "scan", ",", "which", "ruled", "out", "the", "presence", "of", "distant", "disease", ",", "a", "diagnosis", "of", "cT4N1M0", "(", "stage", "IIIB", ")", ",", "HER-2", "positive", ",", "hormone", "receptor", "negative", "left", "breast", "neoplasm", "was", "made", ".", "Considering", "the", "stage", "and", "biological", "characteristics", "of", "the", "disease", ",", "the", "patient", "started", "neoadjuvant", "treatment", "with", "adriamycin", "and", "cyclophosphamide", "(", "AC", ")", "for", "four", "cycles", ",", "followed", "by", "paclitaxel-trastuzumab-pertuzumab", "for", "four", "cycles", ",", "prior", "to", "surgery", ".", "The", "patient", "completed", "neoadjuvant", "treatment", "in", "January", "2017", ",", "with", "good", "tolerance", "to", "treatment", ",", "presenting", "only", "grade", "1-2", "neurotoxicity", "as", "complications", ".", "In", "April", "2017", ",", "surgery", "was", "performed", "and", "a", "mastectomy", "with", "axillary", "lymph", "node", "emptying", "was", "performed", ",", "presenting", "in", "the", "pathological", "anatomy", "nests", "of", "residual", "infiltrating", "ductal", "carcinoma", "in", "an", "extension", "of", "19", "mm", "(", "each", "of", "the", "nests", "less", "than", "1", "mm", ")", "without", "affecting", "the", "margins", "of", "resection", ",", "with", "micrometastasis", "of", "carcinoma", "(", "1", "mm", ")", "in", "one", "of", "the", "11", "isolated", "nodes", ".", "It", "was", "assessed", "as", "a", "partial", "pathological", "response", "(", "Symmans", "RCB-I", ")", ".", "The", "patient", "was", "evaluated", "after", "surgery", ",", "and", "treatment", "with", "subcutaneous", "trastuzumab", "was", "initiated", "to", "complete", "one", "year", "of", "treatment", ",", "starting", "on", "10", "May", "2017", ".", "Physical", "examination", "On", "5", "June", "2017", ",", "the", "patient", "consulted", "our", "centre", "for", "two", "weeks", "of", "dyspnoea", "that", "had", "progressed", "to", "minimal", "effort", "with", "cough", "without", "expectoration", "and", "febrile", "peaks", "of", "up", "to", "38", "°", "C", ",", "predominantly", "at", "night", ".", "Initially", ",", "baseline", "O2", "saturation", "of", "87", "%", "was", "detected", "and", "oxygen", "therapy", "was", "started", ",", "with", "normotension", "and", "no", "fever", ".", "Complementary", "tests", "Laboratory", "tests", "showed", "leukocytosis", "of", "20", ".", "200", "with", "94", "%", "of", "segmented", "neutrophils", "with", "increased", "RFA", "(", "fibrinogen", "695", "mg", "/", "dl", "and", "CRP", "81", ".", "5", "mg", "/", "l", ")", "and", "baseline", "blood", "gas", "showed", "respiratory", "failure", "with", "p02", "of", "51", "mm", "Hg", "with", "normocapnia", "and", "no", "alteration", "of", "pH", ";", "However", ",", "the", "chest", "X-ray", "was", "the", "complementary", "examination", "that", "contributed", "most", "to", "the", "initial", "orientation", "of", "the", "case", ",", "as", "it", "showed", "a", "bilateral", "infiltrate", "due", "to", "alveolar", "space", "involvement", ",", "predominantly", "in", "the", "lower", "lobes", ",", "which", "did", "not", "exist", "in", "the", "chest", "X-ray", "taken", "on", "27", "March", "after", "neoadjuvant", "treatment", "and", "prior", "to", "surgery", ".", "It", "was", "decided", "to", "admit", "the", "patient", "for", "study", "and", "therapeutic", "management", ".", "Diagnosis", "Based", "on", "the", "chest", "X-ray", "pattern", ",", "a", "differential", "diagnosis", "had", "to", "be", "made", "between", "the", "different", "aetiologies", ":", "Infectious", "aetiology", ":", "this", "is", "the", "main", "cause", "to", "rule", "out", "in", "view", "of", "this", "radiological", "finding", "and", "the", "laboratory", "analysis", "with", "leukocytosis", ",", "in", "addition", "to", "the", "history", "of", "fever", ".", "Initially", ",", "blood", "and", "urine", "cultures", "were", "obtained", ".", "Cardiac", "aetiology", ":", "given", "that", "the", "patient", "had", "received", "cardiotoxic", "oncological", "treatment", "(", "such", "as", "adriamycin", "and", "trastuzumab", ")", ",", "we", "had", "to", "rule", "out", "the", "possibility", "that", "the", "image", "corresponded", "to", "pulmonary", "oedema", ".", "For", "this", "purpose", ",", "the", "patient", "'", "s", "recent", "ventriculography", "with", "an", "LVEF", "of", "67", "%", "was", "checked", ".", "Haemorrhagic", "aetiology", ":", "this", "is", "another", "cause", "to", "rule", "out", "with", "the", "radiological", "pattern", ",", "in", "this", "case", "the", "patient", "remained", "haemodynamically", "stable", "at", "all", "times", "and", "with", "a", "preserved", "haematocrit", ".", "Toxic", "aetiology", ":", "this", "origin", "is", "due", "to", "the", "treatment", "the", "patient", "received", ".", "The", "pulmonary", "toxicity", "caused", "by", "trastuzumab", "and", "paclitaxel", "is", "well", "known", ".", "Given", "the", "different", "possible", "aetiologies", ",", "empirical", "antibiotic", "treatment", "was", "started", ",", "in", "this", "case", "ceftriaxone", "and", "levofloxacin", ",", "with", "the", "possibility", "of", "a", "respiratory", "infection", "caused", "by", "atypical", "pathogens", ",", "and", "corticotherapy", "to", "alleviate", "the", "possible", "toxic", "origin", ",", "as", "both", "are", "the", "most", "frequent", "aetiologies", ".", "During", "admission", ",", "a", "thoracic", "CT", "scan", "was", "performed", "which", "confirmed", "the", "presence", "of", "bilateral", "diffuse", "ground-glass", "infiltrates", "with", "basal", "predominance", ",", "which", "could", "be", "attributed", "to", "pulmonary", "toxicity", "due", "to", "drugs", "without", "being", "able", "to", "rule", "out", "other", "causes", "(", "viral", "or", "Pneumocystis", "pneumonia", ",", "pulmonary", "oedema", "or", "alveolar", "haemorrhage", ")", ".", "Bronchoscopy", "showed", "no", "anatomical", "alterations", "and", "bronchoalveolar", "lavage", "(", "BAL", ")", "samples", "were", "obtained", "for", "cytology", "and", "microbiology", ",", "in", "addition", "to", "a", "bronchoalveolar", "aspirate", "(", "BAS", ")", ".", "To", "study", "the", "infectious", "aetiology", ",", "PCR", "detection", "of", "Aspergillus", ",", "herpes", "and", "CMV", "in", "plasma", "was", "also", "performed", ",", "which", "were", "negative", ",", "pneumococcal", "and", "Legionella", "antigenurias", "were", "also", "negative", ",", "and", "finally", "the", "samples", "obtained", "by", "bronchoscopy", "provided", "a", "BAL", "that", "showed", "cellularity", "with", "a", "predominance", "of", "macrophages", ",", "the", "BAL", "and", "BAS", "cultures", "were", "negative", ",", "and", "the", "cytology", "obtained", "was", "negative", "for", "malignant", "cells", ".", "Treatment", "(", "Included", "in", "the", "evolution", "section", ")", ".", "Evolution", "Thus", ",", "after", "ruling", "out", "the", "infectious", "origin", "due", "to", "all", "the", "negative", "findings", ",", "the", "cardiological", "oedema", "by", "recent", "ventriculography", "(", "March", "2017", ")", "with", "LVEF", "of", "67", "%", "and", "absence", "of", "radiological", "signs", "such", "as", "cardiomegaly", ",", "and", "the", "alveolar", "haemorrhage", "due", "to", "the", "preservation", "of", "the", "haematocrit", "and", "the", "bronchoscopy", "findings", ",", "was", "classified", "as", "pneumonitis", "related", "to", "the", "oncological", "treatments", "received", "(", "paclitaxel", ",", "trastuzumab", "and", "pertuzumab", ")", "and", "corticoid", "treatment", "was", "maintained", ",", "improving", "the", "patient", "'", "s", "respiratory", "clinical", "picture", "and", "the", "radiological", "image", "shown", "in", "the", "control", "X-ray", "prior", "to", "discharge", "." ]

[ 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "housewife", "label": "HUMAN", "start": 188, "end": 197 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 270, "end": 276 }, { "text": "child", "label": "HUMAN", "start": 239, "end": 244 }, { "text": "childhood", "label": "HUMAN", "start": 416, "end": 425 }, { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 49, "end": 54 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 14, "end": 21 }, { "text": "father", "label": "HUMAN", "start": 311, "end": 317 }, { "text": "partner", "label": "HUMAN", "start": 217, "end": 224 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 524, "end": 530 }, { "text": "family doctor", "label": "HUMAN", "start": 524, "end": 537 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1752, "end": 1759 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1934, "end": 1941 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2523, "end": 2530 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2720, "end": 2727 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3658, "end": 3665 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4087, "end": 4094 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4286, "end": 4293 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4459, "end": 4466 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4604, "end": 4611 }, { "text": "atypical pathogens", "label": "SPECIES", "start": 4884, "end": 4902 }, { "text": "Pneumocystis", "label": "SPECIES", "start": 5272, "end": 5284 }, { "text": "CMV", "label": "SPECIES", "start": 5596, "end": 5599 }, { "text": "Legionella", "label": "SPECIES", "start": 5668, "end": 5678 }, { "text": "herpes", "label": "SPECIES", "start": 5585, "end": 5591 }, { "text": "Aspergillus", "label": "SPECIES", "start": 5572, "end": 5583 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 6487, "end": 6494 } ]

[ "A", "56-year-old", "male", "patient", "with", "a", "history", "of", "positive", "serology", "for", "HIV", "and", "Hepatitis", "B", "presented", "with", "acute", "cholecystitis", "for", "which", "he", "underwent", "emergency", "laparoscopic", "cholecystectomy", ".", "During", "the", "late", "postoperative", "period", ",", "one", "month", "after", "surgery", ",", "the", "patient", "presented", "a", "bilioma", "which", "was", "percutaneously", "evacuated", ".", "A", "biliary", "bypass", "is", "also", "performed", "by", "means", "of", "endoscopic", "cholangiography", ".", "As", "a", "result", "of", "the", "above", ",", "the", "patient", "presented", "with", "acute", "pancreatitis", "associated", "with", "a", "peri-pancreatic", "collection", ".", "This", "collection", "was", "evacuated", "by", "means", "of", "an", "initial", "percutaneous", "drainage", ",", "which", "proved", "to", "be", "insufficient", "and", "the", "patient", "presented", "with", "a", "large", "retroperitoneal", "collection", ".", "With", "no", "improvement", ",", "and", "with", "persistent", "drainage", "debit", "associated", "with", "fever", "and", "deterioration", "of", "general", "condition", ",", "a", "CT", "scan", "of", "the", "abdomen", "and", "pelvis", "was", "performed", ".", "This", "showed", "encapsulated", "fluid", "with", "a", "hydro-aerial", "level", "in", "the", "right", "flank", "adjacent", "to", "the", "abdominal", "wall", ",", "extending", "17", "cm", "in", "the", "cranial-caudal", "direction", "and", "11", "x", "3", "cm", "in", "transverse", "diameter", ".", "With", "a", "diagnosis", "of", "extraperitoneal", "right", "parietocolic", "abscess", ",", "drainage", "was", "performed", "by", "lumboscopy", ",", "evacuating", "abundant", "necrotic", "and", "purulent", "material", ".", "Two", "pure", "silicone", "drains", "were", "placed", "opposite", "each", "other", ",", "creating", "a", "continuous", "lavage", "system", ",", "using", "slow-drip", "physiological", "solution", ".", "The", "patient", "evolved", "favourably", "with", "few", "febrile", "registers", ".", "He", "had", "a", "positive", "culture", "for", "Pseudomona", "aureaginosa", ",", "which", "was", "treated", "with", "Meropenem", "during", "hospitalisation", ".", "On", "the", "fourth", "postoperative", "day", ",", "continuous", "lavage", "was", "replaced", "by", "a", "haemosuctor", "system", "and", "he", "was", "discharged", ".", "During", "follow-ups", ",", "the", "patient", "remained", "afebrile", "and", "the", "drain", "was", "removed", "after", "cessation", "of", "drainage", "." ]

[ 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 67, "end": 70 }, { "text": "Hepatitis B", "label": "SPECIES", "start": 75, "end": 86 }, { "text": "male patient", "label": "HUMAN", "start": 14, "end": 26 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 19, "end": 26 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 252, "end": 259 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 421, "end": 428 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 625, "end": 632 }, { "text": "Pseudomona aureaginosa", "label": "SPECIES", "start": 1427, "end": 1449 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1342, "end": 1349 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1642, "end": 1649 } ]

[ "A", "53", "year", "old", "man", "came", "to", "the", "emergency", "department", "with", "dyspnoea", "and", "stridor", "of", "one", "hour", "'", "s", "duration", ",", "with", "no", "known", "allergies", ",", "fever", "or", "aspiration", "which", ",", "on", "initial", "assessment", ",", "remained", "constant", ".", "He", "referred", "to", "us", "an", "epiglottic", "lesion", "being", "followed", "up", "in", "another", "Community", ".", "A", "nasofibrolaryngoscopy", "was", "performed", ",", "revealing", "oedema", "that", "started", "in", "the", "rhinopharynx", "and", "at", "the", "oropharynx", "level", ",", "preventing", "endoscopic", "progression", "due", "to", "the", "large", "obstruction", ".", "There", "was", "no", "evidence", "of", "cervical", "swelling", ",", "local", "heat", ",", "erythema", ",", "crusting", "or", "other", "signs", "typical", "of", "deep", "cervical", "infections", ".", "After", "the", "same", "evaluation", ",", "intravenous", "corticotherapy", "was", "prescribed", ",", "and", "due", "to", "his", "imminent", "poor", "condition", "and", "destabilisation", "of", "his", "vital", "signs", ",", "including", "a", "large", "drop", "in", "saturation", ",", "a", "cricothyrotomy", "and", "subsequent", "conversion", "to", "tracheostomy", "was", "performed", ".", "After", "stabilising", "the", "patient", ",", "we", "requested", "a", "cervicothoracic", "CT", "scan", "which", "showed", "images", "compatible", "with", "a", "left", "parapharyngeal", ",", "retropharyngeal", "and", "prevertebral", "abscess", ",", "the", "interior", "of", "which", "showed", "complex", "partitions", "and", "thick", "walls", ".", "The", "mediastinal", "space", "was", "found", "to", "be", "free", ".", "A", "cervical", "approach", "was", "made", "to", "drain", "the", "parapharyngeal", ",", "retropharyngeal", "and", "prevertebral", "abscess", ",", "which", ",", "to", "our", "astonishment", ",", "appeared", "without", "purulent", "content", "or", "signs", "of", "active", "infection", ",", "so", "we", "performed", "a", "laryngoscopic", "approach", ",", "revealing", "a", "large", "cystic", "lesion", "of", "amber", "colour", "from", "the", "left", "aryepiglottic", "fold", ",", "which", "we", "proceeded", "to", "marsupialise", "and", "sent", "its", "contents", "to", "microbiology", ".", "We", "prescribed", "antibiotherapy", "and", "corticotherapy", "and", "the", "evolution", "was", "satisfactory", ",", "managing", "to", "decannulate", "the", "patient", "after", "6", "days", "of", "follow-up", "and", "hospitalisation", ",", "with", "correct", "healing", "of", "the", "surgical", "wound", ",", "without", "obstruction", "of", "the", "airway", ".", "The", "anatomopathological", "result", "of", "the", "lesion", "was", "a", "fibrovascular", "polyp", "and", "the", "microbiological", "study", "of", "the", "contents", "was", "Veillonella", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 867, "end": 874 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1627, "end": 1634 }, { "text": "Veillonella", "label": "SPECIES", "start": 1882, "end": 1893 } ]

[ "Ángel", "is", "an", "18", "year", "old", "adolescent", "who", "attends", "the", "indicated", "prevention", "programme", "for", "adolescents", "and", "families", ",", "Soporte", "de", "Proyecto", "Hombre", "Madrid", ".", "Ángel", "'", "s", "parents", "request", "help", "from", "the", "programme", "due", "to", "their", "son", "'", "s", "drug", "use", "and", "the", "aggressive", "behaviour", "he", "displays", "inside", "(", "on", "several", "occasions", "he", "has", "assaulted", "both", "parents", ")", "and", "outside", "the", "home", ",", "as", "well", "as", "having", "been", "arrested", "for", "robbery", "with", "violence", ".", "At", "no", "time", "does", "the", "adolescent", "have", "any", "perception", "of", "a", "problem", "related", "to", "substance", "use", "or", "aggressive", "behaviour", ".", "Description", "of", "the", "situation", "The", "reason", "for", "the", "adolescent", "'", "s", "request", "for", "attention", "was", "that", "we", "at", "the", "centre", "should", "ensure", "that", "he", "was", "not", "convicted", "and", "sent", "to", "prison", ".", "He", "wanted", "us", "to", "say", "that", "he", "is", "\"", "good", "people", ",", "that", "he", "has", "never", "done", "anything", "wrong", ",", "given", "that", "the", "robbery", "was", "due", "to", "the", "fact", "that", "he", "didn", "'", "t", "have", "any", "money", "at", "the", "time", "and", "that", "the", "woman", "didn", "'", "t", "want", "to", "give", "it", "to", "him", "and", "he", "couldn", "'", "t", "go", "home", "\"", ".", "In", "addition", ",", "we", "at", "the", "centre", "had", "to", "tell", "the", "judge", "that", "he", "doesn", "'", "t", "use", "drugs", ",", "but", "it", "'", "s", "another", "thing", "if", "he", "smokes", "his", "joints", "and", "we", "all", "keep", "it", "a", "secret", ",", "as", "neither", "the", "judge", "nor", "the", "staff", "at", "the", "centre", "had", "sufficient", "criteria", "to", "know", "that", "it", "was", "good", "for", "him", ".", "He", "presents", "substance", "abuse", ",", "especially", "tobacco", ",", "alcohol", "and", "cannabis", ",", "he", "also", "presents", "compulsive", "cocaine", "consumption", "at", "weekends", ".", "The", "psychiatric", "symptomatology", "he", "manifests", "is", "enormously", "varied", ".", "As", "central", "and", "structural", "characteristics", ",", "fulfilling", "the", "generic", "criteria", "for", "personality", "disorders", ",", "he", "presents", "a", "large", "number", "of", "symptoms", "of", "cluster", "B", "personality", "disorders", "(", "antisocial", ",", "borderline", ",", "histrionic", "and", "narcissistic", ")", ".", "In", "addition", ",", "he", "meets", "criteria", "for", "a", "body", "dysmorphic", "disorder", "(", "F", "45", ".", "5", ")", "centred", "on", "the", "skin", "of", "his", "face", ".", "On", "the", "Derogatis", "SCL", "90", "-", "R", "he", "scores", "positively", "and", "very", "high", "in", "the", "area", "of", "obsession-compulsion", "and", "positively", "in", "hostility", ",", "paranoid", "ideation", "and", "psychoticism", ".", "In", "the", "Hare", "Psychopathy", "Scale", "he", "scores", "34", ",", "classifying", "him", "within", "the", "psychopathic", "profile", ",", "obtaining", "20", "out", "of", "22", "possible", "points", "in", "the", "central", "traits", "of", "psychopathy", "and", "14", "out", "of", "18", "in", "the", "traits", "of", "instability", ".", "At", "the", "time", "of", "starting", "the", "treatment", "process", ",", "the", "father", "presents", "depressive", "symptoms", "and", "self-injurious", "behaviour", "and", "the", "mother", "engages", "in", "the", "same", "behaviour", "in", "the", "presence", "of", "the", "psychologist", "responsible", "for", "the", "case", ".", "Angel", "'", "s", "mother", "is", "in", "treatment", "and", "her", "psychiatrist", "states", "that", "she", "has", "symptoms", "of", "borderline", "personality", "disorder", ".", "Angel", "'", "s", "sister", "is", "very", "anxious", "at", "the", "beginning", "of", "the", "process", "due", ",", "according", "to", "her", ",", "to", "the", "fear", "she", "feels", "towards", "her", "brother", "and", "how", "much", "he", "makes", "her", "suffer", ".", "Ángel", "is", "in", "the", "1st", "year", "of", "Bachillerato", "at", "a", "private", "school", "that", "\"", "guarantees", "\"", "a", "pass", ",", "he", "has", "repeated", "2", "years", "of", "ESO", "and", "has", "been", "to", "6", "or", "7", "schools", ",", "including", "two", "boarding", "schools", "for", "behavioural", "problems", "(", "he", "was", "expelled", "from", "both", "for", "violent", "behaviour", "and", "substance", "trafficking", ")", ".", "He", "demands", "that", "his", "father", "do", "the", "homework", "he", "is", "sent", "to", "pass", ",", "and", "when", "he", "doesn", "'", "t", "have", "it", "on", "time", "or", "doesn", "'", "t", "mark", "it", "sufficiently", ",", "he", "humiliates", "and", "insults", "him", ".", "He", "also", "takes", "on", "jobs", "at", "the", "same", "time", ",", "which", "he", "does", "not", "last", "more", "than", "a", "couple", "of", "days", ",", "as", "he", "considers", "them", "unworthy", "of", "him", "at", "all", "times", ".", "At", "home", "he", "maintains", "a", "tyrannical", "behaviour", ",", "he", "demands", "to", "be", "attended", "to", "immediately", ",", "to", "be", "bought", "branded", "clothes", "and", "that", "these", "are", "always", "clean", "and", "ironed", ",", "he", "asks", "to", "be", "bought", "expensive", "creams", "for", "his", "face", "at", "all", "times", ",", "as", "he", "\"", "has", "pimples", "\"", "(", "imperceptible", "to", "the", "rest", ")", ".", "When", "he", "is", "not", "allowed", "to", "do", "so", ",", "he", "becomes", "aggressive", ",", "in", "fact", "he", "has", "assaulted", "all", "the", "members", "of", "his", "family", "on", "several", "occasions", ",", "and", "has", "also", "broken", "most", "of", "the", "furniture", "and", "doors", "in", "the", "house", ".", "He", "takes", "what", "he", "wants", "from", "anyone", "without", "asking", "permission", "and", "occupies", "other", "people", "'", "s", "spaces", "without", "taking", "them", "into", "account", ".", "His", "group", "of", "friends", "is", "very", "focused", "on", "delinquent", "behaviour", "and", "leisure", "activities", "linked", "to", "consumption", ".", "He", "has", "no", "friends", "at", "school", "and", "affective-sexual", "relationships", "are", "sporadic", "and", "in", "contexts", "of", "consumption", ".", "He", "practices", "martial", "arts", "and", "spends", "many", "hours", "going", "to", "the", "gym", "(", "which", "has", "to", "be", "private", ",", "he", "does", "not", "want", "to", "go", "to", "municipal", "sports", "facilities", ",", "according", "to", "him", "\"", "they", "are", "for", "poor", "people", "\"", ")", ".", "Case", "history", "The", "information", "presented", "about", "Angel", "comes", "from", "information", "provided", "by", "the", "family", "and", "by", "the", "adolescent", "himself", ".", "Angel", "is", "a", "child", "who", "has", "been", "described", "as", "hyperactive", "since", "childhood", "without", "any", "firm", "diagnosis", ",", "let", "alone", "neurological", "confirmation", ".", "According", "to", "his", "parents", ",", "he", "is", "a", "child", "with", "many", "behavioural", "problems", "at", "school", ".", "The", "mother", "points", "out", "that", "for", "a", "long", "time", "she", "has", "supported", "the", "idea", "that", "it", "is", "the", "teachers", "who", "have", "a", "grudge", "against", "her", "son", "and", "that", ",", "despite", "the", "fact", "that", "he", "has", "been", "undergoing", "psychological", "treatment", "since", "he", "was", "very", "young", ",", "no", "one", "has", "been", "able", "to", "treat", "him", "properly", ".", "The", "truth", "is", "that", ",", "according", "to", "the", "information", "provided", ",", "he", "showed", "symptoms", "of", "oppositional", "defiant", "disorder", ".", "Furthermore", ",", "it", "should", "be", "added", "that", "dyslexia", "was", "detected", "when", "he", "was", "in", "the", "third", "year", "of", "primary", "school", ",", "with", "all", "that", "this", "entails", "in", "terms", "of", "poor", "learning", ".", "His", "mother", "has", "always", "had", "an", "overprotective", "relationship", "with", "Ángel", ",", "whom", "she", "has", "considered", "the", "best", "thing", "she", "has", "ever", "done", "in", "her", "life", ",", "mainly", "because", "\"", "he", "is", "very", "handsome", "\"", ",", "and", "they", "have", "always", "been", "very", "close", "until", "he", "started", "taking", "drugs", ".", "On", "the", "other", "hand", ",", "throughout", "the", "child", "'", "s", "childhood", "and", "due", "to", "the", "learning", "difficulties", "caused", "by", "the", "aforementioned", "dyslexia", ",", "the", "mother", "loses", "her", "patience", "at", "study", "times", "and", "assaults", "him", "on", "numerous", "occasions", ".", "As", "for", "the", "father", ",", "Angel", "despises", "him", "for", "not", "being", "able", "to", "stand", "up", "to", "him", ",", "demanding", "that", "he", "\"", "behave", "like", "a", "man", "\"", ".", "In", "the", "mother", "'", "s", "family", ",", "there", "is", "a", "psychopathological", "background", "with", "a", "schizophrenic", "grandmother", "and", "a", "father", "with", "borderline", "personality", "disorder", ".", "In", "the", "paternal", "family", ",", "different", "cases", "of", "depressive", "disorders", "are", "reported", ".", "The", "relations", "between", "the", "parents", "are", "very", "deteriorated", ",", "the", "mother", "considers", "the", "father", "a", "pushover", "and", "continually", "threatens", "to", "leave", "home", ".", "On", "the", "other", "hand", ",", "the", "mother", "accompanies", "her", "husband", "everywhere", "and", "does", "not", "allow", "him", "to", "have", "individual", "interviews", "with", "the", "therapist", "in", "the", "case", ",", "as", "well", "as", "being", "very", "angry", "with", "the", "psychologist", "who", "treats", "her", "husband", ".", "Angel", "started", "taking", "drugs", "at", "the", "age", "of", "13", ",", "occasionally", "using", "tobacco", "and", "alcohol", ".", "At", "the", "age", "of", "14", ",", "he", "added", "cannabis", "to", "this", "consumption", ",", "smoking", "around", "7", "joints", "a", "day", ",", "maintaining", "this", "consumption", "until", "the", "age", "of", "18", ".", "It", "was", "also", "at", "the", "age", "of", "14", "that", "he", "started", "to", "use", "amphetamines", "and", "synthetic", "drugs", "occasionally", "(", "less", "than", "once", "a", "month", ")", "and", "cocaine", "only", "once", ".", "From", "the", "age", "of", "15", ",", "he", "uses", "synthetic", "drugs", "and", "cocaine", "in", "leisure", "contexts", "at", "weekends", ",", "and", "also", "increases", "his", "alcohol", "consumption", ".", "At", "the", "age", "of", "16", "he", "had", "his", "first", "alcoholic", "coma", "and", "spent", "a", "month", "using", "cocaine", "almost", "daily", ".", "At", "the", "time", "of", "starting", "the", "intervention", "(", "18", "years", "old", ")", ",", "Angel", "consumes", "a", "pack", "of", "cigarettes", "a", "day", ",", "2", "or", "3", "beers", "a", "day", "and", "7", "or", "8", "drinks", "every", "weekend", "night", ",", "he", "continues", "to", "consume", "7", "joints", "a", "day", ",", "in", "addition", "to", "consuming", "one", "or", "two", "MDMA", "pills", "and", "half", "a", "gram", "of", "cocaine", "at", "weekends", ".", "The", "same", "adolescent", "points", "out", "that", "it", "is", "from", "the", "moment", "he", "starts", "using", "that", "he", "begins", "to", "show", "criminal", "behaviour", "and", "at", "no", "time", "does", "he", "show", "remorse", ".", "He", "understands", "that", "he", "has", "the", "right", "to", "have", "what", "others", "have", "and", "if", "he", "doesn", "'", "t", "have", "money", ",", "he", "takes", "it", ".", "Intervention", "When", "the", "family", "comes", "to", "the", "Support", "programme", ",", "they", "ask", "for", "help", "to", "prevent", "their", "son", "from", "going", "to", "prison", "and", ",", "by", "the", "way", ",", "to", "stop", "using", "drugs", ".", "There", "is", "no", "perception", "of", "further", "associated", "problems", ",", "even", "the", "mother", "continues", "to", "maintain", "her", "overprotective", "attitude", "and", "tries", "to", "justify", "her", "son", "'", "s", "violent", "behaviour", ".", "The", "adolescent", ",", "as", "we", "have", "pointed", "out", "above", ",", "arrives", "with", "no", "perception", "of", "a", "problem", "and", "with", "the", "intention", "of", "demanding", "that", "we", "prevent", "him", "from", "going", "to", "prison", "without", "making", "any", "effort", ".", "Given", "this", "attitude", "and", "some", "family", "confrontations", "in", "front", "of", "the", "therapist", ",", "they", "are", "made", "aware", "that", "the", "problem", "is", "much", "more", "serious", "than", "they", "were", "aware", "of", ".", "Given", "the", "data", "obtained", "in", "the", "SCL", "90", "-", "R", ",", "the", "need", "for", "psychiatric", "care", "is", "indicated", ".", "They", "prescribed", "olanzapine", "5", "mg", "and", "indicated", "that", "it", "was", "a", "possible", "borderline", "personality", "disorder", "and", "ruled", "out", "ADHD", ".", "At", "different", "times", "during", "the", "treatment", ",", "hospitalisation", "was", "suggested", ",", "but", "Angel", "refused", ".", "The", "first", "task", "was", "to", "train", "parents", "to", "set", "rules", ",", "limits", "and", "sanctions", "for", "their", "child", ".", "They", "are", "also", "trained", "to", "resist", "threats", "and", "attempts", "of", "aggression", ".", "In", "the", "first", "applications", "of", "rules", ",", "mental", "health", "and", "police", "services", "had", "to", "be", "called", "in", "because", "of", "the", "adolescent", "'", "s", "violent", "outbursts", ".", "This", "happens", "on", "several", "occasions", "throughout", "the", "intervention", "and", "whenever", "the", "emergency", "services", "arrive", ",", "the", "adolescent", "adapts", "to", "the", "situation", "and", "changes", "his", "or", "her", "attitude", ",", "avoiding", "hospitalisation", ".", "Therapeutic", "work", "was", "attempted", "in", "a", "peer", "group", "but", "due", "to", "the", "successive", "failure", "to", "comply", "with", "the", "rules", ",", "the", "dissimulation", "in", "the", "group", "at", "the", "beginning", "and", "the", "violent", "behaviour", ",", "this", "was", "abandoned", ".", "On", "the", "other", "hand", ",", "Angel", "does", "not", "accept", "the", "authority", "of", "female", "therapists", "and", "only", "accepts", "the", "authority", "of", "men", "who", "are", "capable", "of", "not", "backing", "down", "in", "the", "face", "of", "their", "threats", ".", "At", "one", "point", "he", "physically", "threatened", "a", "female", "psychologist", "and", "had", "to", "be", "temporarily", "expelled", ".", "Surprisingly", ",", "having", "made", "this", "threat", "in", "front", "of", "the", "parents", ",", "the", "mother", "refuses", "to", "accept", "the", "sanction", ".", "At", "the", "end", "of", "the", "sanction", ",", "they", "returned", "to", "the", "centre", ".", "As", "a", "result", "of", "increased", "family", "pressure", "supported", "by", "the", "centre", ",", "the", "violent", "behaviour", "is", "reduced", "and", "a", "normalised", "relationship", "is", "resumed", ".", "They", "begin", "to", "respect", "the", "father", "when", "they", "are", "able", "to", "confront", "him", ",", "even", "kicking", "him", "out", "of", "the", "house", ".", "After", "three", "months", ",", "cannabis", "consumption", "is", "eliminated", "but", "is", "resumed", "two", "months", "later", ",", "although", "in", "smaller", "quantities", ".", "Alcohol", "consumption", "is", "sporadic", "and", "cocaine", "consumption", "disappears", ".", "The", "imposition", "of", "rules", "is", "enough", "to", "get", "him", "to", "attend", "classes", "and", "to", "keep", "a", "job", "as", "a", "security", "guard", "for", "months", ".", "He", "maintained", "this", "attitude", "for", "some", "time", "until", "he", "was", "informed", "that", "as", "it", "was", "his", "first", "offence", "and", "he", "had", "no", "previous", "record", ",", "it", "was", "unlikely", "that", "he", "would", "be", "sent", "to", "prison", ".", "He", "resumes", "his", "violent", "behaviour", "and", "his", "parents", "maintain", "the", "normative", "structure", ".", "Ángel", "leaves", "the", "family", "home", "and", "asks", "for", "voluntary", "discharge", ".", "In", "this", "process", "the", "parents", "continue", "to", "attend", "the", "centre", "and", "make", "progress", "in", "terms", "of", "not", "giving", "in", "to", "emotional", "blackmail", "and", "the", "request", "to", "return", "home", "without", "any", "type", "of", "regulation", ".", "The", "family", "relationship", "improves", ",", "including", "with", "Angel", "who", "is", "away", "from", "home", "and", "who", "begins", "to", "admire", "his", "father", "for", "being", "able", "to", "stand", "up", "to", "him", ".", "All", "this", "breaks", "down", "when", "the", "father", "and", "mother", "decide", "to", "let", "him", "back", "into", "the", "house", "as", "other", "relatives", "give", "Angel", "shelter", "and", "begin", "to", "question", "them", ".", "There", "are", "again", "differences", "between", "the", "parents", "and", "both", "give", "up", "the", "treatment", "with", "the", "intention", "of", "separating", "even", "though", "they", "recognise", "that", "the", "last", "6", "months", "have", "been", "the", "best", "they", "have", "had", "in", "years", "as", "they", "have", "been", "able", "to", "set", "rules", "and", "limits", "for", "Angel", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Hombre", "label": "HUMAN", "start": 132, "end": 138 }, { "text": "adolescents", "label": "HUMAN", "start": 86, "end": 97 }, { "text": "families", "label": "HUMAN", "start": 102, "end": 110 }, { "text": "son", "label": "HUMAN", "start": 208, "end": 211 }, { "text": "parents", "label": "HUMAN", "start": 155, "end": 162 }, { "text": "parents", "label": "HUMAN", "start": 315, "end": 322 }, { "text": "adolescent", "label": "HUMAN", "start": 24, "end": 34 }, { "text": "adolescent", "label": "HUMAN", "start": 425, "end": 435 }, { "text": "adolescent", "label": "HUMAN", "start": 568, "end": 578 }, { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 871, "end": 876 }, { "text": "people", "label": "HUMAN", "start": 726, "end": 732 }, { "text": "judge", "label": "HUMAN", "start": 979, "end": 984 }, { "text": "judge", "label": "HUMAN", "start": 1103, "end": 1108 }, { "text": "cannabis", "label": "SPECIES", "start": 1257, "end": 1265 }, { "text": "tobacco", "label": "SPECIES", "start": 1236, "end": 1243 }, { "text": "sister", "label": "HUMAN", "start": 2458, "end": 2464 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 2234, "end": 2240 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 2341, "end": 2347 }, { "text": "father", "label": "HUMAN", "start": 2161, "end": 2167 }, { "text": "psychologist", "label": "HUMAN", "start": 2294, "end": 2306 }, { "text": "psychiatrist", "label": "HUMAN", "start": 2372, "end": 2384 }, { "text": "father", "label": "HUMAN", "start": 2916, "end": 2922 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 3580, "end": 3586 }, { "text": "people", "label": "HUMAN", "start": 3755, "end": 3761 }, { "text": "friends", "label": "HUMAN", "start": 3819, "end": 3826 }, { "text": "friends", "label": "HUMAN", "start": 3923, "end": 3930 }, { "text": "people", "label": "HUMAN", "start": 4203, "end": 4209 }, { "text": "adolescent", "label": "HUMAN", "start": 4322, "end": 4332 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 4304, "end": 4310 }, { "text": "child", "label": "HUMAN", "start": 4353, "end": 4358 }, { "text": "child", "label": "HUMAN", "start": 4512, "end": 4517 }, { "text": "son", "label": "HUMAN", "start": 4684, "end": 4687 }, { "text": "childhood", "label": "HUMAN", "start": 4403, "end": 4412 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 4564, "end": 4570 }, { "text": "parents", "label": "HUMAN", "start": 4495, "end": 4502 }, { "text": "teachers", "label": "HUMAN", "start": 4645, "end": 4653 }, { "text": "man", "label": "HUMAN", "start": 5678, "end": 5681 }, { "text": "child", "label": "HUMAN", "start": 5389, "end": 5394 }, { "text": "childhood", "label": "HUMAN", "start": 5397, "end": 5406 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 5114, "end": 5120 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 5487, "end": 5493 }, { "text": "father", "label": "HUMAN", "start": 5579, "end": 5585 }, { "text": "adolescent", "label": "HUMAN", "start": 7168, "end": 7178 }, { "text": "cannabis", "label": "SPECIES", "start": 6389, "end": 6397 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 5701, "end": 5707 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 5850, "end": 5856 }, { "text": "paternal family", "label": "HUMAN", "start": 5841, "end": 5856 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 5692, "end": 5698 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 5973, "end": 5979 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 6076, "end": 6082 }, { "text": "father", "label": "HUMAN", "start": 5789, "end": 5795 }, { "text": "father", "label": "HUMAN", "start": 5994, "end": 6000 }, { "text": "parents", "label": "HUMAN", "start": 5938, "end": 5945 }, { "text": "tobacco", "label": "SPECIES", "start": 6341, "end": 6348 }, { "text": "psychologist", "label": "HUMAN", "start": 6240, "end": 6252 }, { "text": "grandmother", "label": "HUMAN", "start": 5771, "end": 5782 }, { "text": "husband", "label": "HUMAN", "start": 6099, "end": 6106 }, { "text": "husband", "label": "HUMAN", "start": 6268, "end": 6275 }, { "text": "therapist", "label": "HUMAN", "start": 6180, "end": 6189 }, { "text": "adolescent", "label": "HUMAN", "start": 7752, "end": 7762 }, { "text": "adolescent", "label": "HUMAN", "start": 8659, "end": 8669 }, { "text": "adolescent", "label": "HUMAN", "start": 8801, "end": 8811 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 7440, "end": 7446 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 7967, "end": 7973 }, { "text": "child", "label": "HUMAN", "start": 8479, "end": 8484 }, { "text": "son", "label": "HUMAN", "start": 7514, "end": 7517 }, { "text": "son", "label": "HUMAN", "start": 7723, "end": 7726 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 7641, "end": 7647 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 9440, "end": 9446 }, { "text": "female", "label": "HUMAN", "start": 9155, "end": 9161 }, { "text": "female", "label": "HUMAN", "start": 9317, "end": 9323 }, { "text": "parents", "label": "HUMAN", "start": 8426, "end": 8433 }, { "text": "parents", "label": "HUMAN", "start": 9427, "end": 9434 }, { "text": "psychologist", "label": "HUMAN", "start": 9324, "end": 9336 }, { "text": "therapist", "label": "HUMAN", "start": 8005, "end": 8014 }, { "text": "female therapists", "label": "HUMAN", "start": 9155, "end": 9172 }, { "text": "police", "label": "HUMAN", "start": 8608, "end": 8614 }, { "text": "cannabis", "label": "SPECIES", "start": 9802, "end": 9810 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 9562, "end": 9568 }, { "text": "father", "label": "HUMAN", "start": 9704, "end": 9710 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 10361, "end": 10367 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 10599, "end": 10605 }, { "text": "father", "label": "HUMAN", "start": 10701, "end": 10707 }, { "text": "parents", "label": "HUMAN", "start": 10302, "end": 10309 }, { "text": "parents", "label": "HUMAN", "start": 10427, "end": 10434 }, { "text": "relatives", "label": "HUMAN", "start": 10839, "end": 10848 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 10785, "end": 10791 }, { "text": "father", "label": "HUMAN", "start": 10774, "end": 10780 }, { "text": "parents", "label": "HUMAN", "start": 10936, "end": 10943 } ]

[ "A", "29-year-old", "man", ",", "fisherman", ",", "first", "consulted", "the", "emergency", "department", "for", "vomiting", ",", "asthenia", ",", "myalgia", "and", "fever", ".", "He", "was", "diagnosed", "with", "viral", "gastroenteritis", "and", "discharged", "with", "symptomatic", "treatment", ".", "Five", "days", "later", ",", "he", "consulted", "again", "due", "to", "persistent", "symptoms", "and", "decay", ":", "hypotension", ",", "tachycardia", ",", "and", "poor", "general", "condition", "were", "observed", ",", "as", "well", "as", "leukocytosis", ",", "neutrophilia", ",", "thrombopenia", ",", "acute", "renal", "failure", ",", "elevated", "creatine", "kinase", "and", "hypertransaminasemia", ",", "with", "normal", "lactate", "dehydrogenase", ".", "Admission", "to", "Internal", "Medicine", "with", "fluid", "therapy", "and", "supportive", "treatment", "was", "decided", ".", "In", "the", "following", "12", "hours", ",", "haemodynamic", "and", "respiratory", "deterioration", ",", "and", "admission", "to", "the", "Intensive", "Care", "Unit", ".", "After", "abdominal", "imaging", "tests", "that", "ruled", "out", "complications", ",", "extraction", "of", "blood", "cultures", "and", "complete", "blood", "tests", "with", "viral", "serology", ",", "atypical", "microorganisms", "and", "possible", "zoonosis", ",", "empirical", "antibiotic", "treatment", "was", "started", "with", "Levofloxacin", "and", "Doxycycline", ".", "The", "patient", "required", "ventilatory", "support", "with", "mechanical", "ventilation", ",", "continuous", "haemodialysis", ",", "vasoactive", "drugs", "and", "alveolar", "recruitment", "manoeuvres", "due", "to", "alveolar", "haemorrhage", ".", "Subsequently", ",", "microbiological", "results", "were", "received", ":", "negative", "cultures", ",", "and", "serology", "for", "Leptospira", "spp", ".", "IgM", "positive", ",", "confirmed", "with", "PCR", "(", "polymerase", "chain", "reaction", ")", "for", "Leptospira", "spp", ".", "in", "urine", ",", "confirming", "Weil", "'", "s", "Syndrome", ",", "and", "de-escalating", "antibiotherapy", "to", "Doxycycline", ".", "Subsequent", "good", "evolution", ",", "being", "discharged", "from", "hospital", ",", "and", "in", "subsequent", "revisions", "seroconversion", "was", "observed", ",", "with", "positive", "IgG", "and", "negative", "IgM", "for", "Leptospira", "spp", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0 ]

[ { "text": "Leptospira spp", "label": "SPECIES", "start": 1231, "end": 1245 }, { "text": "Leptospira spp", "label": "SPECIES", "start": 1312, "end": 1326 }, { "text": "Leptospira spp", "label": "SPECIES", "start": 1570, "end": 1584 }, { "text": "atypical microorganisms", "label": "SPECIES", "start": 839, "end": 862 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 968, "end": 975 }, { "text": "fisherman", "label": "HUMAN", "start": 19, "end": 28 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 136, "end": 141 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 823, "end": 828 } ]

[ "A", "17-year-old", "man", "from", "Romania", "with", "no", "previous", "history", "or", "usual", "treatment", "who", "had", "been", "living", "in", "Spain", "for", "1", "year", "with", "his", "family", ",", "who", "were", "healthy", ".", "He", "did", "not", "report", "any", "toxic", "habits", ".", "He", "consulted", "the", "emergency", "department", "for", "a", "7-day", "history", "of", "continuous", "frontal", "headache", "radiating", "to", "the", "occipital", "region", ",", "which", "in", "the", "last", "48", "hours", "had", "been", "accompanied", "by", "a", "fever", "of", "up", "to", "39", "°", "C", "and", "several", "episodes", "of", "vomiting", "in", "shotgun", "fashion", ".", "There", "were", "no", "other", "clinical", "symptoms", "in", "the", "rest", "of", "the", "anamnesis", "by", "organs", "and", "apparatus", ".", "He", "was", "being", "treated", "with", "amoxicillin", "and", "ibuprofen", "prescribed", "by", "his", "primary", "care", "physician", ",", "with", "little", "response", ".", "On", "physical", "examination", "he", "was", "in", "good", "general", "condition", ",", "although", "febrile", "at", "38", ".", "8o", ",", "haemodynamically", "and", "ventilatorily", "stable", ",", "with", "a", "Glasgow", "Coma", "Scale", "score", "of", "15", "and", "no", "neurological", "focality", "except", "for", "moderate", "nuchal", "rigidity", ".", "The", "haemogram", "showed", "a", "leukocytosis", "of", "15", ",", "600", "per", "mm3", "with", "86", "%", "neutrophils", "and", "a", "C-reactive", "protein", "of", "26", ".", "5", "mg", "/", "dl", ";", "the", "rest", "of", "the", "haemogram", ",", "biochemistry", "and", "coagulation", "were", "normal", ".", "The", "chest", "X-ray", "did", "not", "show", "any", "condensation", ",", "hilar", "adenopathies", "or", "signs", "of", "pleural", "effusion", ".", "A", "lumbar", "puncture", "was", "performed", ",", "after", "fundus", "examination", ",", "which", "ruled", "out", "the", "presence", "of", "papillitis", ",", "and", "a", "clear", "cerebrospinal", "fluid", "(", "CSF", ")", "with", "slightly", "increased", "outflow", "pressure", "was", "obtained", ".", "The", "CSF", "Gram", "stain", "was", "negative", "with", "biochemistry", "showing", "21", "leukocytes", "(", "83", "%", "lymphocytes", ")", ",", "glycosuria", "of", "54", "mg", "/", "dl", ",", "proteinuria", "of", "90", "mg", "/", "dl", "and", "an", "adenosine", "deaminase", "of", "15", "U", "/", "l", ".", "The", "patient", "was", "admitted", "to", "the", "Infectious", "Diseases", "Unit", "with", "a", "syndromic", "diagnosis", "of", "lymphocytic", "meningitis", "of", "possible", "tuberculous", "aetiology", "with", "antibiotic", "coverage", "(", "ceftriaxone", "and", "vancomycin", ")", "and", "acyclovir", "while", "awaiting", "the", "results", "of", "the", "aetiological", "study", "(", "DNA", "hybridisation", "by", "polymerase", "chain", "reaction", "-", "PCR", "-", "and", "CSF", "cultures", ",", "serology", "and", "blood", "cultures", ")", ".", "Differential", "diagnosis", "With", "the", "syndromic", "diagnosis", "of", "lymphocytic", "meningitis", ",", "the", "differential", "diagnosis", "was", "considered", "as", "follows", ":", "Bacterial", "meningitis", ":", "-", "Partially", "treated", "meningitis", ".", "-", "Listeria", "monocytogenes", "meningitis", ".", "-", "Meningitis", "due", "to", "spirochetes", "(", "Treponema", "spp", ".", "Borrelia", "spp", ".", ")", ".", "-", "Bacterial", "infective", "endocarditis", ".", "-", "Suppurative", "pictures", "due", "to", "parameningeal", "foci", ".", "-", "Meningitis", "due", "to", "intracellular", "microorganisms", "(", "Rickettsia", "spp", ".", ",", "Coxiella", "burnetti", ")", ".", "Viral", "meningitis", ":", "-", "Enterovirus", "meningitis", ".", "-", "Herpesvirus", "meningitis", ".", "-", "Human", "immunodeficiency", "virus", "(", "HIV", ")", "meningitis", ".", "-", "adenovirus", "meningitis", "-", "lymphocytic", "choriomeningitis", "virus", "meningitis", ".", "-", "influenzavirus", "meningitis", "-", "mumps", "meningitis", "-", "arbovirus", "meningitis", "tuberculous", "meningitis", "fungal", "meningitis", "non-infectious", "meningitis", "-", "Neoplastic", "meningitis", ".", "-", "Neurosarcoidosis", ".", "-", "Chemical", "meningitis", "(", "non-steroidal", "anti-inflammatory", "drugs", ",", "cotrimoxazole", ".", ".", ".", ")", ".", "Evolution", "CSF", "PCR", "for", "enterovirus", ",", "herpesvirus", ",", "mumps", ",", "Toscana", "virus", "and", "Mycobacterium", "tuberculosis", "were", "negative", ",", "as", "well", "as", "CSF", "reagin", "test", ",", "serology", "for", "HIV", ",", "Borrelia", ",", "Treponema", "pallidum", ",", "Rickettsia", "spp", "and", "Coxiella", "burnetti", ".", "Clinically", ",", "the", "patient", "was", "still", "febrile", "after", "72", "hours", ",", "and", "the", "headache", "and", "vomiting", "had", "worsened", ",", "so", "an", "urgent", "cranial", "computed", "tomography", "(", "CT", ")", "scan", "was", "requested", ".", "The", "CT", "scan", "showed", "a", "bifrontal", "fluid", "collection", "extending", "over", "almost", "the", "entire", "surface", "of", "both", "lobes", "with", "moderate", "mass", "effect", "and", "signs", "of", "cerebritis", ",", "with", "pathological", "uptake", "of", "the", "dura", "mater", ".", "Cranial", "CT", "scan", "(", "axial", "section", "and", "sagittal", "reconstruction", ")", ":", "hypodense", "collection", "corresponding", "to", "epidural", "empyema", "with", "contrast", "uptake", "of", "the", "dura", "mater", "was", "observed", ".", "In", "addition", ",", "there", "was", "lysis", "of", "the", "posterior", "wall", "of", "the", "left", "frontal", "sinus", ",", "which", "was", "confirmed", "by", "three-dimensional", "bone", "reconstruction", "as", "the", "probable", "parameningeal", "origin", "of", "the", "collection", ".", "Cranial", "CT", "scan", "(", "axial", "section", "in", "bone", "window", "and", "three-dimensional", "bone", "reconstruction", ")", ":", "a", "solution", "of", "continuity", "of", "the", "posterior", "wall", "of", "the", "left", "frontal", "sinus", "was", "observed", ".", "With", "the", "radiological", "diagnosis", "of", "epidural", "empyema", ",", "the", "neurosurgery", "department", "was", "contacted", "and", "decided", "to", "intervene", "urgently", "on", "the", "patient", "after", "a", "cranial", "magnetic", "resonance", "imaging", "(", "MRI", ")", "scan", "to", "complete", "the", "study", ".", "This", "confirmed", "epidural", "involvement", "as", "well", "as", "a", "subdural", "and", "parietal", "component", "of", "the", "empyema", "measuring", "up", "to", "16", "mm", ",", "together", "with", "pansinusitis", "of", "both", "maxillary", ",", "frontal", "and", "left", "ethmoid", "sinuses", ".", "MRI", "of", "the", "skull", "(", "sagittal", "T1", "and", "axial", "T2", "before", "craniotomy", ")", ":", "a", "subdural", "component", "of", "the", "empyema", "and", "parietal", "involvement", "of", "the", "empyema", "were", "observed", ".", "The", "water", "diffusion", "sequence", "showed", "water", "restriction", ",", "which", "strongly", "supported", "the", "purulent", "origin", "of", "the", "collection", ".", "A", "bifrontal", "craniotomy", "and", "a", "right", "parietal", "trephine", "were", "performed", "with", "evacuation", "of", "the", "purulent", "contents", "and", "cranialisation", "of", "the", "frontal", "sinus", "together", "with", "a", "galea", "flap", "to", "seal", "the", "fistula", ".", "Intraoperative", "findings", "were", "an", "epidural", "plastron", "with", "a", "thickened", "and", "yellowish", "dura", "mater", ".", "Concurrent", "blood", "cultures", "and", "CSF", "cultures", ",", "including", "long", "incubation", "cultures", "for", "mycobacteria", "and", "fungi", ",", "were", "negative", ";", "however", ",", "Streptococcus", "constellatus", "and", "Prevotella", "oris", "grew", "in", "the", "intraoperative", "sample", ",", "the", "latter", "resistant", "to", "penicillin", "G", ".", "Intravenous", "antibiotic", "coverage", "consisting", "of", "cefotaxime", "2", "grams", "every", "4", "hours", "and", "metronidazole", "500", "milligrams", "every", "6", "hours", "was", "chosen", "and", "continued", "for", "6", "weeks", ".", "The", "patient", "'", "s", "evolution", "was", "very", "favourable", ",", "remaining", "afebrile", "at", "all", "times", "and", "presenting", "no", "neurological", "symptoms", "of", "any", "kind", ",", "although", "in", "the", "control", "MRI", "a", "certain", "5", "mm", "component", "of", "the", "empyema", "persisted", ",", "which", "it", "was", "decided", "not", "to", "evacuate", ",", "as", "well", "as", "the", "rest", "of", "the", "paranasal", "sinuses", ".", "MRI", "of", "the", "skull", "(", "sagittal", "T1", "and", "axial", "T2", "MRI", "after", "craniotomy", ")", ":", "almost", "complete", "evacuation", "of", "the", "empyema", "with", "a", "small", "residual", "component", "of", "about", "5", "mm", "was", "observed", ".", "Subsequent", "examinations", "confirmed", "the", "complete", "resolution", "of", "the", "empyema", "and", "pansinusitis", ",", "and", "the", "patient", "was", "asymptomatic", "and", "there", "were", "no", "recurrences", "of", "the", "process", "at", "the", "present", "time", ".", "Final", "diagnosis", "The", "final", "diagnosis", "was", "polymicrobial", "epidural", "and", "subdural", "empyema", "secondary", "to", "sinusitis", "with", "left", "frontal", "sinus", "posterior", "wall", "fistula", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 124, "end": 130 }, { "text": "primary care physician", "label": "HUMAN", "start": 598, "end": 620 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1535, "end": 1542 }, { "text": "Bacterial", "label": "SPECIES", "start": 2033, "end": 2042 }, { "text": "Listeria monocytogenes", "label": "SPECIES", "start": 2089, "end": 2111 }, { "text": "Borrelia", "label": "SPECIES", "start": 2172, "end": 2180 }, { "text": "Borrelia spp", "label": "SPECIES", "start": 2172, "end": 2184 }, { "text": "Treponema spp", "label": "SPECIES", "start": 2157, "end": 2170 }, { "text": "spirochetes", "label": "SPECIES", "start": 2144, "end": 2155 }, { "text": "Bacterial", "label": "SPECIES", "start": 2190, "end": 2199 }, { "text": "Coxiella burnetti", "label": "SPECIES", "start": 2341, "end": 2358 }, { "text": "Rickettsia spp", "label": "SPECIES", "start": 2324, "end": 2338 }, { "text": "intracellular microorganisms", "label": "SPECIES", "start": 2294, "end": 2322 }, { "text": "Viral", "label": "SPECIES", "start": 2363, "end": 2368 }, { "text": "Enterovirus", "label": "SPECIES", "start": 2383, "end": 2394 }, { "text": "Herpesvirus", "label": "SPECIES", "start": 2409, "end": 2420 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 2465, "end": 2468 }, { "text": "Human immunodeficiency virus", "label": "SPECIES", "start": 2435, "end": 2463 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4098, "end": 4105 }, { "text": "Prevotella oris", "label": "SPECIES", "start": 5108, "end": 5123 }, { "text": "Streptococcus constellatus", "label": "SPECIES", "start": 5077, "end": 5103 } ]

[ "Anamnesis", "A", "63-year-old", "man", "allergic", "to", "acetylsalicylic", "acid", "and", "a", "former", "smoker", "of", "80", "pack-years", ".", "As", "personal", "history", ",", "he", "underwent", "surgery", "20", "years", "ago", "for", "inguinal", "hernia", "and", "left", "femur", "fracture", ",", "with", "implantation", "of", "osteosynthesis", "material", ".", "He", "has", "a", "family", "history", "of", "colon", "cancer", "(", "father", ")", ",", "uterine", "cancer", "(", "sister", ")", "and", "breast", "cancer", "(", "5", "female", "cousins", ")", ".", "She", "started", "in", "April", "2016", "with", "a", "dry", "cough", ",", "which", "was", "treated", "with", "antibiotics", ".", "Given", "the", "persistence", "of", "the", "symptoms", "and", "the", "association", "of", "asthenia", ",", "hyporexia", "and", "dyspnoea", "on", "moderate", "exertion", ",", "she", "was", "referred", "to", "the", "Pneumology", "department", ",", "and", "the", "diagnostic", "study", "was", "started", "on", "an", "outpatient", "basis", ".", "Physical", "examination", "ECOG", "1", ".", "Good", "general", "condition", ".", "Examination", "revealed", "pulmonary", "hypoventilation", "in", "the", "left", "hemithorax", ",", "with", "scattered", "rhonchi", ",", "with", "no", "other", "anomalies", ".", "Complementary", "tests", "Computed", "tomography", "(", "CT", ")", "of", "the", "chest", ",", "abdomen", "and", "pelvis", "showed", "obstructive", "atelectasis", "of", "the", "left", "lower", "lobe", "of", "the", "lung", ",", "associated", "with", "parietal", "thickening", "of", "the", "left", "main", "bronchus", ",", "with", "stenosis", "at", "the", "exit", "of", "the", "upper", "lobar", "bronchus", "and", "occlusion", "of", "the", "lower", "lobar", "bronchus", ".", "In", "addition", ",", "a", "21", "mm", "pulmonary", "nodule", "with", "irregular", "contours", "is", "described", "in", "the", "lateral", "segment", "of", "the", "middle", "lobe", ".", "It", "should", "be", "noted", "the", "existence", "of", "mediastinal", "adenopathic", "conglomerates", "and", "bilateral", "hilar", "adenopathies", ".", "Bronchoscopy", "revealed", "a", "grade", "III", "mucosal", "infiltration", "at", "the", "level", "of", "the", "left", "main", "bronchus", ",", "which", "was", "biopsied", "and", "was", "conclusive", "for", "squamous", "cell", "carcinoma", ".", "The", "EGFR", ",", "ALK", "and", "ROS-1", "studies", "were", "negative", ",", "while", "PD-L1", "was", "positive", "(", "10", "%", ")", ".", "Analytically", ",", "there", "were", "no", "pathological", "findings", ".", "Diagnosis", "Left", "lung", "squamous", "cell", "carcinoma", "cT2N3", "M1a", "(", "contralateral", "lung", "nodule", ")", "stage", "IV", "(", "according", "to", "the", "7th", "edition", "of", "the", "TNM", "classification", ")", ".", "Treatment", "He", "started", "systemic", "chemotherapy", "treatment", "with", "cisplatin-gemcitabine", "in", "December", "2016", ",", "receiving", "a", "total", "of", "4", "cycles", "until", "March", "2017", ".", "A", "re-evaluation", "CT", "scan", "was", "performed", ",", "showing", "a", "partial", "response", ",", "for", "which", "she", "received", "thoracic", "radiotherapy", "for", "consolidation", "until", "the", "end", "of", "May", ".", "It", "should", "be", "noted", "that", "the", "CT", "scan", "showed", "an", "incidental", "pulmonary", "thromboembolism", ",", "for", "which", "the", "patient", "received", "anticoagulant", "treatment", "with", "low", "molecular", "weight", "heparin", "for", "a", "year", ".", "He", "maintains", "disease", "response", "in", "positron", "emission", "tomography", "(", "PET", ")", "performed", "after", "the", "end", "of", "radiotherapy", ".", "Evolution", "In", "September", "2017", ",", "4", "months", "after", "completing", "radiotherapy", ",", "pulmonary", "and", "mediastinal", "lymph", "node", "progression", "was", "observed", "on", "PET", ",", "so", "she", "started", "second", "line", "of", "systemic", "treatment", "with", "immunotherapy", "(", "nivolumab", ")", ".", "Three", "weeks", "after", "the", "first", "dose", ",", "in", "October", ",", "the", "patient", "began", "to", "experience", "proctalgia", "and", "a", "fever", "of", "38", "°", "C", ",", "requiring", "surgery", "for", "a", "7", "cm", "right", "perianal", "abscess", "extending", "to", "the", "ischiorectal", "fossa", ".", "Drainage", "was", "performed", ",", "obtaining", "abundant", "purulent", "material", ",", "and", "a", "Pezzer", "probe", "was", "placed", ",", "with", "progressive", "clinical", "improvement", ".", "We", "should", "highlight", "the", "analytical", "evidence", "of", "asymptomatic", "hyperthyroidism", ",", "for", "which", "she", "started", "treatment", "with", "metamizole", "5", "mg", ".", "In", "December", ",", "treatment", "with", "nivolumab", "was", "resumed", ".", "After", "5", "doses", ",", "in", "January", "2018", ",", "the", "patient", "presented", "a", "worsening", "of", "the", "previous", "right", "perineal", "wound", ",", "with", "spontaneous", "discharge", "through", "the", "wound", ".", "A", "new", "operation", "was", "performed", ",", "revealing", "a", "perineal", "abscess", "extending", "to", "the", "right", "scrotum", ",", "with", "palpable", "crepitus", "at", "this", "level", ".", "The", "necrotic", "material", "was", "debrided", "and", "the", "cavity", "was", "thoroughly", "washed", ",", "and", "microbiological", "documentation", "of", "Escherichia", "coli", "was", "found", ",", "for", "which", "he", "received", "antibiotic", "treatment", "with", "cephalosporins", ".", "Progressive", "favourable", "evolution", ",", "with", "disappearance", "of", "the", "cellulitis", "and", "perilesional", "inflammatory", "signs", ",", "for", "which", "he", "was", "discharged", "with", "a", "diagnosis", "of", "Fournier", "'", "s", "gangrene", ",", "continuing", "local", "treatment", "on", "an", "outpatient", "basis", ".", "One", "month", "after", "being", "discharged", ",", "in", "February", "2018", ",", "he", "was", "admitted", "again", "due", "to", "respiratory", "insufficiency", ",", "with", "CT", "scan", "findings", "of", "pulmonary", "consolidations", "related", "to", "pneumonitis", "secondary", "to", "nivolumab", ".", "He", "started", "treatment", "with", "systemic", "steroids", "at", "a", "dose", "of", "1", "mg", "/", "kg", ",", "with", "progressive", "clinical", "improvement", ",", "and", "was", "discharged", ".", "In", "April", ",", "a", "re-evaluation", "CT", "scan", "was", "performed", ",", "with", "improvement", "of", "the", "infiltrates", "and", "tumour", "stabilisation", ",", "so", "he", "remained", "without", "oncological", "treatment", ".", "In", "June", "steroid", "treatment", "was", "suspended", "and", "the", "CT", "scan", "was", "repeated", ",", "showing", "disappearance", "of", "the", "consolidations", "and", "partial", "response", "of", "the", "lung", "and", "mediastinal", "lymph", "node", "disease", ".", "One", "month", "after", "discontinuing", "steroid", "treatment", ",", "in", "July", "2018", ",", "the", "patient", "began", "to", "experience", "macroscopic", "haematuria", ",", "so", "he", "was", "assessed", "by", "the", "Urology", "Department", ",", "who", "performed", "a", "cystoscopy", ",", "revealing", "an", "enlarged", "papillary", "bladder", "tumour", "at", "the", "level", "of", "the", "left", "hemitrigoneum", ",", "suggestive", "of", "malignancy", ".", "In", "August", ",", "transurethral", "resection", "of", "the", "lesion", "was", "performed", ",", "and", "the", "pathological", "anatomy", "concluded", "that", "it", "was", "a", "low", "grade", "non-invasive", "urothelial", "carcinoma", "pT1a", ".", "She", "continued", "to", "be", "monitored", ",", "presenting", "clinical", "deterioration", "of", "one", "month", "'", "s", "evolution", "consisting", "of", "asthenia", ",", "hyporexia", "and", "epigastric", "pain", "with", "associated", "nausea", "and", "vomiting", ",", "for", "which", "she", "was", "admitted", "in", "October", "2018", ".", "During", "admission", ",", "a", "re-evaluation", "CT", "scan", "was", "performed", ",", "showing", "stabilisation", "of", "the", "lung", "and", "mediastinal", "lymph", "node", "disease", ",", "but", ",", "as", "new", "findings", ",", "a", "lesion", "in", "the", "head", "of", "the", "pancreas", "with", "possible", "infiltration", "of", "the", "second", "duodenal", "portion", ",", "and", "locoregional", "lymphadenopathies", ",", "suggestive", "of", "malignancy", ".", "In", "view", "of", "the", "patient", "'", "s", "clinical", "deterioration", ",", "with", "poor", "functional", "status", ",", "it", "was", "decided", "to", "focus", "treatment", "on", "symptomatic", "relief", ",", "without", "any", "other", "diagnostic", "or", "therapeutic", "measures", ".", "The", "patient", "finally", "died", "in", "November", "2018", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 102, "end": 110 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 254, "end": 260 }, { "text": "sister", "label": "HUMAN", "start": 311, "end": 317 }, { "text": "father", "label": "HUMAN", "start": 286, "end": 292 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2207, "end": 2214 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2674, "end": 2681 }, { "text": "Escherichia coli", "label": "SPECIES", "start": 3527, "end": 3543 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3173, "end": 3180 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4584, "end": 4591 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5537, "end": 5544 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5715, "end": 5722 } ]

[ "An", "81-year-old", "man", "with", "a", "history", "of", "chronic", "atrial", "fibrillation", "came", "to", "our", "hospital", "with", "progressive", "dyspnoea", "of", "2", "months", "'", "duration", ",", "accompanied", "by", "asthenia", "and", "unquantified", "weight", "loss", ".", "The", "patient", "was", "afebrile", ",", "with", "semiology", "of", "right", "pleural", "effusion", ".", "Chest", "X-ray", "confirmed", "pleural", "effusion", "and", "mediastinal", "enlargement", "without", "lung", "parenchymal", "involvement", ".", "Blood", "tests", "were", "normal", ".", "Thoracentesis", "showed", "a", "thick", "milky", "fluid", "with", "1400", "leukocytes", "/", "mm3", "with", "10", "%", "neutrophils", "and", "90", "%", "lymphocytes", ",", "protein", "49", "g", "/", "L", "(", "pleuroplasmic", "ratio", ":", "0", ".", "66", ")", ",", "LDH", "262", "U", "/", "L", "(", "pleuroplasmic", "ratio", ":", "0", ".", "75", ")", ",", "glucose", "10", ".", "2", "mmol", "/", "L", ",", "ADA", "16", "U", "/", "L", ",", "cholesterol", "1", ".", "75", "mmol", "/", "L", "and", "triglycerides", "12", ".", "8", "mmol", "/", "L", ".", "Cytology", "and", "conventional", "culture", "were", "negative", ".", "Intradermal", "Mantoux", "test", "was", "negative", ".", "Fibrobronchoscopy", "showed", "no", "endobronchial", "lesions", ".", "Ziehl-Neelsen", "staining", "and", "Löwenstein-Jensen", "medium", "culture", "of", "bronchoalveolar", "lavage", "were", "negative", ".", "A", "thoracoabdominal", "CT", "scan", "showed", "multiple", "adenopathic", "masses", "in", "the", "mediastinum", "and", "bilateral", "pleural", "effusion", "predominantly", "on", "the", "right", ".", "A", "CT-guided", "fine", "needle", "puncture-aspiration", "of", "the", "mediastinal", "mass", "was", "performed", ",", "without", "being", "able", "to", "collect", "adenopathic", "tissue", ".", "Thoracoscopy", "with", "pleural", "and", "lung", "biopsy", "and", "placement", "of", "a", "pleural", "drainage", "tube", "was", "performed", ".", "Pathology", "showed", "chronic", "granulomatous", "lesions", "compatible", "with", "tuberculosis", "in", "both", "pleura", "and", "lung", ".", "PCR", "for", "Mycobacterium", "tuberculosis", "was", "positive", "in", "the", "lung", "biopsy", "and", "negative", "in", "the", "pleura", ".", "Treatment", "was", "started", "with", "Isoniazid", "300", "mg", "/", "day", ",", "Rifampicin", "600", "mg", "/", "day", "and", "Pyrazinamide", "1250", "mg", "/", "day", ".", "Despite", "the", "treatment", ",", "the", "patient", "presented", "a", "clinical", "worsening", "and", "respiratory", "failure", ",", "and", "died", ".", "Necropsy", "was", "performed", "and", "bilateral", "chylothorax", ",", "chronic", "granulomatous", "caseating", "lymphadenitis", "compatible", "with", "tuberculosis", "of", "mediastinal", "lymph", "nodes", "and", "bilateral", "pleuropulmonary", ",", "hepatic", ",", "left", "adrenal", "and", "renal", "miliary", "dissemination", "were", "reported", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 193, "end": 200 }, { "text": "Mycobacterium tuberculosis", "label": "SPECIES", "start": 1388, "end": 1414 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1603, "end": 1610 } ]

[ "A", "79", "year", "old", "patient", "came", "to", "the", "emergency", "department", "with", "a", "bad", "evolution", "of", "a", "spider", "bite", "that", "had", "bitten", "him", "after", "he", "had", "put", "on", "his", "bathrobe", ".", "The", "patient", "started", "with", "a", "sting", "in", "the", "right", "latero-cervical", "area", ",", "followed", "by", "pruritus", "and", "a", "single", "small", "maculo-papular", "lesion", ",", "evolving", "within", "a", "few", "hours", "into", "hot", ",", "painful", "oedema", "and", "local", "swelling", ",", "which", "progressively", "increased", "without", "improvement", ".", "Twenty-four", "hours", "after", "the", "bite", ",", "a", "lighelloid", "plaque", "appeared", "in", "the", "area", "of", "the", "bite", "and", "serous", "blisters", "with", "an", "erythematous", "area", "of", "cellulitis", "around", "them", ".", "The", "patient", "was", "in", "good", "general", "condition", ",", "but", "with", "intense", "pain", "in", "the", "left", "supraclavicular", "area", "and", "significant", "oedema", "with", "fluctuation", "on", "which", "there", "was", "a", "6", "cm", "erythematous-violaceous", "plaque", "with", "irregular", "boundaries", ",", "well-defined", "and", "an", "erythematous", "area", "extending", "to", "the", "breast", "together", "with", "a", "mobile", "and", "painful", "supraclavicular", "lymphadenopathy", ".", "In", "the", "emergency", "department", ",", "due", "to", "the", "poor", "clinical", "evolution", ",", "an", "incision-contra", "incision", "was", "made", "over", "the", "most", "fluctuant", "area", ",", "with", "no", "externalisation", "of", "pus", ".", "Complementary", "studies", ":", "leukocytosis", "with", "neutrophilia", ",", "the", "rest", "normal", ".", "Diagnosis", ":", "cutaneous", "loxoscelism", ".", "The", "patient", "recognised", "the", "spider", "when", "shown", "a", "photograph", "of", "a", "specimen", ".", "She", "was", "treated", "on", "the", "ward", "with", "corticosteroids", ",", "antihistamines", "and", "prophylactic", "antibiotics", "due", "to", "the", "risk", "of", "superinfection", ",", "with", "a", "very", "good", "clinical", "evolution", ".", "She", "remained", "stable", ",", "with", "no", "evidence", "of", "systemic", "involvement", ",", "apyretic", ",", "blood", "cultures", "were", "negative", "and", "antibiotic", "therapy", "was", "suspended", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 14, "end": 21 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 151, "end": 158 }, { "text": "spider", "label": "SPECIES", "start": 81, "end": 87 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 566, "end": 573 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1188, "end": 1195 }, { "text": "spider", "label": "SPECIES", "start": 1211, "end": 1217 } ]

[ "An", "81-year-old", "female", "patient", "presented", "to", "the", "emergency", "department", "with", "asthenia", ",", "anorexia", "and", "right", "lumbar", "pain", "of", "2", "weeks", "'", "evolution", ".", "Haemodynamically", "stable", ",", "and", "with", "fever", "(", "38", ".", "5", "degrees", ")", "for", "3", "days", ".", "With", "a", "history", "of", "heart", "failure", "associated", "with", "atrial", "fibrillation", ",", "with", "no", "history", "of", "urological", "diseases", ".", "Physical", "examination", "revealed", "pain", "on", "deep", "palpation", "located", "in", "the", "right", "hemiabdomen", ",", "with", "no", "signs", "of", "peritoneal", "irritation", ",", "with", "the", "presence", "of", "a", "palpable", "mass", "and", "positive", "renal", "Murphy", "on", "the", "right", ".", "Analyses", "showed", "leukocytosis", "(", "22", ",", "390", "with", "left", "shift", ")", ",", "normochromic", "normocytic", "anaemia", ",", "with", "renal", "function", "within", "normal", "parameters", ",", "leukocyturia", "and", "microscopic", "haematuria", ".", "Reno-vesical", "radiography", "showed", "multiple", "radiopaque", "stones", "located", "in", "the", "right", "kidney", ".", "Abdominal-pelvic", "computed", "axial", "tomography", "with", "intravenous", "contrast", "injection", "showed", "an", "enlarged", "right", "kidney", ",", "with", "cortico-medullary", "disorganisation", "and", "the", "presence", "of", "multiple", "large", "lithiasic", "formations", "located", "in", "the", "renal", "pelvis", ".", "With", "the", "diagnosis", "of", "pyonephrosis", "and", "in", "order", "to", "stabilise", "the", "general", "deterioration", ",", "we", "decided", "to", "perform", "a", "pecutaneous", "nephrostomy", "at", "first", ".", "We", "witnessed", "abundant", "purulent", "fluid", "coming", "out", "of", "the", "nephrostomy", ",", "the", "culture", "of", "which", "revealed", "polymicrobial", "flora", ".", "Intravenous", "broad-spectrum", "antibiotic", "therapy", "was", "started", ".", "After", "four", "days", "and", "as", "the", "surgical", "conditions", "were", "more", "suitable", ",", "we", "decided", "to", "perform", "a", "right", "nephrectomy", "by", "lombotomy", ".", "The", "description", "of", "the", "surgical", "specimen", "is", "as", "follows", ":", "Kidney", "(", "13x8", ".", "5x5", "cm", ")", "sent", "with", "ureteral", "segment", "10", "cm", "long", "and", "with", "presence", "of", "perirenal", "adipose", "tissue", ".", "There", "is", "dilatation", "of", "the", "pyelocaliceal", "tree", "and", "marked", "atrophy", "of", "the", "renal", "parenchyma", ".", "Inside", "the", "pyelic", "tree", "there", "is", "purulent", "content", "and", "stones", "are", "identified", ",", "the", "largest", "of", "which", "is", "4", ".", "5", "cm", ".", "There", "are", "foci", "of", "suppuration", "with", "abcedification", "of", "the", "renal", "parenchyma", "and", "perirenal", "adipose", "tissue", ".", "In", "the", "pelvis", "and", "adjacent", "calyxes", "there", "is", "white", "tissue", "with", "a", "soft", "consistency", "measuring", "6x5", "cm", ",", "10", "cm", "away", "from", "the", "ureteral", "surgical", "top", ".", "Histological", "examination", "showed", "adenocarcinoma", "with", "predominant", "areas", "of", "tubular", "pattern", "and", "focal", "areas", "of", "tubulovillous", "pattern", ".", "The", "neoplasm", "presents", "characteristics", "of", "intestinal", "type", "adenocarcinoma", ",", "being", "possible", "to", "identify", "intestinal", "type", "Goblet", "cells", "characterised", "by", "the", "presence", "of", "apical", "intracytoplasmic", "mucus", "vacuoles", ".", ".", ".", ".", "The", "nuclei", "in", "some", "areas", "are", "uniform", "and", "monotonous", "and", "in", "other", "areas", "are", "more", "aggressive", ",", "irregular", ",", "of", "different", "sizes", "and", "with", "frequent", "mitotic", "activity", ".", "The", "neoplasm", "invades", "the", "subepithelial", "connective", "tissue", ".", "Glandular", "metaplasia", "of", "the", "urothelial", "epithelium", "is", "identified", "in", "the", "lining", "of", "the", "pyelocaliceal", "tree", ".", "Six", "months", "after", "surgery", "the", "patient", "died", "." ]

[ 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0 ]

[ { "text": "female patient", "label": "HUMAN", "start": 15, "end": 29 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 22, "end": 29 }, { "text": "polymicrobial flora", "label": "SPECIES", "start": 1261, "end": 1280 }, { "text": "tree", "label": "SPECIES", "start": 1667, "end": 1671 }, { "text": "tree", "label": "SPECIES", "start": 1734, "end": 1738 }, { "text": "tree", "label": "SPECIES", "start": 2722, "end": 2726 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2757, "end": 2764 } ]

[ "The", "patient", "was", "a", "one-month-old", "male", "of", "Moroccan", "origin", "who", "came", "to", "the", "emergency", "department", "with", "vomiting", ",", "refusal", "of", "food", "and", "abdominal", "distension", "of", "4", "days", "'", "duration", ".", "The", "pregnancy", "was", "controlled", ",", "with", "no", "obstetric", "or", "perinatal", "history", "of", "interest", ",", "and", "the", "baby", "was", "born", "at", "term", "with", "a", "weight", "appropriate", "for", "his", "gestational", "age", ".", "Examination", "revealed", "a", "fair", "general", "condition", ",", "with", "cutaneous", "and", "mucosal", "pallor", "and", "generalised", "oedema", ",", "predominantly", "in", "the", "lower", "extremities", ".", "A", "polyfocal", "grade", "IV", "/", "VI", "systolic", "murmur", "was", "auscultated", ".", "The", "abdomen", "was", "distended", ",", "with", "presence", "of", "superficial", "venous", "network", "and", "ascites", ".", "Laboratory", "examination", "showed", "normocytic", "normochromic", "anaemia", ",", "leukocytosis", "with", "normal", "formula", ",", "creatinine", "less", "than", "0", ".", "2mg", "/", "dl", "and", "urea", "10mg", "/", "dl", ",", "increased", "cholesterol", "and", "triglycerides", ",", "and", "decreased", "total", "protein", "and", "albumin", ",", "in", "addition", "to", "hyponatraemia", ",", "hypokalaemia", "and", "hypocalcaemia", ".", "Parathyroid", "hormone", "was", "slightly", "elevated", ".", "Urine", "proteinuria", "was", "in", "the", "nephrotic", "range", "with", "a", "proteinuria", "/", "creatinuria", "ratio", "of", "33", ".", "7", ".", "Given", "the", "suspicion", "of", "CNS", ",", "intensive", "diuretic", "and", "antiproteinuric", "therapy", ",", "antithrombotic", "prophylaxis", ",", "adjuvant", "treatment", "with", "alpha-calcidiol", ",", "iron", ",", "calcium", "carbonate", "and", "levothyroxine", ",", "as", "well", "as", "enteral", "nutrition", "with", "hyperproteic", "and", "hypercaloric", "formula", "were", "started", ".", "He", "required", "treatment", "with", "serum", "albumin", "and", "erythropoietin", ".", "The", "cardiological", "study", "diagnosed", "moderate", "valvular", "pulmonary", "stenosis", "and", "atrial", "septal", "defect", ".", "The", "genetic", "study", "found", "Frameshift", "type", "mutations", "for", "the", "NPHS1", "gene", ",", "Intronic", "Variant", "type", "for", "the", "NPHS2", "gene", "and", "Missense", "type", "for", "the", "WT1", "gene", ".", "At", "three", "months", "of", "age", "he", "was", "readmitted", "for", "seizures", "secondary", "to", "severe", "hypocalcaemia", ".", "Due", "to", "the", "high", "levels", "of", "intravenous", "calcium", "required", "for", "its", "control", "through", "a", "peripheral", "venous", "access", ",", "a", "third-degree", "burn", "occurred", ",", "which", "required", "the", "placement", "of", "a", "skin", "graft", ".", "He", "required", "intensive", "care", "on", "two", "occasions", "at", "4", "and", "6", "months", "of", "age", "due", "to", "sepsis", "secondary", "to", "Staphylococcus", "hominis", "and", "Enterococcus", "faecalis", ",", "respectively", ",", "which", "were", "resolved", "with", "empirical", "antibiotherapy", "and", "subsequently", "according", "to", "antibiogram", ".", "Finally", ",", "the", "patient", "died", "at", "8", "months", "of", "age", "due", "to", "bilateral", "pneumonia", "associated", "with", "pneumothorax", "with", "decompensation", "of", "his", "underlying", "pathology", "that", "caused", "refractory", "hypoxaemia", "." ]

[ 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "male", "label": "HUMAN", "start": 32, "end": 36 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4, "end": 11 }, { "text": "Staphylococcus hominis", "label": "SPECIES", "start": 1990, "end": 2012 }, { "text": "Enterococcus faecalis", "label": "SPECIES", "start": 2017, "end": 2038 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2160, "end": 2167 } ]

[ "Anamnesis", "This", "is", "a", "79-year-old", "male", ",", "with", "a", "known", "allergic", "drug", "reaction", "to", "beta-lactams", "and", "oxaliplatin", ",", "who", "attended", "the", "Emergency", "Department", "in", "August", "2017", "for", "a", "cat", "bite", "on", "the", "right", "lower", "limb", ";", "noting", "serous", "exudate", "in", "the", "wound", ",", "as", "well", "as", "a", "dystrophic", "sensation", "with", "chills", "and", "a", "home", "thermometric", "fever", "of", "39", "oC", ".", "During", "the", "anamnesis", ",", "she", "reported", "pleuritic", "pain", "in", "the", "left", "field", ",", "dyspnoea", ",", "expectoration", "and", "increased", "oedema", "in", "the", "lower", "limbs", ".", "The", "oncological", "history", "began", "in", "September", "2011", ",", "when", "the", "patient", "was", "diagnosed", "with", "native", "RAS", "mixed", "mucinous", "adenocarcinoma", "of", "the", "colon", ",", "with", "vascular", "invasion", ",", "initially", "at", "stage", "T3N0M0", "and", "treated", "with", "surgery", ".", "In", "January", "2012", ",", "he", "was", "diagnosed", "with", "liver", "recurrence", ",", "so", "he", "started", "chemotherapy", "with", "FOLFOX", "(", "leucovorin", "calcium", ",", "fluorouracil", "and", "oxaliplatin", ")", "+", "bevacizumab", ",", "obtaining", "a", "partial", "response", "and", "receiving", "a", "total", "of", "33", "cycles", "until", "December", "2013", ",", "after", "which", "three", "left", "hepatic", "segments", "were", "resected", "due", "to", "metastasis", ".", "He", "received", "subsequent", "treatment", "with", "5-FU", "(", "5-fluorouracil", ")", "+", "bevacizumab", "x", "8", "cycles", ".", "A", "computed", "tomography", "(", "CT", ")", "scan", "in", "October", "2014", "showed", "progression", "with", "the", "appearance", "of", "bilateral", "pulmonary", "nodules", ",", "suggestive", "of", "metastatic", "involvement", ".", "Treatment", "was", "started", "with", "FOLFIRI", "(", "leucovorin", "calcium", ",", "fluorouracil", "and", "irinotecan", "hydrochloride", ")", "+", "panitumumumab", ",", "receiving", "a", "total", "of", "5", "cycles", ",", "with", "regular", "tolerance", ",", "so", "it", "was", "decided", "to", "continue", "with", "panitumumumab", "in", "monotherapy", ",", "treatment", "that", "was", "maintained", "until", "July", "2016", ",", "when", ",", "due", "to", "new", "pulmonary", "progression", ",", "it", "was", "decided", "to", "start", "a", "new", "line", "of", "treatment", "with", "regorafenib", ",", "receiving", "6", "cycles", ".", "In", "the", "last", "CT", "scan", ",", "in", "February", "2017", ",", "pulmonary", "nodules", "persisted", ",", "predominantly", "in", "the", "left", "hemithorax", "with", "areas", "of", "cavitation", ".", "At", "the", "time", "of", "ED", "consultation", ",", "chemotherapy", "treatment", "had", "been", "suspended", "four", "months", "earlier", "(", "April", "2017", ")", ",", "with", "3", "admissions", "since", "then", "for", "respiratory", "infection", "treated", "with", "piperacillin-tazobactam", ",", "levofloxacin", "and", "meropenem", ".", "After", "being", "assessed", "by", "the", "Home", "Care", "Support", "Team", "(", "ESAD", ")", "in", "the", "area", "for", "progression", "despite", "treatment", "and", "worsening", "of", "performance", "status", "(", "PS", ")", ",", "therapeutic", "rest", "had", "been", "decided", ".", "Physical", "examination", "Physical", "examination", "revealed", "bilateral", "perimalleolar", "oedema", "on", "the", "lower", "limbs", "with", "pitting", "and", "punctate", "wounds", "on", "the", "dorsum", "of", "the", "distal", "third", "of", "the", "MID", ",", "which", "was", "warm", ",", "slightly", "erythematous", ",", "with", "serous", "exudate", "on", "application", "of", "pressure", ".", "Bilateral", "inguinal", "adenopathies", "less", "than", "1", "cm", "in", "size", ",", "of", "elastic", "consistency", ",", "cold", ",", "not", "adherent", "to", "deep", "planes", ",", "are", "palpated", ".", "There", "were", "no", "other", "significant", "findings", "except", "for", "hepatomegaly", "of", "2", "finger", "widths", "of", "the", "left", "hepatic", "lobe", ".", "During", "cardiopulmonary", "auscultation", ",", "rhythmic", "heart", "tones", ",", "without", "murmurs", ";", "and", "preserved", "vesicular", "murmur", "without", "added", "noises", ".", "Complementary", "tests", "Blood", "tests", "showed", "leukocytosis", "(", "18", ".", "20", "10", "E3", "/", "mcl", ")", ",", "with", "83", "%", "neutrophils", ",", "and", "CRP", "of", "11", ".", "0", "mg", "/", "dl", ";", "without", "significant", "alterations", "in", "the", "rest", "of", "the", "parameters", ".", "A", "chest", "X-ray", "was", "performed", ",", "with", "no", "evident", "changes", "with", "respect", "to", "the", "previous", "ones", ".", "In", "the", "thoracic", "CT", "scan", ",", "at", "the", "level", "of", "the", "lung", "parenchyma", ",", "opacities", "of", "nodular", "morphology", "were", "observed", ",", "widely", "cavitated", ",", "which", "were", "located", "in", "the", "left", "upper", "lobe", ",", "while", "the", "rest", "of", "the", "already", "known", "opacities", "showed", "progressive", "growth", ".", "In", "addition", ",", "numerous", "opacities", "are", "also", "observed", "in", "both", "lung", "bases", ".", "In", "view", "of", "these", "findings", ",", "and", "taking", "into", "account", "the", "radiological", "evolution", ",", "a", "diagnosis", "of", "infection", "by", "atypical", "mycobacteria", "was", "suggested", "as", "a", "possible", "diagnosis", ".", "A", "microbiological", "study", "was", "requested", ",", "highlighting", "QuantiFERON", "®", "TB", "positive", ",", "as", "well", "as", "incubation", "in", "3", "sputa", "of", "50", "BAAR", "/", "field", ",", "without", "mutation", "to", "rifampicin", ".", "Diagnosis", "Given", "the", "results", "of", "the", "microbiological", "study", ",", "a", "diagnosis", "of", "respiratory", "infection", "was", "made", ",", "with", "a", "final", "diagnosis", "of", "bacilliferous", "pulmonary", "tuberculosis", ".", "Treatment", "Based", "on", "current", "treatment", "recommendations", "for", "rifampicin-sensitive", "Mycobacterium", "tuberculosis", ",", "antibiotic", "treatment", "with", "ethambutol", "hydrochloride", ",", "isoniazid", ",", "pyrazinamide", "and", "rifampicin", "was", "started", "and", "continued", "for", "at", "least", "6", "months", ".", "Evolution", "Reviewing", "images", "with", "the", "Radiology", "Department", "from", "2014", "to", "the", "present", ",", "given", "the", "evolution", "of", "the", "pulmonary", "nodules", "and", "infiltrates", ",", "and", "having", "been", "diagnosed", "with", "TB", ",", "the", "nature", "of", "the", "pulmonary", "lesions", "is", "not", "clearly", "defined", ".", "Given", "that", "the", "patient", "has", "an", "active", "infectious", "process", ",", "no", "oncological", "treatment", "is", "currently", "being", "considered", "until", "it", "is", "resolved", ".", "It", "should", "be", "noted", "that", ",", "at", "the", "last", "review", "in", "the", "Medical", "Oncology", "consultation", "(", "February", "2018", ")", ",", "the", "patient", "reported", "improvement", "in", "general", "condition", ",", "with", "no", "symptoms", "of", "dyspnoea", ",", "fever", ",", "cough", "or", "expectoration", ".", "He", "continues", "to", "receive", "antibiotic", "treatment", "for", "tuberculosis", ".", "The", "CT", "scan", "performed", "in", "November", "2017", "showed", "an", "improvement", "in", "the", "cavitated", "lesion", "of", "the", "LSI", ",", "compared", "to", "the", "previous", "study", ",", "with", "no", "signs", "of", "recurrence", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "cat", "label": "SPECIES", "start": 166, "end": 169 }, { "text": "male", "label": "HUMAN", "start": 32, "end": 36 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 514, "end": 521 }, { "text": "BAAR", "label": "SPECIES", "start": 3688, "end": 3692 }, { "text": "atypical mycobacteria", "label": "SPECIES", "start": 3510, "end": 3531 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4405, "end": 4412 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4626, "end": 4633 } ]

[ "28-year-old", "woman", ",", "who", "reported", "allergy", "to", "penicillin", "studied", "in", "childhood", "by", "the", "Allergology", "Service", ",", "with", "intradermal", "test", ".", "She", "had", "no", "other", "known", "medical", "or", "surgical", "history", "of", "interest", ".", "She", "denied", "toxic", "habits", ".", "She", "did", "not", "take", "treatment", "on", "a", "regular", "basis", ".", "She", "consulted", "her", "primary", "care", "physician", "for", "symptoms", "of", "odynophagia", "of", "10", "days", "'", "evolution", "and", "self-palpation", "of", "the", "cervical", "lymph", "nodes", ".", "Examination", "revealed", "hypertrophic", "tonsils", "with", "whitish", "exudate", ",", "and", "treatment", "was", "started", "with", "oral", "corticotherapy", "(", "deflazacort", "30", "mg", "per", "day", ")", "and", "empirical", "oral", "antibiotherapy", "with", "clarithromycin", "500", "mg", "every", "12", "hours", "for", "10", "days", ".", "After", "48", "hours", ",", "the", "patient", "went", "to", "the", "emergency", "department", "for", "worsening", "general", "condition", ",", "presenting", "fever", "up", "to", "39", ".", "7oC", ",", "dry", "cough", ",", "dyspnoea", "and", "right", "costal", "pain", "with", "pleuritic", "characteristics", ".", "On", "arrival", "the", "patient", "was", "febrile", "(", "38", ".", "3o", ")", ",", "hypotensive", "(", "84", "/", "40", "mmHg", ")", ",", "tachycardic", "(", "120", "bpm", ")", "and", "tachypneic", "(", "30", "rpm", ")", ".", "On", "examination", "she", "presented", ":", "cardiopulmonary", "auscultation", "with", "rhythmic", "tachycardic", "tones", "and", "good", "vesicular", "murmur", "with", "dry", "bibasal", "crackles", ";", "abdomen", "and", "lower", "extremities", "without", "findings", ".", "The", "otorhinolaryngological", "examination", "showed", "hypertrophic", "tonsils", "with", "a", "slight", "whitish", "exudate", "and", "multiple", "cervical", "adenopathies", "of", "1-2", "cm", ",", "not", "attached", "to", "deep", "planes", ",", "painful", "and", "mobile", ".", "There", "were", "no", "pathological", "findings", "in", "the", "dental", "pieces", "on", "examination", ".", "The", "complementary", "tests", "requested", "in", "the", "emergency", "department", "showed", "the", "following", "results", ":", "haemoglobin", "10", ".", "7", "mg", "/", "dl", ",", "leucocytes", "47", ",", "000", "/", "ul", ",", "with", "44", ",", "120", "absolute", "neutrophils", "and", "platelets", "160", ",", "000", "/", "uL", ".", "The", "smear", "showed", "leukocytosis", "with", "neutrophilia", "at", "the", "expense", "of", "mature", "elements", "with", "significant", "toxic", "granulation", "and", "the", "presence", "of", "a", "few", "cysts", ".", "No", "platelet", "aggregates", ".", "Coagulation", "with", "INR", "1", ".", "4", "with", "times", "within", "normality", ".", "Renal", "function", "with", "Cr", "0", ".", "7", "mg", "/", "dL", "with", "an", "estimated", "glomerular", "filtration", "rate", "according", "to", "CKD-EPI", "of", "105", ".", "90", "ml", "/", "min", "/", "1", ".", "73", "m2", ",", "and", "normal", "ions", ",", "normal", "abdominal", "profile", "(", "Bilirubin", "0", ".", "5", "mg", "/", "dL", ")", ",", "CRP", "337", "mg", "/", "L", ",", "procalcitonin", "58", ".", "4", "mg", "/", "L", ".", "Venous", "blood", "gas", "analysis", "showed", "pH", "7", ".", "34", ",", "pO2", "61", "mmHg", ",", "pCO2", "35", "mmHg", ",", "HCO3", "-", "19", "mE", "/", "L", ",", "lactic", "acid", "2", ".", "7", "mosm", "/", "L", ".", "Chest", "X-ray", "showed", "normal", "cardiothoracic", "index", "and", "bibasal", "reticulonodular", "infiltrate", "(", "Chest", "X-ray", ":", "reticulonodular", "infiltrate", "in", "both", "bases", "and", "pulmonary", "nodules", "in", "LSD", ")", "and", "abdominal", "ultrasound", "showed", "right", "pleural", "effusion", "in", "discrete", "quantity", "and", "an", "image", "suggestive", "of", "consolidation", "in", "the", "lower", "lobe", "of", "the", "right", "lung", ".", "Differential", "diagnosis", "In", "view", "of", "the", "data", "obtained", "in", "the", "anamnesis", "and", "the", "complementary", "tests", "requested", "in", "the", "emergency", "department", ",", "we", "considered", "severe", "sepsis", "of", "otorhinolaryngological", "/", "respiratory", "origin", "as", "a", "syndromic", "diagnosis", ",", "with", "the", "following", "diagnostic", "possibilities", ":", "-", "Streptococcal", "tonsillitis", "complicated", "with", ":", "-", "Streptococcal", "toxic", "shock", "syndrome", ",", "this", "could", "be", "considered", "due", "to", "the", "aggressiveness", "of", "the", "picture", ",", "however", "the", "absence", "of", "cutaneous", "involvement", "leads", "us", "to", "doubt", "this", "picture", ",", "as", "less", "than", "20", "%", "present", "without", "such", "involvement", ".", "-", "Septic", "thrombophlebitis", "or", "Lemierre", "'", "s", "syndrome", ":", "factors", "in", "favour", "include", "a", "septic", "picture", "in", "the", "context", "of", "possible", "tonsillitis", ",", "the", "presence", "of", "respiratory", "symptoms", "(", "cough", "and", "dyspnoea", ")", ".", "-", "However", ",", "for", "the", "moment", "we", "did", "not", "have", "enough", "complementary", "tests", ",", "nor", "a", "decisive", "semiology", "in", "the", "cervical", "examination", ",", "to", "confirm", "that", "the", "patient", "had", "a", "jugular", "vein", "thrombosis", ".", "-", "Ludwig", "'", "s", "angina", ",", "practically", "ruled", "out", "due", "to", "the", "presentation", "of", "the", "picture", "and", "the", "absence", "of", "inflammatory", "signs", "in", "the", "floor", "of", "the", "mouth", "and", "submaxillary", "region", ".", "-", "Plaut-Vincent", "'", "s", "angina", ",", "initially", "we", "cannot", "rule", "it", "out", ",", "despite", "the", "otorhinolaryngological", "examination", "described", "above", ",", "as", "no", "ulceronecrotic", "lesion", "with", "formation", "of", "membranes", "can", "be", "seen", ".", "-", "Mononucleosis", "syndrome", "is", "considered", "in", "the", "presence", "of", "fever", ",", "lymphadenopathy", ",", "odynophagia", "and", "tonsillar", "hypertrophy", ";", "however", ",", "the", "intense", "leukocytosis", "at", "the", "expense", "of", "neutrophils", "would", "make", "this", "diagnosis", "difficult", ",", "unless", "it", "is", "a", "possible", "superinfection", ".", "-", "Community-acquired", "pneumonia", ",", "in", "principle", "we", "would", "be", "faced", "with", "a", "mixed", "profile", ",", "atypical", "due", "to", "the", "absence", "of", "clear", "radiological", "consolidation", ",", "dry", "cough", "without", "expectoration", ",", "and", "typical", "due", "to", "high", "fever", "and", "neutrophilic", "leukocytosis", ".", "Evolution", "On", "arrival", "at", "the", "hospital", "ward", ",", "empirical", "treatment", "with", "clarithromycin", "(", "500", "mg", "every", "12", "hours", ")", "had", "already", "been", "started", "in", "the", "emergency", "department", ",", "given", "the", "patient", "'", "s", "history", "of", "allergy", "to", "penicillins", ".", "The", "patient", "was", "in", "septic", "shock", ",", "with", "BP", "90", "/", "40", "mmHg", ",", "HR", "120", "bpm", "and", "tachypnoea", "of", "30", "breaths", "per", "minute", ".", "She", "was", "assessed", "by", "the", "Bacteraemia", "Programme", "team", ",", "who", "added", "clindamycin", "(", "600", "mg", "every", "6", "hours", "IV", ")", "and", "requested", "an", "urgent", "cervico-thoracic", "CT", "scan", ",", "showing", "a", "left", "parapharyngeal", "abscess", "associated", "with", "thrombosis", "of", "the", "left", "internal", "jugular", "vein", "(", "cervical", "CT", "c", "/", "c", ".", "left", "parapharyngeal", "abscess", "associated", "with", "thrombosis", "of", "the", "left", "internal", "jugular", "vein", ")", ".", "left", "parapharyngeal", "abscess", "and", "thrombosis", "of", "the", "left", "internal", "jugular", "vein", ")", "as", "well", "as", "bilateral", "cavitated", "pulmonary", "nodules", "compatible", "with", "septic", "embolism", ",", "associated", "with", "bilateral", "pleural", "effusion", ",", "which", "was", "drained", ",", "obtaining", "pleural", "fluid", "compatible", "with", "empyema", "(", "chest", "CT", "scan", ":", "bilateral", "septic", "emboli", "and", "image", "of", "pleural", "effusion", "predominantly", "on", "the", "right", ")", ",", "with", "the", "placement", "of", "pleural", "drainage", "tubes", ".", "After", "48", "hours", "of", "incubation", ",", "results", "of", "complementary", "microbiological", "tests", "were", "received", ".", "Blood", "culture", "isolated", "Fusobacterium", "spp", ",", "pending", "definitive", "identification", "and", "antibiogram", ".", "Streptococcus", "pneumoniae", "and", "Legionella", "pneumophila", "antigenuria", "was", "negative", ".", "Sputum", "culture", "was", "also", "negative", "for", "bacteria", "and", "mycobacteria", ".", "Serology", "for", "pneumonia", ",", "including", "Mycoplasma", "pneumoniae", ",", "Chlamydia", "pneumoniae", ",", "Chlamydophila", "psittaci", ",", "Coxiella", "burnetti", "and", "respiratory", "viruses", "was", "negative", ",", "as", "well", "as", "for", "Epstein", "Barr", "virus", ",", "cytomegalovirus", ",", "Toxoplasma", "gondii", ",", "hepatitis", "A", ",", "B", ",", "C", "virus", ",", "rubella", "and", "human", "immunodeficiency", "virus", ".", "In", "view", "of", "these", "data", "(", "CT", "scan", "and", "blood", "culture", ")", ",", "as", "well", "as", "the", "absence", "of", "clinical", "improvement", ",", "presenting", "hypoxaemic", "respiratory", "failure", "and", "hypotension", "refractory", "to", "fluid", "therapy", ",", "an", "assessment", "was", "requested", "from", "the", "Intensive", "Care", "Unit", ",", "which", "decided", "to", "admit", "him", "to", "the", "ICU", ".", "During", "his", "stay", "in", "the", "ICU", ",", "tonsillectomy", "and", "abscess", "drainage", "were", "performed", "by", "the", "Otorhinolaryngology", "Department", "and", "assessment", "by", "the", "Allergy", "Department", ",", "which", "performed", "skin", "tests", "with", "major", "and", "minor", "determinants", "of", "benzylpenicillin", "sodium", ",", "with", "negative", "results", ".", "Following", "this", ",", "a", "controlled", "exposure", "test", "with", "penicillin", "was", "performed", ",", "and", "combined", "antibiotic", "treatment", "was", "started", "with", "peciniline", "(", "4", "MU", "every", "4", "hours", ")", "and", "clindamycin", "(", "600mg", "every", "6", "hours", "IV", ")", ",", "methylprednisolone", "(", "40mg", "every", "8", "hours", "IV", ")", "and", "anticoagulation", "with", "low", "molecular", "weight", "heparin", "SC", "(", "60", "mg", "every", "12", "hours", ")", ".", "No", "vasoactive", "amines", "were", "required", ".", "The", "definitive", "results", "of", "the", "blood", "cultures", "were", "received", ",", "which", "reported", "isolation", "of", "Fusobacterium", "necrophorum", "sensitive", "to", "penicillin", ",", "amoxicillin-clavulanic", "acid", ",", "clindamycin", ",", "and", "metronidazole", ";", "and", "the", "pleural", "fluid", "culture", ",", "which", "was", "negative", ".", "After", "these", "therapeutic", "measures", ",", "the", "patient", "improved", "progressively", "without", "requiring", "mechanical", "ventilation", "or", "vasoactive", "amines", ".", "A", "control", "cervico-thoracic", "CT", "scan", "was", "performed", "with", "a", "favourable", "radiological", "response", ",", "and", "the", "patient", "was", "subsequently", "transferred", "to", "the", "Infectious", "Diseases", "hospital", "ward", ".", "Laboratory", "and", "radiological", "controls", "were", "carried", "out", "and", "showed", "an", "improvement", "in", "the", "condition", ",", "despite", "the", "persistence", "of", "residual", "lesions", "in", "the", "form", "of", "smaller", "pulmonary", "nodules", "and", "chronic", "thrombosis", "of", "the", "left", "jugular", "vein", ".", "Given", "the", "clinical", "stability", "of", "the", "patient", ",", "hospital", "discharge", "was", "decided", "on", "day", "+", "20", "of", "admission", ",", "with", "home", "treatment", "with", "clindamycin", "450", "mg", "every", "8", "hours", "for", "a", "further", "2", "weeks", ",", "deflazacort", "30", "mg", "in", "a", "descending", "pattern", ",", "enoxaparin", "60", "mg", "every", "12", "hours", ".", "The", "patient", "was", "reviewed", "in", "the", "outpatient", "infectious", "diseases", "department", "2", "weeks", "after", "hospital", "discharge", ",", "where", "clinical", "improvement", "was", "observed", ",", "with", "virtual", "disappearance", "of", "the", "odynophagia", "and", "normalisation", "of", "the", "haemogram", "and", "acute", "phase", "reactants", ".", "Final", "diagnosis", "Lemierre", "'", "s", "syndrome", "with", "the", "presence", "of", "peritonsillar", "and", "parapharyngeal", "abscess", "complicated", "by", "septic", "thrombophlebitis", "of", "the", "left", "internal", "jugular", "vein", "and", "bilateral", "pulmonary", "septic", "embolisms", "and", "pleural", "empyema", "." ]

[ 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 12, "end": 17 }, { "text": "childhood", "label": "HUMAN", "start": 65, "end": 74 }, { "text": "primary care physician", "label": "HUMAN", "start": 280, "end": 302 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 653, "end": 660 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 847, "end": 854 }, { "text": "Streptococcal", "label": "SPECIES", "start": 2776, "end": 2789 }, { "text": "Streptococcal", "label": "SPECIES", "start": 2822, "end": 2835 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3389, "end": 3396 }, { "text": "Chlamydia pneumoniae", "label": "SPECIES", "start": 5775, "end": 5795 }, { "text": "cytomegalovirus", "label": "SPECIES", "start": 5912, "end": 5927 }, { "text": "Coxiella burnetti", "label": "SPECIES", "start": 5821, "end": 5838 }, { "text": "Fusobacterium spp", "label": "SPECIES", "start": 5506, "end": 5523 }, { "text": "Legionella pneumophila", "label": "SPECIES", "start": 5605, "end": 5627 }, { "text": "Mycoplasma pneumoniae", "label": "SPECIES", "start": 5752, "end": 5773 }, { "text": "Streptococcus pneumoniae", "label": "SPECIES", "start": 5576, "end": 5600 }, { "text": "Toxoplasma gondii", "label": "SPECIES", "start": 5929, "end": 5946 }, { "text": "bacteria", "label": "SPECIES", "start": 5691, "end": 5699 }, { "text": "mycobacteria", "label": "SPECIES", "start": 5704, "end": 5716 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4467, "end": 4474 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4516, "end": 4523 }, { "text": "human immunodeficiency virus", "label": "SPECIES", "start": 5985, "end": 6013 }, { "text": "respiratory viruses", "label": "SPECIES", "start": 5843, "end": 5862 }, { "text": "Chlamydophila psittaci", "label": "SPECIES", "start": 5797, "end": 5819 }, { "text": "Bacteraemia", "label": "SPECIES", "start": 4641, "end": 4652 }, { "text": "Epstein Barr virus", "label": "SPECIES", "start": 5892, "end": 5910 }, { "text": "rubella", "label": "SPECIES", "start": 5973, "end": 5980 }, { "text": "Fusobacterium necrophorum", "label": "SPECIES", "start": 7015, "end": 7040 } ]

[ "History", ",", "current", "disease", "and", "physical", "examination", "A", "54-year-old", "male", "patient", "with", "a", "history", "of", "arterial", "hypertension", ",", "type", "2", "diabetes", "mellitus", ",", "with", "no", "known", "allergies", ".", "Home", "treatment", "with", "insulin", "Lantus", "24", "IU", "/", "24h", "and", "rapid", "insulin", "4", "IU", "/", "8h", ",", "losartan", "100", "mg", "/", "24h", ".", "She", "came", "to", "the", "emergency", "department", "with", "a", "sensation", "of", "numbness", "in", "the", "right", "upper", "limb", "(", "MSD", ")", "the", "previous", "night", ",", "and", "when", "she", "woke", "up", "she", "was", "unable", "to", "move", "it", ".", "He", "denied", "any", "other", "symptoms", ".", "Conscious", ",", "oriented", ",", "alert", ".", "Normal", "language", ".", "Normal", "EOM", ".", "Normal", "cranial", "nerves", ".", "Paresis", "in", "MSD", "3", "/", "5", "and", "slight", "hypoesthesia", ".", "Rhythmic", "heart", "tones", "without", "murmurs", ".", "Preserved", "MV", "without", "added", "noises", ".", "No", "oedema", "in", "lower", "limbs", ".", "Rest", "normal", ".", "Complementary", "tests", "CBC", ":", "normal", "haemogram", ",", "normal", "coagulation", ".", "Biochemistry", "with", "G", "123", "mg", "/", "dl", ",", "Cr", "1", "mg", "/", "dl", ".", "Cholesterol", "192", "mg", "/", "dl", ",", "LDL", "133", "mg", "/", "dl", ",", "TG", "97", "mg", "/", "dl", ".", "Rest", "normal", ".", "ECG", ":", "sinus", "rhythm", "at", "54", "bpm", ",", "normal", "axis", ",", "without", "repolarisation", "alterations", ".", "Cranial", "CT", "scan", ":", "ischaemic", "lesion", "in", "the", "most", "posterior", "portion", "of", "the", "left", "parietal", "lobe", ".", "There", "is", "another", "hypodense", "image", "of", "triangular", "morphology", "in", "the", "left", "frontal", "lobe", "suggesting", "ischaemic", "lesion", ".", "No", "other", "relevant", "findings", ".", "TSA", "echo-Doppler", ":", "parvus", "tardus", "wave", "at", "the", "level", "of", "the", "ICA", "in", "discordance", "with", "what", "was", "seen", "in", "B-mode", "and", "colour", ",", "which", "may", "be", "related", "to", "stenosis", ",", "so", "angio-MRI", "is", "recommended", ".", "Angio-MRI", "of", "TSA", ":", "no", "significant", "stenosis", "data", "are", "seen", "in", "the", "carotid", "bulbs", "or", "in", "the", "internal", "or", "external", "carotid", "arteries", "on", "both", "sides", ".", "Basilar", "and", "vertebral", "arteries", "are", "patent", ".", "Cerebral", "MRI", ":", "several", "lesions", "in", "the", "left", "MCA", "territory", "with", "diffusion", "restriction", ",", "corresponding", "to", "acute", "ischaemic", "lesions", "of", "probable", "embolic", "origin", ".", "Transthoracic", "echocardiogram", ":", "aI", "35", ".", "9", "mm", "and", "Ao", "32", "mm", ".", "Preserved", "LV", "systolic", "function", "with", "LVEF", "of", "64", "%", ".", "Ventricular", "filling", "with", "altered", "relaxation", "pattern", ".", "Mild", "LVH", ".", "Peripheral", "intravenous", "FSS", "was", "injected", "and", "no", "bubbles", "were", "observed", "passing", "through", "the", "interatrial", "septum", "suggestive", "of", "PFO", ".", "Clinical", "evolution", "The", "patient", "recovered", "muscle", "strength", ",", "but", "presented", "mild", "hypoaesthesia", "in", "the", "right", "arm", ".", "He", "was", "discharged", "with", "a", "diagnosis", "of", "left", "parietal", "and", "frontal", "cerebral", "infarction", "of", "uncertain", "nature", ";", "under", "treatment", "with", "Adiro", "300", "mg", "/", "24h", "and", "atorvastatin", "80", "mg", "/", "24h", ".", "She", "was", "readmitted", "after", "8", "months", "due", "to", "vertiginous", "symptoms", ",", "vomiting", ",", "dysarthria", "and", "gait", "instability", ",", "as", "well", "as", "horizontal", "nystagmus", "to", "the", "left", "which", ",", "in", "addition", "to", "the", "previous", "infarcts", ",", "showed", "a", "new", "lesion", "in", "the", "cranial", "CAT", "scan", ",", "compatible", "with", "acute", "infarction", "in", "the", "left", "PICA", "territory", ".", "The", "cardiological", "study", "was", "normal", "and", "transesophageal", "echocardiography", "(", "TEE", ")", "was", "requested", "on", "a", "scheduled", "basis", ".", "He", "was", "discharged", "with", "a", "diagnosis", "of", "cryptogenetic", "left", "cerebellar", "ischaemic", "stroke", ",", "and", "treatment", "with", "Sintrom", ",", "suspending", "Adiro", ".", "TEE", "was", "performed", "and", "reported", "as", "no", "dilatation", "of", "cavities", ".", "Thinning", "of", "the", "interatrial", "septum", "at", "the", "level", "of", "the", "foramen", "ovale", "without", "macroscopic", "detachment", "and", "without", "abnormalities", "in", "mobility", ",", "with", "no", "signs", "of", "shunt", "seen", "with", "colour", "Doppler", ".", "Echocontrast", "was", "performed", "with", "agitated", "colloidal", "solution", "both", "at", "baseline", "and", "after", "the", "Valsalva", "manoeuvre", ".", "Early", "passage", "of", "microbubbles", "to", "the", "left", "cavities", "was", "observed", "after", "the", "Valsalva", "manoeuvre", ".", "The", "patient", "has", "remained", "stable", "during", "follow-up", "with", "no", "new", "cardioembolic", "episodes", ".", "Diagnosis", "Patent", "foramen", "ovale", "Recurrent", "cryptogenic", "ischaemic", "stroke" ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "male patient", "label": "HUMAN", "start": 64, "end": 76 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 69, "end": 76 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2006, "end": 2013 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3268, "end": 3275 } ]

[ "We", "present", "the", "case", "of", "a", "26-year-old", "woman", ",", "with", "no", "previous", "history", "of", "interest", ",", "who", ",", "although", "previously", "well", ",", "began", "with", "mild", "odynophagia", ",", "an", "afternoon", "fever", "of", "up", "to", "38", ".", "5o", ",", "which", "resolved", "well", "with", "paracetamol", ",", "and", "general", "malaise", ".", "No", "accompanying", "chills", "or", "sweating", "crises", ".", "4-5", "days", "later", ",", "she", "noticed", "the", "appearance", "of", "lymph", "nodes", "in", "both", "laterocervical", "areas", "and", "started", "treatment", "with", "amoxicillin", ",", "500", "mg", "/", "8", "h", ",", "on", "her", "own", ",", "without", "observing", "any", "improvement", ".", "Physical", "examination", "revealed", "the", "presence", "of", "lymph", "nodes", "in", "both", "laterocervical", "chains", ",", "of", "medium", "consistency", ",", "rolling", ",", "non-adherent", ",", "1-2", "cm", "in", "diameter", "and", "painless", ".", "There", "were", "no", "palpable", "lymphadenopathies", "at", "other", "levels", "or", "organomegaly", ".", "No", "goitre", "or", "pain", "on", "pressure", "over", "the", "thyroid", "region", ".", "The", "analytical", "study", "showed", "leukocytosis", "with", "lymphocyte", "predominance", ",", "with", "an", "ESR", "of", "22", "mm", "/", "h", ".", "Liver", "function", "was", "preserved", ",", "there", "was", "no", "hypergammaglobulinaemia", "and", "mantoux", "was", "negative", ".", "Chest", "X-ray", "was", "normal", ".", "Serology", "for", "the", "viruses", "studied", "was", "negative", "(", "anti-EBV", ",", "CMV", ",", "HIV", ",", "HTLV-1", ",", "HV-6", ",", "toxoplasma", "and", "syphilis", ")", ".", "In", "the", "immunological", "study", ":", "ANA", ":", "1", "/", "40", "(", "80", ")", ",", "antiDNA", ":", "13", ".", "4", "IU", "/", "ml", "(", "50", ")", ",", "antiRNA", ":", "negative", ",", "ENA-RNP", ":", "0", ".", "45", "and", "anticardiolipin", ":", "negative", ".", "Thyroid", "function", "was", "assessed", ":", "T3", ":", "1", ".", "31", "mg", "/", "L", "(", "0", ".", "6-1", ".", "6", ")", ",", "T4", ":", "84", "mg", "/", "L", "(", "46-93", ")", ",", "TSH", ":", "6", ".", "3", "mU", "/", "L", "(", "<", "7", ")", ",", "TGB", "(", "antithyroglobulin", ")", ":", "20", ".", "17", "U", "/", "mL", "(", "<", "60", ")", ",", "TPO", "(", "antiperoxidase", ")", ":", "1071", "U", "/", "mL", ".", "Thyroid", "scan", "was", "normal", ".", "The", "fever", "disappeared", "after", "12", "days", ",", "but", "the", "lymph", "nodes", "remained", "unchanged", ",", "so", "a", "biopsy", "of", "two", "lymph", "nodes", "in", "the", "middle", "area", "of", "the", "right", "latero-cervical", "chain", "was", "performed", ",", "which", "was", "diagnostic", ".", "Histological", "examination", "was", "compatible", "with", "non-lymphocytic", "histiocytic", "necrotising", "lymphadenitis", "or", "Kikuchi-Fujimoto", "disease", ".", "In", "the", "evolutionary", "control", "of", "thyroid", "function", "5", "months", "after", "the", "onset", "of", "the", "disease", ",", "a", "decrease", "in", "the", "titre", "of", "antithyroid", "antibodies", "was", "observed", "(", "TGB", ":", "7", ".", "6", "U", "/", "mL", ";", "TPO", ":", "870", "U", "/", "mL", ")", ",", "maintaining", "normal", "thyroid", "hormone", "and", "TSH", "levels", "(", "2", ".", "95", "mU", "/", "L", ")", ".", "Our", "diagnosis", "was", "subacute", "lymphocytic", "thyroiditis", "associated", "with", "Kikuchi", "'", "s", "disease", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 37, "end": 42 }, { "text": "CMV", "label": "SPECIES", "start": 1031, "end": 1034 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 1036, "end": 1039 }, { "text": "EBV", "label": "SPECIES", "start": 1026, "end": 1029 }, { "text": "HTLV-1", "label": "SPECIES", "start": 1041, "end": 1047 }, { "text": "HV-6", "label": "SPECIES", "start": 1049, "end": 1053 }, { "text": "toxoplasma", "label": "SPECIES", "start": 1055, "end": 1065 } ]

[ "Reason", "for", "consultation", "Pain", "and", "swelling", "in", "the", "left", "abdomen", ".", "Anamnesis", "and", "physical", "examination", "Male", ",", "40", "years", "old", ",", "with", "no", "personal", "history", "of", "interest", ",", "drinker", "of", "about", "three", "beers", "a", "day", ",", "without", "regular", "treatment", "at", "home", ".", "He", "consulted", "the", "Emergency", "Department", "for", "presenting", "fever", "of", "up", "to", "38oC", "and", "pain", "with", "a", "sensation", "of", "inflammation", "in", "the", "left", "hemiabdomen", "of", "about", "20", "days", "'", "evolution", ".", "Dyspnoea", "on", "moderate", "exertion", "for", "the", "last", "ten", "days", ",", "with", "no", "accompanying", "cough", "or", "expectoration", ".", "She", "had", "no", "weight", "loss", "or", "night", "sweats", ",", "nor", "did", "she", "report", "any", "other", "symptoms", "in", "the", "anamnesis", "by", "apparatus", ".", "At", "the", "onset", "of", "the", "symptoms", "he", "had", "visited", "his", "regional", "referral", "hospital", "on", "two", "occasions", ",", "where", "he", "had", "undergone", "a", "blood", "test", "showing", "mild", "leukocytes", "and", "elevated", "CRP", ",", "as", "well", "as", "a", "CT", "scan", "of", "the", "abdomen", "showing", "thickening", "of", "the", "muscle", "bellies", "and", "subcutaneous", "cellular", "tissue", ",", "with", "no", "other", "findings", ",", "for", "which", "antibiotic", "treatment", "with", "amoxicillin", "/", "clavulanic", "acid", "was", "prescribed", ",", "without", "the", "patient", "noticing", "any", "improvement", "in", "his", "symptoms", ".", "Physical", "examination", "showed", "blood", "pressure", "140", "/", "100", "mmHg", ",", "heart", "rate", "100", "bpm", ",", "baseline", "oxygen", "saturation", "93", "%", ",", "temperature", "37", ".", "5oC", ".", "General", "condition", "is", "good", ",", "with", "good", "level", "of", "consciousness", "and", "orientation", "in", "the", "three", "spheres", ".", "No", "cervical", "or", "axillary", "lymphadenopathy", ".", "Cardiac", "auscultation", "was", "rhythmic", ",", "with", "no", "murmurs", ",", "and", "respiratory", "auscultation", "showed", "hyperventilation", "in", "the", "left", "base", ".", "The", "abdomen", "was", "soft", ",", "not", "painful", "on", "palpation", ",", "with", "no", "palpable", "masses", "or", "megaliths", ".", "The", "lateral", "and", "posterior", "area", "of", "the", "left", "abdomen", "was", "oedematous", ",", "slightly", "erythematous", "and", "warmer", "than", "the", "rest", "of", "the", "abdomen", ".", "Extremities", "without", "oedema", ",", "with", "palpable", "distal", "pulses", "and", "no", "other", "alterations", ".", "No", "cervical", ",", "axillary", "or", "inguinal", "lymph", "nodes", "were", "palpable", ".", "Examination", "of", "the", "cranial", "nerves", "was", "normal", ",", "with", "intact", "strength", ",", "muscle", "tone", "and", "sensation", ".", "Complementary", "tests", "Laboratory", "tests", "performed", "in", "the", "ED", "showed", "a", "haemocyte", "count", "of", "106", ",", "000", "leukocytes", "/", "μL", ",", "with", "a", "normal", "leukocyte", "formula", ",", "haemoglobin", "13", ".", "8", "g", "/", "dL", ",", "platelets", "183", ",", "000", "/", "μL", ".", "Coagulation", "with", "75", "%", "prothrombin", "activity", ".", "Biochemistry", "with", "normal", "glucose", ",", "renal", "function", "and", "ions", ",", "CRP", "47", ".", "Chest", "X-ray", "shows", "a", "left", "pleural", "effusion", ".", "The", "electrocardiogram", "showed", "sinus", "rhythm", "at", "85", "bpm", ",", "with", "normal", "QRS", "complex", "axis", "and", "no", "repolarisation", "abnormalities", ".", "An", "ultrasound", "scan", "of", "the", "abdomen", "showed", "thickening", "of", "the", "abdominal", "oblique", ",", "latissimus", "dorsi", "and", "left", "serratus", "muscle", "bellies", ",", "as", "well", "as", "inflammatory", "changes", "in", "the", "subcutaneous", "cellular", "tissue", "and", "slight", "attenuation", "changes", "in", "the", "fat", "of", "the", "posas", "and", "left", "iliac", "region", ".", "With", "these", "data", ",", "the", "patient", "was", "admitted", "to", "the", "Internal", "Medicine", "hospital", "ward", "for", "investigation", "of", "localised", "or", "focal", "myositis", ".", "Differential", "diagnosis", "Myositis", "is", "an", "inflammation", "of", "the", "musculoskeletal", "tissue", "that", "can", "be", "caused", "by", "different", "pathologies", ".", "Infection", "is", "a", "rare", "cause", "of", "soft", "tissue", "infections", ".", "It", "can", "be", "caused", "by", "multiple", "pathogens", ",", "including", "viruses", "(", "Coxsackie", "group", "B", "or", "HIV", ")", ",", "trichinosis", "and", "bacterial", "infections", ".", "In", "addition", ",", "in", "the", "case", "of", "penetrating", "wounds", "contaminated", "by", "spores", "of", "Clostridium", "perfringens", ",", "which", "causes", "gas", "gangrene", ",", "the", "following", "can", "occur", "1", ".", "Inflammatory", "myopathies", "include", "a", "heterogeneous", "group", "of", "muscle", "diseases", "that", "have", "in", "common", "subacute", "or", "chronic", "muscle", "weakness", "and", "the", "presence", "of", "inflammatory", "infiltrates", "in", "the", "muscle", "biopsy", ".", "Included", "in", "this", "group", "is", "polymyositis", "characterised", "by", "proximal", "predominantly", "symmetrical", "weakness", "of", "chronic", "course", ",", "in", "addition", "to", "systemic", "manifestations", ".", "It", "also", "includes", "dermatomyositis", ",", "characterised", "by", "asthenia", "and", "fever", ",", "followed", "by", "muscle", "involvement", "and", "the", "appearance", "of", "skin", "lesions", ".", "Finally", ",", "inclusion", "body", "myositis", "is", "the", "only", "one", "most", "prevalent", "in", "males", ",", "characterised", "by", "slow", ",", "symmetrical", "weakness", ",", "initially", "in", "the", "lower", "limbs", ",", "and", "atrophy", "of", "the", "affected", "musculature", ".", "2", "Metabolic", "myopathies", "have", "in", "common", "abnormalities", "in", "muscle", "energy", "metabolism", ",", "muscle", "biopsy", "reveals", "fibre", "necrosis", "and", "phagocytosis", ",", "as", "well", "as", "esonophilic", "myositis", "as", "part", "of", "an", "eosinophilic", "syndrome", ",", "granulomatous", "myositis", "(", "isolated", "or", "associated", "with", "granulomatous", "syndromes", ")", ".", "Other", "diseases", "to", "consider", "in", "the", "diagnosis", "especially", "when", "the", "form", "is", "localised", "are", "muscle", "cancer", "and", "/", "or", "thrombophlebitis", ".", "3", "The", "diagnosis", "of", "inflammatory", "myopathies", "is", "suspected", "on", "the", "basis", "of", "clinical", "features", "and", "confirmed", "by", "laboratory", "tests", ",", "serum", "muscle", "enzyme", "concentration", ",", "presence", "of", "autoantibodies", ",", "electromyography", "and", "muscle", "biopsy", ".", "Recently", ",", "muscle", "MRI", "and", "ultrasound", "studies", "have", "been", "introduced", "as", "auxiliary", "tools", "in", "the", "process", "of", "differential", "diagnosis", "of", "myopathies", ".", "The", "definitive", "diagnostic", "procedure", "is", "muscle", "biopsy", ",", "which", "ideally", "should", "be", "performed", "prior", "to", "the", "start", "of", "treatment", "and", "is", "usually", "taken", "from", "the", "vastolateral", ",", "deltoid", "or", "biceps", "brachii", "muscles", ",", "verifying", "that", "the", "muscle", "does", "not", "show", "severe", "atrophy", ".", "3", "Final", "result", "In", "our", "case", ",", "the", "patient", "presented", "with", "a", "very", "localised", "myositis", ",", "with", "exclusive", "involvement", "of", "the", "muscle", "bellies", "of", "the", "chest", "and", "abdominal", "wall", ",", "as", "well", "as", "involvement", "of", "the", "subcutaneous", "cellular", "tissue", ".", "Given", "the", "patient", "'", "s", "epidemiological", "history", ",", "a", "diagnosis", "of", "trichinosis", "was", "made", "and", "treatment", "was", "started", "with", "albendazole", "and", "antibiotic", "therapy", "aimed", "at", "the", "cellulitis", "secondary", "to", "the", "process", ".", "Blood", "cultures", ",", "stool", "cultures", "and", "serology", "(", "including", "trichina", "spiralis", ")", "were", "also", "taken", ",", "with", "negative", "results", ".", "The", "patient", "'", "s", "muscular", "lesion", "did", "not", "improve", "despite", "the", "start", "of", "treatment", ",", "and", "even", "progressed", "to", "other", "muscle", "bellies", ",", "and", "the", "pleural", "effusion", "got", "progressively", "worse", ".", "Diagnostic", "thoracentesis", "was", "performed", ",", "compatible", "with", "exudate", ",", "which", "was", "sent", "to", "microbiology", "and", "pathological", "anatomy", ",", "with", "negative", "results", "for", "malignant", "cells", ",", "although", "suggestive", "of", "an", "inflammatory", "process", "with", "abundant", "eosinophilia", ".", "Finally", ",", "it", "was", "necessary", "to", "perform", "a", "pleural", "drainage", "due", "to", "respiratory", "failure", "with", "massive", "pleural", "effusion", ".", "In", "view", "of", "the", "persistence", "of", "the", "symptoms", ",", "muscular", "magnetic", "resonance", "imaging", "(", "MRI", ")", "was", "requested", ",", "which", "showed", "a", "destructuring", "of", "the", "muscular", "wall", ",", "with", "inflammatory", "changes", ",", "fundamental", "involvement", "of", "the", "muscles", "of", "the", "lateral", "abdominal", "wall", "and", "left", "flank", ",", "which", "showed", "irregular", "enhancement", "with", "contrast", ",", "without", "appreciable", "drainable", "organised", "collections", ",", "as", "well", "as", "oedema", "in", "the", "fat", "of", "the", "abdominal", "wall", "and", "in", "the", "interior", "of", "the", "abdominal", "cavity", ".", "Finally", ",", "it", "was", "decided", "to", "perform", "a", "muscle", "biopsy", "by", "surgery", ",", "sending", "the", "sample", "to", "the", "microbiology", "and", "pathological", "anatomy", "laboratories", "at", "our", "centre", ".", "The", "microbiological", "study", "was", "negative", ".", "The", "anatomopathological", "study", "was", "of", "fibroadipose", "tissue", "and", "striated", "muscle", "bundles", "showing", "infiltration", "by", "a", "proliferation", "of", "large", "cells", "with", "an", "oval", "nucleus", "accompanied", "by", "numerous", "eosinophils", ",", "after", "the", "immunohistochemical", "study", "a", "diagnosis", "of", "a", "peripheral", "T", "lymphoproliferative", "process", "of", "the", "peripheral", "T", "lymphoma", "type", "with", "an", "aberrant", "T", "immunophenotype", "was", "made", ".", "The", "patient", "was", "assessed", "by", "the", "Oncology", "Department", ",", "which", "started", "chemotherapy", "treatment", "with", "the", "CHOP", "scheme", "with", "the", "patient", "hospitalised", ",", "with", "good", "tolerance", "by", "the", "patient", ",", "so", "it", "was", "decided", "to", "discharge", "him", "home", "to", "continue", "treatment", "and", "follow-up", "on", "an", "outpatient", "basis", ".", "The", "chemotherapy", "treatment", "has", "now", "been", "completed", "and", "in", "the", "latest", "check-ups", "the", "patient", "is", "in", "complete", "remission", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Male", "label": "HUMAN", "start": 99, "end": 103 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1001, "end": 1008 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 127, "end": 135 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2651, "end": 2658 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 3021, "end": 3024 }, { "text": "pathogens", "label": "SPECIES", "start": 2970, "end": 2979 }, { "text": "Coxsackie group B", "label": "SPECIES", "start": 3000, "end": 3017 }, { "text": "bacterial", "label": "SPECIES", "start": 3043, "end": 3052 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4959, "end": 4966 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5161, "end": 5168 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5466, "end": 5473 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 7022, "end": 7029 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 7138, "end": 7145 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 7187, "end": 7194 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 7378, "end": 7385 }, { "text": "trichina spiralis", "label": "SPECIES", "start": 5403, "end": 5420 } ]

[ "Anamnesis", "53-year-old", "male", ",", "businessman", ",", "with", "no", "known", "drug", "allergies", "or", "toxic", "habits", ".", "He", "came", "to", "our", "clinic", "accompanied", "by", "his", "wife", ".", "He", "was", "diagnosed", "with", "myasthenia", "gravis", "with", "ocular", "and", "bulbar", "involvement", "of", "20", "years", "of", "evolution", ",", "thymectomised", "and", "under", "treatment", "with", "azathioprine", "100", "mg", "per", "day", "and", "pyridostigmine", "180", "mg", "per", "day", ".", "He", "did", "not", "follow", "routine", "check-ups", "by", "Neurology", ".", "He", "consulted", "for", "generalised", "pruritic", "skin", "lesions", "of", "two", "days", "'", "evolution", "accompanied", "by", "intense", "burning", ",", "stabbing", "pain", "in", "the", "right", "parieto-temporal", "region", ".", "The", "patient", "reported", "pain", "in", "the", "right", "ear", "for", "5", "days", "and", "his", "general", "practitioner", ",", "observing", "some", "erythema", "in", "the", "external", "auditory", "canal", ",", "had", "prescribed", "ciprofloxacin", "drops", "for", "possible", "otitis", "externa", ".", "He", "also", "explained", "that", "he", "had", "been", "going", "through", "a", "period", "of", "stress", "for", "several", "months", "due", "to", "problems", "at", "work", ".", "Physical", "examination", "The", "patient", "was", "conscious", ",", "oriented", ",", "normal", "colour", "and", "normohydrated", ".", "There", "was", "a", "disseminated", "cutaneous", "eruption", "consisting", "of", "multiple", "erythematous", "papules", ",", "some", "of", "which", "were", "vesicular", "and", "others", "crusted", ",", "which", "he", "related", "to", "the", "application", "of", "ear", "drops", ".", "They", "were", "distributed", "on", "both", "the", "trunk", "and", "the", "extremities", ".", "There", "was", "no", "involvement", "of", "the", "mucous", "membranes", ",", "palms", "or", "soles", ".", "In", "addition", ",", "a", "large", "necrotic", "plaque", "with", "smaller", "satellite", "lesions", "was", "observed", "in", "the", "right", "temporal", "region", ".", "The", "rest", "of", "the", "physical", "examination", "was", "normal", ".", "Complementary", "examinations", "Blood", "tests", "showed", "megaloblastic", "anaemia", "(", "haemoglobin", "9", ".", "6", "g", "/", "dl", "and", "mean", "corpuscular", "volume", "124", "fl", ")", ",", "coagulation", ",", "renal", ",", "hepatic", "and", "electrolyte", "function", "in", "the", "normal", "range", ".", "In", "addition", ",", "a", "chest", "X-ray", "showed", "a", "bilateral", "interstitial", "pattern", "suggestive", "of", "pneumonia", ".", "Diagnosis", "Clinical", "manifestations", "were", "compatible", "with", "disseminated", "right", "temporal", "herpes", "zoster", "in", "a", "patient", "immunosuppressed", "by", "chronic", "azathioprine", ".", "In", "addition", ",", "secondary", "varicella", "pneumonia", "and", "azathioprine", "megaloblastic", "anaemia", "were", "diagnosed", ".", "Treatment", "The", "patient", "was", "admitted", "(", "in", "isolation", ")", "and", "started", "treatment", "with", "intravenous", "acyclovir", "at", "a", "dose", "of", "10", "mg", "/", "kg", "every", "8", "hours", ",", "analgesia", "with", "paracetamol", ",", "nolotil", "and", "pregabalin", ",", "as", "well", "as", "zinc", "sulphate", "fomentation", "for", "10", "minutes", "twice", "a", "day", "and", "topical", "fusidic", "acid", "on", "the", "necrotic", "lesions", "of", "the", "scalp", ".", "Evolution", "The", "patient", "was", "admitted", "to", "hospital", "for", "a", "week", "with", "good", "evolution", "and", "completing", "the", "antiviral", "treatment", ".", "At", "discharge", "the", "lesions", "were", "in", "the", "crusting", "phase", "and", "the", "neuropathic", "pain", "was", "controlled", "with", "the", "prescribed", "analgesia", ".", "The", "control", "chest", "X-ray", "showed", "no", "abnormalities", ",", "and", "the", "pneumonia", "had", "resolved", ".", "The", "patient", "was", "referred", "to", "the", "outpatient", "neurology", "department", "for", "monitoring", "of", "his", "underlying", "disease", "." ]

[ 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "male", "label": "HUMAN", "start": 22, "end": 26 }, { "text": "general practitioner", "label": "HUMAN", "start": 607, "end": 627 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 549, "end": 556 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 887, "end": 894 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1825, "end": 1832 }, { "text": "varicella", "label": "SPECIES", "start": 1898, "end": 1907 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1988, "end": 1995 }, { "text": "antiviral", "label": "SPECIES", "start": 2387, "end": 2396 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2304, "end": 2311 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2616, "end": 2623 } ]

[ "Personal", "history", "45-year-old", "woman", "from", "Lithuania", ",", "working", "as", "a", "strawberry", "farmer", "in", "Spain", "for", "five", "months", ".", "She", "smoked", "ten", "cigarettes", "a", "day", ".", "Initially", "diagnosed", "with", "tuberculosis", "in", "Lithuania", ",", "undergoing", "treatment", "for", "four", "years", ".", "In", "2001", "she", "underwent", "a", "left", "lower", "lobectomy", ".", "Initially", ",", "we", "had", "no", "reports", "or", "other", "sources", "to", "verify", "and", "expand", "the", "information", ".", "However", ",", "we", "subsequently", "obtained", "additional", "information", "on", "her", "history", ":", "she", "was", "initially", "diagnosed", "with", "tuberculosis", "in", "1995", ",", "and", "started", "treatment", "with", "five", "drugs", "(", "rifampicin", ",", "ethambutol", ",", "isoniazid", ",", "pyrazinamide", "and", "streptomycin", ")", ",", "which", "she", "maintained", "for", "four", "years", "due", "to", "poor", "evolution", ".", "In", "1999", "the", "antibiotic", "regimen", "was", "changed", "to", "ofloxacin", ",", "cycloserine", "and", "amikacin", ".", "In", "2001", ",", "a", "left", "lower", "lobectomy", "was", "performed", ",", "and", "after", "the", "operation", ",", "ofloxacin", "and", "cycloserine", "were", "continued", "for", "another", "year", ".", "There", "was", "no", "other", "history", "of", "interest", ".", "Present", "illness", "Since", "December", "2004", ",", "he", "presented", "cough", "with", "mucopurulent", "expectoration", "and", "febrile", "syndrome", ",", "predominantly", "in", "the", "evening", ",", "accompanied", "by", "profuse", "sweating", "and", "unquantified", "weight", "loss", ".", "She", "underwent", "a", "course", "of", "antibiotic", "treatment", "without", "improvement", ".", "She", "subsequently", "attended", "the", "Emergency", "Department", "of", "the", "Hospital", "Juan", "Ramón", "Jiménez", "in", "February", "2005", ",", "referred", "from", "her", "health", "centre", ".", "Physical", "examination", "The", "patient", "was", "conscious", ",", "oriented", "and", "cooperative", ",", "in", "good", "general", "condition", ",", "well", "hydrated", "and", "perfused", ".", "Eupneic", "at", "rest", ".", "Weight", "was", "49", ".", "5", "kg", ".", "Arterial", "oxygen", "saturation", "was", "99", "%", "(", "FiO2", "0", ".", "21", ")", ",", "blood", "pressure", "127", "/", "74", "mmHg", "and", "temperature", "40", ".", "5oC", ".", "There", "were", "no", "palpable", "adenopathies", ".", "On", "auscultation", ",", "the", "cardiac", "tones", "were", "rhythmic", "with", "no", "murmurs", ",", "and", "the", "vesicular", "murmur", "was", "preserved", "in", "the", "right", "hemithorax", "and", "decreased", "in", "the", "left", "base", "with", "a", "tubal", "murmur", "in", "the", "left", "upper", "third", "and", "crackles", "in", "the", "middle", "and", "upper", "third", ".", "The", "abdomen", "was", "soft", ",", "depressible", ",", "without", "masses", "or", "megaliths", ",", "and", "in", "the", "lower", "limbs", "there", "were", "no", "signs", "of", "deep", "vein", "thrombosis", ".", "Peripheral", "pulses", "were", "full", "and", "symmetrical", "and", "the", "neurological", "examination", "was", "normal", ".", "Complementary", "examinations", "The", "red", "blood", "count", "was", "normal", ",", "leukocytes", "15", ",", "900", "/", "μL", "(", "86", "%", "neutrophils", ",", "6", ".", "8", "%", "lymphocytes", ")", ",", "and", "platelets", "775", ",", "000", "/", "μL", ".", "Biochemistry", "showed", ":", "glycaemia", "132", "mg", "/", "dL", ",", "creatinine", "0", ".", "61", "mg", "/", "dL", ",", "urea", "11", "mg", "/", "dL", ",", "total", "proteins", "5", ".", "8", "g", "/", "dL", "and", "ESR", "113", "mm", "/", "h", ".", "The", "rest", "showed", "no", "significant", "alterations", ".", "HIV", "serology", "was", "negative", ".", "Chest", "X-ray", "showed", "an", "image", "of", "increased", "density", "in", "the", "left", "hemithorax", "with", "areas", "of", "basal", "aeration", "and", "left", "apex", ",", "with", "marked", "ipsilateral", "volume", "loss", ".", "There", "was", "traction", "of", "mediastinal", "structures", "towards", "the", "left", "hemifield", "and", "suture", "in", "the", "left", "lower", "lobe", "stump", ".", "Fibrobronchoscopy", "showed", "inflammatory", "signs", "in", "the", "left", "upper", "lobe", "with", "oedematous", "mucosa", "and", "stenosis", "of", "the", "segmental", "bronchi", "with", "purulent", "material", "inside", ".", "The", "bronchial", "suture", "stump", "in", "the", "left", "lower", "lobe", "bronchus", "formed", "a", "kind", "of", "cul-de-sac", "and", "a", "rounded", "formation", "suggestive", "of", "granuloma", "was", "observed", ".", "Diagnostic", "test", "Bronchoaspirate", "and", "sputum", "smear", "microscopy", ":", "abundant", "acid-fast", "bacilli", "were", "observed", ".", "Mycobacterium", "tuberculosis", "was", "isolated", "in", "mycobacterial", "culture", ".", "Clinical", "judgement", "Active", "pulmonary", "tuberculosis", "(", "recurrence", ")", ".", "Evolution", "The", "patient", "was", "initially", "treated", "with", "ceftriaxone", "2", "g", "/", "d", "and", "clarithromycin", "500", "mg", "/", "12h", ".", "After", "a", "positive", "smear", "microscopy", ",", "treatment", "was", "started", "with", "isoniazid", "250", "mg", "/", "d", ",", "rifampicin", "600", "mg", "/", "d", ",", "pyrazanamide", "1", ",", "500", "mg", "/", "d", "and", "ethambutol", "1", ",", "200", "mg", "/", "d", ",", "with", "fever", "persisting", "after", "two", "weeks", "of", "treatment", ".", "At", "this", "point", "he", "was", "transferred", "to", "our", "chronic", "admission", "hospital", "to", "continue", "treatment", ".", "During", "his", "stay", "at", "this", "centre", ",", "the", "febrile", "fever", "and", "haemoptotic", "sputum", "persisted", ".", "Shortly", "afterwards", ",", "the", "mycobacterial", "culture", "report", "was", "received", ",", "which", "isolated", "Mycobacterium", "tuberculosis", "resistant", "to", "streptomycin", ",", "ethambutol", ",", "rifampicin", ",", "isoniazid", "and", "possibly", "pyrazinamide", ",", "so", "she", "was", "transferred", "to", "Hospital", "La", "Fuenfría", "in", "Madrid", "for", "treatment", "compliance", "in", "respiratory", "isolation", ".", "Once", "there", ",", "the", "sensitivity", "study", "was", "repeated", ",", "detecting", "resistance", "to", "all", "first-line", "drugs", "except", "pyrazinamide", "and", "sensitivity", "to", "all", "second-line", "drugs", "tested", ",", "initiating", "treatment", "with", "levofloxacin", "500", "mg", "/", "day", ",", "cycloserine", "250", "mg", "/", "8", "hours", "and", "amikacin", "1", "vial", "of", "500", "mg", "/", "48", "hours", ".", "After", "four", "weeks", "of", "treatment", ",", "weight", "gain", ",", "disappearance", "of", "fever", "and", "negative", "smear", "tests", "were", "observed", ",", "and", "the", "patient", "was", "discharged", "for", "a", "check-up", "." ]

[ 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Personal", "label": "HUMAN", "start": 0, "end": 8 }, { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 29, "end": 34 }, { "text": "strawberry", "label": "SPECIES", "start": 64, "end": 74 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1341, "end": 1348 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 2397, "end": 2400 }, { "text": "smear microscopy", "label": "SPECIES", "start": 3042, "end": 3058 }, { "text": "Mycobacterium tuberculosis", "label": "SPECIES", "start": 3102, "end": 3128 }, { "text": "acid-fast bacilli", "label": "SPECIES", "start": 3069, "end": 3086 }, { "text": "smear microscopy", "label": "SPECIES", "start": 3348, "end": 3364 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3247, "end": 3254 }, { "text": "Mycobacterium tuberculosis", "label": "SPECIES", "start": 3794, "end": 3820 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4412, "end": 4419 } ]

[ "On", "1", "January", "2020", ",", "a", "42-year-old", "man", "was", "admitted", "to", "Union", "Hospital", "(", "Tongji", "Medical", "School", ",", "Wuhan", ",", "Hubei", "Province", ")", "with", "hyperthermia", "(", "39", ".", "6", "°", "C", ")", ",", "cough", "and", "fatigue", "of", "one", "week", "'", "s", "duration", ".", "On", "auscultation", ",", "bilateral", "breath", "sounds", "with", "moist", "rales", "were", "heard", "at", "the", "bases", "of", "both", "lungs", ".", "Laboratory", "tests", "showed", "leukocytopenia", "(", "leukocyte", "count", ":", "2", ".", "88", "3", "109", "/", "L", ")", "and", "lymphocytosis", "(", "lymphocyte", "count", ":", "0", ".", "90", "3", "109", "/", "L", ")", ".", "The", "leukocyte", "count", "showed", "56", ".", "6", "%", "neutrophils", ",", "32", ".", "1", "%", "lymphocytes", "and", "10", ".", "2", "%", "monocytes", ".", "Several", "additional", "analytical", "tests", "gave", "abnormal", "results", ",", "such", "as", "C-reactive", "protein", "(", "158", ".", "95", "mg", "/", "L", ";", "normal", "range", ":", "0-10", "mg", "/", "L", ")", ",", "erythrocyte", "sedimentation", "rate", "(", "38", "mm", "/", "h", ";", "normal", "value", ":", "20", "mm", "/", "h", ")", ",", "serum", "amyloid", "A", "protein", "(", "607", ".", "1", "mg", "/", "L", ";", "normal", "value", ":", "10", "mg", "/", "L", ")", ",", "aspartate", "aminotransferase", "(", "53", "U", "/", "L", ";", "normal", "range", ":", "8-40", "U", "/", "L", ")", "and", "alanine", "aminotransferase", "(", "60", "U", "/", "L", ";", "normal", "range", ":", "5-40", "U", "/", "L", ")", ".", "Real-time", "fluorescence", "PCR", "of", "the", "patient", "'", "s", "sputum", "was", "positive", "for", "2019-nCoV", "nucleic", "acid", ".", "The", "patient", "was", "treated", "with", "antivirals", "(", "ganciclovir", ",", "oseltamivir", ")", "and", "anti-inflammatory", "drugs", "(", "meropenem", ",", "linezolid", ")", ",", "with", "symptomatic", "treatment", ",", "from", "1", "January", "2020", "until", "his", "discharge", "on", "25", "January", "2020", ".", "The", "consecutive", "imaging", "tests", "shown", "in", "the", "figure", "illustrate", "the", "patient", "'", "s", "improvement", "after", "therapy", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "man", "label": "HUMAN", "start": 33, "end": 36 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 899, "end": 906 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 961, "end": 968 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1229, "end": 1236 }, { "text": "2019-nCoV", "label": "SPECIES", "start": 933, "end": 942 }, { "text": "antivirals", "label": "SPECIES", "start": 986, "end": 996 } ]

[ "A", "43-year-old", "patient", "presented", "to", "the", "emergency", "department", "with", "fever", "and", "general", "malaise", "of", "three", "weeks", "'", "duration", ".", "The", "patient", "had", "no", "family", "or", "personal", "medical", "or", "surgical", "history", "of", "interest", "and", "only", "reported", "taking", "occasional", "omeprazole", "and", "regular", "analgesics", ".", "He", "had", "been", "an", "active", "smoker", "of", "1", "pack", "/", "day", "since", "the", "age", "of", "12", "and", "a", "regular", "beer", "drinker", "and", "occasional", "gin", "drinker", ".", "Lived", "with", "his", "mother", "in", "a", "rural", "area", "of", "the", "province", "of", "Granada", ",", "single", "and", "childless", ".", "He", "was", "engaged", "in", "agricultural", "and", "livestock", "tasks", "so", "he", "had", "daily", "contact", "with", "animals", "(", "goats", ",", "dogs", "and", "chickens", ")", ",", "had", "no", "recent", "international", "travel", "or", "risky", "sexual", "contact", "in", "the", "last", "12", "months", ".", "The", "fever", "was", "daily", ",", "up", "to", "40oC", ",", "of", "about", "3", "weeks", "'", "duration", ",", "predominantly", "in", "the", "evening", ",", "with", "bacteremic", "features", ",", "accompanied", "by", "chills", ",", "profuse", "sweating", "and", "even", "nocturnal", "delirium", ".", "He", "was", "also", "associated", "with", "severe", "asthenia", ",", "progressive", "generalised", "weakness", "and", "unweighted", "weight", "loss", "for", "a", "year", ",", "which", "had", "become", "more", "pronounced", "in", "the", "last", "four", "months", ".", "In", "the", "anamnesis", "by", "organs", "and", "apparatus", ",", "he", "only", "described", "discrete", "pharyngeal", "pain", "and", "unspecific", "abdominal", "discomfort", ",", "with", "a", "feeling", "of", "abdominal", "distension", ",", "as", "well", "as", "a", "dry", "cough", "without", "expectoration", "or", "dyspnoea", "of", "long", "evolution", ",", "which", "he", "related", "to", "smoking", ".", "Physical", "examination", "on", "arrival", "showed", "haemodynamic", "stability", "with", "a", "tendency", "to", "hypotension", "(", "temperature", "36", ".", "4o", "C", ",", "BP", "108", "/", "62", "mmHg", ",", "HR", "66", "bpm", ",", "RR", "16", "rpm", "and", "SpO2", "98", "%", "baseline", ")", "and", "good", "general", "condition", "with", "mild", "facial", "flushing", ".", "Normohydrated", "and", "normoperfused", ".", "Conscious", "and", "oriented", ",", "with", "neurological", "examination", "compatible", "with", "normality", ".", "Oropharynx", "was", "slightly", "erythematous", "with", "no", "exudate", "and", "no", "palpable", "laterocervical", ",", "preauricular", ",", "supraclavicular", ",", "axillary", "or", "inguinal", "lymphadenopathy", ".", "Cardiorespiratory", "auscultation", "was", "normal", ".", "Hepato-splenomegaly", "was", "palpable", "in", "the", "abdomen", ",", "but", "not", "painful", ".", "There", "was", "no", "oedema", ",", "signs", "of", "DVT", ",", "skin", "lesions", "or", "bite", "marks", "on", "the", "extremities", ".", "Initial", "complementary", "tests", "showed", "pancytopenia", "with", "leukocytes", "3280", "x", "10e3", "/", "mcl", ",", "neutrophils", "36", ".", "1", "%", "(", "absolute", "1180", "x", "10e3", "/", "mcl", ")", ",", "lymphocytes", "55", ".", "5", "%", "(", "absolute", "1820", "x", "10e3", "/", "mcl", ")", ",", "haemoglobin", "11", ".", "6", "g", "/", "dL", "with", "MCV", "87", "fL", "and", "77000", "platelets", "/", "mcl", ".", "Biochemistry", "showed", "mild", "elevation", "of", "LDH", "(", "585", "IU", "/", "L", ")", ",", "liver", "enzymes", "(", "GOT", "67", "U", "/", "L", ",", "GPT", "143", "U", "/", "L", ")", "with", "dissociated", "cholestasis", "(", "GGT", "319", "U", "/", "L", ",", "FA", "207", "U", "/", "L", "and", "normal", "total", "bilirubin", ")", "and", "CRP", "114", "mg", "/", "L", ".", "Renal", "function", "and", "ions", "were", "within", "normal", "limits", ".", "An", "anaemia", "study", "was", "performed", "and", "found", "an", "iron", "level", "of", "27", "mcg", "/", "dl", "with", "a", "ferritin", "of", "3581", "ng", "/", "ml", ",", "transferrin", "175", "mg", "/", "dl", ",", "IST", "12", ".", "4", "%", ",", "reticulocytes", "2", ".", "24", "%", "and", "a", "peripheral", "blood", "smear", "compatible", "with", "normality", ".", "Finally", ",", "in", "basic", "coagulation", ",", "prothrombin", "activity", "was", "71", "%", "and", "INR", "1", ".", "25", ".", "An", "ECG", ",", "chest", "X-ray", "in", "posteroanterior", "and", "lateral", "projections", ",", "as", "well", "as", "a", "simple", "decubitus", "abdominal", "X-ray", "were", "performed", ",", "both", "of", "which", "were", "normal", ".", "The", "abdominal", "ultrasound", "showed", "moderate", "hepatomegaly", "and", "splenomegaly", "with", "heterogeneous", "echogenicity", ".", "With", "the", "diagnoses", "of", "fever", "of", "intermediate", "duration", ",", "pancytopenia", "and", "hepatosplenomegaly", ",", "he", "was", "admitted", "to", "the", "Infectious", "Diseases", "Department", ".", "Differential", "diagnosis", "The", "differential", "diagnosis", "of", "a", "patient", "with", "fever", ",", "pancytopenia", "and", "splenomegaly", "is", "not", "uncommon", "in", "an", "Infectious", "Diseases", "Department", ".", "Generally", "speaking", ",", "there", "are", "three", "possible", "origins", ":", "infectious", ",", "tumoural", "and", "autoimmune", "causes", ",", "although", "we", "cannot", "forget", "other", "miscellaneous", "causes", ".", "Among", "the", "infectious", "aetiologies", ",", "there", "are", "many", "micro-organisms", "that", "can", "cause", "this", "condition", ":", "a", ")", "viruses", ":", "HIV", "infection", ",", "herpes", "virus", "(", "HSV", ",", "EBV", ",", "CMV", ",", "VH6", ")", "and", "Parvovirus", "B19", "mainly", "should", "be", "ruled", "out", ";", "b", ")", "considering", "a", "bacterial", "cause", ",", "it", "is", "necessary", "to", "rule", "out", "mycobacterial", "disease", "(", "tuberculous", "and", "atypical", ")", ",", "in", "its", "disseminated", "form", ",", "or", "the", "possibility", "of", "infection", "by", "intracellular", "bacteria", "(", "Anaplasma", ",", "Ehrlichia", ".", ".", ".", ")", ",", "in", "addition", ",", "sepsis", "due", "to", "pyogenic", "bacteria", "may", "also", "begin", "with", "fever", "and", "cytopenias", ";", "c", ")", "in", "terms", "of", "parasites", ",", "it", "will", "be", "necessary", "to", "rule", "out", "infection", "by", "malaria", ",", "Toxoplasma", "or", "Leishmania", ".", "In", "the", "group", "of", "onco-haematological", "diseases", ",", "the", "possibility", "of", "a", "solid", "organ", "tumour", "with", "bone", "marrow", "infiltration", "must", "be", "taken", "into", "account", ".", "With", "regard", "to", "haematological", "diseases", ",", "there", "is", "a", "wide", "range", "of", "possibilities", "in", "a", "patient", "with", "fever", ",", "cytopenias", "and", "splenomegaly", ".", "Lymphoproliferative", "disease", "(", "mainly", "splenic", "lymphoma", "and", "tricholeukaemia", ")", ",", "myelofibrosis", "or", "myelodysplastic", "syndrome", "must", "be", "ruled", "out", ".", "Although", "less", "likely", ",", "we", "should", "also", "consider", "ruling", "out", "autoimmune", "diseases", "or", "connective", "tissue", "diseases", ",", "mainly", "systemic", "lupus", "erythematosus", ",", "sarcoidosis", "and", "much", "less", "frequently", "rheumatoid", "arthritis", "such", "as", "Felty", "'", "s", "syndrome", ".", "Within", "the", "miscellaneous", "group", ",", "the", "clinical", "picture", "could", "correspond", "to", "a", "haemophagocytic", "lymphohistiocytosis", "syndrome", ".", "Although", "less", "likely", ",", "histiocytosis", "or", "paroxysmal", "nocturnal", "haemoglobinuria", "could", "also", "be", "ruled", "out", ".", "With", "this", "wide", "range", "of", "possibilities", ",", "we", "must", "fit", "together", "the", "data", "offered", "by", "the", "patient", "to", "reach", "a", "definitive", "diagnosis", ".", "This", "is", "a", "gradual", "process", "in", "which", "specific", "complementary", "tests", "are", "often", "necessary", ".", "Evolution", "During", "admission", ",", "serologies", "were", "requested", "for", "hepatotropic", "virus", ",", "HIV", ",", "Parvovirus", "B19", ",", "HSV", ",", "HSV6", ",", "HIV", ",", "lupus", "and", "Brucella", "which", "were", "negative", ",", "serologies", "for", "CMV", "and", "EBV", "with", "positive", "IgG", "and", "negative", "IgM", ",", "and", "urinary", "antigen", "for", "Leishmania", "spp", "which", "was", "also", "negative", ".", "As", "part", "of", "the", "study", ",", "a", "thoracic-abdominal", "CT", "scan", "was", "also", "requested", ",", "showing", "only", "moderate", "hepato-splenomegaly", "with", "no", "evidence", "of", "pleuro-pulmonary", "or", "mediastinal", "alterations", ",", "hepatic", "LOES", "or", "adenopathies", ".", "In", "view", "of", "these", "results", ",", "a", "bone", "marrow", "puncture-aspiration", "was", "performed", ",", "which", "was", "non-specific", ",", "where", "no", "haemophagocytosis", "phenomena", ",", "parasites", ",", "dysplasia", ",", "myelofibrosis", "or", "pathological", "cellular", "infiltrate", "were", "observed", ".", "During", "his", "admission", "to", "the", "ward", ",", "the", "patient", "remained", "haemodynamically", "stable", "at", "all", "times", ",", "but", "with", "a", "daily", "high", "fever", "of", "up", "to", "40oC", "that", "was", "difficult", "to", "control", ",", "with", "the", "general", "condition", "being", "slightly", "affected", "when", "he", "remained", "apyretic", ".", "Multiple", "blood", "cultures", "were", "obtained", "during", "admission", "and", "all", "were", "negative", ".", "Due", "to", "the", "fever", "with", "elevated", "liver", "enzymes", "and", "cytopenias", ",", "it", "was", "decided", "to", "start", "empirical", "treatment", "with", "doxycycline", ",", "which", "was", "withdrawn", "after", "a", "week", "as", "no", "improvement", "was", "observed", ".", "Given", "the", "absence", "of", "diagnosis", "and", "the", "fact", "that", "the", "patient", "continued", "with", "daily", "fever", ",", "it", "was", "decided", "jointly", "by", "the", "Infectious", "Diseases", ",", "Haematology", "and", "General", "Surgery", "Departments", "to", "perform", "a", "splenectomy", "on", "suspicion", "of", "splenic", "lymphoproliferative", "syndrome", ".", "After", "the", "intervention", ",", "the", "patient", "began", "to", "improve", ",", "with", "a", "decrease", "in", "fever", ",", "improvement", "in", "general", "condition", "and", "recovery", "of", "the", "cytopenias", ".", "The", "pathological", "anatomy", "report", "of", "the", "spleen", "described", "abundant", "haemophagocytosis", "phenomena", ".", "After", "learning", "of", "this", ",", "a", "PCR", "test", "for", "Leishmania", "in", "the", "spleen", "was", "requested", "and", "was", "positive", ".", "The", "patient", "was", "treated", "with", "liposomal", "amphotericin", "B", "at", "the", "usual", "doses", "(", "3", "cycles", "of", "5", "mg", "/", "kg", "/", "day", "separated", "by", "5", "days", ")", "with", "very", "good", "clinical", "evolution", ",", "total", "recovery", "and", "no", "recurrence", "after", "2", "years", "of", "follow-up", ".", "Final", "diagnosis", "Haemophagocytic", "lymphohistiocytosis", "(", "HLH", ")", "secondary", "to", "leishmaniasis", "." ]

[ 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 3, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 14, "end": 21 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 121, "end": 128 }, { "text": "animals", "label": "SPECIES", "start": 552, "end": 559 }, { "text": "goats", "label": "SPECIES", "start": 561, "end": 566 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 136, "end": 142 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 399, "end": 405 }, { "text": "dogs", "label": "SPECIES", "start": 568, "end": 572 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 146, "end": 154 }, { "text": "single", "label": "HUMAN", "start": 450, "end": 456 }, { "text": "sexual contact", "label": "HUMAN", "start": 632, "end": 646 }, { "text": "bacteremic", "label": "SPECIES", "start": 767, "end": 777 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3212, "end": 3219 }, { "text": "CMV", "label": "SPECIES", "start": 3615, "end": 3618 }, { "text": "EBV", "label": "SPECIES", "start": 3610, "end": 3613 }, { "text": "VH6", "label": "SPECIES", "start": 3620, "end": 3623 }, { "text": "HSV", "label": "SPECIES", "start": 3605, "end": 3608 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 3576, "end": 3579 }, { "text": "herpes virus", "label": "SPECIES", "start": 3591, "end": 3603 }, { "text": "virus", "label": "SPECIES", "start": 3598, "end": 3603 }, { "text": "Parvovirus B19", "label": "SPECIES", "start": 3629, "end": 3643 }, { "text": "Ehrlichia", "label": "SPECIES", "start": 3880, "end": 3889 }, { "text": "bacterial", "label": "SPECIES", "start": 3689, "end": 3698 }, { "text": "pyogenic bacteria", "label": "SPECIES", "start": 3922, "end": 3939 }, { "text": "Anaplasma", "label": "SPECIES", "start": 3869, "end": 3878 }, { "text": "intracellular bacteria", "label": "SPECIES", "start": 3845, "end": 3867 }, { "text": "Leishmania", "label": "SPECIES", "start": 4077, "end": 4087 }, { "text": "Toxoplasma", "label": "SPECIES", "start": 4063, "end": 4073 }, { "text": "malaria", "label": "SPECIES", "start": 4054, "end": 4061 }, { "text": "parasites", "label": "SPECIES", "start": 3997, "end": 4006 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4318, "end": 4325 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5041, "end": 5048 }, { "text": "Brucella", "label": "SPECIES", "start": 5293, "end": 5301 }, { "text": "CMV", "label": "SPECIES", "start": 5338, "end": 5341 }, { "text": "Leishmania", "label": "SPECIES", "start": 5410, "end": 5420 }, { "text": "Leishmania spp", "label": "SPECIES", "start": 5410, "end": 5424 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5920, "end": 5927 }, { "text": "EBV", "label": "SPECIES", "start": 5346, "end": 5349 }, { "text": "HSV", "label": "SPECIES", "start": 5267, "end": 5270 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 5246, "end": 5249 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 5278, "end": 5281 }, { "text": "parasites", "label": "SPECIES", "start": 5795, "end": 5804 }, { "text": "virus", "label": "SPECIES", "start": 5239, "end": 5244 }, { "text": "hepatotropic virus", "label": "SPECIES", "start": 5226, "end": 5244 }, { "text": "Parvovirus B19", "label": "SPECIES", "start": 5251, "end": 5265 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 6445, "end": 6452 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 6683, "end": 6690 }, { "text": "Leishmania", "label": "SPECIES", "start": 6933, "end": 6943 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 6994, "end": 7001 } ]

[ "", "On", "23", "January", "2020", ",", "a", "61-year-old", "woman", "presented", "with", "acute", "asthenia", "in", "both", "legs", "and", "severe", "fatigue", ",", "with", "a", "one-day", "evolution", ".", "She", "had", "returned", "from", "Wuhan", "on", "19", "January", "but", "reported", "no", "fever", ",", "cough", ",", "chest", "pain", "or", "diarrhoea", ".", "His", "temperature", "was", "36", ".", "5", "°", "C", ",", "oxygen", "saturation", "was", "99", "%", "on", "room", "air", "and", "respiratory", "rate", "was", "16", "bpm", ".", "Pulmonary", "auscultation", "revealed", "no", "abnormalities", ".", "Neurological", "examination", "showed", "symmetrical", "asthenia", "(", "Medical", "Research", "Council", "grade", "4", "/", "5", ")", "and", "areflexia", "in", "both", "legs", "and", "feet", ".", "Three", "days", "after", "admission", ",", "his", "symptoms", "worsened", ".", "Muscle", "strength", "was", "grade", "4", "/", "5", "in", "both", "arms", "and", "hands", "and", "3", "/", "5", "in", "both", "legs", "and", "feet", ".", "Sensitivity", "to", "touch", "and", "pinprick", "decreased", "distally", ".", "Laboratory", "tests", "on", "admission", "were", "clinically", "significant", "for", "lymphocytopenia", "(", "0", ".", "52", "×", "109", "/", "L", ";", "normal", "range", ":", "1", ".", "1-3", ".", "2", "×", "109", "/", "L", ")", "and", "thrombocytopenia", "(", "113", "×", "109", "/", "L", ";", "normal", "range", ":", "125-300", "×", "109", "/", "L", ")", ".", "CSF", "tests", "gave", "normal", "cell", "counts", "(", "5", "x", "106", "/", "L", ";", "normal", "range", ":", "0-8", "×", "106", "/", "L", ")", "and", "high", "protein", "values", "(", "124", "mg", "/", "dL", ";", "normal", "range", ":", "8-43", "mg", "/", "dL", ")", ".", "Nerve", "conduction", "tests", "(", "day", "5", ")", "revealed", "delayed", "distal", "latencies", "and", "absent", "early", "F", "waves", ",", "manifestations", "consistent", "with", "demyelinating", "neuropathy", ".", "Guillain-Barré", "syndrome", "was", "diagnosed", "and", "immunoglobulin", "was", "administered", "i", ".", "v", ".", "On", "day", "8", "(", "30", "January", ")", ",", "the", "patient", "presented", "with", "dry", "cough", "and", "fever", "of", "38", ".", "2", "°", "C", ".", "Chest", "CT", "showed", "ground-glass", "opacities", "in", "both", "lungs", ".", "Oropharyngeal", "swabs", "were", "positive", "for", "SARS-CoV-2", "by", "RT-PCR", "test", ".", "The", "patient", "was", "immediately", "transferred", "to", "an", "infectious", "disease", "ward", "and", "given", "symptomatic", "treatment", "and", "the", "antiviral", "drugs", "arbidol", ",", "lopinavir", "and", "ritonavir", ".", "Her", "clinical", "condition", "gradually", "improved", "and", "her", "lymphocyte", "and", "thrombocyte", "counts", "normalised", "on", "day", "20", ".", "She", "was", "discharged", "on", "day", "30", ",", "with", "normal", "muscle", "strength", "and", "recovery", "of", "reflexes", "in", "both", "arms", "and", "legs", ".", "Her", "respiratory", "symptoms", "also", "subsided", ".", "Oropharyngeal", "swab", "tests", "for", "SARS-CoV-2", "were", "negative", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 35, "end": 40 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1274, "end": 1281 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1452, "end": 1459 }, { "text": "SARS-CoV-2", "label": "SPECIES", "start": 1421, "end": 1431 }, { "text": "SARS-CoV-2", "label": "SPECIES", "start": 1889, "end": 1899 }, { "text": "antiviral", "label": "SPECIES", "start": 1558, "end": 1567 } ]

[ "Medical", "history", ":", "chronic", "bronchitis", ",", "a", "single", "hospital", "admission", "two", "years", "before", "the", "current", "one", "for", "respiratory", "failure", "secondary", "to", "non-condensing", "respiratory", "infection", "due", "to", "influenza", "A", "(", "H1N1", ")", "pmd09", ",", "possible", "brucellosis", "in", "childhood", ".", "Surgical", "history", ":", "operated", "on", "a", "year", "ago", "for", "ischiorectal", "abscess", "without", "complications", ".", "He", "is", "not", "currently", "receiving", "any", "treatment", ".", "Three", "months", "before", "the", "current", "episode", "he", "had", "received", "ciprofloxacin", "prescribed", "by", "his", "primary", "care", "doctor", ",", "with", "no", "cause", "recorded", "in", "his", "medical", "history", ".", "Toxic", "habits", ":", "smoker", "of", "1", "pack", "of", "cigarettes", "a", "day", ",", "occasional", "hashish", "user", "and", "drinker", "of", "2-3", "litres", "of", "beer", "a", "day", ".", "He", "lives", "in", "a", "rural", "area", ";", "he", "has", "not", "recently", "travelled", "outside", "his", "town", "or", "gone", "out", "to", "the", "countryside", ".", "Currently", "unemployed", ".", "Pets", "at", "home", ":", "a", "dog", ".", "She", "came", "to", "the", "emergency", "department", "for", "general", "malaise", "and", "moderate", "asthenia", "accompanied", "by", "hyperthermia", "of", "39-40oC", "of", "3", "days", "'", "evolution", ",", "nausea", "and", "a", "single", "vomit", ".", "He", "also", "began", "with", "holocranial", "headache", "and", "interscapular", "pain", ",", "followed", "by", "sweating", "and", "general", "malaise", ".", "In", "the", "anamnesis", "by", "apparatus", ",", "she", "reported", "no", "cough", "or", "expectoration", ",", "urinary", "symptoms", "or", "alterations", "in", "intestinal", "transit", ",", "no", "pruritus", "or", "choluria", ".", "In", "the", "last", "few", "months", ",", "there", "had", "been", "no", "weight", "loss", ".", "In", "the", "previous", "weeks", ",", "she", "had", "presented", "an", "open", "wound", "on", "the", "left", "ankle", ",", "which", "she", "could", "not", "relate", "to", "any", "circumstance", ";", "no", "dermal", "lesions", "have", "been", "visualised", "and", "she", "does", "not", "remember", "recent", "bites", ".", "She", "did", "not", "report", "any", "risky", "sexual", "relations", ".", "Physical", "examination", "showed", "blood", "pressure", "of", "105", "/", "67", ".", "Afebrile", ",", "in", "good", "general", "condition", ",", "oriented", "and", "cooperative", ".", "Eupneic", "with", "no", "oxygen", "intake", ".", "Well", "perfused", "and", "normal", "colour", ".", "Asthenic", "constitution", ".", "Rhythmic", "heart", "tones", "at", "103", "bpm", "and", "no", "audible", "murmurs", ".", "Bladder", "murmur", "preserved", ",", "without", "other", "respiratory", "sounds", ".", "Abdomen", "soft", ",", "without", "organomegaly", "or", "peritonism", ".", "No", "notable", "dermal", "lesions", "and", "no", "palpable", "adenopathies", "in", "superficial", "ganglion", "chains", ".", "Neurological", "examination", ":", "no", "nuchal", "rigidity", ",", "negative", "Kernig", "'", "s", "and", "Brudzinsky", "'", "s", "signs", ",", "conscious", "(", "Glasgow", "15", "/", "15", ")", ",", "normal", "cranial", "nerves", ",", "strength", "and", "sensitivity", ",", "both", "algesic", "and", "arthrokinetic", ",", "skin-plant", "reflexes", "are", "bilaterally", "flexor", ".", "No", "dysmetria", "or", "diadochokinesias", ".", "Normal", "gait", "without", "lateralisation", "or", "increase", "in", "the", "base", "of", "support", ".", "He", "names", ",", "understands", "and", "repeats", ".", "Speech", "is", "fluent", "and", "the", "rest", "of", "the", "higher", "functions", "are", "normal", ".", "While", "being", "treated", "in", "the", "emergency", "department", ",", "he", "had", "a", "seizure", "of", "30", "seconds", "'", "duration", "with", "tonic-clonic", "movements", "and", "decerebrate", "posture", ".", "The", "seizure", "ceased", "with", "clonazepam", "and", "during", "the", "seizure", "there", "was", "no", "sphincter", "relaxation", ".", "After", "the", "seizure", ",", "she", "presented", "a", "post-critical", "episode", "with", "central", "cyanosis", "that", "gradually", "improved", "with", "support", "measures", "and", "oxygen", "therapy", ".", "A", "blood", "test", "was", "carried", "out", "in", "the", "emergency", "department", ",", "where", "the", "haemogram", "showed", "a", "platelet", "count", "of", "40", ",", "000", "with", "the", "rest", "of", "the", "series", "normal", ".", "Biochemistry", "showed", "elevated", "CRP", "129", ".", "21", "mg", "/", "l", "and", "procalcitonin", "20", "ng", "/", "ml", ".", "Renal", "function", "and", "ions", "were", "normal", ".", "Urinalysis", "showed", "low", "leukocytes", "and", "red", "blood", "cells", ",", "with", "negative", "nitrites", ".", "In", "the", "toxicity", "test", ",", "benzodiazepines", "and", "hashish", "were", "positive", ".", "In", "the", "imaging", "studies", "requested", ",", "no", "foci", "of", "consolidation", ",", "infiltrates", "or", "effusion", "were", "observed", "in", "the", "chest", "X-ray", ",", "and", "the", "abdominal", "X-ray", "was", "normal", ".", "The", "CT", "scan", "of", "the", "skull", ",", "requested", "due", "to", "the", "coma", "episode", ",", "showed", "an", "inflammatory", "appearance", "of", "the", "ethmoid", "and", "right", "maxillary", "sinuses", ",", "ruling", "out", "signs", "of", "established", "acute", "ischaemia", "and", "/", "or", "space-occupying", "lesions", ".", "A", "peripheral", "blood", "smear", ",", "requested", "urgently", ",", "showed", "neutrophils", "with", "increased", "granulation", "and", "a", "few", "cilia", ",", "as", "well", "as", "reactive", "lymphocytes", ".", "Following", "the", "results", ",", "a", "lumbar", "puncture", "was", "performed", "and", "samples", "of", "cerebrospinal", "fluid", "(", "CSF", ")", "were", "sent", "to", "the", "biochemistry", "and", "microbiology", "laboratories", "for", "culture", "of", "the", "usual", "microorganisms", ",", "mycobacteria", ",", "PCR", "for", "viruses", "and", "pneumococcal", "antigen", ".", "The", "CSF", "was", "cloudy", "with", "glucose", "29", ".", "3", "mg", "/", "dl", ",", "protein", "130", ".", "8", "mg", "/", "dl", ",", "35", "red", "blood", "cells", "/", "mm3", ",", "1170", "leukocytes", "/", "mm3", "(", "66", "%", "mononuclear", ")", ".", "At", "the", "same", "time", ",", "serology", "was", "performed", "to", "rule", "out", "HIV", "and", "zoonosis", ".", "Differential", "diagnosis", "A", ")", "In", "our", "case", "we", "are", "dealing", "with", "a", "patient", "who", "initially", "presented", "with", "non-specific", "clinical", "manifestations", "but", "with", "deterioration", "of", "general", "condition", "associated", "with", "headache", "and", "fever", ",", "later", "presenting", "with", "seizures", ".", "A", "lumbar", "puncture", "was", "performed", "due", "to", "a", "high", "suspicion", "of", "meningitis", ",", "obtaining", "CSF", "compatible", "with", "lymphocytic", "meningitis", ",", "and", "therefore", "the", "following", "etiological", "diagnoses", "are", "proposed", ".", "a", ")", "Infections", "*", "Bacterial", "meningitis", "1", "-", "Listeria", "monocytogenes", ":", "causes", "meningoencephalitis", "in", "patients", "over", "50", "years", "of", "age", ",", "immunosuppressed", "due", "to", "corticosteroid", "/", "immunosuppressive", "treatment", "or", "the", "presence", "of", "comorbidities", "(", "liver", "cirrhosis", ",", "diabetes", "mellitus", ",", "chronic", "renal", "failure", "or", "active", "neoplasia", ")", ".", "2", "-", "Tuberculous", "meningitis", ":", "subacute-chronic", "onset", "with", "clinical", "manifestations", "of", "weakness", ",", "headache", ",", "low-grade", "fever", "and", "personality", "changes", ".", "This", "is", "followed", "by", "another", "phase", "with", "predominant", "neurological", "symptoms", "such", "as", "lethargy", ",", "confusion", ",", "involvement", "of", "cranial", "nerves", ".", "In", "the", "last", "phase", ",", "confusion", "leads", "to", "stupor", ",", "convulsions", ",", "hemiparesis", ",", "coma", ".", "3", "-", "Decapitated", "bacterial", "meningitis", ":", "this", "clinical", "circumstance", "requires", "the", "use", "of", "antimicrobials", "prior", "to", "CSF", "analysis", ".", "The", "most", "frequent", "causes", "in", "our", "environment", "are", "Streptococcus", "pneumoniae", "and", "Neisseria", "meningitidis", ".", "4", "-", "Neurosyphilis", ":", "Advanced", "stage", "of", "infection", "by", "Treponema", "pallidum", "and", "which", "clinically", "presents", "with", "headache", ",", "fever", "and", "stiff", "neck", ".", "If", "syphilitic", "gummas", "form", ",", "seizures", "are", "more", "likely", "to", "develop", ".", "*", "Viral", "meningoencephalitis", ":", "Clinically", "they", "may", "present", "with", "altered", "level", "of", "consciousness", ",", "fever", ",", "seizures", "and", "neurological", "focality", ".", "In", "our", "environment", "we", "should", "rule", "out", "the", "presence", "of", ":", "HSV", "1", "and", "2", ",", "Enterovirus", ",", "varicella", "zoster", "virus", "(", "VZV", ")", "and", "West", "Nile", "virus", ".", "*", "Fungal", "meningitis", ":", "Opportunistic", "disease", "caused", "by", "Cryptococcus", "neoformans", ",", "which", "mainly", "affects", "immunocompromised", "patients", "and", "whose", "most", "frequent", "neurological", "manifestation", "is", "meningoencephalitis", "leading", "to", "the", "formation", "of", "cryptococcomas", ".", "b", ")", "Non-infectious", ":", "1", "-", "Temporal", "arteritis", ":", "This", "is", "the", "most", "frequent", "vasculitis", ",", "affecting", "large", "and", "medium-sized", "vessels", "in", "patients", "aged", "over", "60-70", "years", ".", "The", "neurological", "symptoms", ",", "consisting", "of", "headache", "and", "sometimes", "seizures", ",", "are", "associated", "with", "persistent", "fever", "and", "constitutional", "syndrome", ".", "2", "-", "Primary", "cerebral", "lymphoma", ":", "This", "is", "a", "rare", "variant", "of", "extranodal", "non-Hodgkin", "'", "s", "lymphoma", ".", "The", "most", "frequently", "described", "symptoms", "are", "neurological", "deficits", ",", "personality", "alterations", ",", "headache", "with", "vomiting", "and", "seizures", ".", "3", "-", "Other", "brain", "tumours", ":", "The", "most", "frequent", "brain", "tumour", "lesion", "is", "metastasis", "and", "among", "the", "primary", "tumours", "we", "find", "glioblastoma", "and", "meningioma", ".", "Clinically", ",", "they", "present", "with", "headache", ",", "convulsions", ",", "vomiting", ",", "syncope", ",", "behavioural", "alterations", "and", "neurological", "focality", ".", "4", "-", "Pharmacological", ":", "Due", "to", "the", "use", "of", "non-steroidal", "anti-inflammatory", "drugs", "and", "cotrimoxazole", ",", "among", "others", ".", "5", "-", "Sarcoidosis", ":", "Cause", "of", "aseptic", "meningitis", "due", "to", "granulomatous", "inflammation", "that", "follows", "a", "perivascular", "distribution", "affecting", "the", "CNS", "and", "may", "produce", "focal", "or", "generalised", "seizures", "depending", "on", "the", "area", "affected", ".", "B", ")", "Considering", "the", "circumstances", "surrounding", "our", "patient", ",", "we", "previously", "mentioned", "that", "he", "lives", "in", "a", "rural", "area", "and", "has", "a", "dog", "as", "a", "pet", ",", "so", "we", "would", "include", "the", "following", "zoonoses", "in", "the", "differential", "diagnosis", ":", "1", "-", "Capnocytophaga", "spp", ":", "can", "present", "as", "fulminant", "sepsis", "or", "lymphocytic", "meningitis", "in", "immunocompromised", "patients", ".", "Domestic", "animals", "such", "as", "dogs", "and", "cats", "act", "as", "a", "reservoir", ".", "2", "-", "Q", "fever", ":", "caused", "by", "Coxiella", "burnetii", ".", "Unusually", ",", "it", "may", "present", "with", "neurological", "symptoms", ";", "it", "is", "the", "most", "frequent", "zoonosis", "in", "our", "environment", ".", "3", "-", "Lyme", "disease", ":", "caused", "by", "Borrelia", "burgdorferi", "which", ",", "characteristically", ",", "presents", "with", "erythema", "migrans", "after", "tick", "bite", ".", "It", "can", "cause", "lymphocytic", "meningitis", "with", "cerebellar", "and", "cranial", "nerve", "involvement", "(", "mainly", "facial", "nerve", ")", ".", "Evolution", "In", "view", "of", "the", "clinical", "findings", "and", "the", "results", "of", "the", "complementary", "tests", ",", "pending", "completion", "of", "the", "microbiological", "studies", ",", "the", "patient", "was", "transferred", "to", "the", "Infectious", "Diseases", "ward", ".", "Given", "the", "characteristics", "of", "the", "CSF", ",", "the", "acute", "/", "subacute", "presentation", "of", "the", "symptoms", "and", "the", "occupation", "of", "the", "paranasal", "sinuses", "in", "the", "skull", "CT", "scan", ",", "empirical", "treatment", "was", "started", "with", "Ceftriaxone", "2", "g", "/", "12", "hours", "and", "Ampicillin", "2g", "/", "4", "hours", "(", "listeriosis", "was", "initially", "suspected", ")", ".", "Subsequently", ",", "Microbiology", "reported", "the", "presence", "of", "abundant", "mononuclear", "leukocytes", "in", "the", "gram", "stain", ",", "pending", "culture", "results", "for", "usual", "pathogenic", "microorganisms", ".", "During", "the", "following", "days", ",", "the", "patient", "improved", "clinically", ",", "relieving", "his", "headache", "with", "first-step", "analgesics", "and", "was", "afebrile", "from", "the", "first", "day", "of", "hospitalisation", ".", "There", "were", "no", "new", "episodes", "of", "coma", ".", "Analytically", ",", "the", "patient", "'", "s", "inflammatory", "parameters", "improved", "with", "a", "decrease", "in", "CRP", ",", "which", "at", "discharge", "was", "3", ".", "52", "mg", "/", "l", ",", "although", "he", "persisted", "with", "leukocytosis", ",", "which", "was", "attributed", "to", "corticoid", "treatment", ".", "Complementary", "tests", "were", "completed", "and", "it", "was", "observed", "that", "PCR", "for", "TB", "and", "viruses", "(", "enterovirus", ",", "HSV", "1", ",", "2", "and", "VZV", ")", "and", "pneumococcal", "antigen", "in", "CSF", "were", "negative", ".", "Serologies", "for", "Q", "fever", "(", "Ig", "M", "C", ".", "burnetti", ")", ",", "Leptospira", "spp", ".", "and", "Bartonella", "spp", ".", "were", "negative", ".", "Blood", "cultures", "drawn", "in", "the", "ED", "were", "also", "negative", ".", "CSF", "samples", "stained", "on", "chocolate", "agar", "and", "blood", "agar", "were", "negative", "at", "72", "hours", ".", "Samples", "incubated", "in", "liquid", "medium", "(", "thioglycollate", "and", "BHI", "broths", ")", "at", "five", "days", "showed", "growth", "of", "Capnocytophaga", "canimorsus", "without", "being", "able", "to", "recover", "viable", "microorganisms", "for", "antibiogram", ".", "Based", "on", "what", "was", "described", "in", "the", "literature", "and", "the", "clinical-analytical", "improvement", ",", "sequential", "treatment", "was", "continued", "with", "amoxicillin", "/", "clavulanic", "acid", "875", "/", "125", "mg", "every", "8", "hours", "orally", ".", "Other", "complementary", "tests", "were", "requested", ",", "notably", "an", "EEG", ",", "which", "showed", "excessive", "emotional", "tension", "without", "paroxysmal", "activity", "or", "other", "anomalies", ";", "and", "a", "brain", "MRI", ",", "which", "showed", "slight", "atrophy", "of", "the", "cerebellar", "vermis", ".", "MRI", "of", "the", "patient", "'", "s", "brain", ":", "slight", "atrophy", "of", "the", "cerebellar", "vermis", ".", "After", "eleven", "days", "of", "hospitalisation", ",", "the", "patient", "was", "discharged", "as", "he", "was", "asymptomatic", ",", "continuing", "with", "the", "established", "treatment", "for", "14", "days", ".", "He", "was", "reviewed", "in", "the", "Outpatient", "Infectious", "Diseases", "Department", "eleven", "days", "later", ",", "the", "patient", "remained", "asymptomatic", "and", "was", "discharged", "definitively", ".", "No", "new", "hospital", "admissions", "or", "emergency", "room", "visits", "have", "been", "recorded", "since", "the", "referral", ".", "Given", "that", "the", "patient", "had", "a", "history", "of", "open", "wounds", ",", "and", "there", "is", "a", "history", "of", "contact", "with", "dogs", ",", "this", "could", "well", "have", "been", "the", "entry", "point", "for", "the", "microorganism", ",", "and", "he", "also", "had", "excessive", "alcohol", "consumption", "as", "an", "added", "risk", "factor", "for", "infection", "by", "Capnocytophaga", "canimorsus", ".", "Final", "diagnosis", "Capnocytophaga", "canimorsus", "meningitis", "in", "a", "patient", "with", "active", "alcoholism", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "influenza A (H1N1) pmd09", "label": "SPECIES", "start": 179, "end": 203 }, { "text": "childhood", "label": "HUMAN", "start": 229, "end": 238 }, { "text": "dog", "label": "SPECIES", "start": 790, "end": 793 }, { "text": "infection", "label": "SPECIES", "start": 162, "end": 171 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 4159, "end": 4162 }, { "text": "mycobacteria", "label": "SPECIES", "start": 3922, "end": 3934 }, { "text": "microorganisms", "label": "SPECIES", "start": 3906, "end": 3920 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4238, "end": 4245 }, { "text": "Infections", "label": "SPECIES", "start": 4617, "end": 4627 }, { "text": "patients", "label": "HUMAN", "start": 6083, "end": 6091 }, { "text": "Fungal", "label": "SPECIES", "start": 5968, "end": 5974 }, { "text": "patients", "label": "HUMAN", "start": 6335, "end": 6343 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 7366, "end": 7373 }, { "text": "dog", "label": "SPECIES", "start": 7439, "end": 7442 }, { "text": "Borrelia burgdorferi", "label": "SPECIES", "start": 7874, "end": 7894 }, { "text": "tick", "label": "SPECIES", "start": 7959, "end": 7963 }, { "text": "Bartonella spp", "label": "SPECIES", "start": 9350, "end": 9364 }, { "text": "Capnocytophaga canimorsus", "label": "SPECIES", "start": 9609, "end": 9634 }, { "text": "Capnocytophaga canimorsus", "label": "SPECIES", "start": 10815, "end": 10840 }, { "text": "enterovirus", "label": "SPECIES", "start": 9209, "end": 9220 }, { "text": "Leptospira spp", "label": "SPECIES", "start": 9330, "end": 9344 }, { "text": "HSV 1", "label": "SPECIES", "start": 9222, "end": 9227 }, { "text": "VZV", "label": "SPECIES", "start": 9235, "end": 9238 }, { "text": "microorganisms", "label": "SPECIES", "start": 8702, "end": 8716 }, { "text": "microorganisms", "label": "SPECIES", "start": 9672, "end": 9686 }, { "text": "pathogenic microorganisms", "label": "SPECIES", "start": 8691, "end": 8716 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 8218, "end": 8225 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 8749, "end": 8756 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 8938, "end": 8945 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 10121, "end": 10128 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 10221, "end": 10228 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 10411, "end": 10418 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 10580, "end": 10587 }, { "text": "dogs", "label": "SPECIES", "start": 10657, "end": 10661 }, { "text": "infection", "label": "SPECIES", "start": 10802, "end": 10811 }, { "text": "HSV 1, 2", "label": "SPECIES", "start": 9222, "end": 9230 }, { "text": "C. burnetti", "label": "SPECIES", "start": 9316, "end": 9327 }, { "text": "Capnocytophaga canimorsus", "label": "SPECIES", "start": 10859, "end": 10884 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 10901, "end": 10908 } ]

[ "A", "64-year-old", "man", "with", "right", "mandibular", "swelling", "of", "6", "months", "'", "duration", ".", "Plain", "radiography", "showed", "a", "well-demarcated", ",", "osteolytic", ",", "multiloculated", ",", "expansive", "lesion", "located", "in", "the", "horizontal", "mandibular", "ramus", ".", "The", "computed", "tomography", "showed", "an", "expansive", "lesion", "with", "destruction", "of", "the", "bone", "cortex", ".", "With", "the", "provisional", "diagnosis", "of", "probable", "ameloblastoma", ",", "the", "lesion", "was", "resected", "and", "biopsied", ".", "By", "means", "of", "an", "interpapillary", "incision", ",", "the", "mandible", "was", "exposed", ",", "showing", "a", "bulging", "surface", "destroyed", "by", "a", "fleshy", "tumour", "of", "dense", "consistency", "surrounding", "the", "branch", "of", "the", "inferior", "dental", "nerve", ".", "After", "careful", "curettage", "of", "the", "bone", "cavity", ",", "the", "mandible", "was", "reconstructed", "and", "the", "mucosa", "was", "replaced", ".", "There", "were", "no", "postoperative", "complications", ".", "The", "material", "sent", "to", "the", "pathological", "anatomy", "consisted", "of", "tumour", "fragments", "of", "about", "2x1", ".", "5", "cm", ",", "greyish-white", "when", "cut", "and", "with", "a", "firm", "consistency", ".", "Several", "samples", "were", "taken", ",", "fixed", "in", "formaldehyde", ",", "embedded", "in", "paraffin", "and", "processed", "using", "routine", "techniques", ":", "4m", "thick", "sections", "were", "cut", "and", "stained", "with", "haematoxylin-eosin", ".", "Representative", "sections", "were", "immunohistochemically", "studied", "by", "the", "avidin-biotin", "peroxidase", "method", ",", "using", "primary", "antibodies", "anti", "epithelial", "membrane", "antigen", "EMA", ",", "(", "Dako", "M613", ",", "USA", ",", "10", "/", "500", ")", ",", "S-100", "protein", "(", "Dako", ",", "L1845", ",", "USA", ",", "pre-diluted", ")", ",", "neurofilaments", "(", "Biogenex", "6670-0154", ",", "USA", ")", ",", "NSE", "neuro-specific", "enolase", ",", "(", "Biogenex", "MU055-VC", ",", "USA", ",", "10", "/", "1000", ")", ",", "CD57", "(", "Becton-Dickinson", "7660", ",", "USA", ",", "10", "/", "500", ")", ",", "CD34", "(", "Becton-Dickinson", "7660", ",", "USA", ",", "10", "/", "500", ")", ",", "smooth", "muscle", "a-actin", "(", "Dako", "MO851", ",", "USA", ",", "10", "/", "200", ")", ",", "desmin", "(", "Dako", "M760", ",", "USA", ",", "10", "/", "500", ")", ",", "and", "vimentin", "(", "Shandon", "402255", ",", "USA", ",", "pred", ".", ")", ".", "The", "process", "was", "performed", "following", "the", "standard", "protocol", ",", "using", "positive", "and", "negative", "controls", ".", "Fluorescence", "in", "situ", "hybridisation", "(", "FISH", ")", "was", "performed", "on", "50m", "thick", "paraffin-embedded", "sections", "using", "an", "LSI", "BCR", "/", "ABL", "dual", "colour", "mixer", "(", "VYSIS", "Inc", ",", "Downers", "Grove", ",", "USA", ")", "following", "the", "manufacturer", "'", "s", "recommended", "procedure", "and", "examined", "with", "a", "Nikon", "fluorescence", "microscope", "with", "a", "triple", "band", "filter", ",", "and", "a", "hundred", "nuclei", "were", "studied", "by", "two", "of", "the", "authors", ".", "Histologically", ",", "the", "tumour", "fragments", "consisted", "of", "elongated", "cells", "of", "regular", "shape", "and", "size", "arranged", "in", "interlacing", "bundles", "and", "in", "\"", "onion", "bulb", "\"", "structured", "whorls", ".", "The", "cell", "density", "and", "intercellular", "stroma", "were", "variable", ",", "with", "some", "areas", "showing", "a", "myxoid", "appearance", ".", "No", "palisaded", "cells", "or", "atypical", "cell", "pleomorphism", "or", "atypical", "mitoses", "were", "observed", ".", "Residual", "fibres", "of", "the", "mandibular", "nerve", "trunk", "were", "identified", "at", "the", "periphery", "of", "some", "fragments", ".", "With", "the", "provisional", "diagnosis", "of", "PIN", ",", "complementary", "examinations", "were", "performed", ".", "Immunohistochemistry", "showed", "that", "the", "tumour", "cells", "were", "strongly", "positive", "for", "EMA", "and", "vimentin", "and", "negative", "for", "S-100", "protein", ",", "NSE", ",", "collagen", "IV", ",", "CD57", ",", "smooth", "muscle", "a-actin", ",", "desmin", "and", "CD34", ".", "Schwann", "cells", "in", "the", "whorls", "were", "positive", "for", "S-100", "protein", "and", "axons", "positive", "for", "anti-neurofilament", "antigen", "were", "identified", "in", "the", "centre", "of", "the", "\"", "bulbs", "\"", ".", "Residual", "dental", "nerve", "fibres", "were", "positive", "for", "S-100", "protein", ",", "NSE", "and", "neurofilaments", "and", "the", "perineurium", "positive", "for", "EMA", ".", "Fluorescence", "in", "situ", "hybridisation", "revealed", "deletion", "of", "the", "long", "arm", "of", "chromosome", "22", "(", "22q11", ")", "in", "the", "nuclei", "of", "75", "%", "of", "tumour", "cells", "as", "well", "as", "centromere", "loss", "of", "chromosome", "22", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "authors", "label": "HUMAN", "start": 2047, "end": 2054 }, { "text": "onion", "label": "SPECIES", "start": 2188, "end": 2193 } ]

[ "In", "June", "2010", ",", "a", "61-year-old", "man", "came", "to", "the", "internal", "medicine", "department", "to", "be", "examined", "for", "almost", "daily", "febrile", "fever", "and", "occasional", "fever", "over", "38oC", ".", "His", "personal", "history", "included", ":", "hypertension", ",", "hypercholesterolemia", ",", "haemochromatosis", "under", "treatment", "with", "periodic", "bleeding", "up", "to", "a", "year", "earlier", ",", "ex-smoker", ",", "and", "a", "patient", "with", "a", "prosthetic", "mitral", "valve", "and", "stent", "since", "2008", "due", "to", "ischaemic", "heart", "disease", "with", "biventricular", "involvement", ".", "Six", "months", "earlier", ",", "the", "patient", "had", "started", "to", "experience", "a", "progressive", "onset", "of", "fever", ",", "asthenia", ",", "hyporexia", "and", "cough", ".", "In", "March", "of", "the", "same", "year", ",", "he", "was", "referred", "by", "his", "primary", "care", "physician", "for", "the", "finding", "of", "three", "peripheral", "pulmonary", "micronodules", "measuring", "5", "mm", ".", "Complementary", "examinations", "revealed", "moderate", "normochromic", "anaemia", ",", "elevated", "ESR", "and", "CRP", "together", "with", "significant", "homogeneous", "splenomegaly", ".", "No", "fever", "was", "noted", "and", "he", "was", "discharged", "to", "continue", "the", "study", "in", "the", "outpatient", "department", ".", "In", "April", "he", "returned", "to", "the", "ED", "with", "fever", "of", "38", ".", "7oC", "and", "pleuritic", "pain", "in", "the", "left", "hemithorax", ".", "Two", "blood", "cultures", "were", "taken", "and", "were", "negative", "after", "5", "days", "of", "incubation", ".", "He", "started", "empirical", "antibiotic", "treatment", "with", "amoxicillin", "/", "clavulanic", "acid", "with", "partial", "improvement", "of", "symptoms", ".", "From", "the", "internal", "medicine", "department", "and", "due", "to", "a", "further", "worsening", "of", "symptoms", ",", "it", "was", "decided", "to", "admit", "him", ".", "At", "that", "time", "he", "was", "anaemic", ",", "with", "iron", "levels", "of", "34", "mcg", "/", "dl", ",", "a", "blood", "rate", "of", "56", "mm", "/", "h", "and", "CRP", "of", "3", ".", "6", "mg", "/", "dl", ".", "Thoracic-abdominal", "CT", "showed", "splenomegaly", "with", "an", "image", "compatible", "with", "splenic", "infarcts", "and", "persistence", "of", "the", "aforementioned", "unchanged", "pulmonary", "micronodules", ".", "A", "transesophageal", "echocardiogram", "showed", "a", "mechanical", "mitral", "prosthesis", "with", "two", "vegetation", "images", ",", "a", "medial", "one", "measuring", "14", "x", "5", "mm", "and", "a", "lateral", "one", "measuring", "13", "x", "4", "mm", "on", "the", "atrial", "side", ".", "There", "was", "no", "prosthetic", "dysfunction", ".", "Three", "blood", "cultures", "were", "taken", "(", "aerobic", "and", "anaerobic", "flasks", ")", ".", "All", "three", "anaerobic", "flasks", "grew", "a", "non-spore-forming", ",", "pleomorphic", "gram-positive", "bacillus", "at", "7", ",", "8", "and", "10", "days", ".", "The", "isolate", "was", "sent", "to", "the", "Centro", "Nacional", "de", "Microbiología", "in", "Majadahonda", "where", "it", "was", "identified", "as", "Propionibacterium", "acnes", "by", "amplification", "and", "sequencing", "of", "the", "16S", "rRNA", "gene", ".", "When", "initially", "reporting", "the", "growth", "of", "an", "anaerobic", "gram-positive", "bacillus", "in", "blood", "cultures", ",", "the", "patient", "was", "treated", "with", "vancomycin", ",", "ceftriaxone", "and", "gentamicin", ".", "Subsequently", ",", "ceftriaxone", "and", "gentamicin", "were", "replaced", "by", "clindamycin", ".", "After", "suspecting", "that", "the", "microorganism", "was", "P", ".", "acnes", ",", "it", "was", "decided", "to", "change", "antibiotherapy", "to", "penicillin", "G", "sodium", ",", "4", ",", "000", ",", "000", "IU", "every", "4", "hours", ".", "The", "patient", "'", "s", "evolution", "at", "the", "start", "of", "treatment", "was", "favourable", ",", "but", "the", "reappearance", "of", "fever", "with", "peaks", "above", "38oC", "after", "ten", "days", ",", "together", "with", "the", "results", "of", "a", "second", "transesophageal", "echocardiogram", "(", "unchanged", "from", "the", "previous", "one", ")", ",", "made", "it", "advisable", "to", "perform", "surgery", "to", "replace", "the", "prosthesis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 313, "end": 320 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 155, "end": 163 }, { "text": "Propionibacterium acnes", "label": "SPECIES", "start": 2102, "end": 2125 }, { "text": "spore", "label": "SPECIES", "start": 1928, "end": 1933 }, { "text": "primary care physician", "label": "HUMAN", "start": 606, "end": 628 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 461, "end": 468 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2278, "end": 2285 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2564, "end": 2571 }, { "text": "P. acnes", "label": "SPECIES", "start": 2458, "end": 2466 } ]

[ "A", "67-year-old", "male", "patient", "with", "type", "II", "diabetes", "mellitus", ".", "He", "had", "been", "suffering", "for", "7", "days", "from", "diarrhoeal", "evacuations", "with", "mucus", "and", "blood", "6", "to", "8", "times", "a", "day", ",", "fever", ",", "nausea", "and", "vomiting", "of", "gastric", "contents", ",", "as", "well", "as", "stabbing", "abdominal", "pain", "in", "the", "last", "3", "days", ",", "initially", "in", "the", "right", "lower", "quadrant", "and", "finally", "generalised", ".", "On", "examination", "she", "presented", "tachycardia", ",", "tachypnoea", "and", "hyperthermia", "of", "38", ".", "7", "◦", "C", ".", "Acute", "abdomen", ",", "with", "muscular", "resistance", ",", "positive", "decompression", "sign", ",", "and", "decreased", "peristalsis", ".", "Laboratory", "tests", "showed", "leukocytosis", ",", "neutrophilia", "and", "bandaemia", ".", "Simple", "abdominal", "X-rays", "in", "the", "standing", "and", "recumbent", "position", "showed", "distension", "of", "the", "intestinal", "loops", "and", "pneumatosis", "of", "the", "cecal", "wall", ".", "X-ray", "image", "showing", "distension", "of", "intestinal", "loops", "and", "pneumatosis", "in", "the", "cecum", ".", "X-ray", "image", "with", "greater", "detail", "of", "pneumatosis", "in", "the", "cecum", ".", "At", "laparotomy", ",", "areas", "of", "necrosis", "were", "found", "throughout", "the", "colon", ",", "with", "fibrinopurulent", "crepitus", "and", "crepitus", "in", "the", "cecum", ".", "Subtotal", "colectomy", "was", "performed", ".", "Indirect", "haemagglutination", "and", "PCR", "tests", "supported", "the", "diagnosis", "of", "invasive", "amebiasis", ".", "Histopathological", "study", "reported", "haematophagous", "Entamoeba", "histolytica", "trophozoites", "in", "the", "colon", "wall", ",", "and", "lymphoplasmacytic", "infiltrate", ".", "Entamoeba", "histolytica", "trophozoites", "in", "the", "colon", "wall", ",", "identified", "in", "the", "histopathological", "study", "of", "the", "patient", "." ]

[ 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0 ]

[ { "text": "male patient", "label": "HUMAN", "start": 14, "end": 26 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 19, "end": 26 }, { "text": "Entamoeba histolytica trophozoites", "label": "SPECIES", "start": 1146, "end": 1180 }, { "text": "Entamoeba histolytica trophozoites", "label": "SPECIES", "start": 1234, "end": 1268 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1337, "end": 1344 } ]

[ "A", "72-year-old", "man", "with", "a", "history", "of", "smoking", "(", "ex-smoker", "of", "10", "cigarettes", "a", "day", "for", "30", "years", ")", ",", "long-standing", "hypertension", "with", "poor", "home", "control", "and", "a", "history", "of", "ischaemic", "heart", "disease", ",", "without", "previous", "infarction", ",", "revascularised", "with", "three", "stents", "six", "years", "ago", ".", "Diagnosed", "with", "primary", "Sjögren", "'", "s", "syndrome", "with", "regular", "outbreaks", "of", "arthritis", ".", "He", "suffered", "from", "prostate", "cancer", "undergoing", "radiotherapy", "and", "without", "hormone", "blockade", "for", "three", "years", "and", "last", "year", "suffered", "a", "left", "femoral", "deep", "vein", "thrombosis", ",", "starting", "anticoagulation", "with", "acenocoumarol", "4mg", ",", "which", "he", "currently", "maintains", ".", "He", "is", "also", "being", "treated", "with", "deflazacort", "for", "his", "autoimmune", "disease", "(", "6mg", "a", "day", ")", ",", "atenolol", "(", "50mg", "a", "day", ")", ",", "rosuvastatin", "(", "10mg", "a", "day", ")", ",", "nitroglycerin", "(", "5mg", "a", "day", "patch", ")", "and", "esomeprazole", "(", "40mg", "a", "day", ")", ".", "Currently", "retired", "and", "living", "in", "an", "urban", "environment", ",", "he", "leads", "an", "active", "life", "without", "limitations", ".", "He", "lives", "alone", ",", "with", "no", "contact", "with", "animals", ".", "He", "consulted", "the", "emergency", "department", "for", "a", "febrile", "syndrome", "of", "one", "week", "'", "s", "evolution", "accompanied", "by", "joint", "pain", "in", "the", "right", "wrist", "and", "ankle", ",", "with", "no", "other", "notable", "symptoms", ".", "On", "examination", "the", "patient", "was", "hypertensive", "(", "BP", "160", "/", "90", "mmHg", ")", ",", "with", "normal", "heart", "rate", "(", "65", "bpm", ")", ",", "afebrile", "and", "eupneic", "at", "rest", ".", "Cardiopulmonary", "auscultation", "is", "normal", ",", "as", "is", "abdominal", "palpation", ".", "There", "was", "swelling", ",", "erythema", "and", "pain", "on", "the", "back", "of", "the", "right", "hand", "at", "the", "level", "of", "the", "extensor", "tendons", ",", "as", "well", "as", "in", "the", "internal", "malleolus", "of", "the", "right", "ankle", ",", "with", "the", "rest", "of", "the", "joint", "being", "normal", ".", "Blood", "tests", "showed", ":", "leukocytosis", "of", "23820", "cells", "/", "μL", "with", "81", "%", "neutrophilia", "and", "32", "%", "lymphocytes", ";", "elevated", "C-reactive", "protein", "(", "CRP", ")", "of", "234", "mg", "/", "L", ";", "mild", "hypertransaminasemia", "(", "AST", "142", ".", "5", "IU", "/", "L", ",", "ALT", "114", ".", "7", "IU", "/", "L", ")", ";", "mild", "deterioration", "of", "renal", "function", "with", "creatinine", "of", "1", ".", "51", "mg", "/", "dl", "and", "normal", "ions", ".", "The", "systematic", "urine", "analysis", "showed", "no", "data", "suggestive", "of", "infection", "and", "the", "chest", "X-ray", "showed", "no", "pulmonary", "infiltrates", "or", "other", "alterations", "of", "interest", ".", "He", "was", "admitted", "to", "the", "ward", "with", "a", "diagnosis", "of", "suspected", "septic", "arthritis", ".", "Serial", "blood", "cultures", "were", "performed", "and", "Streptococcus", "zooepidemicus", "sensitive", "to", "penicillin", "(", "MIC", "≤", "0", ".", "12", ")", "was", "isolated", "in", "the", "two", "aerobic", "samples", "and", "in", "the", "two", "anaerobic", "samples", ".", "Urine", "culture", "was", "negative", ".", "The", "patient", "was", "re-interviewed", "and", "insisted", "on", "not", "having", "direct", "contact", "with", "animals", ".", "His", "son", "has", "a", "dog", "which", "he", "sees", "occasionally", ".", "He", "was", "initially", "treated", "empirically", "with", "ceftriaxone", "and", "cloxacillin", ",", "which", "was", "simplified", "to", "ceftriaxone", "after", "the", "microbiological", "isolation", "described", ".", "Echocardiographic", "screening", "was", "performed", ",", "ruling", "out", "valvular", "heart", "disease", "and", "images", "suggestive", "of", "endocarditis", ".", "Clinical", "improvement", "was", "observed", "with", "a", "decrease", "in", "inflammatory", "signs", "in", "both", "joints", ",", "with", "no", "pain", "in", "both", ",", "although", "there", "was", "still", "mild", "oedema", "in", "the", "wrist", "and", "erythema", "in", "the", "ankle", "without", "inflammation", ".", "The", "analytical", "parameters", "also", "improved", ",", "so", "he", "was", "discharged", "6", "days", "later", "with", "amoxicillin-clavulanic", "acid", "875-125mg", "every", "8", "hours", "by", "mouth", "until", "completing", "two", "weeks", "of", "antibiotherapy", ".", "The", "control", "blood", "culture", "after", "6", "days", "of", "antibiotic", "therapy", "was", "negative", ".", "The", "plan", "is", "for", "a", "check-up", "at", "the", "clinic", "and", "a", "new", "control", "blood", "culture", "one", "week", "after", "completing", "the", "treatment", ".", "One", "week", "after", "discharge", ",", "and", "with", "one", "day", "left", "to", "complete", "the", "antibiotic", "therapy", ",", "she", "consulted", "the", "emergency", "department", "again", "due", "to", "sudden", "disorientation", "and", "confusion", "with", "dysarthric", "speech", "and", "generalised", "slowness", ".", "He", "had", "not", "presented", "fever", ".", "On", "examination", "he", "was", "hypertensive", "(", "BP", "179", "/", "79", "mmHg", ")", ",", "with", "normal", "heart", "rate", "(", "66", "bpm", ")", ",", "eupneic", "and", "afebrile", ".", "Cardiopulmonary", "auscultation", "with", "no", "findings", ".", "Neurologically", "disoriented", "in", "time", ",", "bradypsychic", ",", "and", "on", "neurological", "examination", ",", "left", "homonymous", "haemianopsia", "was", "observed", "with", "no", "other", "focality", ".", "The", "electrocardiogram", "showed", "sinus", "rhythm", ".", "Blood", "tests", "showed", "leukocytosis", "of", "13330", "cells", "/", "μL", "with", "85", "%", "neutrophilia", ",", "elevated", "acute", "phase", "reactants", "(", "CRP", "52", ".", "8", "mg", "/", "L", ",", "erythrocyte", "sedimentation", "rate", "(", "ESR", ")", "66", "mm", "/", "h", ")", "and", "troponin", "increased", "by", "170", "pg", "/", "ml", ".", "An", "urgent", "cranial", "CT", "scan", "was", "performed", ",", "which", "revealed", "a", "hypodense", "millimetric", "focus", "in", "the", "head", "of", "the", "left", "caudate", "nucleus", "with", "a", "chronic", "appearance", ",", "without", "defining", "acute", "lesions", ".", "Differential", "diagnosis", "The", "patient", "presented", "with", "an", "abrupt", "neurological", "condition", "with", "a", "history", "of", "infectious", "arthritis", "and", "bacteraemia", "due", "to", "S", ".", "zooepidemicus", ",", "without", "having", "completed", "the", "prescribed", "antimicrobial", "treatment", ".", "In", "the", "differential", "diagnosis", "approach", ",", "given", "the", "abruptness", "of", "the", "picture", ",", "we", "mainly", "included", "cerebrovascular", "accident", "(", "CVA", ")", "and", "infectious", "aetiology", ".", "Our", "patient", "has", "a", "high", "burden", "of", "cardiovascular", "risk", "factors", "(", "history", "of", "smoking", ",", "long-standing", "hypertension", "and", "previous", "ischaemic", "heart", "disease", ")", ",", "which", "together", "with", "the", "observed", "neurological", "focality", "(", "homonymous", "haemianopsia", ")", "suggests", "atherothrombotic", "or", "lacunar", "stroke", ".", "Embolic", "stroke", "is", "less", "likely", "as", "the", "patient", "was", "in", "sinus", "rhythm", ",", "although", "the", "presence", "of", "embolism", "secondary", "to", "intracardiac", "thrombus", "cannot", "be", "ruled", "out", ".", "On", "the", "other", "hand", ",", "the", "presence", "of", "leukocytosis", ",", "neutrophilia", "and", "elevated", "acute", "phase", "reactants", "make", "it", "necessary", "to", "rule", "out", "an", "infectious", "aetiology", "as", "the", "origin", "of", "the", "neurological", "picture", ".", "Infection", "of", "the", "central", "nervous", "system", "is", "a", "likely", "cause", "considering", "the", "recent", "diagnosis", "of", "infectious", "arthritis", "and", "bacteraemia", "due", "to", "S", ".", "zooepidemicus", ".", "In", "fact", ",", "although", "infections", "by", "this", "organism", "are", "rare", ",", "after", "bacteraemia", ",", "dissemination", "to", "other", "organs", "may", "occur", ",", "with", "meningitis", ",", "endophthalmitis", ",", "endocarditis", ",", "pneumonia", "or", "arthritis", "having", "been", "described", ".", "Few", "cases", "of", "meningitis", "specifically", "caused", "by", "S", ".", "zooepidemicus", "have", "been", "reported", "in", "the", "literature", ",", "although", "it", "is", "one", "of", "the", "most", "frequent", "species", "of", "group", "C", "streptococci", "causing", "meningitis3", ".", "The", "incubation", "period", "in", "humans", "varies", "from", "1", "to", "21", "days", ",", "with", "a", "median", "of", "7", "days", ".", "Fever", "and", "meningeal", "signs", "(", "which", "our", "patient", "did", "not", "have", ")", "are", "common", "at", "diagnosis", ",", "although", "alterations", "in", "mental", "status", ",", "low", "level", "of", "consciousness", "and", "stupor", "(", "which", "were", "present", "in", "this", "case", ")", "may", "also", "be", "present", ".", "Although", "meningitis", ",", "following", "dissemination", "by", "the", "bacteraemia", ",", "cannot", "be", "ruled", "out", ",", "its", "appearance", "after", "a", "period", "of", "improvement", "and", "the", "aforementioned", "neurological", "focality", "make", "it", "necessary", "to", "consider", "another", "process", ".", "Finally", ",", "in", "a", "patient", "with", "streptococcal", "bacteraemia", "who", "develops", "neurological", "focality", ",", "the", "main", "diagnosis", "to", "consider", "is", "the", "presence", "of", "cerebral", "septic", "embolisms", "secondary", "to", "infective", "endocarditis", ".", "Evolution", "The", "patient", "is", "admitted", "to", "the", "neurology", "ward", "with", "initial", "suspicion", "of", "acute", "stroke", ".", "This", "diagnosis", "was", "confirmed", "by", "magnetic", "resonance", "imaging", "(", "MRI", ")", "of", "the", "skull", ",", "which", "showed", "an", "alteration", "in", "signal", "intensity", "(", "hyperintense", "in", "T1", ",", "with", "increased", "perilesional", "signal", "in", "T2", "/", "FLAIR", ")", "of", "gyral", "morphology", ",", "patchy", "and", "discontinuous", "involvement", "of", "some", "of", "the", "convolutions", "of", "the", "right", "occipital", "lobe", "(", "lingual", "gyrus", ")", "in", "relation", "to", "a", "subacute", "ischaemic", "lesion", "with", "cortical", "microbleeding", ".", "The", "patchy", "and", "discontinuous", "involvement", "suggests", "embolic", "aetiology", ".", "As", "a", "study", "of", "the", "embolic", "source", ",", "a", "transthoracic", "echocardiogram", "was", "requested", ",", "showing", "an", "echogenic", "image", ",", "pedunculated", ",", "with", "erratic", "movement", "and", "ventricular", "prolapse", "in", "diastole", ",", "of", "irregular", "contour", "and", "17x10mm", "attached", "to", "the", "atrial", "facet", "of", "the", "posterior", "mitral", "valve", "leaflet", ",", "highly", "suggestive", "of", "endocarditis", ".", "Empirical", "treatment", "was", "started", "with", "ceftriaxone", "2g", "daily", "with", "simultaneous", "extraction", "of", "blood", "cultures", "without", "fever", ".", "The", "diagnosis", "was", "confirmed", "with", "a", "transesophageal", "echocardiogram", "that", "confirmed", "the", "18x10mm", "vegetation", "on", "the", "atrial", "side", "of", "the", "mitral", "valve", "p2", "festoon", ",", "with", "prolapsing", "movement", "in", "the", "left", "atrium", ",", "which", "led", "to", "mild", "mitral", "regurgitation", ".", "After", "discussing", "the", "case", "with", "Cardiac", "Surgery", ",", "intervention", "was", "ruled", "out", "as", "the", "mitral", "valve", "did", "not", "present", "any", "structural", "damage", ".", "The", "patient", "had", "a", "good", "clinical", "evolution", ",", "remaining", "afebrile", "and", "haemodynamically", "stable", "throughout", "the", "hospital", "stay", ".", "After", "a", "week", "of", "treatment", ",", "a", "decrease", "in", "acute", "phase", "reactants", "was", "observed", "(", "CRP", "6", ".", "5", "mg", "/", "dl", ",", "ESR", "55", "mm", "/", "h", ")", ".", "On", "withdrawing", "corticosteroid", "treatment", ",", "which", "the", "patient", "usually", "takes", "due", "to", "his", "Sjögren", "'", "s", "syndrome", ",", "he", "again", "presented", "non-fluctuating", "swelling", "on", "the", "dorsum", "of", "the", "right", "hand", "with", "redness", ".", "MRI", "of", "the", "right", "hand", "showed", "tenosynovitis", "of", "the", "extensors", "of", "the", "fingers", "and", "signs", "of", "arthritis", "of", "the", "radius", "and", "ulna", "joints", "with", "the", "carpus", ",", "which", "improved", "with", "the", "reintroduction", "of", "deflazacort", ".", "Antibiotic", "treatment", "started", "with", "ceftriaxone", "2g", "iv", "per", "day", "is", "continued", "for", "6-8", "weeks", "(", "MIC", "Cefotaxime", "≤", "1", ")", ".", "He", "was", "discharged", "three", "weeks", "after", "starting", "antibiotic", "therapy", "to", "continue", "treatment", "on", "an", "outpatient", "basis", ".", "Control", "blood", "cultures", "were", "repeated", "with", "negative", "results", "and", "echocardiogram", "with", "no", "changes", ",", "with", "vegetation", "still", "adhering", "to", "the", "mitral", "valve", ".", "The", "patient", "completed", "treatment", "for", "8", "weeks", "without", "incident", ",", "and", "a", "new", "control", "echocardiogram", "was", "performed", "4", "months", "later", "with", "no", "images", "suggestive", "of", "endocarditis", ".", "Blood", "cultures", "one", "month", "after", "the", "end", "of", "treatment", "were", "also", "negative", "and", "the", "patient", "was", "discharged", "from", "the", "Infectious", "Diseases", "Department", ".", "Final", "diagnosis", "-", "Infective", "endocarditis", "on", "native", "mitral", "valve", "due", "to", "Streptococcus", "zooepidemicus", ".", "-", "Right", "occipital", "stroke", "of", "embolic", "aetiology", "secondary", "to", "endocarditis", ".", "-", "Autoimmune", "arthritis", "of", "the", "right", "wrist", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "animals", "label": "SPECIES", "start": 913, "end": 920 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1114, "end": 1121 }, { "text": "microbiological isolation", "label": "SPECIES", "start": 2465, "end": 2490 }, { "text": "animals", "label": "SPECIES", "start": 2293, "end": 2300 }, { "text": "son", "label": "HUMAN", "start": 2306, "end": 2309 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2219, "end": 2226 }, { "text": "dog", "label": "SPECIES", "start": 2316, "end": 2319 }, { "text": "Streptococcus zooepidemicus", "label": "SPECIES", "start": 2048, "end": 2075 }, { "text": "bacteraemia", "label": "SPECIES", "start": 4313, "end": 4324 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4214, "end": 4221 }, { "text": "S. zooepidemicus", "label": "SPECIES", "start": 4332, "end": 4348 }, { "text": "humans", "label": "HUMAN", "start": 5778, "end": 5784 }, { "text": "S. zooepidemicus", "label": "SPECIES", "start": 5330, "end": 5346 }, { "text": "S. zooepidemicus", "label": "SPECIES", "start": 5605, "end": 5621 }, { "text": "bacteraemia", "label": "SPECIES", "start": 6316, "end": 6327 }, { "text": "streptococcal bacteraemia", "label": "SPECIES", "start": 6302, "end": 6327 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 6289, "end": 6296 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 6492, "end": 6499 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 7856, "end": 7863 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 8129, "end": 8136 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 8842, "end": 8849 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 9084, "end": 9091 }, { "text": "Streptococcus zooepidemicus", "label": "SPECIES", "start": 9220, "end": 9247 } ]

[ "Anamnesis", "A", "40-year-old", "male", "patient", ",", "HIV", "+", ",", "referred", "by", "the", "Infection", "Service", "for", "lesions", "in", "the", "genital", "area", ".", "The", "patient", "describes", "an", "initial", "single", "lesion", "of", "one", "month", "'", "s", "evolution", "in", "the", "perineum", "area", "treated", "with", "betamethasone", "/", "gentamicin", "cream", ",", "which", "does", "not", "disappear", "after", "10", "days", "of", "application", ",", "adding", "new", "lesions", ",", "and", "coinciding", "with", "throat", "discomfort", "and", "oral", "aphthae", ".", "Subsequently", ",", "treatment", "with", "systemic", "and", "topical", "famciclovir", "was", "started", "on", "suspicion", "of", "Herpes", "Simplex", ",", "but", "no", "improvement", "was", "achieved", ".", "Physical", "examination", "Erythematous", "scaly", "plaques", "were", "seen", "on", "the", "scrotum", "and", "shaft", "of", "the", "penis", "and", "erythematous", "papular", "lesions", "of", "approximately", "6-10", "mm", "with", "an", "eroded", "centre", "in", "the", "bilateral", "inguinal", "region", ".", "Complementary", "examinations", "Serology", "for", "syphilis", ",", "PCR", "for", "other", "STIs", "and", "stool", "culture", "were", "requested", ",", "which", "were", "negative", ".", "Histopathological", "examination", "revealed", "spongiosis", "with", "exocytosis", "of", "neutrophils", "and", "lymphocytes", "and", "apoptotic", "keratinocytes", "at", "different", "levels", ".", "The", "granular", "layer", "is", "absent", "in", "some", "areas", ",", "coinciding", "with", "parakeratosis", ".", "In", "the", "dermis", "there", "is", "an", "inflammatory", "infiltrate", "of", "lymphohistiocytic", "cells", ",", "with", "some", "plasma", "cells", ",", "arranged", "around", "small", "vessels", "of", "the", "superficial", "capillary", "and", "interstitial", "plexus", "with", "a", "tendency", "to", "band-like", "arrangement", ".", "Diagnosis", "Pityriasis", "rosea", "inversa", ".", "Treatment", "Treatment", "with", "prednisone", "40", "mg", "/", "day", "was", "started", ".", "Evolution", "New", "lesions", "were", "added", "in", "the", "intergluteal", "area", "and", "there", "was", "an", "erythematous", ",", "chalky", "plaque", "on", "the", "scalp", "measuring", "about", "2", "cm", "in", "the", "left", "parietal", "region", ".", "One", "month", "after", "starting", "oral", "corticosteroids", ",", "the", "lesions", "stabilised", "and", "began", "to", "disappear", "without", "the", "appearance", "of", "new", "ones", ",", "so", "the", "corticosteroids", "were", "gradually", "reduced", "until", "they", "were", "discontinued", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "male patient", "label": "HUMAN", "start": 24, "end": 36 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 38, "end": 41 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 29, "end": 36 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 115, "end": 122 }, { "text": "Herpes Simplex", "label": "SPECIES", "start": 470, "end": 484 }, { "text": "syphilis", "label": "SPECIES", "start": 771, "end": 779 } ]

[ "A", "46-year-old", "female", "patient", "came", "to", "the", "emergency", "department", "with", "severe", "headache", "and", "tinnitus", ".", "In", "the", "past", "she", "had", "presented", "with", "symptoms", "of", "lesser", "intensity", ",", "for", "which", "she", "had", "been", "diagnosed", "with", "sinusitis", ".", "Based", "on", "the", "guidelines", "of", "the", "American", "College", "of", "Radiology", ",", "an", "urgent", "cranial", "CT", "scan", "was", "recommended1", ".", "1", "The", "CT", "scan", "showed", "an", "occupied", "left", "sphenoid", "sinus", "(", "hydro-aerial", "level", ")", ",", "extensive", "pneumatization", "of", "the", "sphenoid", "sinuses", "and", "a", "bony", "defect", "in", "the", "lateral", "portion", "of", "the", "roof", "of", "the", "sphenoid", "sinus", ".", "Other", "findings", "were", "an", "empty", "sella", "turcica", "and", "prominent", "arachnoid", "granulations", "in", "the", "greater", "wings", "of", "the", "sphenoid", ".", "The", "study", "was", "extended", "with", "a", "scheduled", "cranial", "MRI", ",", "which", "detected", "a", "temporal", "meningocele", "crossing", "the", "bony", "defect", ".", "The", "diagnosis", "was", "spontaneous", "meningocele", "/", "CSF", "fistula", "with", "intracranial", "hypertension", "syndrome", "(", "IHS", ")", "." ]

[ 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "female patient", "label": "HUMAN", "start": 14, "end": 28 } ]

[ "Anamnesis", "A", "37-year-old", "man", "with", "no", "personal", "history", "of", "interest", "came", "for", "consultation", "with", "pustular", "lesions", "on", "the", "right", "hand", "of", "4", "months", "'", "evolution", ".", "He", "reported", "that", "4", "months", "earlier", ",", "during", "a", "visit", "to", "a", "zoo", ",", "he", "had", "been", "bitten", "by", "an", "albino", "tiger", "cub", "and", "had", "not", "undergone", "local", "treatment", "or", "antibiotic", "prophylaxis", ".", "The", "animal", "was", "healthy", "and", "correctly", "vaccinated", "according", "to", "the", "zoo", "veterinarian", ".", "After", "the", "wound", "had", "healed", ",", "progressive", "local", "desquamation", "of", "the", "skin", "appeared", ",", "followed", "shortly", "afterwards", "by", "papular", "lesions", "that", "evolved", "into", "pustules", ",", "progressively", "increasing", "in", "number", "and", "size", ".", "In", "the", "anamnesis", "by", "organs", "and", "apparatus", ",", "the", "patient", "reported", "no", "fever", "or", "other", "accompanying", "symptoms", ".", "Three", "days", "before", "coming", "to", "the", "clinic", "she", "had", "started", "empirical", "treatment", "with", "amoxicillin-clavulanic", "acid", "500", "mg", "/", "8", "h", "v", ".", "o", ".", "without", "improvement", ".", "Physical", "examination", "On", "the", "dorsal", "ulnar", "border", "of", "the", "right", "hand", "there", "was", "an", "inflammatory", "erythematous", "plaque", "with", "well-defined", "borders", "and", "abundant", "yellowish", "pustules", ",", "extending", "to", "the", "palm", ".", "On", "the", "dorsum", "of", "the", "proximal", "phalanx", "of", "the", "5th", "finger", ",", "corresponding", "to", "the", "area", "of", "the", "bite", ",", "there", "is", "an", "increase", "in", "soft", "tissue", "with", "intense", "erythema", ",", "increased", "local", "temperature", "and", "pustules", ".", "No", "regional", "loco-regional", "lymphadenopathies", "are", "palpable", ".", "Complementary", "tests", "A", "skin", "biopsy", "of", "the", "area", "of", "increased", "inflammation", "revealed", "acute", "abscessifying", "inflammation", "in", "the", "dermis", ",", "predominantly", "in", "areas", "close", "to", "follicles", ",", "with", "the", "presence", "of", "filamentous", "fungal", "structures", "and", "accompanied", "by", "histiocytes", "and", "multinucleated", "giant", "cells", ",", "as", "well", "as", "a", "small", "granuloma", ".", "Bacterial", "culture", "of", "the", "biopsy", ",", "Lowenstein", "and", "Zhiel-Nielsen", "were", "negative", ".", "Fungal", "culture", "of", "the", "biopsy", "isolated", "Trichophyton", "mentagrophytes", ".", "Diagnosis", "Majocchi", "granuloma", "on", "the", "hand", ".", "Treatment", "Itraconazole", "100", "mg", "/", "12h", "and", "Ciclopirox", "olamine", "cream", "every", "12h", "were", "started", ".", "Evolution", "The", "patient", "has", "evolved", "satisfactorily", ",", "with", "disappearance", "of", "the", "erythema", "and", "pustules", "after", "6", "weeks", "of", "treatment", "and", "persistence", "of", "discrete", "violaceous", "inflammation", "on", "the", "dorsum", "of", "the", "1st", "phalanx", "of", "the", "5th", "finger", ".", "Currently", ",", "she", "continues", "treatment", "for", "3", "months", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "animal", "label": "SPECIES", "start": 322, "end": 328 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 648, "end": 655 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 36, "end": 44 }, { "text": "vaccinated", "label": "SPECIES", "start": 355, "end": 365 }, { "text": "albino tiger", "label": "SPECIES", "start": 236, "end": 248 }, { "text": "veterinarian", "label": "HUMAN", "start": 387, "end": 399 }, { "text": "Trichophyton mentagrophytes", "label": "SPECIES", "start": 1733, "end": 1760 }, { "text": "Bacterial", "label": "SPECIES", "start": 1618, "end": 1627 }, { "text": "filamentous fungal structures", "label": "SPECIES", "start": 1495, "end": 1524 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1908, "end": 1915 } ]

[ "Clinical", "history", ".", "Anamnesis", "63-year-old", "woman", "with", "the", "following", "personal", "history", ":", "hypertension", ",", "rectal", "neoplasia", "treated", "with", "surgery", ",", "hypothyroidism", ",", "hypoparathyroidism", "and", "radiotherapy", "(", "complete", "remission", ")", ",", "lymphoedema", "secondary", "to", "radiotherapy", ",", "McLeod", "'", "s", "syndrome", "(", "peripheral", "neuropathy", ",", "cardiomyopathy", ",", "haemolytic", "anaemia", "with", "acanthosis", "and", "respiratory", "insufficiency", ")", "and", "venous", "insufficiency", ".", "Usual", "treatment", ":", "enalapril", ",", "levothyroxine", ",", "rocaltrol", "and", "mastical", "D", ".", "Admitted", "to", "Hospital", "Axarquía", "for", "asthenia", "and", "progressive", "oedema", "in", "both", "lower", "limbs", ",", "of", "1", "month", "'", "s", "evolution", ".", "In", "the", "last", "2", "weeks", ",", "acute", "gastroenteritis", "(", "treated", "with", "ciprofloxacin", ")", "and", "in", "the", "last", "few", "days", ",", "erythematous", "lesions", "with", "increased", "temperature", "in", "the", "distal", "third", "of", "the", "right", "lower", "limb", ",", "suggestive", "of", "cellulitis", ".", "Occasionally", ",", "urinary", "incontinence", ",", "choluria", "and", "frothy", "urine", ",", "but", "she", "denies", "voiding", "syndrome", ".", "After", "being", "treated", "with", "furosemide", "and", "ceftriaxone", "i", ".", "v", ".", ",", "peripheral", "oedema", "decreased", "but", "ascites", "increased", ".", "After", "this", ",", "an", "abdominal", "CT", "scan", "with", "contrast", "was", "performed", "and", "after", "2", "days", ",", "there", "was", "a", "further", "increase", "in", "oedema", ",", "oligoanuria", "and", "deterioration", "of", "renal", "function", "(", "Creatinine", "1", ".", "6", "mg", "/", "dl", ")", ".", "For", "this", "reason", "she", "was", "transferred", "to", "the", "HRU", "Carlos", "Haya", "to", "complete", "the", "study", ".", "Physical", "examination", "BP", ":", "116", "/", "70", ".", "Afebrile", ".", "Good", "general", "condition", ",", "conscious", "and", "oriented", ",", "eupneic", "at", "rest", ",", "well", "hydrated", "and", "perfused", ".", "Pulmonary", "auscultation", "showed", "crackles", "in", "the", "right", "base", "and", "hypoventilation", "in", "the", "left", "base", ".", "Abdomen", ":", "hepatomegaly", ",", "wall", "oedema", "in", "declivity", "and", "hypogastrium", "and", "ascites", ".", "Right", "lower", "limb", ":", "lymphoedema", "up", "to", "the", "thigh", ",", "with", "warm", "erythematous", "plaques", "in", "the", "pretibial", "area", "(", "suggestive", "of", "cellulitis", ")", ".", "Left", "lower", "limb", ":", "oedema", "up", "to", "the", "thigh", "with", "no", "signs", "of", "DVT", ".", "Complementary", "tests", "Blood", "count", ":", "normal", "except", "for", "ESR", "70", "mm", ".", "Coagulation", ":", "normal", ".", "Biochemistry", ":", "Creatinine", "1", ".", "24", ",", "cholesterol", "226", "(", "LDL", "165", ")", ",", "AST", "110", ",", "ALT", "39", ",", "FA", "423", ",", "GGT", "433", ",", "bilirubin", "normal", ".", "LDH", "270", ",", "Calcium", "6", ".", "8", ",", "phosphorus", "3", ".", "9", ",", "total", "protein", "4", ".", "1", ",", "albumin", "2", ".", "3", ",", "sodium", ",", "potassium", ",", "chloride", "and", "CRP", "normal", ".", "Sediment", "with", "isolated", "urine", ":", "50", "red", "blood", "cells", "/", "field", ",", "protein", "500mg", "/", "dl", ".", "Proteinogram", ":", "protein", "4", ".", "2", ",", "albumin", "2", ",", "beta", "globulin", "0", ".", "4", ",", "gamma", "globulin", "0", ".", "5", ",", "no", "monoclonal", "component", "observed", ".", "IgA", "72", ",", "IgM", "176", ",", "IgG", "415", ".", "Ferritin", "79", ",", "thyroid", "profile", "normal", ",", "anti-TPO", "and", "TSI", "negative", ",", "ANA", ",", "antiDNA", "and", "ANCAs", "negative", "as", "well", "as", "the", "rest", "of", "autoimmunity", ".", "Complement", "normal", ".", "HAV", ",", "HBV", ",", "HCV", "and", "HIV", "serology", "negative", ".", "CEA", "5", ".", "9", ".", "24h", "urine", ":", "volume", "2400", ",", "proteins", ":", "3538", "mg", ",", "Na", "109", ",", "K", "52", "and", "Calcium", "72", ".", "Chest", "X-ray", ":", "loss", "of", "volume", "in", "left", "hemithorax", "which", "has", "increased", "with", "respect", "to", "previous", "X-ray", ".", "Abdominal", "ultrasound", ":", "left", "pleural", "effusion", ".", "Simple", "cyst", "in", "the", "left", "hepatic", "lobe", ".", "Slightly", "decreased", "kidney", "size", "with", "small", "parapelvic", "cysts", "already", "known", "previously", ".", "Moderate", "amount", "of", "fluid", "in", "the", "perihepatic", ",", "perisplenic", "and", "pelvic", "areas", ".", "Thoracoabdominal", "CT", "scan", ":", "gross", "calcifications", "in", "the", "thyroid", "gland", ".", "Mild-moderate", "pericardial", "effusion", ".", "Bilateral", "effusion", "of", "left", "predominance", ".", "Decreased", "size", "of", "the", "left", "pulmonary", "artery", ".", "Volume", "loss", "in", "left", "hemithorax", "without", "central", "obstructive", "cause", ".", "Multiple", "varicoid", "and", "cystic", "bronchiectasis", ",", "predominantly", "in", "the", "left", "lower", "lobe", ".", "Lesion", "suggestive", "of", "cyst", "in", "left", "hepatic", "lobe", ".", "Perihepatic", "and", "perisplenic", "fluid", ".", "Kidneys", "with", "increased", "attenuation", ".", "Tracheal", "diverticulum", "in", "the", "right", "posterolateral", "wall", ".", "Echocardiogram", ":", "severe", "left", "ventricular", "hypertrophy", ",", "with", "borderline", "systolic", "dysfunction", "and", "diastolic", "dysfunction", ".", "Mild", "pericardial", "effusion", "surrounding", "the", "left", "atrium", ".", "Differential", "diagnosis", "It", "is", "a", "nephrotic", "syndrome", "with", "impaired", "renal", "function", "(", "without", "previous", "nephropathy", ")", ",", "in", "the", "context", "of", "radiological", "study", "with", "contrast", ".", "With", "all", "these", "data", ",", "the", "following", "diagnostic", "options", "are", "considered", "on", "admission", ":", "Glomerular", "disease", ":", "-", "Minimal", "changes", "or", "lipoid", "nephrosis", ":", "usually", "more", "frequent", "in", "children", "between", "2", "and", "10", "years", "of", "age", ".", "So", "it", "is", "unlikely", ".", "-", "Focal", "and", "segmental", "glomerulosclerosis", ":", "more", "frequent", "in", "adolescents", ".", "-", "Membranous", "nephropathy", "or", "membranoproliferative", "glomerulonephritis", ":", "<", "1", "%", "of", "cases", ".", "Within", "this", "group", "it", "is", "the", "most", "compatible", "with", "our", "case", ".", "Systemic", "disease", ":", "SLE", ",", "viral", "infections", "(", "HIV", ",", "hepatitis", "B", "and", "C", ")", ",", "bacterial", "infections", "(", "streptococcal", "tonsillitis", ",", "etc", ".", ")", ",", "vasculitis", ",", "multiple", "myeloma", ",", "amyloidosis", ",", "etc", ".", "These", "entities", "are", "the", "most", "compatible", "with", "the", "picture", ",", "but", "have", "already", "been", "ruled", "out", "with", "blood", "tests", ",", "except", "for", "multiple", "myeloma", "and", "amyloidosis", ".", "Therefore", ",", "further", "complementary", "tests", "should", "be", "carried", "out", "to", "confirm", "or", "rule", "out", "these", "last", "two", "processes", ".", "Complementary", "tests", "Renal", "biopsy", ":", "acellular", "nodular", "glomeruli", "with", "an", "impression", "of", "amyloidosis", ".", "The", "area", "of", "AA", "amyloid", "deposition", "stained", "brown", "by", "immunohistochemistry", "coincides", "with", "that", "of", "Kappa", "light", "chain", "deposition", ".", "In", "principle", ",", "this", "seems", "somewhat", "contradictory", ",", "as", "the", "two", "types", "of", "amyloid", "cannot", "be", "stained", "at", "the", "same", "time", ".", "The", "test", "is", "repeated", ",", "with", "the", "same", "results", ".", "Bone", "marrow", "biopsy", ":", "Myelogram", ":", "marrow", "with", "good", "clumps", ",", "cellularity", ",", "quite", "fat", "in", "some", "of", "the", "clumps", ".", "Presence", "of", "all", "populations", "in", "their", "various", "mature", "forms", "with", "plasma", "in", "7", "%", "of", "the", "cellular", "total", ",", "of", "mature", "morphology", "and", "without", "the", "presence", "of", "intermediate", "lymphoid", "elements", ".", "J", ".", "C", ":", "haematopoietic", "marrow", ".", "Flow", "cytometry", ":", "3", "%", "of", "plasma", "cells", "with", "abnormal", "phenotype", ",", "typical", "of", "myelomatous", "plasma", "cells", ",", "together", "with", "0", ".", "2", "%", "of", "plasma", "cells", "with", "normal", "phenotype", ".", "Final", "diagnosis", "Primary", "amyloidosis", "with", "possible", "coexistence", "of", "AA", "amyloid", "(", "cardiac", ",", "renal", ",", "digestive", "and", "neuropathic", "infiltration", ")", ".", "Evolution", "On", "admission", ",", "an", "ultrasound-guided", "renal", "biopsy", "was", "performed", ",", "which", "revealed", "AA", "amyloid", "deposits", ",", "as", "well", "as", "positive", "IF", "for", "Kappa", "chains", ".", "Laboratory", "tests", "showed", ":", "nephrotic", "proteinuria", ",", "presence", "of", "kappa", "light", "chains", "in", "urine", ".", "In", "blood", ",", "absence", "of", "monoclonal", "peak", ",", "but", "presence", "of", "kappa", "light", "chains", "and", "altered", "ratio", ".", "Global", "hypogammaglobulinaemia", ",", "with", "normal", "complements", ".", "Significant", "dissociated", "cholestasis", "pattern", ",", "severe", "increase", "in", "GGT", "and", "LDH", ".", "Based", "on", "these", "data", ",", "the", "haematology", "department", "was", "consulted", "and", "carried", "out", "a", "flow", "cytometry", "test", ",", "which", "reported", "the", "presence", "of", "3", "%", "of", "plasma", "cells", "with", "an", "abnormal", "kappa", "phenotype", ".", "Finally", ",", "it", "was", "concluded", "that", "it", "was", "primary", "amyloidosis", ",", "with", "the", "possible", "coexistence", "of", "AA", "amyloid", ".", "Treatment", "was", "started", "with", "cyclophosphamide", "and", "steroids", "as", "indicated", "by", "the", "haematology", "department", ",", "with", "further", "check-ups", "in", "the", "outpatient", "haematology", "and", "nephrology", "departments", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 40, "end": 45 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 65, "end": 73 }, { "text": "HAV", "label": "SPECIES", "start": 2445, "end": 2448 }, { "text": "HBV", "label": "SPECIES", "start": 2450, "end": 2453 }, { "text": "HCV", "label": "SPECIES", "start": 2455, "end": 2458 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 2463, "end": 2466 }, { "text": "children", "label": "HUMAN", "start": 3927, "end": 3935 }, { "text": "adolescents", "label": "HUMAN", "start": 4045, "end": 4056 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 4242, "end": 4245 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 4224, "end": 4229 }, { "text": "hepatitis B", "label": "SPECIES", "start": 4247, "end": 4258 }, { "text": "hepatitis B and C", "label": "SPECIES", "start": 4247, "end": 4264 } ]

[ "An", "81-year-old", "man", "with", "a", "history", "of", "hypertension", ",", "dyslipidaemia", "and", "atrial", "fibrillation", "under", "treatment", "and", "a", "recent", "trip", "to", "South", "Africa", ".", "He", "was", "admitted", "with", "a", "fever", "of", "five", "days", "'", "evolution", "together", "with", "multiple", "vesicular", "punctate", "lesions", "of", "different", "morphology", "on", "the", "lower", "extremities", ",", "as", "well", "as", "a", "right", "buttocks", "eschar", "of", "black", "colour", "surrounded", "by", "erythema", ".", "The", "results", "of", "the", "complementary", "study", "showed", "slight", "alteration", "of", "transaminases", "together", "with", "neutrophilia", "and", "elevated", "CRP", ",", "with", "X-rays", "without", "relevant", "alterations", ".", "Blood", "cultures", ",", "malaria", "test", "and", "Giemsa", "stain", "were", "requested", "and", "were", "negative", ",", "as", "well", "as", "serology", "for", "HAV", ",", "HBV", ",", "HCV", ",", "HIV", ",", "coxiella", "burnetti", ",", "borrelia", "burgdorferi", "and", "leishmania", ",", "with", "positive", "serology", "for", "Rickettsia", ".", "In", "this", "patient", ",", "given", "the", "clinical", "presentation", "and", "the", "history", "of", "a", "trip", "to", "a", "Rickettsia", "endemic", "area", "with", "positive", "serology", ",", "it", "was", "decided", "to", "start", "treatment", "with", "doxycycline", ",", "with", "disappearance", "of", "the", "fever", ",", "and", "he", "was", "found", "to", "be", "asymptomatic", "on", "discharge", ".", "Firstly", ",", "the", "patient", "tested", "positive", "for", "Rickettsia", "conorii", "by", "cross-reaction", ",", "and", "later", "tested", "positive", "for", "Rickettsia", "africana", "(", "when", "the", "samples", "were", "sent", "to", "the", "reference", "centre", ")", ".", "African", "tick-borne", "fever", "should", "be", "considered", "in", "patients", "with", "suggestive", "symptoms", "and", "a", "history", "of", "travel", "to", "susceptible", "areas", ",", "as", "it", "is", "one", "of", "the", "most", "frequently", "imported", "rickettsial", "diseases", ".", "African", "tick", "bite", "fever", "caused", "by", "Ricketttsia", "africana", "is", "mainly", "established", "in", "rural", "areas", "of", "sub-Saharan", "countries", "and", "Caribbean", "islands", ",", "transmitted", "by", "vectors", "(", "Amblyomma", "hebraeum", "and", "A", ".", "variegatum", "ticks", ")", "with", "an", "average", "incubation", "period", "of", "7", "days", ".", "The", "clinical", "presentation", "consists", "mainly", "of", "fever", ",", "headache", "with", "eschar", "and", "regional", "lymphadenopathy", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 4, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Rickettsia", "label": "SPECIES", "start": 744, "end": 754 }, { "text": "Rickettsia", "label": "SPECIES", "start": 836, "end": 846 }, { "text": "HAV", "label": "SPECIES", "start": 641, "end": 644 }, { "text": "HBV", "label": "SPECIES", "start": 646, "end": 649 }, { "text": "HCV", "label": "SPECIES", "start": 651, "end": 654 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 656, "end": 659 }, { "text": "borrelia burgdorferi", "label": "SPECIES", "start": 680, "end": 700 }, { "text": "coxiella burnetti", "label": "SPECIES", "start": 661, "end": 678 }, { "text": "leishmania", "label": "SPECIES", "start": 705, "end": 715 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 764, "end": 771 }, { "text": "Rickettsia", "label": "SPECIES", "start": 1061, "end": 1071 }, { "text": "Rickettsia", "label": "SPECIES", "start": 1129, "end": 1139 }, { "text": "Rickettsia africana", "label": "SPECIES", "start": 1129, "end": 1148 }, { "text": "Rickettsia conorii", "label": "SPECIES", "start": 1061, "end": 1079 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1033, "end": 1040 }, { "text": "Amblyomma hebraeum", "label": "SPECIES", "start": 1564, "end": 1582 }, { "text": "African tick", "label": "SPECIES", "start": 1204, "end": 1216 }, { "text": "African tick", "label": "SPECIES", "start": 1400, "end": 1412 }, { "text": "patients", "label": "HUMAN", "start": 1253, "end": 1261 }, { "text": "vectors", "label": "SPECIES", "start": 1555, "end": 1562 }, { "text": "A. variegatum", "label": "SPECIES", "start": 1587, "end": 1600 }, { "text": "Ricketttsia africana", "label": "SPECIES", "start": 1434, "end": 1454 }, { "text": "ticks", "label": "SPECIES", "start": 1601, "end": 1606 } ]

[ "A", "21", "year", "old", "male", ",", "who", "was", "involuntarily", "admitted", "to", "the", "psychiatric", "hospitalisation", "unit", "after", "presenting", "with", "the", "first", "psychotic", "episode", "due", "to", "cannabis", "consumption", ".", "According", "to", "the", "father", ",", "a", "progressive", "abandonment", "of", "activities", "(", "work", ",", "leisure", ")", "and", "affective", "relationships", "(", "friendships", ")", "is", "observed", ",", "with", "the", "patient", "finding", "himself", "in", "a", "situation", "of", "isolation", ",", "inactivity", "and", "apathy", "in", "the", "last", "6", "months", ".", "Likewise", ",", "behavioural", "alterations", "have", "increased", ",", "with", "heteroaggressiveness", "at", "home", "and", "psychotic", "symptoms", ";", "delusions", "of", "harm", ",", "centred", "on", "the", "family", "environment", ".", "As", "well", "as", "the", "presence", "of", "auditory", "hallucinations", ".", "EVALUATION", "HEALTH", "PERCEPTION", "/", "MAINTENANCE", "PATTERN", "Neglected", "physical", "appearance", ".", "No", "awareness", "of", "illness", ".", "Toxic", "habits", ":", "Cannabis", "smoker", "since", "the", "age", "of", "15", ",", "reaching", "quantities", "of", "about", "8", "joints", "a", "day", ".", "Intranasal", "cocaine", "user", "since", "the", "age", "of", "18", ",", "sporadically", "(", "recreational", "use", "at", "weekends", ")", ".", "No", "known", "allergies", "NUTRITIONAL", "/", "METABOLIC", "PATTERN", ":", "Weight", ":", "60", "kg", "Height", ":", "1", "\"", "75m", "BMI", ":", "19", "\"", "5", "(", "Normopeso", ")", ".", "Inadequate", "nutrition", "due", "to", "delusions", "of", "harm", "in", "the", "family", "environment", "(", "ideas", "of", "poisoning", ")", ".", "Occasional", "vomiting", ",", "coinciding", "with", "delirious", "activity", "(", "verbalised", "by", "the", "patient", ")", ".", "Significant", "weight", "loss", "in", "recent", "months", ".", "ELIMINATION", "/", "EXCHANGE", "PATTERN", "Mixed", "continent", ".", "Adequate", "bowel", "rhythm", ":", "every", "3", "days", ".", "No", "use", "of", "laxatives", "ACTIVITY", "/", "EXERCISE", "PATTERN", "Self-care", ":", "needs", "supervision", "for", "toileting", "/", "hygiene", "although", "able", "to", "perform", "tasks", "without", "assistance", ".", "Leisure", "activities", ":", "verbalises", "anhedonia", ".", "Shows", "no", "interest", "in", "any", "activity", ".", "Mobility", ":", "slowed", "pace", ".", "SLEEP", "-", "REST", "PATTERN", "Sleeping", "hours", ":", "9", "hours", ".", "Sleep", "pattern", "currently", "preserved", ",", "requiring", "occasional", "hypnotic", "medication", ".", "Other", "breaks", ":", "1", "hour", "nap", "daily", ".", "COGNITIVE-PERCEPTUAL", "PATTERN", "Conscious", "and", "oriented", "in", "all", "three", "spheres", ".", "Alert", ";", "uncooperative", "Thought", "content", ":", "delusions", "of", "harm", ".", "Auditory", "hallucinatory", "phenomena", "and", "delusional", "interpretations", "of", "harm", "are", "observed", ".", "Language", "poor", "in", "content", ",", "verbalising", "feelings", "of", "anhedonia", ",", "as", "well", "as", "abulia", ".", "Slowed", "course", "of", "thought", ";", "a", "delusional", "ideation", "of", "harm", "is", "observed", ",", "as", "well", "as", "self-referential", "experiences", "and", "auditory", "hallucinations", "with", "emotional", "and", "behavioural", "repercussions", "(", "irritability", ",", "heteroaggressiveness", ",", "isolation", ",", "withdrawal", "from", "activities", "and", "social", "interaction", ")", ".", "SELF-PERCEPTION", "-", "SELF-CONCEPT", "PATTERN", "Emotional", "reactivity", ":", "apathy", ",", "abulia", ".", "No", "ideas", "of", "self-harm", "or", "death", ".", "ROLE", "PATTERN", "-", "RELATIONSHIPS", "Lives", "with", "his", "father", "and", "siblings", "in", "the", "family", "home", ".", "He", "is", "the", "eldest", "of", "three", "siblings", ".", "Conflict", "in", "family", "relationships", ",", "due", "to", "the", "ideas", "of", "harm", "and", "heteroaggressiveness", "that", "he", "presents", ".", "At", "an", "academic", "level", ",", "he", "finished", "primary", "school", ".", "Currently", "unemployed", ".", "Previously", "worked", "in", "different", "jobs", "in", "parcel", "delivery", "companies", ".", "SEXUALITY", "-", "REPRODUCTION", "PATTERN", "Currently", "without", "a", "partner", ".", "Previously", "risky", "behaviour", ":", "several", "sexual", "partners", "at", "the", "same", "time", ".", "No", "use", "of", "STD", "protection", ".", "COPING", "PATTERN", "-", "STRESS", "TOLERANCE", "Stress", "trigger", ":", "delusional", "thoughts", "/", "ideas", "and", "auditory", "hallucinations", ".", "Does", "not", "adopt", "coping", "strategies", "due", "to", "inability", "to", "cope", "effectively", ".", "Has", "difficulty", "with", "problem", "solving", "and", "few", "coping", "strategies", "to", "deal", "with", "stressful", "situations", ".", "VALUES", "/", "BELIEFS", "PATTERN", "No", "alterations", "in", "this", "pattern" ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "cannabis", "label": "SPECIES", "start": 148, "end": 156 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 316, "end": 323 }, { "text": "father", "label": "HUMAN", "start": 188, "end": 194 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 556, "end": 562 }, { "text": "Cannabis", "label": "SPECIES", "start": 753, "end": 761 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 1083, "end": 1089 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1200, "end": 1207 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 2519, "end": 2525 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 2580, "end": 2586 }, { "text": "siblings", "label": "HUMAN", "start": 2503, "end": 2511 }, { "text": "siblings", "label": "HUMAN", "start": 2558, "end": 2566 }, { "text": "father", "label": "HUMAN", "start": 2492, "end": 2498 }, { "text": "partner", "label": "HUMAN", "start": 2865, "end": 2872 }, { "text": "partners", "label": "HUMAN", "start": 2918, "end": 2926 } ]

[ "Anamnesis", "44-year-old", "male", ",", "with", "chronic", "enolic", "habit", "(", "40g", "/", "day", ")", "and", "history", "of", "CDC", "group", "A2", "HIV-1", "infection", "diagnosed", "in", "1993", ",", "on", "treatment", "with", "tenofovir", ",", "emtricitabine", "and", "efavirez", "with", "undetectable", "viral", "load", "and", "CD4", "=", "846", "cells", "/", "μl", ",", "as", "well", "as", "chronic", "hepatitis", "C", ",", "genotype", "4", "of", "recent", "diagnosis", "(", "untreated", ")", ",", "who", "was", "referred", "to", "the", "dermatology", "department", "for", "presenting", "blisters", "on", "the", "back", "of", "the", "hands", "that", "had", "been", "evolving", "for", "4", "months", "in", "the", "context", "of", "minor", "trauma", "in", "this", "area", ",", "which", "had", "broken", ",", "resulting", "in", "wounds", "that", "healed", "leaving", "scars", ".", "Physical", "examination", "Examination", "revealed", "the", "presence", "of", "tense", "blisters", "of", "serous", "content", "measuring", "0", ".", "51cm", "on", "the", "dorsum", "of", "the", "hands", "and", "both", "forearms", ",", "as", "well", "as", "superficial", "erosions", "and", "serohaematic", "crusts", ".", "He", "had", "an", "isolated", "lesion", "of", "similar", "characteristics", "on", "the", "auricles", ".", "The", "patient", "had", "an", "isolated", "lesion", "of", "similar", "characteristics", "on", "the", "auricular", "pavilions", ".", "There", "were", "also", "residual", "atrophic", "scars", "with", "hypopigmentation", "in", "the", "periphery", "and", "some", "millium", "cysts", ".", "On", "the", "face", ",", "at", "the", "periocular", "level", "and", "on", "both", "cheeks", ",", "there", "was", "melasma-type", "pigmentation", "and", "slight", "malar", "hypertrichosis", ".", "Complementary", "examinations", "-", "Biochemistry", ":", "GPT", "80", "(", "5-45", "U", "/", "l", ")", ",", "GOT", "49", "(", "5-37", "U", "/", "l", ")", ",", "GGT", "117", "(", "8-61", "U", "/", "l", ")", ".", "Glucose", ",", "cholesterol", ",", "renal", "function", "and", "ions", "without", "alterations", ".", "-", "Haemogram", ":", "Hb", "17", ".", "2", "g", "/", "dl", ",", "haematocrit", "49", ".", "6", "(", "39", ".", "1-49", ".", "7", "%", ")", ".", "-", "Iron", "profile", ":", "Iron", "192", "(", "59-158", "μg", "/", "dl", ")", ",", "Ferritin", "440", "(", "30-400ng", "/", "ml", ")", ",", "Transferrin", "230", "(", "200360mg", "/", "dl", ")", ",", "%", "transferrin", "saturation", "53", "(", "20-50", "%", ")", ".", "Cerulopasmin", "27", "(", "15-30", "mg", "/", "dl", ")", ".", "Alpha-1-antitrypsin", "150", "(", "90-200mg", "/", "dl", ")", ".", "-", "Serology", ":", "Positive", "for", "HCV", "with", "detectable", "viral", "load", "(", "14", ".", "00IU", "/", "ml", ")", "and", "positive", "for", "HIV", "with", "undetectable", "viral", "load", ".", "Other", "serologies", "negative", ".", "-", "Porphyrins", "in", "24-hour", "urine", ":", "Screening", "total", "porphyrins", "4773", "(", "10-200", ")", "with", "the", "presence", "of", "a", "high", "intensity", "peak", "at", "623nm", "in", "the", "fluorometric", "scan", ".", "Coproporphyrins", "1709", "(", "<", "150", "μg", "/", "gr", ")", ",", "Uroporphyrins", "3064", "(", "<", "30", "μg", "/", "gr", ")", ",", "Delta-aminolevulinic", "acid", "5", ".", "52", "(", "<", "7", ".", "50", "mg", "/", "l", ")", ",", "Porphobilinogen", "1", ".", "31", "(", "<", "2", ".", "50", "mg", "/", "l", ")", ".", "-", "Total", "plasma", "porphyrins", ":", "9", ".", "5", "(", "0", ".", "1", "μg", "/", "dl", ")", ".", "-", "Histological", "study", "of", "a", "blistering", "lesion", "showed", "a", "subepidermal", "blister", "surrounded", "by", "mixed", "inflammatory", "infiltrate", "as", "well", "as", "PAS-positive", "deposition", "of", "fibrillar", "material", "at", "perivascular", "level", "in", "superficial", "dermis", ".", "Immunofluorescence", "revealed", "IgG", "deposition", "in", "the", "vessel", "walls", ".", "Diagnosis", "Based", "on", "clinical", ",", "analytical", "and", "histological", "features", "the", "patient", "was", "diagnosed", "with", "Porphyria", "Cutanea", "Tarda", "(", "PCT", ")", ".", "Treatment", "After", "diagnosis", "the", "patient", "was", "referred", "to", "the", "infectious", "disease", "unit", "where", "treatment", "for", "Hepatitis", "C", "was", "started", "with", "interferon", "alpha", "and", "ribavirin", ".", "We", "insisted", "on", "the", "importance", "of", "eliminating", "clinical", "triggers", "(", "trauma", ",", "alcohol", "consumption", ")", "and", "on", "the", "use", "of", "photoprotection", ".", "On", "the", "other", "hand", ",", "given", "the", "presence", "of", "alterations", "in", "the", "ferrokinetic", "profile", ",", "we", "recommend", "periodic", "bleeding", "every", "15", "days", ".", "Evolution", "After", "4", "months", "of", "treatment", ",", "serological", "cure", "of", "the", "Hepatitis", "C", "was", "observed", ",", "maintaining", "an", "undetectable", "viral", "load", "to", "date", ",", "as", "well", "as", "normalisation", "of", "the", "ferrokinetic", "profile", "and", "great", "improvement", "in", "the", "porphyria", "with", "practically", "complete", "resolution", "of", "the", "skin", "lesions", "and", "progressive", "reduction", "of", "the", "profirin", "levels", "in", "blood", "and", "urine", "." ]

[ 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 92, "end": 95 }, { "text": "HIV-1", "label": "SPECIES", "start": 92, "end": 97 }, { "text": "male", "label": "HUMAN", "start": 22, "end": 26 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 201, "end": 206 }, { "text": "chronic hepatitis C, genotype 4", "label": "SPECIES", "start": 246, "end": 277 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 839, "end": 846 }, { "text": "HCV", "label": "SPECIES", "start": 1614, "end": 1617 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 1675, "end": 1678 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 1634, "end": 1639 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 1697, "end": 1702 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2436, "end": 2443 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2525, "end": 2532 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 3032, "end": 3037 } ]

[ "Anamnesis", "and", "physical", "examination", "The", "patient", "is", "63", "years", "old", ",", "a", "taxi", "driver", "by", "profession", ",", "with", "a", "personal", "history", "of", "hypertension", ",", "hyperuricaemia", ",", "dyslipidaemia", "and", "non-insulin-dependent", "type", "II", "diabetes", "mellitus", ".", "He", "presented", "with", "more", "than", "a", "year", "'", "s", "history", "of", "lesions", "on", "his", "face", ",", "which", "he", "reported", "were", "very", "pruritic", ".", "In", "addition", ",", "her", "condition", "worsened", "with", "exposure", "to", "the", "sun", "and", "alcoholic", "beverages", ".", "He", "denied", "having", "introduced", "new", "treatments", ",", "having", "other", "family", "members", "affected", "by", "a", "similar", "dermatosis", ",", "living", "with", "children", "or", "animals", ",", "as", "well", "as", "travelling", "abroad", "in", "recent", "years", ".", "He", "had", "been", "treated", "at", "the", "primary", "care", "centre", "with", "various", "topicals", "whose", "name", "he", "could", "not", "remember", ",", "with", "occasional", "improvement", ",", "and", "for", "the", "last", "month", "with", "betamethasone", "dipropionate", "ointment", "first", ",", "and", "then", "with", "ketoconazole", "cream", ".", "However", ",", "the", "worsening", "of", "her", "symptoms", "became", "noticeable", "over", "the", "last", "few", "weeks", "and", "was", "unbearable", ",", "and", "she", "consulted", "the", "emergency", "department", ".", "The", "dermatological", "examination", "showed", "a", "profusion", "of", "infiltrated", "erythematous", "papules", ",", "in", "some", "areas", "with", "associated", "slight", "desquamation", ",", "scattered", "over", "both", "hemicaras", ",", "predominantly", "on", "the", "left", ".", "Some", "of", "the", "lesions", "had", "a", "subtle", "annular", "arrangement", "on", "the", "periphery", "of", "the", "face", ",", "and", "isolated", "intermingled", "vesicles", "could", "also", "be", "seen", ".", "Diagnosis", "and", "treatment", "Although", "the", "initial", "diagnostic", "impression", "was", "of", "possible", "rosacea", "or", "seborrhoeic", "dermatitis", ",", "due", "to", "the", "tendency", "of", "some", "of", "the", "lesions", "to", "be", "annular", ",", "although", "not", "very", "noticeable", ",", "the", "larval", "nature", "of", "the", "process", "and", "the", "lack", "of", "response", "to", "topical", "corticosteroid", "treatment", ",", "it", "was", "decided", "to", "take", "a", "scraping", "sample", "for", "direct", "examination", "with", "KOH", "and", "fungal", "culture", ".", "For", "the", "following", "two", "weeks", ",", "treatment", "with", "primecrolimus", "1", "%", "cream", "once", "daily", "was", "prescribed", ",", "with", "only", "partial", "improvement", "in", "symptoms", ".", "The", "fungal", "culture", "then", "showed", "the", "growth", "of", "Trichopyton", "Tonsurans", "species", ",", "and", "the", "final", "diagnosis", "of", "incognito", "tinea", "facialis", "or", "Tinea", "Faciei", "incognito", "was", "established", ".", "With", "the", "suspension", "of", "primecrolimus", "cream", "and", "an", "oral", "regimen", "of", "terbinafine", ",", "250", "mg", "per", "day", "for", "4", "weeks", ",", "all", "the", "skin", "lesions", "disappeared", ",", "as", "well", "as", "the", "associated", "pruritus", "and", "photosensitivity", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "animals", "label": "SPECIES", "start": 540, "end": 547 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 467, "end": 473 }, { "text": "children", "label": "HUMAN", "start": 528, "end": 536 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 39, "end": 46 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 100, "end": 108 }, { "text": "taxi driver", "label": "HUMAN", "start": 66, "end": 77 } ]

[ "Girl", ",", "4", "years", "old", ",", "referred", "for", "dermatitis", ".", "No", "history", "of", "allergies", ".", "Atopic", "dermatitis", ".", "At", "the", "age", "of", "2", "years", ",", "she", "began", "with", "episodes", "of", "micropapular", ",", "vesicular", ",", "exudative", "lesions", "that", "evolved", "with", "desquamation", "on", "the", "feet", ".", "Occasionally", "she", "presented", "with", "more", "extensive", "generalised", "outbreaks", "with", "facial", "involvement", ".", "She", "underwent", "treatment", "prescribed", "by", "dermatology", "with", "oral", "or", "topical", "corticosteroids", "with", "Diprogenta", "®", "and", "Elidel", "®", ",", "with", "improvement", "but", "a", "recurrence", "that", "has", "been", "persistent", "on", "the", "dorsum", "of", "the", "feet", "for", "some", "months", ".", "No", "usual", "respiratory", "symptoms", "were", "reported", ".", "Allergological", "study", ":", "Tests", "with", "foods", ":", "egg", ",", "peanut", ",", "lentil", ",", "kiwi", ",", "wheat", "flour", ":", "negative", ".", "Tests", "with", "aeroallergens", ":", "dpt", ",", "alternaria", ",", "cat", "dog", ",", "phleum", ",", "profilin", "and", "latex", ":", "negative", ".", "Patch", "tests", ":", "GEIDAC", "standard", "battery", "and", "shoe", "battery", ":", "positive", "at", "96", "hours", "with", "chromium", "and", "cobalt", "(", "+", "+", ")", "and", "neomycin", "sulphate", "and", "quaternium", "(", "+", ")", ".", "Conclusions", ":", "We", "present", "the", "case", "of", "a", "4-year-old", "girl", ",", "diagnosed", "with", "atopic", "dermatitis", ",", "with", "persistent", "symptoms", "of", "eczematous", "dermatitis", "on", "the", "dorsum", "of", "the", "feet", "." ]

[ 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Girl", "label": "HUMAN", "start": 0, "end": 4 }, { "text": "kiwi", "label": "SPECIES", "start": 645, "end": 649 }, { "text": "wheat", "label": "SPECIES", "start": 651, "end": 656 }, { "text": "peanut", "label": "SPECIES", "start": 629, "end": 635 }, { "text": "lentil", "label": "SPECIES", "start": 637, "end": 643 }, { "text": "alternaria", "label": "SPECIES", "start": 705, "end": 715 }, { "text": "cat", "label": "SPECIES", "start": 717, "end": 720 }, { "text": "dog", "label": "SPECIES", "start": 721, "end": 724 }, { "text": "phleum", "label": "SPECIES", "start": 726, "end": 732 }, { "text": "dpt", "label": "SPECIES", "start": 700, "end": 703 }, { "text": "girl", "label": "HUMAN", "start": 962, "end": 966 } ]

[ "44-year-old", "male", "with", "no", "known", "drug", "allergies", ".", "Ex-smoker", "for", "8", "years", ".", "His", "personal", "history", "included", "HIV", "infection", "stage", "C2", "with", "undetectable", "viral", "load", "since", "August", "2017", ",", "last", "CD4", "count", "in", "May", "2018", "of", "536", "cells", "/", "mm3", "(", "16", "%", ")", ",", "under", "follow-up", "by", "the", "Infectious", "Diseases", "Service", "of", "our", "hospital", ".", "His", "past", "history", "also", "included", "a", "cutaneous", "Kaposi", "'", "s", "sarcoma", "in", "remission", ",", "under", "follow-up", "by", "oncology", ",", "a", "normal", "functioning", "goitre", "and", "chronic", "gastritis", "due", "to", "Helicobacter", "pylori", "infection", "that", "was", "treated", "and", "cured", ".", "The", "only", "epidemiological", "history", "was", "that", "the", "patient", "lived", "with", "a", "cat", "at", "home", ".", "He", "was", "being", "treated", "with", "FTC", "/", "TAF", "/", "EVG", "/", "COBI", "1", "tablet", "per", "day", "and", "omeprazole", "20mg", "/", "day", ".", "The", "patient", "came", "to", "the", "emergency", "department", "with", "fever", "of", "39oC", ",", "with", "cough", "and", "rusty", "expectoration", ",", "putrid", "in", "appearance", ",", "of", "two", "weeks", "'", "evolution", ",", "without", "improvement", "after", "antibiotic", "treatment", "with", "amoxicillin", "/", "clavulanic", "acid", "500", "/", "125", "mg", "/", "8h", "for", "three", "days", ".", "On", "arrival", "at", "the", "ED", ",", "the", "patient", "was", "febrile", "(", "38", ".", "5oC", ")", ",", "hypotensive", "(", "93", "/", "58", "mmHg", ")", ",", "tachycardic", "(", "111", "spm", ")", ",", "with", "O2", "saturation", "of", "98", "%", "without", "oxygen", "intake", "and", "eupneic", "at", "rest", ".", "On", "inspection", ",", "he", "was", "in", "fair", "general", "condition", "and", "was", "not", "sweating", "profusely", ".", "Cardiorespiratory", "examination", "revealed", "sinus", "tachycardia", ",", "no", "audible", "murmurs", ",", "preserved", "vesicular", "murmur", "and", "no", "extra", "sounds", ".", "The", "abdomen", "was", "soft", ",", "depressible", ",", "not", "painful", "on", "deep", "palpation", ",", "without", "masses", "or", "megaliths", ",", "no", "signs", "of", "peritonism", "or", "peritoneal", "irritation", ".", "The", "lower", "limbs", "were", "not", "oedematous", "and", "there", "were", "no", "signs", "of", "deep", "vein", "thrombosis", ".", "Oropharyngeal", "examination", "was", "unremarkable", ".", "No", "skin", "lesions", ".", "Complementary", "tests", "performed", "in", "the", "ED", "showed", "a", "leukocytosis", "of", "20", ",", "840", "cells", "/", "μl", "at", "the", "expense", "of", "neutrophils", "(", "17", ",", "650", "cells", "/", "μl", ")", ",", "haemoglobin", "of", "11", ".", "6", "g", "/", "dl", ",", "with", "normal", "platelet", "count", "and", "coagulation", ".", "Biochemically", ",", "he", "had", "preserved", "renal", "function", "and", "a", "normal", "ionogram", ",", "with", "a", "C-reactive", "protein", "of", "294", "mg", "/", "L", ".", "Chest", "X-ray", "showed", "a", "large", "cavitary", "lesion", "in", "the", "left", "lower", "lobe", ",", "with", "thickened", "walls", "and", "spiculated", "borders", ",", "without", "costophrenic", "sinus", "impingement", "or", "other", "condensed", "images", ".", "Chest", "X-ray", "on", "admission", ":", "cavitated", "lesion", "in", "the", "left", "lower", "lobe", ".", "Blood", "cultures", ",", "sputum", "culture", ",", "Legionella", "spp", "and", "Streptococcus", "pneumoniae", "antigenuria", "in", "urine", "and", "urgent", "smear", "microscopy", "with", "Ziehl-Neelsen", "staining", "were", "negative", ".", "In", "view", "of", "the", "patient", "'", "s", "clinical", "condition", ",", "it", "was", "decided", "to", "admit", "him", "to", "the", "infectious", "diseases", "department", "with", "a", "diagnosis", "of", "lung", "abscess", "of", "possible", "bacterial", "aetiology", ",", "and", "treatment", "was", "started", "with", "amoxicillin", "/", "clavulanic", "acid", "2g", "/", "200mg", "IV", "every", "8", "hours", ".", "Differential", "diagnosis", "The", "diagnosis", "of", "lung", "abscess", "is", "mainly", "based", "on", "a", "detailed", "anamnesis", ",", "careful", "examination", "and", "obtaining", "compatible", "images", ",", "with", "radiological", "and", "microbiological", "studies", "being", "fundamental", "to", "reach", "a", "diagnosis", "of", "certainty", ".", "The", "most", "characteristic", "radiological", "image", "is", "usually", "a", "cavitated", "parenchymal", "infiltrate", ",", "usually", "with", "a", "hydro-aerial", "level", ",", "although", "multiple", "bilateral", "cavitated", "lesions", "may", "also", "appear", ",", "so", "it", "is", "necessary", "to", "make", "a", "differential", "diagnosis", "that", "includes", "the", "following", "entities", ":", "-", "Bacterial", "infections", ":", "in", "primary", "lung", "abscesses", "there", "is", "almost", "always", "a", "risk", "factor", "for", "aspiration", "of", "oral", "contents", "(", "periodontal", "disease", ",", "dental", "abscess", ",", "dental", "surgery", ",", "dental", "surgery", ",", "substance", "abuse", ",", "alcoholism", ",", "epilepsy", ",", "stroke", "with", "oropharyngeal", "dysfunction", ",", "sinusitis", ",", "general", "anaesthesia", ",", "dysphagia", ",", "tracheal", "/", "nasogastric", "tube", ",", "severe", "gastrointestinal", "reflux", "disease", "or", "cerebral", "palsy", ")", ".", "They", "are", "usually", "caused", "by", "anaerobic", "germs", "such", "as", "Prevotella", "spp", ",", "Bacteroides", "spp", ",", "Peptostreptococcus", "spp", ",", "Streptococcus", "milleri", ",", "or", "microaerophilic", "streptococci", ".", "Our", "patient", "did", "not", "present", "any", "risk", "factor", "that", "would", "lead", "us", "to", "think", "of", "a", "possible", "bronchoaspiration", ",", "so", "this", "aetiology", "was", "unlikely", ".", "In", "contrast", ",", "in", "secondary", "lung", "abscesses", ",", "there", "is", "usually", "an", "underlying", "immune", "compromise", ",", "as", "was", "the", "case", "in", "our", "patient", ".", "In", "this", "case", ",", "the", "aetiology", "differs", "from", "primary", "abscesses", "and", "may", "be", "caused", "by", ":", "Staphylococcus", "aureus", ",", "gram-negative", "bacilli", "(", "P", ".", "aeruginosa", ",", "other", "enterobacteria", ")", "or", "opportunistic", "pathogens", "such", "as", "Nocardia", "spp", ".", ",", "Legionella", "spp", ".", "or", "Rhodococcus", "equi", ".", "-", "Fungal", "infections", ":", "in", "immunocompromised", "patients", ",", "as", "is", "the", "case", "here", ",", "infections", "caused", "by", "opportunistic", "fungi", "such", "as", "Aspergillus", "spp", ".", "and", "Zygomycetes", "spp", ".", "must", "be", "taken", "into", "account", "in", "the", "differential", "diagnosis", ".", "-", "Embolic", "lesions", ":", "endocarditis", "over", "the", "tricuspid", "valve", "(", "often", "by", "Staphylococcus", "aureus", ")", "or", "in", "Lemièrre", "'", "s", "syndrome", ",", "where", "infection", "starts", "in", "the", "pharynx", ",", "almost", "always", "by", "Fusobacterium", "necrophorum", ",", "and", "then", "spreads", "to", "the", "neck", "and", "carotid", "sheath", "to", "cause", "septic", "thrombophlebitis", "and", "multiple", "pulmonary", "embolisms", ",", "are", "characteristic", ".", "In", "our", "case", "the", "patient", "had", "no", "audible", "murmurs", "or", "signs", "of", "oropharyngeal", "infection", "that", "would", "lead", "us", "to", "suspect", "embolic", "pathology", ".", "Furthermore", ",", "pulmonary", "septic", "emboli", "are", "usually", "small", "and", "multiple", ".", "-", "Pulmonary", "tuberculosis", ":", "always", "be", "aware", "of", "cavitary", "lesions", "in", "immunocompromised", "patients", ".", "Our", "patient", "had", "no", "epidemiological", "history", "and", "the", "urgently", "requested", "Ziehl-Neelsen", "test", "was", "negative", ",", "making", "this", "aetiology", "unlikely", ".", "Nevertheless", ",", "further", "sputum", "smears", "and", "mycobacterial", "cultures", "were", "requested", "and", "were", "negative", ".", "-", "Cavitated", "pulmonary", "neoplasm", ":", "sometimes", "we", "are", "faced", "with", "a", "pulmonary", "neoplasm", "that", "has", "become", "superinfected", "and", "can", "cause", "an", "image", "similar", "to", "the", "one", "presented", "by", "this", "patient", ".", "In", "addition", ",", "the", "edges", "of", "the", "lesion", "were", "thick", "and", "irregular", "and", "the", "patient", "had", "a", "history", "of", "having", "been", "a", "smoker", ".", "In", "our", "case", ",", "FNA", "of", "the", "lesion", "was", "performed", "and", "did", "not", "demonstrate", "the", "presence", "of", "malignant", "cells", ".", "-", "In", "patients", "with", "rheumatoid", "arthritis", "or", "granulomatosis", "with", "polyangiitis", ",", "we", "may", "find", "cavitated", "nodules", "that", "may", "lead", "us", "to", "think", "that", "we", "are", "dealing", "with", "a", "lung", "abscess", ",", "which", "is", "why", "it", "is", "important", "to", "take", "a", "detailed", "clinical", "history", "with", "all", "the", "patient", "'", "s", "medical", "history", ".", "Our", "patient", "had", "no", "systemic", "symptoms", "compatible", "with", "the", "aforementioned", "entities", ".", "Evolution", "During", "the", "first", "days", "of", "admission", "to", "the", "ward", ",", "the", "patient", "continued", "to", "be", "febrile", ",", "with", "a", "maximum", "temperature", "of", "39oC", ".", "The", "continuous", "foul-smelling", "and", "putrid", "expectoration", "was", "noteworthy", "despite", "empirical", "antibiotic", "therapy", ".", "Blood", "cultures", "performed", "in", "the", "ED", "were", "negative", ",", "as", "was", "the", "antigenuria", "for", "Legionella", "spp", "and", "S", ".", "pneumoniae", ",", "and", "the", "sputum", "culture", "showed", "abundant", "gram-negative", "bacilli", ".", "A", "chest", "computed", "tomography", "(", "CT", ")", "scan", "with", "contrast", "and", "a", "regular", "fibrobronchoscopy", "were", "requested", ".", "After", "6", "days", "of", "treatment", "with", "amoxicillin", "/", "clavulanic", "acid", "2g", "/", "200", "mg", "IV", "every", "8", "hours", ",", "Bordetella", "bronchiseptica", "was", "identified", "in", "the", "sputum", ".", "After", "a", "systematic", "review", "of", "the", "available", "literature", "and", "before", "knowing", "the", "sensitivity", ",", "treatment", "was", "started", "with", "levofloxacin", "(", "500", "mg", "/", "12", "h", "iv", ")", "and", "trimethoprim", "/", "sulfamethoxazole", "(", "800", "/", "160", "mg", "/", "8h", "iv", ")", ",", "as", "both", "had", "good", "intracellular", "activity", "and", "synergy", ".", "On", "the", "seventh", "antibiogram", "was", "available", "showing", "resistance", "to", "ampicillin", ",", "cefuroxime", ",", "cefotaxime", ",", "cefepime", "and", "aztreoman", ".", "The", "patient", "remained", "completely", "afebrile", "from", "the", "start", "of", "combination", "therapy", ",", "with", "a", "progressive", "decrease", "in", "expectoration", ".", "Chest", "CT", "scan", "showed", "a", "cavitated", "lesion", "in", "the", "postero-superior", "location", "of", "the", "left", "lower", "lobe", "measuring", "8", "cm", "dc", "x", "6", "cm", "ap", "x", "8", "cm", "transverse", "with", "a", "scarce", "hydroaerial", "level", "and", "relatively", "thick", "walls", "surrounded", "by", "an", "area", "of", "alveolar", "consolidation", "extending", "caudally", "towards", "postero-basal", "segments", ",", "where", "thickening", "of", "the", "septa", "and", "bronchial", "walls", "could", "also", "be", "seen", ".", "In", "the", "lingula", "there", "was", "another", "small", "focus", "of", "consolidation", "in", "the", "peribronchial", "area", ",", "the", "findings", "being", "compatible", "with", "the", "clinical", "diagnosis", "of", "lung", "abscess", "with", "a", "small", "satellite", "inflammatory", "focus", ".", "Chest", "CT", "scan", "with", "intravenous", "contrast", ":", "cavitated", "lesion", "in", "the", "left", "lower", "lobe", "with", "thick", "walls", "and", "minimal", "hydro-aerial", "level", ".", "Chest", "CT", "scan", "with", "intravenous", "contrast", "(", "coronal", "section", ")", ":", "large", "cavitated", "lesion", "in", "left", "lower", "lobe", "with", "associated", "alveolar", "consolidation", "extending", "caudally", ".", "Fibrobronchoscopy", "was", "normal", ",", "and", "samples", "were", "sent", "to", "microbiology", "and", "pathology", "where", "no", "neoplastic", "cells", "were", "found", "and", "the", "culture", "of", "the", "samples", "was", "negative", ".", "Following", "the", "CT", "findings", ",", "CT-guided", "percutaneous", "drainage", "was", "requested", ",", "obtaining", "scant", "purulent", "material", "in", "which", "Streptococcus", "constellatus", ",", "resistant", "only", "to", "erythromycin", ",", "was", "identified", ",", "Therefore", ",", "after", "thirteen", "days", "of", "intravenous", "treatment", "with", "levofloxacin", "plus", "trimethoprim", "/", "sulfamethoxazole", ",", "treatment", "was", "simplified", "to", "levofloxacin", "750mg", "orally", ",", "and", "the", "patient", "remained", "afebrile", "and", "presented", "normal", "acute", "phase", "reactants", "at", "discharge", "three", "days", "after", "starting", "oral", "treatment", ".", "Treatment", "with", "levofloxacin", "was", "maintained", "until", "he", "was", "reviewed", "2", "weeks", "later", "in", "the", "outpatient", "infectious", "diseases", "department", ".", "At", "this", "time", "he", "showed", "a", "clear", "radiological", "improvement", "(", "control", "chest", "X-ray", "at", "the", "end", "of", "treatment", ")", "and", "was", "completely", "asymptomatic", ",", "so", "treatment", "was", "discontinued", ".", "The", "total", "duration", "of", "treatment", "was", "36", "days", ".", "Final", "diagnosis", "Lung", "abscess", "due", "to", "Bordetella", "bronchiseptica", "and", "Streptococcus", "constellatus", "in", "a", "patient", "with", "HIV", "C2", "infection", "." ]

[ 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 100, "end": 103 }, { "text": "male", "label": "HUMAN", "start": 12, "end": 16 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 74, "end": 82 }, { "text": "smear microscopy", "label": "SPECIES", "start": 2266, "end": 2282 }, { "text": "bacterial", "label": "SPECIES", "start": 2482, "end": 2491 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2341, "end": 2348 }, { "text": "Legionella spp", "label": "SPECIES", "start": 4150, "end": 4164 }, { "text": "Nocardia spp", "label": "SPECIES", "start": 4135, "end": 4147 }, { "text": "Peptostreptococcus spp", "label": "SPECIES", "start": 3595, "end": 3617 }, { "text": "Prevotella spp", "label": "SPECIES", "start": 3562, "end": 3576 }, { "text": "Staphylococcus aureus", "label": "SPECIES", "start": 4017, "end": 4038 }, { "text": "Streptococcus milleri", "label": "SPECIES", "start": 3619, "end": 3640 }, { "text": "gram-negative bacilli", "label": "SPECIES", "start": 4040, "end": 4061 }, { "text": "Bacterial", "label": "SPECIES", "start": 3117, "end": 3126 }, { "text": "enterobacteria", "label": "SPECIES", "start": 4084, "end": 4098 }, { "text": "Bordetella bronchiseptica", "label": "SPECIES", "start": 9082, "end": 9107 }, { "text": "Streptococcus constellatus", "label": "SPECIES", "start": 9112, "end": 9138 } ]

[ "A", "53-year-old", "man", "was", "admitted", "with", "sepsis", "without", "a", "clear", "focus", ".", "The", "patient", "had", "a", "personal", "history", "of", "chronic", "osteomyelitis", "of", "the", "calcaneus", "secondary", "to", "an", "ulcer", "of", "8", "years", "of", "evolution", "due", "to", "neuropathy", "of", "the", "left", "sciatic", "nerve", "in", "the", "middle", "third", "of", "the", "thigh", "caused", "by", "a", "bull", "horn", "injury", "in", "1993", ",", "leaving", "a", "club", "foot", "as", "a", "sequel", ".", "Followed", "by", "Traumatology", "during", "these", "years", "the", "patient", "has", "presented", "multiple", "admissions", "for", "worsening", "of", "ulcer", "in", "the", "heel", "as", "well", "as", "multiple", "microbiological", "isolations", "of", "multiresistant", "microorganisms", "requiring", "intravenous", "antibiotherapy", "and", "multiple", "surgical", "debridements", ".", "During", "a", "trip", "to", "Brazil", ",", "the", "patient", "was", "admitted", "for", "acute", "coronary", "syndrome", "with", "conventional", "stent", "placement", "in", "the", "anterior", "descending", "artery", "and", "during", "this", "admission", "he", "presented", "with", "septic", "shock", "of", "probable", "respiratory", "origin", ",", "requiring", "admission", "to", "the", "intensive", "care", "unit", "and", "orotracheal", "intubation", ".", "After", "several", "months", "in", "hospital", ",", "the", "patient", "returned", "to", "Spain", ",", "where", "he", "was", "admitted", "with", "symptoms", "compatible", "with", "sepsis", "without", "a", "clear", "focus", ".", "Complementary", "examinations", "revealed", "pulmonary", "condensation", "in", "the", "right", "base", "and", "physical", "examination", "revealed", "scattered", "rhonchi", ",", "oedema", "and", "erythema", "in", "the", "forefoot", "area", "with", "a", "known", "ulcer", "that", "was", "closing", "by", "second", "intention", ".", "Fluid", "therapy", "and", "empirical", "antibiotic", "therapy", "with", "ceftriaxone", "and", "levofloxacin", "was", "started", ",", "with", "improvement", "in", "BP", "and", "diuresis", ".", "During", "his", "admission", ",", "an", "MRI", "of", "the", "ankle", "was", "requested", ",", "showing", "the", "presence", "of", "abscesses", "and", "bone", "infarcts", "with", "a", "significant", "increase", "in", "inflammatory", "activity", "compared", "to", "the", "previous", "scan", "in", "November", "2015", ",", "and", "Staphylococcus", "aureus", "methicillin-resistant", "Staphylococcus", "aureus", "was", "isolated", "in", "a", "culture", "of", "the", "heel", "ulcer", ".", "A", "few", "days", "after", "admission", ",", "the", "patient", "began", "to", "experience", "dorsal-lumbar", "pain", "that", "prevented", "him", "from", "resting", "and", "new", "febrile", "peaks", ".", "On", "physical", "examination", ",", "he", "had", "pain", "on", "percussion", "in", "the", "spinous", "process", "at", "the", "level", "of", "D11", ",", "so", "a", "dorsal", "spine", "X-ray", "was", "requested", "with", "loss", "of", "vertebral", "height", "of", "the", "soma", "of", "D11", "with", "marked", "vertebral", "wedging", ".", "Treatment", "was", "started", "with", "vancomycin", "and", "rifampicin", ".", "For", "all", "these", "reasons", ",", "a", "thoracic", "CT", "scan", "and", "MRI", "of", "the", "spine", "were", "requested", ",", "which", "showed", "subacute", "spondylodiscitis", "D10", "-", "11", "subacute", "spondylodiscitis", "in", "evolution", "possibly", "secondary", "to", "haematogenous", "dissemination", "secondary", "to", "the", "focus", "of", "osteomyelitis", "Despite", "correct", "antibiotic", "therapy", ",", "the", "patient", "presented", "new", "feverish", "peaks", "and", "local", "worsening", "in", "the", "left", "ankle", ",", "so", "the", "case", "was", "discussed", "with", "the", "Traumatology", "Department", "and", "it", "was", "decided", ",", "given", "the", "poor", "evolution", "of", "the", "osteomyelitis", "of", "the", "ankle", "and", "the", "presence", "of", "complications", ",", "to", "perform", "an", "amputation", "which", "was", "successfully", "carried", "out", "and", "to", "continue", "antibiotic", "treatment", ",", "with", "progressive", "improvement", "of", "dorsal", "pain", ",", "defervescence", "and", "reduction", "of", "acute", "phase", "reactants", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 70, "end": 77 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 385, "end": 392 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 84, "end": 92 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 644, "end": 651 } ]

[ "50-year-old", "appendectomised", "woman", "with", "hypercholesterolemia", ",", "with", "no", "other", "history", "of", "interest", ",", "in", "close", "contact", "with", "dogs", "and", "cats", "at", "home", ".", "She", "was", "admitted", "in", "March", "2019", "with", "a", "severe", "cough", "without", "expectoration", ",", "febrile", "fever", "and", "mechanical", "rib", "pain", "of", "1", "week", "'", "s", "evolution", ".", "Physical", "examination", "and", "chest", "X-ray", "were", "unremarkable", ";", "blood", "tests", "showed", "eosinophilia", ">", "50", "%", "with", "a", "total", "count", "of", "14", ",", "000", "/", "μL", "and", "IgE", ">", "5000", "kUA", "/", "L", "(", "0-120", ")", ".", "Immunophenotyping", "and", "peripheral", "blood", "morphology", "ruled", "out", "malignancy", ".", "After", "a", "course", "of", "antibiotics", ",", "it", "was", "decided", "to", "discharge", "the", "patient", "and", "follow-up", "visits", "were", "made", "after", "disappearance", "of", "febrile", "fever", "and", "partial", "improvement", "of", "cough", ",", "with", "persistent", "costal", "pain", "which", ",", "due", "to", "its", "characteristics", ",", "was", "attributed", "to", "the", "cough", ".", "The", "study", "was", "extended", "with", "serologies", ",", "all", "of", "which", "were", "negative", "except", "for", "Toxocara", "canis", "IgG", "positive", ",", "and", "a", "CT", "scan", "was", "performed", "with", "the", "finding", "of", "multiple", "bilateral", "millimetric", "pulmonary", "opacities", ",", "some", "with", "a", "ground-glass", "halo", "suggestive", "of", "an", "atypical", "infectious", "process", ",", "probably", "parasitic", ".", "Given", "this", "picture", "of", "eosinophilia", ",", "respiratory", "symptoms", ",", "epidemiology", ",", "serology", "and", "compatible", "imaging", "tests", ",", "a", "diagnosis", "of", "Toxocara", "canis", "infestation", "was", "made", ".", "Ophthalmology", "was", "requested", "and", "ruled", "out", "ocular", "toxocariasis", "and", "specific", "treatment", "was", "started", "with", "albendazole", "400mg", "every", "12h", "for", "5", "days", "and", "30mg", "of", "prednisone", "for", "5", "days", ".", "One", "month", "after", "the", "end", "of", "treatment", ",", "the", "residual", "cough", "disappeared", ",", "in", "addition", "to", "a", "reduction", "of", "eosinophilia", "values", "by", "half", "and", "IgE", "in", "peripheral", "blood", ".", "With", "this", ",", "deworming", "of", "domestic", "animals", "was", "recommended", ".", "Toxocariasis", "is", "a", "rare", "infection", "in", "our", "environment", ",", "caused", "by", "the", "ingestion", "of", "eggs", "of", "the", "nematode", "Toxocara", "canis", "or", "Toxocara", "cati", "that", "usually", "infects", "dogs", "and", "cats", "." ]

[ 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 3, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0 ]

[ { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 28, "end": 33 }, { "text": "cats", "label": "SPECIES", "start": 127, "end": 131 }, { "text": "dogs", "label": "SPECIES", "start": 118, "end": 122 }, { "text": "Toxocara canis", "label": "SPECIES", "start": 844, "end": 858 }, { "text": "parasitic", "label": "SPECIES", "start": 1058, "end": 1067 }, { "text": "Toxocara canis", "label": "SPECIES", "start": 1195, "end": 1209 }, { "text": "animals", "label": "SPECIES", "start": 1598, "end": 1605 }, { "text": "deworming", "label": "SPECIES", "start": 1576, "end": 1585 }, { "text": "Toxocara canis", "label": "SPECIES", "start": 1724, "end": 1738 }, { "text": "cats", "label": "SPECIES", "start": 1786, "end": 1790 }, { "text": "eggs of the nematode Toxocara canis", "label": "SPECIES", "start": 1703, "end": 1738 }, { "text": "dogs", "label": "SPECIES", "start": 1777, "end": 1781 }, { "text": "eggs of the nematode Toxocara canis or Toxocara cati", "label": "SPECIES", "start": 1703, "end": 1755 } ]

[ "Loxoscelism", "is", "the", "clinical", "picture", "secondary", "to", "the", "bite", "of", "a", "spider", "of", "the", "genus", "Loxosceles", "laeta", ",", "which", "has", "a", "form", "limited", "to", "the", "skin", "and", "another", "systemic", "form", "(", "visceral", "cutaneous", "loxoscelism", ")", ",", "characterised", "by", "haemolytic", "anaemia", ",", "haematuria", ",", "jaundice", ",", "fever", ",", "compromised", "consciousness", "and", "acute", "renal", "failure", ",", "with", "a", "mortality", "rate", "of", "around", "20", "%", ".", "Necrotic", "cutaneous", "loxoscelism", "presents", "with", "a", "livedoid", "plaque", "within", "the", "first", "24", "h", ",", "resulting", "from", "vasculitis", "secondary", "to", "the", "bite", "and", "venom", "inoculation", ".", "It", "is", "a", "painful", "violaceous", "plaque", ",", "surrounded", "by", "an", "erythematous", "halo", ".", "It", "progresses", "to", "the", "formation", "of", "a", "necrotic", "eschar", ",", "which", "peels", "off", "and", "leaves", "a", "slowly", "healing", "ulcer", ".", "Treatment", "consists", "of", "local", "icing", ",", "elevation", "of", "the", "limb", ",", "systemic", "corticosteroids", ",", "analgesia", "and", "antihistamines", ".", "Anti-loxosceles", "serum", "may", "be", "used", "and", "should", "be", "administered", "within", "4", "hours", "of", "the", "bite", ".", "Diagnosis", "Necrotic", "cutaneous", "loxoscelism" ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "spider", "label": "SPECIES", "start": 63, "end": 69 }, { "text": "genus Loxosceles", "label": "SPECIES", "start": 77, "end": 93 }, { "text": "Loxosceles laeta", "label": "SPECIES", "start": 83, "end": 99 }, { "text": "Loxosceles", "label": "SPECIES", "start": 83, "end": 93 }, { "text": "loxosceles", "label": "SPECIES", "start": 803, "end": 813 } ]

[ "A", "17-year-old", "woman", "from", "the", "town", "of", "Pozo", "Azul", "(", "San", "Pedro", ")", ",", "who", "suffered", "the", "accident", "in", "May", "2014", "when", "she", "was", "picking", "mandarins", ".", "Approximately", "24", "hours", "after", "the", "accident", ",", "she", "arrived", "at", "the", "hospital", "lucid", ",", "reporting", "pain", "and", "burning", "at", "the", "site", "of", "injury", "(", "stinging", "dermatitis", ")", "and", "arthralgia", "in", "the", "lower", "limbs", ".", "Physical", "examination", "revealed", "the", "presence", "of", "oedema", "in", "the", "region", "of", "the", "left", "knee", ",", "which", "was", "later", "confirmed", "with", "an", "ultrasound", "scan", "that", "suggested", "haemarthrosis", ".", "Laboratory", "examination", "showed", "AP", "20", "%", "and", "KPTT", ">", "180", "seconds", ".", "Complementary", "laboratory", "tests", "showed", ":", "red", "blood", "cells", "4", "050", "000", "/", "mm3", ";", "leukocytes", "12", "500", "/", "mm3", ";", "platelets", "256", "000", "/", "mm3", ";", "haematocrit", "34", "%", ";", "haemoglobin", "11", ".", "3", "g", "/", "dl", ".", "Microscopic", "examination", "of", "the", "urinary", "sediment", "revealed", "the", "presence", "of", "abundant", "red", "blood", "cells", "per", "field", "(", "haematuria", ")", ".", "At", "the", "Laboratory", "of", "Entomology", "and", "Taxonomy", "of", "the", "INMeT", "(", "Argentina", ")", ",", "the", "specimens", "of", "the", "causative", "animal", "brought", "by", "the", "patient", "at", "the", "time", "of", "consultation", "were", "identified", "as", "larvae", "of", "L", ".", "obliqua", ",", "and", "a", "diagnosis", "of", "Lonomia", "erucism", "was", "made", ".", "The", "patient", "was", "admitted", "to", "the", "Intensive", "Care", "Unit", "(", "ICU", ")", "and", "received", "specific", "treatment", "a", "few", "hours", "after", "admission", ".", "She", "was", "treated", "with", "supportive", "measures", ",", "receiving", "regular", "corticosteroids", "(", "hydrocortisone", ")", ",", "antibiotics", "(", "ceftriaxone", ")", ",", "antihistamines", "(", "diphenhydramine", ")", ",", "anti-inflammatory", "drugs", "(", "ibuprofen", ",", "ketorolac", ")", "and", "vitamin", "K", ".", "The", "day", "after", "admission", ",", "the", "following", "laboratory", "results", "were", "obtained", ":", "red", "blood", "cells", "3", "330", "000", "/", "mm3", ";", "leukocytes", "17", "100", "/", "mm3", ";", "platelets", "208", "000", "/", "mm3", ";", "haematocrit", "30", "%", ";", "haemoglobin", "9", ".", "6", "g", "/", "dl", ";", "AP", "60", "%", "and", "KPTT", "30", "seconds", ".", "Ultrasound", "scanning", "of", "the", "left", "knee", "showed", "moderate", "/", "abundant", "fluid", "at", "the", "level", "of", "the", "joint", "associated", "with", "haemarthrosis", ".", "The", "patient", "remained", "in", "hospital", "for", "5", "days", ",", "during", "which", "time", "clinical", "and", "laboratory", "parameters", "normalised", "." ]

[ 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 14, "end": 19 }, { "text": "animal", "label": "SPECIES", "start": 920, "end": 926 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 942, "end": 949 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1068, "end": 1075 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1746, "end": 1753 }, { "text": "mandarins", "label": "SPECIES", "start": 119, "end": 128 }, { "text": "Entomology", "label": "SPECIES", "start": 839, "end": 849 }, { "text": "Lonomia", "label": "SPECIES", "start": 1038, "end": 1045 } ]

[ "26-year-old", "female", "patient", "with", "a", "9-day", "febrile", "illness", "associated", "with", "fever", ",", "pleuritic", "pain", ",", "cough", "with", "mucoid", "expectoration", "and", "pruritic", "erythematous", "vesicles", ".", "Hospitalised", "one", "week", "prior", "to", "admission", "for", "ectopic", "pregnancy", "(", "managed", "with", "3", "doses", "of", "methotrexate", ")", ".", "Chest", "X-ray", ".", "Anteroposterior", "projection", ".", "Nodular", ",", "ill-defined", "opacities", "with", "multilobar", "distribution", ".", "Symmetrical", "bilateral", "basal", "opacities", "difficult", "to", "assess", "due", "to", "interposition", "of", "the", "sinuses", ".", "High", "resolution", "computed", "tomography", "of", "the", "thorax", ".", "Axial", "section", "and", "coronal", "reconstruction", ".", "Multilobar", "parenchymal", "nodules", ",", "bilateral", ",", "with", "soft", "tissue", "density", ",", "irregular", "borders", "and", "perilesional", "ground-glass", "halo", ".", "Nodules", "and", "patchy", "areas", "of", "ground-glass", ".", "Chest", "CT", "scan", ".", "Nodules", "with", "soft", "tissue", "densities", "and", "ground-glass", ",", "irregular", "borders", ".", "Nodular", "lesions", "on", "the", "skin", "of", "the", "sinuses", "correlating", "with", "the", "physical", "examination", "finding", "of", "erythematous", "vesicles", ".", "Differential", "diagnosis", ":", "Varicella", "pneumonia", "Herpes", "simplex", "pneumonia", "CMV", "pneumonia", "Invasive", "pulmonary", "aspergillosis", "Histoplasmosis", "C", ".", "albicans", "pneumonia", "Tuberculosis", "Haemorrhagic", "metastases", "Granulomatosis", "with", "polyangiitis", "Microscopic", "polyangiitis", "Other", "positive", "findings", ":", "Blood", "picture", "with", "leukocytosis", ",", "neutrophilia", "and", "thrombocytopenia", ".", "Urine", "sediment", "without", "alterations", "Elevated", "transaminases", "Sputum", "smear", "microscopy", "(", "-", ")", "Direct", "examination", "and", "fungal", "cultures", "(", "-", ")", "Diagnosis", "Varicella-Zoster", "pneumonia" ]

[ 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0 ]

[ { "text": "female patient", "label": "HUMAN", "start": 12, "end": 26 }, { "text": "Herpes simplex", "label": "SPECIES", "start": 976, "end": 990 }, { "text": "CMV", "label": "SPECIES", "start": 1001, "end": 1004 }, { "text": "C. albicans", "label": "SPECIES", "start": 1063, "end": 1074 }, { "text": "smear microscopy", "label": "SPECIES", "start": 1339, "end": 1355 }, { "text": "Varicella-Zoster", "label": "SPECIES", "start": 1414, "end": 1430 } ]

[ "Personal", "history", "A", "43-year-old", "Spanish", "man", "with", "a", "history", "of", "surgery", "for", "right", "spontaneous", "pneumothorax", "and", "chronic", "hepatitis", "C", "cured", "with", "interferon", ".", "He", "reported", "multiple", "intercontinental", "trips", ",", "with", "no", "apparent", "health", "problems", ":", "Morocco", ",", "Turkey", "(", "2005", ")", ",", "Patagonia", "(", "2005", ")", ",", "Gambia", "(", "2006", ",", "vaccinated", "against", "yellow", "fever", ",", "without", "antimalarial", "prophylaxis", ")", "and", "two", "recent", "trips", "to", "Mali", ",", "one", "in", "November", "2006", "(", "vaccinated", "against", "hepatitis", "A", ",", "typhoid", "fever", ",", "tetanus-diphtheria", "and", "cholera", "and", "prophylaxis", "with", "atavacuone-proguanil", ")", "and", "the", "last", "one", "in", "September", "2007", "(", "itinerary", "Bamako", "-", "Niger", "River", "-", "Toubouctou", "-", "Dogon", "Country", ")", ".", "Here", "he", "took", "the", "correct", "antimalarial", "prophylaxis", "with", "doxycycline", ",", "but", "confessed", "to", "drinking", "untreated", "water", "and", "bathing", "in", "the", "Niger", "River", "and", "at", "the", "waterfalls", "in", "the", "Dogon", "Country", "in", "the", "middle", "of", "the", "trip", ".", "Present", "illness", "The", "patient", "presented", "with", "intermittent", "high", "fever", "(", "up", "to", "39oC", ")", "of", "twelve", "days", "'", "evolution", "without", "focal", "symptoms", ",", "starting", "in", "the", "last", "days", "of", "the", "trip", "and", "accompanied", "by", "chills", ",", "shivering", ",", "arthromylagia", "and", "headache", ",", "with", "significant", "sweating", "after", "antipyretics", ".", "Her", "partner", "had", "started", "with", "similar", "symptoms", "48", "hours", "earlier", ",", "of", "lesser", "intensity", ",", "and", "both", "continued", "with", "chemoprophylaxis", "with", "doxycycline", ",", "with", "apparent", "good", "tolerance", ".", "On", "questioning", ",", "they", "reported", "having", "presented", "generalised", "pruritus", "lasting", "several", "hours", "after", "bathing", "in", "the", "Dogon", "Country", "waterfalls", ",", "without", "skin", "lesions", "and", "self-limited", ".", "Physical", "examination", "The", "patient", "was", "afebrile", ",", "with", "a", "blood", "pressure", "of", "110", "/", "70", "mmHg", ",", "weight", "68", "kg", "(", "usual", ")", ",", "right", "thoracotomy", "scar", "and", "no", "skin", "lesions", ",", "hepatosplenomegaly", "or", "other", "relevant", "findings", ".", "Complementary", "examinations", "The", "haemogram", "showed", "7", ",", "200", "leukocytes", "/", "μL", "(", "600", "eosinophils", ",", "8", "%", ")", ";", "haemoglobin", "14", ".", "4", "g", "/", "dL", ";", "179", ",", "000", "platelets", "and", "the", "coagulation", "study", "was", "normal", ".", "Biochemistry", "showed", "GPT", "48", "IU", "/", "L", ",", "GOT", "24", "IU", "/", "L", ",", "alkaline", "phosphatase", "153", "IU", "/", "L", "and", "total", "bilirubin", "0", ".", "3", "mg", "/", "dL", ".", "All", "other", "parameters", "(", "glycaemia", ",", "renal", "function", ",", "ions", ",", "proteinogram", "and", "urine", "elemental", ")", "were", "normal", ".", "The", "chest", "X-ray", "showed", "no", "abnormalities", ".", "The", "study", "of", "parasites", "in", "peripheral", "blood", "(", "on", "two", "occasions", ",", "with", "febrile", "peak", ")", "was", "negative", ",", "as", "were", "serial", "blood", "cultures", ",", "Rose", "Bengal", ",", "urine", "culture", "and", "stool", "culture", ".", "The", "stool", "parasite", "study", "(", "three", "samples", "on", "alternate", "days", ")", "showed", "only", "non-pathogenic", "amoeba", "cysts", ".", "Urine", "parasite", "analysis", "(", "three", "samples", "every", "other", "day", ")", "was", "also", "negative", ".", "Initial", "evolution", "Given", "the", "negative", "results", "of", "the", "initial", "studies", ",", "a", "wait-and-see", "attitude", "was", "adopted", ",", "recommending", "only", "antipyretic", "treatment", "(", "paracetamol", ")", "and", "serological", "studies", "were", "requested", "(", "dengue", "virus", ",", "Rickettsia", "spp", ".", ",", "Coxiella", ",", "Brucella", ",", "Strongyloides", ",", "Toxocara", ",", "Schistosoma", ",", "Fasciola", ",", "chikungunya", "virus", "and", "amoebae", ")", ".", "Seventeen", "days", "after", "returning", "from", "the", "trip", ",", "and", "seven", "days", "after", "the", "first", "consultation", ",", "the", "patient", "consulted", "again", "due", "to", "the", "appearance", "of", "generalised", "urticaria", "in", "the", "last", "24", "hours", "and", "persistent", "fever", ".", "On", "examination", ",", "he", "was", "afebrile", "and", "haemodynamically", "stable", ",", "with", "generalised", "urticarial", "lesions", "predominantly", "on", "the", "back", ",", "buttocks", "and", "flanks", ",", "with", "no", "mucosal", "involvement", ",", "evidence", "of", "bronchospasm", ",", "regional", "adenopathy", "or", "hepatosplenomegaly", ".", "An", "urgent", "blood", "test", "was", "performed", "at", "this", "time", ",", "showing", "700", "eosinophils", "/", "μL", "(", "12", ".", "2", "%", ")", ",", "IgE", "24", ".", "7", "IU", "/", "mL", "(", "normal", "values", "<", "100", "IU", "/", "mL", ")", ",", "GPT", "42", "IU", "/", "L", ",", "CRP", "36", "mg", "/", "L", "and", "ESR", "12", "mm", "/", "h", ".", "Diagnostic", "test", "Serology", "against", "Schistosoma", "spp", ".", "positive", ".", "Clinical", "judgement", "Acute", "schistosomiasis", "(", "Katayama", "syndrome", ")", ".", "Evolution", "With", "suspicion", "of", "acute", "schistosomiasis", "(", "Katayama", "syndrome", "or", "fever", ")", ",", "treatment", "was", "started", "with", "praziquantel", "(", "20", "mg", "/", "kg", "/", "8", "hours", "oral", ")", "for", "72", "hours", ",", "associated", "with", "antihistamines", ",", "with", "good", "tolerance", "and", "disappearance", "of", "symptoms", "and", "an", "initial", "increase", "and", "subsequent", "normalisation", "of", "the", "eosinophil", "count", ":", "4", ",", "000", "eosinophils", "/", "μL", "(", "42", ".", "6", "%", ")", ";", "700", "eosinophils", "/", "μL", "(", "9", ".", "6", "%", ")", ";", "and", "finally", "400", "eosinophils", "/", "μL", "(", "4", ".", "7", "%", ")", ".", "The", "first", "serology", "sample", "for", "Schistosoma", "spp", ".", "extracted", "during", "the", "acute", "phase", "and", "performed", "at", "the", "National", "Microbiology", "Centre", "in", "Majadahonda", "was", "negative", ",", "and", "a", "new", "sample", "sent", "three", "months", "later", "was", "positive", ".", "The", "rest", "of", "the", "serological", "studies", "were", "negative", ".", "One", "year", "later", ",", "the", "patient", "is", "asymptomatic", ",", "without", "peripheral", "eosinophilia", "and", "with", "negative", "serial", "studies", "(", "at", "three", ",", "six", "and", "twelve", "months", ")", "for", "parasites", "in", "faeces", "and", "urine", ".", "His", "travel", "partner", ",", "who", "had", "accompanied", "him", "on", "the", "trip", "to", "Gambia", "in", "2006", "and", "on", "the", "second", "trip", "to", "Mali", "(", "September", "2007", ")", ",", "presented", "10-15", "days", "after", "returning", "from", "the", "trip", "with", "a", "similar", "picture", ",", "with", "self-limited", "fever", "without", "urticaria", ",", "with", "mild", "eosinophilia", "(", "600", "eosinophils", "/", "μL", ",", "11", ".", "3", "%", ")", "and", "negative", "first", "serology", "for", "schistosomiasis", ".", "In", "April", "2008", ",", "six", "months", "after", "his", "return", ",", "a", "complete", "colonoscopy", "was", "performed", "up", "to", "the", "terminal", "ileum", "due", "to", "the", "appearance", "of", "rectorrhagia", "and", "an", "increase", "in", "his", "usual", "constipation", ".", "Macroscopically", ",", "multiple", "discontinuous", "raised", "lesions", "of", "the", "mucosa", "were", "observed", "in", "the", "rectum", "and", "distal", "sigma", "(", "up", "to", "30", "centimetres", "from", "the", "anal", "margin", ")", ",", "very", "friable", "to", "the", "touch", "and", "less", "than", "2", "centimetres", "in", "diameter", ",", "alternating", "with", "depressed", "and", "ulcerated", "areas", ".", "Biopsies", "showed", "ulceration", "of", "the", "mucosa", "due", "to", "a", "granulomatous", "foreign", "body", "reaction", "by", "Schistosoma", "spp", ".", "eggs", "in", "the", "lamina", "propria", "and", "epithelium", ".", "At", "this", "time", "the", "patient", "had", "mild", "eosinophilia", "(", "400", "eosinophils", "/", "μL", ",", "7", "%", ")", ",", "mild", "iron", "deficiency", "anaemia", "(", "haemoglobin", "10", ".", "6", "g", "/", "dL", ",", "ferritin", "8", "μg", "/", "L", ")", "and", "a", "pathological", "urine", "sediment", "(", "microhaematuria", "and", "leucocyturia", ")", ".", "Parasitological", "examination", "of", "both", "urine", "and", "faeces", "detected", "Schistosoma", "haematobium", "eggs", "(", "more", "abundant", "in", "urine", ")", ",", "with", "a", "positive", "miracidium", "viability", "test", ".", "Serology", "for", "Schistosoma", "was", "also", "positive", ".", "With", "the", "diagnosis", "of", "intestinal", "and", "urinary", "schistosomiasis", ",", "he", "was", "prescribed", "treatment", "with", "praziquantel", "(", "a", "single", "dose", "of", "60", "mg", "/", "kg", "divided", "into", "two", "doses", ")", ",", "with", "subsequent", "disappearance", "of", "the", "eosinophilia", "(", "200", "/", "μL", ",", "3", ".", "4", "%", ")", ",", "negativisation", "of", "egg", "excretion", "in", "faeces", "and", "urine", ",", "and", "remission", "of", "the", "inflammatory", "lesions", "of", "the", "distal", "intestinal", "mucosa", "in", "a", "new", "colonoscopy", "performed", "three", "months", "later", ".", "For", "our", "patient", "with", "Katayama", "syndrome", ",", "and", "given", "the", "doubts", "about", "the", "activity", "of", "praziquantel", "against", "non-adult", "forms", "of", "the", "parasite", ",", "the", "patient", "received", "a", "new", "course", "of", "treatment", "with", "a", "single", "dose", "of", "60", "mg", "/", "kg", "(", "divided", "in", "two", "doses", ")", "six", "months", "after", "the", "initial", "acute", "schistosomiasis", "." ]

[ 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Personal", "label": "HUMAN", "start": 0, "end": 8 }, { "text": "vaccinated", "label": "SPECIES", "start": 286, "end": 296 }, { "text": "vaccinated", "label": "SPECIES", "start": 405, "end": 415 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 856, "end": 863 }, { "text": "partner", "label": "HUMAN", "start": 1120, "end": 1127 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1492, "end": 1499 }, { "text": "parasites", "label": "SPECIES", "start": 2099, "end": 2108 }, { "text": "Brucella", "label": "SPECIES", "start": 2675, "end": 2683 }, { "text": "Coxiella", "label": "SPECIES", "start": 2665, "end": 2673 }, { "text": "Fasciola", "label": "SPECIES", "start": 2723, "end": 2731 } ]

[ "FTRJ", ",", "12", "years", "old", ",", "female", ",", "from", "the", "community", "of", "Mojuí", "dos", "Campos", ",", "municipality", "of", "Santarém", "(", "PA", ")", ".", "She", "is", "one", "of", "the", "patients", "belonging", "to", "the", "above-described", "group", "who", "also", "reported", "ingesting", "açaí", "juice", ".", "In", "May", "2006", ",", "he", "presented", "with", "fever", "and", "was", "diagnosed", "with", "RCT", "positive", "for", "T", ".", "cruzi", ".", "She", "had", "no", "cardiological", "complaints", ".", "The", "electrocardiogram", "was", "normal", "and", "the", "echocardiogram", "showed", "moderate", "pericardial", "effusion", ".", "After", "treatment", "with", "benzonidazole", "there", "was", "complete", "resolution", "of", "the", "pericardial", "effusion", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "female", "label": "HUMAN", "start": 20, "end": 26 }, { "text": "patients", "label": "HUMAN", "start": 117, "end": 125 }, { "text": "T. cruzi", "label": "SPECIES", "start": 282, "end": 290 }, { "text": "açaí", "label": "SPECIES", "start": 193, "end": 197 } ]

[ "We", "present", "the", "case", "of", "a", "19", "year", "old", "boy", "with", "no", "relevant", "past", "history", "of", "fever", ",", "purulent", "rhinorrhoea", "in", "the", "NIF", "and", "progressive", "pain", "in", "the", "ipsilateral", "hemiface", "exacerbated", "by", "head", "movements", ",", "of", "almost", "a", "month", "'", "s", "evolution", ",", "which", "worsened", "despite", "antibiotic", "treatment", ";", "in", "addition", ",", "malar", "and", "eyelid", "oedema", "leading", "to", "double", "vision", "and", "a", "painful", "central", "frontal", "tumour", "of", "hard", "consistency", ".", "On", "examination", ",", "purulent", "rhinorrhoea", "at", "the", "level", "of", "the", "middle", "meatus", ",", "pain", "in", "the", "malar", "region", "and", "a", "frontal", "tumour", "of", "approximately", "5cm", "in", "size", ",", "slightly", "fluctuating", ",", "painful", ".", "Analysis", "of", "infection", "and", "CT", "scan", "confirmed", "involvement", "of", "the", "maxillary", "sinus", ",", "ethmoidal", "cells", "and", "left", "frontal", "sinus", ",", "with", "bone", "destruction", "of", "the", "external", "wall", "of", "the", "same", "and", "extension", "of", "the", "inflammatory", "process", "to", "adjacent", "soft", "tissues", ".", "Surgical", "intervention", "was", "performed", ":", "CENS", "+", "frontal", "osteoplasty", "type", "Draft", "IIB", "+", "drainage", "of", "frontal", "subperiosteal", "abscess", "(", "CMF", ")", ";", "abundant", "pus", "was", "drained", "and", "an", "external", "frontal", "penrose", "was", "left", ";", "favourable", "evolution", ".", "Positive", "culture", "for", "Prevotella", "Loeschii", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0 ]

[ { "text": "Prevotella Loeschii", "label": "SPECIES", "start": 1051, "end": 1070 } ]

[ "Anamnesis", "81-year-old", "woman", "with", "a", "history", "of", "hyperuricaemia", ",", "hyperthyroidism", ",", "dyslipidaemia", ",", "diabetes", "mellitus-II", "with", "organic", "involvement", "(", "diabetic", "retinopathy", ")", "and", "ischaemic", "heart", "disease", ".", "His", "medical", "treatment", "included", "antiplatelet", "aggregation", ",", "lipid-lowering", ",", "hypolipidemic", ",", "hypouricemic", "and", "oral", "antidiabetic", "drugs", ".", "She", "came", "to", "the", "emergency", "department", "with", "gait", "instability", "after", "a", "casual", "fall", "a", "few", "hours", "earlier", ".", "Within", "24", "hours", "of", "admission", "to", "Internal", "Medicine", ",", "he", "suffered", "a", "new", "fall", ",", "beginning", "with", "macroscopic", "haematuria", ".", "Physical", "examination", "On", "admission", "he", "had", "arrhythmic", "heart", "sounds", "with", "a", "frequency", "of", "100", "bpm", ".", "The", "abdomen", "was", "soft", ",", "depressible", ",", "painless", "and", "without", "palpation", "of", "masses", "or", "megaliths", ".", "Physical", "examination", "24", "hours", "after", "admission", "was", "unchanged", "except", "for", "macroscopic", "haematuria", ".", "Complementary", "tests", "On", "admission", ":", "-", "Biochemistry", ":", "glycaemia", "244", "mg", "/", "dl", ",", "creatinine", "0", ".", "94", "mg", "/", "dl", ",", "urea", "54", "mg", "/", "dl", ",", "ck", "5", ",", "091", "IU", "/", "l", ",", "CRP", "3", ".", "30", "mg", "/", "dl", ".", "Haemogram", ":", "11", ",", "600", "leukocytes", "/", "l", "(", "82", "neutrophils", ",", "8", "lymphocytes", ",", "10", "monocytes", ")", ".", "Coagulation", ":", "fibrinogen", "499", "mg", "/", "dl", ".", "Urine", "sediment", "and", "urine", "system", ":", "red", "blood", "cells", "+", "+", "+", ",", "glycosuria", "+", "+", ",", "protein", "+", ".", "Mild", "haematuria", "(", "5-10", "H", "x", "C", ")", ".", "-", "Electrocardiogram", ":", "atrial", "fibrillation", ",", "125", "bpm", ".", "-", "Computed", "tomography", "(", "CT", ")", "scan", "of", "the", "brain", "without", "contrast", ":", "no", "bleeding", "or", "other", "images", "suggestive", "of", "acute", "intracranial", "pathology", ".", "Twenty-four", "hours", "after", "admission", ":", "-", "Microbiology", ":", "urine", "culture", "and", "two", "blood", "cultures", "in", "which", "multisensitive", "Escherichia", "coli", "was", "isolated", ".", "-", "Thoracic-abdominal", "CT", "scan", ":", "kidneys", "with", "extrarenal", "pelvis", ".", "Small", "amount", "of", "free", "fluid", ".", "Rectal", "wall", "thickening", ",", "thickening", "of", "the", "presacral", "space", ".", "Thickened", "bladder", "walls", "with", "gas", "inside", ".", "Diagnosis", "-", "Emphysematous", "cystitis", ".", "-", "Diabetic", "decompensation", ".", "-", "Atrial", "fibrillation", "with", "rapid", "ventricular", "response", ".", "-", "Rhabdomyolysis", ".", "Treatment", "After", "confirming", "the", "clinical", "suspicion", "of", "emphysematous", "cystitis", ",", "she", "received", "conservative", "medical", "treatment", "consisting", "of", "urethral", "catheter", "with", "lavage", ",", "antibiotic", "therapy", "with", "piperacillin", "/", "tazobactam", "and", "insulin", "therapy", ".", "Evolution", "The", "clinical", "and", "radiological", "evolution", "was", "satisfactory", ",", "with", "improvement", "in", "blood", "glucose", "levels", ",", "which", "remained", "below", "150", "mg", "/", "dl", ",", "and", "almost", "total", "disappearance", "of", "gas", "images", "in", "the", "bladder", "wall", "in", "the", "control", "CT", "scan", "performed", "12", "days", "after", "admission", ".", "Despite", "this", ",", "she", "suffered", "a", "cardiorespiratory", "arrest", "on", "the", "ward", "witnessed", "by", "healthcare", "staff", ",", "who", "began", "resuscitation", "manoeuvres", "and", "transferred", "the", "patient", "to", "the", "Intensive", "Care", "Unit", ",", "where", "she", "died", "of", "cardiorespiratory", "arrest", "secondary", "to", "ventricular", "fibrillation", "in", "probable", "relation", "to", "an", "ischaemic", "event", "given", "her", "personal", "history", "of", "ischaemic", "heart", "disease", "of", "the", "infarct", "type", "." ]

[ 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 22, "end": 27 }, { "text": "Escherichia coli", "label": "SPECIES", "start": 1478, "end": 1494 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2490, "end": 2497 }, { "text": "staff", "label": "HUMAN", "start": 2428, "end": 2433 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 2660, "end": 2668 } ]

[ "On", "1", "February", "2020", ",", "a", "64-year-old", "woman", "presented", "to", "the", "emergency", "department", "reporting", "a", "fever", "of", "7", "days", "'", "duration", ",", "with", "a", "maximum", "temperature", "of", "38", ".", "7", "°", "C", ",", "coughing", ",", "slight", "expectoration", "and", "myalgia", ",", "but", "no", "chest", "discomfort", "or", "dyspnoea", ".", "He", "had", "flown", "back", "to", "Hangzhou", "(", "China", ")", "from", "Malaysia", "7", "days", "earlier", ".", "Physical", "examination", "revealed", "no", "dry", "or", "moist", "rales", "in", "both", "lungs", "and", "a", "temperature", "of", "37", ".", "3", "°", "C", ",", "pulse", "92", "bpm", ",", "respiratory", "rate", "18", "bpm", "and", "blood", "pressure", "113", "/", "79", "mmHg", ".", "Laboratory", "tests", "gave", "a", "white", "blood", "cell", "count", "of", "2", ".", "5", "x", "109", "cells", "/", "mL", ",", "with", "63", ".", "3", "%", "neutrophils", "and", "29", ".", "2", "%", "lymphocytes", ";", "the", "C-reactive", "protein", "value", "was", "3", ".", "62", "mg", "/", "L", ".", "Sputum", "tests", "for", "influenza", "A", "+", "B", "(", "by", "real-time", "RT-PCR", ")", "were", "negative", ".", "Lung", "CT", "scans", "of", "the", "patient", "showed", "several", "ground-glass", "shadows", "with", "diffuse", "borders", "and", "irregular", "densities", "in", "the", "peripheral", "and", "posterior", "areas", "of", "the", "lungs", ",", "mainly", "subpleural", ".", "These", "images", "were", "consistent", "with", "previous", "radiological", "manifestations", "of", "coronavirus", "disease", "2019", "(", "COVID-19", ")", ".", "Further", ",", "real-time", "fluorescence", "RT-PCR", "testing", "detected", "SARS-CoV-2", "RNA", "and", "the", "patient", "was", "diagnosed", "with", "COVID-19", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 34, "end": 39 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 718, "end": 725 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1068, "end": 1075 }, { "text": "SARS-CoV-2", "label": "SPECIES", "start": 1045, "end": 1055 }, { "text": "influenza A", "label": "SPECIES", "start": 646, "end": 657 } ]

[ "A", "36-year-old", "male", "patient", "with", "a", "history", "of", "hepatitis", "C", ".", "Hospitalised", "for", "fever", "and", "dyspnoea", ".", "Initial", "history", "Patient", "was", "admitted", "with", "septic", "symptoms", "associated", "with", "respiratory", "distress", ".", "History", "of", "IV", "drug", "addiction", ".", "As", "part", "of", "the", "bacteraemia", "study", ",", "an", "imaging", "study", "was", "performed", "showing", "findings", "compatible", "with", "septic", "embolism", ".", "Coronal", "reconstruction", "and", "axial", "slices", "of", "the", "CT", "scan", "on", "admission", ":", "the", "presence", "of", "multiple", "bilateral", "pulmonary", "nodules", ",", "predominantly", "peripheral", ",", "cavitated", ",", "suggestive", "of", "septic", "embolism", ",", "was", "confirmed", ".", "Trans", "oesophageal", "echocardiogram", "showed", "the", "presence", "of", "vegetation", "on", "the", "tricuspid", "valve", "associated", "with", "severe", "regurgitation", ".", "Chest", "X-ray", "PA", ":", "bilateral", "parenchymal", "alveolar", "filling", "opacities", ",", "some", "cavitated", ",", "more", "confluent", "in", "the", "right", "lung", "base", ".", "Mild", "right", "pleural", "effusion", ".", "Post-surgical", "changes", "of", "tricuspid", "valve", "replacement", ".", "Axial", "slices", "and", "coronal", "CT", "reconstruction", ":", "Multiple", "pulmonary", "nodules", ",", "peripheral", ",", "bilateral", ",", "some", "cavitated", ",", "more", "clustered", "in", "the", "right", "lung", "base", ".", "Mild", "right", "pleural", "effusion", ".", "During", "hospitalisation", "the", "patient", "underwent", "tricuspid", "valve", "replacement", "surgery", ".", "The", "patient", "completed", "antibiotic", "treatment", ",", "evolved", "favourably", "and", "was", "discharged", "with", "indications", "for", "monitoring", "by", "the", "infectious", "diseases", "and", "toxicology", "team", ".", "Pulmonary", "septic", "embolism" ]

[ 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 19, "end": 26 }, { "text": "male", "label": "HUMAN", "start": 14, "end": 18 }, { "text": "Patient", "label": "HUMAN", "start": 115, "end": 122 }, { "text": "bacteraemia", "label": "SPECIES", "start": 240, "end": 251 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1088, "end": 1095 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1148, "end": 1155 } ]

[ "", "A", "56-year-old", "patient", "was", "admitted", "to", "our", "institution", "due", "to", "an", "ischaemic", "stroke", "caused", "by", "occlusion", "of", "the", "right", "middle", "cerebral", "artery", ".", "An", "angiotomography", "performed", "on", "admission", "showed", "lesions", "indicative", "of", "COVID-19", ";", "this", "was", "confirmed", "by", "specific", "PCR", "for", "SARS-CoV-2", ".", "The", "following", "day", ",", "the", "patient", "presented", "with", "abdominal", "pain", "and", "vomiting", ".", "A", "CT", "scan", "showed", "a", "free", "thrombus", "in", "the", "aortic", "arch", ",", "associated", "with", "occlusion", "of", "the", "superior", "mesenteric", "artery", ".", "There", "were", "no", "signs", "of", "aortic", "atherosclerosis", ".", "There", "was", "also", "a", "lack", "of", "enhancement", "of", "part", "of", "the", "small", "bowel", ".", "The", "patient", "underwent", "endovascular", "thromboectomy", "and", "laparotomy", "with", "resection", "of", "two", "metres", "of", "the", "small", "bowel", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 15, "end": 22 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 294, "end": 301 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 576, "end": 583 }, { "text": "SARS-CoV-2", "label": "SPECIES", "start": 259, "end": 269 } ]

[ "Reason", "for", "consultation", "A", "27-year-old", "male", "patient", "attended", "primary", "care", "for", "odynophagia", "of", "3", "weeks", "'", "evolution", ",", "afebrile", ",", "with", "no", "other", "accompanying", "symptoms", ".", "At", "the", "onset", "of", "the", "symptoms", "he", "consulted", "the", "emergency", "department", "and", "was", "discharged", "with", "a", "diagnosis", "of", "tonsillar", "aphthous", "ulcer", "and", "treatment", "with", "ibuprofen", "600mg", "1", "tablet", "every", "8h", ".", "As", "the", "symptoms", "did", "not", "improve", ",", "he", "decided", "to", "come", "to", "our", "clinic", "for", "a", "new", "assessment", ".", "Individual", "approach", "Anamnesis", ":", "Family", "history", ":", "No", "family", "history", "of", "interest", ".", "Personal", "history", ":", "No", "personal", "history", "of", "interest", ".", "Usual", "home", "treatment", ":", "No", "treatment", "whatsoever", ".", "Physical", "examination", ":", "Good", "general", "condition", ",", "conscious", "and", "oriented", ",", "eupneic", "at", "rest", ",", "normal", "mucocutaneous", "colouring", ".", "ENT", ":", "erythematous", "and", "hyperpigmented", "lesion", "with", "indurated", "edges", "on", "the", "right", "tonsil", ".", "Blood", "tests", "were", "requested", "with", "complete", "blood", "count", "and", "biochemistry", ",", "tonsillar", "exudate", "and", "CMV", "and", "EBV", "serology", "and", "STD", "screening", "(", "hepatitis", ",", "syphilis", "and", "HIV", ")", "as", "the", "patient", "reported", "having", "had", "risky", "sexual", "relations", "in", "previous", "weeks", ".", "Complementary", "tests", ":", "blood", "test", "with", "haemogram", "and", "biochemistry", "without", "alterations", ".", "Positive", "syphilis", "serology", ".", "Family", "and", "community", "approach", "Family", "Life", "Cycle", ":", "According", "to", "the", "WHO", "classification", "modified", "by", "De", "la", "Revilla", ":", "She", "would", "be", "in", "stage", "I", "abandonment", "of", "the", "home", ".", "This", "is", "a", "single", "person", "who", "has", "recently", "become", "independent", "from", "her", "parents", ".", "Clinical", "judgement", "Primary", "syphilis", ".", "Initially", "the", "differential", "diagnosis", "was", "raised", "with", ":", "tonsillitis", "(", "acute", "bacterial", "/", "pulaceous", ")", ",", "infectious", "mononucleosis", ",", "herpangina", ",", "herpes", "primoinfection", ",", "syphilis", "with", "primary", "oral", "manifestation", ".", "Action", "plan", "and", "evolution", "She", "was", "given", "2", ".", "4", "million", "IU", "of", "penicillin", "G", "benzathine", "IM", "in", "a", "single", "dose", ".", "During", "the", "following", "months", "the", "titres", "were", "monitored", "by", "reaginic", "tests", ",", "with", "a", "progressive", "decrease", "in", "titres", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "male patient", "label": "HUMAN", "start": 38, "end": 50 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 43, "end": 50 }, { "text": "Family", "label": "HUMAN", "start": 464, "end": 470 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 483, "end": 489 }, { "text": "Personal", "label": "HUMAN", "start": 511, "end": 519 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 532, "end": 540 }, { "text": "CMV", "label": "SPECIES", "start": 909, "end": 912 }, { "text": "EBV", "label": "SPECIES", "start": 917, "end": 920 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 985, "end": 992 }, { "text": "syphilis", "label": "SPECIES", "start": 960, "end": 968 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 973, "end": 976 }, { "text": "syphilis", "label": "SPECIES", "start": 1149, "end": 1157 }, { "text": "Family", "label": "HUMAN", "start": 1169, "end": 1175 }, { "text": "Family", "label": "HUMAN", "start": 1199, "end": 1205 }, { "text": "parents", "label": "HUMAN", "start": 1399, "end": 1406 }, { "text": "person", "label": "HUMAN", "start": 1347, "end": 1353 }, { "text": "syphilis", "label": "SPECIES", "start": 1436, "end": 1444 }, { "text": "bacterial", "label": "SPECIES", "start": 1519, "end": 1528 }, { "text": "syphilis", "label": "SPECIES", "start": 1602, "end": 1610 } ]

[ "Background", "Woman", ",", "51", "years", "old", ".", "Arterial", "hypertension", ".", "Chronic", "glaucoma", ".", "No", "known", "allergies", ".", "No", "toxic", "habits", ".", "On", "treatment", "with", "telmisartan", "80", "mg", "/", "day", ".", "Baseline", "situation", ":", "active", ".", "Independent", "for", "activities", "of", "daily", "living", ".", "Moderate", "exertional", "dyspnoea", "(", "NHYA", "II", ")", ".", "Current", "illness", "She", "visited", "her", "family", "doctor", "for", "moderate", "dyspnoea", "of", "about", "3", "months", "of", "evolution", ".", "Since", "then", "she", "has", "also", "presented", "oedema", "in", "the", "lower", "limbs", ".", "She", "reported", "no", "previous", "history", "of", "chest", "pain", "or", "palpitations", ".", "A", "chest", "X-ray", "was", "performed", "and", "in", "view", "of", "the", "presence", "of", "cardiomegaly", ",", "preferential", "assessment", "was", "requested", "in", "the", "outpatient", "cardiology", "department", ".", "Physical", "examination", "BP", ":", "130", "/", "90", "mmHg", "HR", ":", "77", "bpm", "SatO2", ":", "98", "%", ".", "Normal", "head", "and", "neck", ".", "No", "IY", "CA", ":", "rhythmic", ",", "holosystolic", "murmur", "II", "/", "VI", "with", "R2", "splitting", ".", "AP", ":", "VCM", "in", "both", "lung", "fields", "Abdomen", ":", "nondescript", "LES", ":", "oedema", "with", "perimalleolar", "fovea", ".", "COMPLEMENTARY", "TESTS", "ECG", ":", "sinus", "rhythm", "at", "75", "bpm", "with", "signs", "of", "AD", "growth", ",", "normal", "PR", ",", "wide", "QRS", "(", "150", "msec", ")", "with", "morphology", "of", "complete", "right", "bundle", "branch", "block", "and", "secondary", "repolarisation", "alterations", ".", "Echocardiography", ":", "severe", "dilatation", "of", "right", "chambers", ".", "Apical", "displacement", "of", "the", "insertion", "point", "of", "the", "tricuspid", "septal", "leaflet", "(", "about", "2", ".", "5", "cm", "with", "respect", "to", "the", "plane", "of", "the", "mitral", "annulus", ")", ".", "Massive", "TR", "due", "to", "lack", "of", "leaflet", "coaptation", ".", "Assessment", "of", "RV", "systolic", "function", "is", "difficult", "but", "appears", "to", "be", "severely", "depressed", ".", "The", "pulmonary", "trunk", "is", "of", "normal", "size", ".", "The", "pulmonary", "valve", "has", "no", "abnormalities", ".", "The", "left", "chambers", "are", "small", "in", "size", "and", "displaced", "by", "the", "right", "chambers", ".", "LV", "systolic", "function", "is", "visually", "at", "the", "lower", "limit", "of", "normal", ".", "The", "left", "valves", "are", "normal", ".", "Mitral", "filling", "pattern", "of", "impaired", "relaxation", ".", "No", "ASD", "(", "although", "assessment", "is", "difficult", ")", ",", "no", "other", "shunts", ".", "Normal", "aortic", "arch", ".", "Slight", "systemic", "venous", "congestion", ".", "EVOLUTION", "Furosemide", "40", "mg", "/", "day", "was", "added", "to", "the", "treatment", ",", "cardiac", "MRI", "was", "requested", "for", "anatomical", "characterisation", "and", "better", "assessment", "of", "RV", "function", ".", "At", "the", "6-month", "check-up", ",", "the", "patient", "was", "asymptomatic", ".", "The", "result", "of", "the", "cardiac", "MRI", "was", "brought", "in", ":", "a", "study", "of", "very", "poor", "technical", "quality", "(", "movement", "artefacts", ")", ".", "Dilatation", "of", "the", "right", "chambers", ",", "with", "apical", "displacement", "of", "the", "tricuspid", "leaflets", ",", "which", "do", "not", "coapt", ".", "Free", "tricuspid", "regurgitation", ".", "RVEF", "43", "%", ".", "No", "associated", "malformations", "are", "seen", ".", "Left", "ventricle", "displaced", "by", "the", "right", ",", "with", "preserved", "ventricular", "function", ".", "Given", "the", "improvement", "in", "symptoms", ",", "it", "was", "decided", "to", "maintain", "medical", "treatment", "and", "outpatient", "monitoring", "at", "6", "months", "with", "new", "echocardiography", ",", "new", "MRI", "and", "cardiopulmonary", "stress", "test", ".", "DIAGNOSIS", "Mild", "heart", "failure", "on", "debut", "Ebstein", "'", "s", "anomaly", "Severe", "tricuspid", "regurgitation", "and", "mild", "RV", "systolic", "dysfunction" ]

[ 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Woman", "label": "HUMAN", "start": 11, "end": 16 }, { "text": "family doctor", "label": "HUMAN", "start": 296, "end": 309 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1995, "end": 2002 } ]

[ "The", "patient", "was", "a", "55-year-old", "man", ",", "with", "no", "previous", "history", "of", "interest", "and", "a", "farm", "worker", "(", "Albufera", "area", ")", ",", "who", "came", "to", "the", "emergency", "department", "with", "asthenia", ",", "very", "intense", "myalgia", ",", "pharyngitis", "and", "fever", "of", "up", "to", "39o", "C", "for", "5", "days", "of", "evolution", ".", "He", "also", "had", "paresthesia", "in", "his", "hands", ",", "feet", "and", "lips", ",", "together", "with", "dysphonia", "and", "significant", "dysphagia", "for", "solids", "and", "liquids", ",", "for", "which", "he", "had", "been", "fasting", "for", "48", "hours", ".", "For", "the", "last", "2", "days", ",", "his", "urine", "had", "been", "dark", "and", "he", "reported", "a", "clear", "decrease", "in", "diuresis", ".", "Physical", "examination", "was", "unremarkable", ",", "except", "for", "a", "hyperemic", "pharynx", ".", "A", "blood", "test", "was", "requested", ",", "which", "showed", "acute", "renal", "failure", ",", "hyperbilirubinaemia", "at", "the", "expense", "of", "direct", "renal", "function", ",", "discrete", "elevation", "of", "GOT", ",", "GPT", "and", "CK", ",", "marked", "elevation", "of", "CRP", "and", "ESR", ",", "and", "very", "severe", "platelets", ".", "The", "urine", "was", "clearly", "choluric", "and", "there", "was", "intense", "bacteriuria", ".", "An", "ultrasound", "scan", "was", "requested", ",", "which", "only", "showed", "homogeneous", "splenomegaly", "measuring", "14", "cm", ".", "In", "the", "pre-transfusion", "study", ",", "a", "positive", "Direct", "Coombs", "was", "observed", "with", "a", "cold", "antibody", "panagglutinin", "(", "without", "haemolytic", "anaemia", ")", ".", "At", "that", "time", "and", "in", "view", "of", "the", "suspicion", "of", "infectious", "syndrome", "with", "multi-organ", "dysfunction", ",", "the", "family", "was", "questioned", ",", "who", "told", "us", "that", "the", "patient", "usually", "works", "with", "organophosphates", "(", "chlorpyrifos", ")", "with", "little", "protection", "and", "that", "in", "the", "previous", "days", "he", "had", "had", "a", "marked", "conjunctival", "injection", ".", "The", "suspicion", "of", "Weil", "'", "s", "syndrome", "became", "strong", ",", "and", "serology", "was", "requested", ",", "which", "was", "positive", "for", "Leptospira", "(", "IgM", "+", ",", "IgG", "-", ")", "and", "a", "determination", "of", "Leptospira", "DNA", "in", "urine", "(", "positive", ")", "and", "blood", "(", "negative", ")", ",", "probably", "explained", "by", "the", "fact", "that", "the", "septicaemic", "(", "leptospiremic", ")", "phase", "had", "resolved", "and", "the", "immune", "(", "leptospiruric", ")", "phase", "of", "the", "disease", "was", "beginning", ".", "While", "the", "manifestations", "secondary", "to", "leptospiremia", "are", "resolving", ",", "the", "paraesthesia", "gradually", "gives", "way", "to", "total", "flaccid", "paralysis", "with", "areflexia", "and", "progression", "of", "the", "bulbar", "symptoms", ",", "with", "dyspnoea", "requiring", "intubation", "and", "mechanical", "ventilation", "in", "the", "ICU", "to", "maintain", "proper", "ventilation", ".", "Given", "the", "possibility", "of", "Guillain-Barré", "syndrome", "secondary", "to", "infection", ",", "an", "EMG", "was", "requested", ",", "with", "neurophysiological", "data", "compatible", "with", "the", "diagnosis", "of", "acute", "sensory-motor", "polyneuropathy", "/", "polyradiculoneuropathy", "without", "signs", "of", "demyelination", ".", "At", "this", "point", ",", "the", "option", "of", "a", "polyneuropathy", "associated", "with", "exposure", "to", "organophosphates", "(", "chlorpyrifos", ")", ",", "widely", "described", "in", "the", "literature", ",", "is", "raised", ".", "Cholinesterase", "levels", "were", "normal", ",", "ruling", "out", "this", "option", ".", "A", "few", "days", "later", ",", "plateletopenia", "recovered", "and", "a", "lumbar", "puncture", "compatible", "with", "Guillain-Barré", "(", "albumin-cytological", "dissociation", ")", "was", "performed", ".", "At", "this", "point", "we", "reviewed", "the", "literature", ",", "finding", "that", "the", "syndromic", "diagnosis", "of", "Guillain-Barré", "does", "not", "necessarily", "imply", "demyelination", ",", "but", "that", "its", "most", "common", "variant", "PIDA", "(", "acute", "demyelinating", "inflammatory", "polyneuropathy", ")", "is", "what", "is", "classically", "known", "as", "Guillain-Barré", ",", "however", ",", "there", "are", "less", "common", "variants", "where", "the", "damage", "is", "not", "necessarily", "caused", "by", "demyelinating", "demyelinating", "polyneuropathy", ",", "However", ",", "there", "are", "less", "common", "variants", "where", "the", "damage", "is", "axonal", "and", "not", "demyelinating", ",", "which", "are", "usually", "more", "severe", "and", "have", "a", "worse", "prognosis", ",", "such", "as", "AMAN", "(", "acute", "motor", "axonal", "neuropathy", ")", "and", "AMSAN", "(", "acute", "sensory-motor", "axonal", "neuropathy", ")", ",", "the", "latter", "being", "the", "subtype", "of", "our", "patient", ".", "The", "evolution", "was", "good", "and", "the", "patient", "has", "now", "resumed", "his", "pre-disease", "daily", "life", "." ]

[ 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4, "end": 11 }, { "text": "farm worker", "label": "HUMAN", "start": 78, "end": 89 }, { "text": "bacteriuria", "label": "SPECIES", "start": 851, "end": 862 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 1190, "end": 1196 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1234, "end": 1241 }, { "text": "Leptospira", "label": "SPECIES", "start": 1489, "end": 1499 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3331, "end": 3338 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3371, "end": 3378 } ]

[ "23", "year", "old", "male", "who", "came", "to", "the", "consultation", "at", "the", "Centre", "for", "Comprehensive", "Care", "for", "Drug", "Addicts", "(", "CAID", ")", "with", "the", "intention", "of", "giving", "up", "cannabis", "use", "\"", "because", "he", "wants", "to", "use", "his", "brain", "to", "its", "full", "extent", "\"", "and", "does", "not", "want", "to", "be", "\"", "stoned", "\"", "all", "day", ".", "There", "is", "nothing", "to", "report", "in", "the", "family", "history", ".", "Personal", "history", "In", "early", "childhood", "he", "had", "major", "medical", "problems", "due", "to", "a", "malformation", "of", "the", "ureters", "with", "renal", "involvement", ",", "which", "resolved", "at", "the", "age", "of", "three", "but", "which", "forced", "him", "to", "need", "an", "external", "urine", "collection", "bag", "for", "months", "with", "check-ups", "and", "examinations", "that", "the", "patient", "remembers", "because", "of", "the", "pain", "it", "caused", "him", ".", "He", "was", "subsequently", "diagnosed", "with", "amblyopia", ",", "and", "eye", "patches", "and", "glasses", "were", "prescribed", ".", "The", "patient", "reports", "that", "he", "ended", "up", "memorising", "the", "letters", "and", "figures", "on", "the", "scanning", "devices", "because", "his", "aim", "was", "not", "to", "wear", "patches", "or", "glasses", "to", "school", ".", "He", "was", "eventually", "discharged", "for", "improvement", "at", "the", "age", "of", "12", "years", ".", "Currently", "the", "patient", "has", "poor", "vision", "in", "his", "left", "eye", ".", "School", "performance", "was", "very", "good", "until", "the", "age", "of", "14", "when", "behavioural", "and", "academic", "problems", "started", "to", "occur", "at", "school", ".", "The", "parents", "consulted", "the", "school", "psychologist", "who", "diagnosed", "that", "the", "patient", "had", "an", "IQ", "of", "130", "and", "that", "the", "problems", "in", "school", "performance", "were", "due", "to", "the", "fact", "that", "he", "was", "\"", "very", "restless", "and", "rebellious", "\"", ".", "It", "was", "suggested", "that", "he", "should", "study", "Social", "But", "the", "patient", "set", "out", "to", "prove", "that", "\"", "he", "was", "good", "at", "studying", "\"", "and", "obtained", "very", "good", "marks", "in", "the", "following", "year", ",", "but", "continued", "to", "behave", "inappropriately", "in", "the", "school", "environment", ".", "He", "finished", "secondary", "school", "late", "and", "did", "not", "want", "to", "prepare", "for", "the", "Selectividad", ".", "At", "the", "age", "of", "fourteen", "he", "had", "started", "using", "cannabis", ",", "had", "tried", "other", "substances", ",", "and", "was", "always", "socialising", "with", "boys", "older", "than", "him", ".", "History", "of", "use", "Between", "the", "ages", "of", "fourteen", "and", "fifteen", "he", "started", "using", "tobacco", ",", "cannabis", "and", "tried", "LSD", "and", "amphetamines", ".", "The", "use", "of", "the", "latter", "two", "substances", "only", "becomes", "occasional", ",", "some", "weekends", ",", "but", "he", "takes", "them", "until", "the", "age", "of", "nineteen", "or", "twenty", ".", "He", "tried", "cocaine", "at", "the", "age", "of", "sixteen", ",", "but", "he", "did", "not", "like", "it", ",", "he", "said", "that", "it", "was", "bad", "for", "him", ",", "although", "he", "did", "not", "report", "paranoid", "ideas", "when", "he", "used", "it", ",", "but", "he", "did", "say", "that", "it", "\"", "made", "him", "very", "upset", "\"", ".", "He", "also", "tried", "alcohol", "at", "the", "age", "of", "fifteen", ",", "but", "did", "not", "have", "more", "than", "two", "or", "three", "drinks", "on", "the", "days", "he", "went", "out", "at", "weekends", ".", "The", "patient", "had", "requested", "treatment", "a", "year", "and", "a", "half", "ago", ",", "at", "the", "age", "of", "21", ",", "also", "with", "the", "intention", "of", "abandoning", "the", "consumption", "that", "he", "considered", "was", "making", "it", "difficult", "for", "him", "to", "solve", "the", "problems", "that", "his", "girlfriend", ",", "also", "a", "cannabis", "user", "and", "ten", "years", "older", "than", "him", ",", "was", "causing", "him", ".", "He", "had", "gone", "to", "the", "CSM", "in", "his", "area", "due", "to", "the", "anxious", "symptoms", "he", "presented", ",", "and", "after", "additional", "tests", ",", "including", "an", "ECG", ",", "a", "diagnosis", "of", "possible", "hyperactivity", "was", "made", ",", "sertraline", "and", "topiramate", "were", "recommended", "and", "he", "was", "advised", "to", "stop", "using", "cannabis", ".", "The", "patient", "was", "critical", "of", "his", "consumption", ",", "stating", "that", "it", "made", "it", "difficult", "for", "him", "to", "make", "decisions", "and", "to", "cope", "with", "the", "events", "occurring", "in", "his", "environment", ".", "He", "managed", "to", "reduce", "his", "use", "to", "two", "or", "three", "joints", "a", "day", "and", "left", "treatment", "although", "he", "was", "aware", "that", "he", "had", "not", "achieved", "his", "goal", "of", "detoxification", ".", "Current", "status", "The", "patient", "lives", "with", "his", "parents", "and", "a", "sister", "five", "years", "younger", "than", "him", ".", "There", "is", "a", "good", "family", "relationship", ".", "He", "is", "working", "part-time", "to", "cover", "his", "expenses", ",", "he", "is", "preparing", "for", "his", "second", "university", "entrance", "exam", ",", "he", "is", "studying", "English", "without", "external", "support", ",", "he", "is", "preparing", "to", "become", "a", "driving", "school", "teacher", ",", "where", "he", "sees", "a", "professional", "outlet", "in", "the", "family", "environment", "and", "which", "would", "help", "him", "to", "finance", "his", "studies", "in", "health", "sciences", ".", "He", "has", "a", "new", "girlfriend", ",", "also", "older", "than", "him", ",", "who", "is", "not", "a", "drug", "user", "and", "from", "whom", "he", "wants", "to", "separate", ".", "At", "the", "time", "of", "the", "consultation", ",", "the", "patient", "shows", "great", "anxiety", ",", "emotional", "lability", "without", "anhedonia", ",", "insomnia", "and", "broken", "sleep", ",", "crises", "of", "anxiety", ",", "irritability", "and", "a", "feeling", "of", "lack", "of", "control", "in", "his", "actions", "and", "in", "expressing", "his", "thoughts", "adequately", ",", "which", "causes", "great", "social", "withdrawal", "and", "makes", "it", "impossible", "for", "him", "to", "concentrate", "on", "pleasant", "tasks", ",", "such", "as", "reading", ";", "he", "complains", "of", "alterations", "in", "his", "immediate", "memory", ".", "He", "perceives", "as", "anomalous", "the", "fact", "that", "he", "tries", "to", "perform", "many", "tasks", "that", "he", "does", "not", "finish", "because", "he", "is", "unable", "to", "concentrate", "for", "a", "long", "time", ",", "but", "reports", "that", "his", "performance", "improves", "if", "he", "changes", "tasks", "with", "a", "certain", "frequency", ".", "He", "does", "not", "present", "delusions", "of", "any", "kind", ",", "but", "he", "does", "present", "obsessive", "ideas", "that", "cause", "him", "great", "concern", ":", "\"", "I", "don", "'", "t", "think", "well", "\"", ".", "The", "patient", "is", "well", "aware", "that", "his", "problem", "is", "related", "to", "cannabis", "use", ",", "but", "he", "is", "unable", "to", "detoxify", "himself", ",", "going", "so", "far", "as", "to", "propose", "hospital", "admission", "to", "achieve", "his", "goal", ".", "He", "appears", "well-groomed", "and", "well-groomed", ",", "with", "slight", "motor", "agitation", "that", "disappears", "during", "the", "conversation", ".", "The", "language", "is", "correct", ",", "fluent", ",", "spontaneous", ",", "with", "a", "wide", "vocabulary", ",", "good", "command", "of", "the", "language", "and", "with", "cultured", ",", "unforced", "expressions", ";", "he", "shows", "great", "interest", "and", "is", "very", "interested", "in", "the", "appreciation", "of", "the", "interlocutor", ",", "maintaining", "intense", "eye", "contact", "and", "showing", "affection", "appropriate", "to", "the", "content", "of", "the", "conversation", ".", "He", "admits", "criticism", ",", "but", "refers", "that", "he", "does", "not", "tolerate", "incoherence", "well", ".", "He", "says", "that", "he", "has", "\"", "almost", "always", "looked", "different", "\"", ",", "and", "that", "he", "does", "not", "know", "whether", "this", "is", "due", "to", "his", "personal", "characteristics", "or", "to", "his", "\"", "way", "of", "thinking", "\"", ".", "Smoker", "of", "about", "eight", "to", "ten", "tobacco", "cigarettes", ".", "No", "other", "consumption", ",", "except", "for", "a", "very", "occasional", "consumption", "of", "no", "more", "than", "50", "grams", "of", "alcohol", "at", "weekends", "when", "he", "goes", "out", "and", "in", "order", "to", "mitigate", "the", "anxiety", "caused", "by", "social", "contact", ".", "He", "is", "critical", "of", "alcohol", "consumption", "and", "says", "that", "it", "sometimes", "worsens", "his", "mood", "as", "he", "sees", "no", "solution", "in", "drinking", ",", "and", "even", "perceives", "it", "as", "an", "attitude", "of", "self-aggressiveness", ".", "An", "outpatient", "detoxification", "is", "proposed", "with", "the", "help", "of", "anxiolytics", "-", "5mg", ".", "of", "alprazolam", "retard", "daily", "-", "and", "30mg", ".", "of", "mirtazapine", "at", "night", ".", "The", "patient", "is", "able", "to", "reduce", "his", "consumption", "to", "two", "or", "three", "joints", "a", "day", ",", "which", "he", "smokes", "compulsively", "in", "the", "evening", ",", "and", "even", "goes", "without", "smoking", "cannabis", "for", "two", "or", "three", "days", "in", "a", "row", ".", "In", "any", "case", ",", "he", "reports", "great", "anxiety", "accompanied", "by", "a", "vegetative", "component", ",", "intense", "irritability", ",", "obsessive", "ideas", ",", "anorexia", ",", "altered", "intestinal", "transit", ",", "a", "feeling", "of", "dystrophy", "and", "an", "increase", "in", "tobacco", "consumption", "to", "more", "than", "double", "what", "he", "used", "to", "smoke", ".", "His", "insomnia", "improves", "and", "he", "reports", "\"", "feeling", "more", "alert", "\"", ",", "but", "there", "is", "no", "abstinence", "as", "his", "anxiety", "is", "very", "intense", "in", "the", "afternoons", ",", "above", "all", "related", "to", "obsessive", "ideas", "concerning", "self-criticism", "of", "his", "behaviour", "and", "decision", "making", ",", "and", "he", "ends", "up", "smoking", "in", "an", "attempt", "to", "reduce", "his", "anxious", "symptoms", "and", "irritability", ",", "reporting", "that", "his", "anxiety", "improves", "but", "not", "the", "rest", "of", "his", "symptoms", ".", "Treatment", "with", "risperidone", "1mg", ".", "at", "midday", "is", "proposed", ",", "and", "he", "manages", "to", "maintain", "abstinence", "more", "easily", "as", "his", "anxiety", "improves", "and", "it", "is", "easier", "for", "him", "to", "stop", "thinking", "and", "plan", "activities", "outside", "of", "consumption", ".", "The", "patient", "has", "not", "yet", "achieved", "abstinence", "for", "more", "than", "a", "month", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "male", "label": "HUMAN", "start": 12, "end": 16 }, { "text": "cannabis", "label": "SPECIES", "start": 139, "end": 147 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 283, "end": 289 }, { "text": "Personal", "label": "HUMAN", "start": 300, "end": 308 }, { "text": "childhood", "label": "HUMAN", "start": 326, "end": 335 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 576, "end": 583 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 724, "end": 731 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 961, "end": 968 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1191, "end": 1198 }, { "text": "parents", "label": "HUMAN", "start": 1126, "end": 1133 }, { "text": "school psychologist", "label": "HUMAN", "start": 1148, "end": 1167 }, { "text": "cannabis", "label": "SPECIES", "start": 1681, "end": 1689 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1378, "end": 1385 }, { "text": "boys", "label": "HUMAN", "start": 1751, "end": 1755 }, { "text": "cannabis", "label": "SPECIES", "start": 1855, "end": 1863 }, { "text": "cannabis", "label": "SPECIES", "start": 2591, "end": 2599 }, { "text": "cannabis", "label": "SPECIES", "start": 2899, "end": 2907 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2363, "end": 2370 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2913, "end": 2920 }, { "text": "tobacco", "label": "SPECIES", "start": 1846, "end": 1853 }, { "text": "girlfriend", "label": "HUMAN", "start": 2572, "end": 2582 }, { "text": "cannabis", "label": "SPECIES", "start": 4645, "end": 4653 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 3333, "end": 3339 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 3602, "end": 3608 }, { "text": "sister", "label": "HUMAN", "start": 3281, "end": 3287 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3244, "end": 3251 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3831, "end": 3838 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4592, "end": 4599 }, { "text": "parents", "label": "HUMAN", "start": 3267, "end": 3274 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 5388, "end": 5396 }, { "text": "driving school teacher", "label": "HUMAN", "start": 3535, "end": 3557 }, { "text": "tobacco", "label": "SPECIES", "start": 5471, "end": 5478 }, { "text": "girlfriend", "label": "HUMAN", "start": 3702, "end": 3712 }, { "text": "interlocutor", "label": "HUMAN", "start": 5089, "end": 5101 }, { "text": "cannabis", "label": "SPECIES", "start": 6154, "end": 6162 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 6007, "end": 6014 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 7066, "end": 7073 }, { "text": "tobacco", "label": "SPECIES", "start": 6391, "end": 6398 } ]

[ "Anamnesis", "A", "32-year-old", "woman", "with", "ulcer", "on", "the", "right", "upper", "extremity", ".", "No", "known", "drug", "allergies", "and", "no", "toxic", "habits", ".", "Strict", "vegetarian", ".", "Biologist", ".", "5", "months", "stay", "in", "Peru", "in", "direct", "contact", "with", "all", "kinds", "of", "animals", ":", "monkeys", ",", "bats", ",", "insects", ",", "etc", ".", ".", ".", ".", "Previously", "vaccinated", "against", "yellow", "fever", ",", "hepatitis", "A", "and", "B", ",", "typhoid", "fever", "and", "rabies", ".", "Since", "her", "return", "to", "Spain", ",", "she", "has", "been", "suffering", "from", "night", "sweats", "every", "day", "while", "afebrile", ".", "Three", "months", "later", ",", "rounded", "raised", "lesion", "(", "similar", "to", "a", "cigarette", "burn", ")", ",", "crusted", ",", "on", "the", "posterior", "region", "of", "the", "left", "arm", ".", "Worsening", "and", "progressive", "growth", "as", "the", "days", "went", "by", ".", "He", "started", "several", "courses", "of", "antibiotics", "on", "an", "outpatient", "basis", "after", "taking", "a", "culture", "of", "exudate", "with", "growth", "of", "S", ".", "coagulase", "negative", ",", "(", "Amoxicillin-clavulanic", "acid", ",", "Ciprofloxacin", ",", "Clindamycin", ")", "and", "topical", "ointments", "(", "Gentamicin", ")", "without", "improvement", ".", "After", "the", "growth", "and", "poor", "evolution", ",", "she", "was", "assessed", "by", "surgery", ",", "increasing", "the", "duration", "of", "antibiotic", "treatment", "and", "debridement", ".", "After", "this", "time", "and", "due", "to", "the", "persistence", "of", "the", "lesion", ",", "increase", "in", "size", "and", "signs", "of", "infection", "and", "secondary", "inflammation", ",", "she", "was", "referred", "to", "the", "hospital", "for", "assessment", ".", "Exploration", "BP", "97", "/", "60", ",", "HR", "52", ",", "Ta", "36", ".", "4oC", ",", "good", "general", "condition", ",", "well", "hydrated", "and", "perfused", ".", "Eupneic", "at", "rest", ".", "AC", ":", "rhythmic", "at", "52", "bpm", ".", "AP", ":", "m", ".", "v", "preserved", "without", "added", "noises", ".", "Abdomen", "soft", ",", "not", "painful", ",", "no", "masses", "or", "megaliths", ".", "No", "signs", "of", "peritoneal", "irritation", ".", "Lower", "extremities", ":", "no", "oedema", "or", "signs", "of", "DVT", ".", "Crusty", "cutaneous", "lesion", "on", "the", "posterior", "aspect", "of", "the", "left", "arm", "measuring", "4", ".", "5cm", "x", "3cm", ".", "Complementary", "tests", "-", "Blood", "count", ",", "biochemistry", ",", "coagulation", ",", "thyroid", "hormones", ",", "iron", "profile", "and", "autoimmunity", "were", "normal", ".", "-", "Serology", "for", "Leishmania", ",", "Hepatitis", "A", ",", "B", "and", "C", ",", "HIV", ",", "Brucella", ",", "Borrellia", ",", "Coxiella", "and", "Lues", "negative", ".", "Mantoux", "and", "Quantiferon", "negative", ".", "-", "Endoscopy", "(", "gastro", "and", "colonoscopy", ")", "normal", "due", "to", "persistent", "abdominal", "discomfort", "at", "epigastric", "level", "with", "diarrhoea", "and", "negative", "stool", "culture", ".", "-", "Chest-abdomen-pelvis", "CT", "scan", ":", "no", "significant", "findings", ".", "-", "Initial", "suspicion", "of", "Leishmaniasis", "and", "pending", "microbiology", "results", ",", "treatment", "with", "amphotericin", "was", "started", "with", "no", "apparent", "improvement", ".", "-", "A", "skin", "biopsy", "compatible", "with", "pyoderma", "gangrenosum", "was", "performed", "and", "treatment", "with", "corticosteroids", "was", "started", ".", "Subsequently", "suspended", "with", "the", "results", "of", "microbiology", ".", "-", "Microbiology", ":", "aerobic", "and", "anerobic", "cultures", "negative", ".", "PCR", "for", "Leishmania", ":", "negative", ".", "Ulcer", "exudate", ":", "auramine", "stain", "negative", ",", "culture", "for", "mycobacteria", "with", "growth", "of", "M", ".", "Ulcerans", ".", "PCR", "for", "M", ".", "Ulcerans", ":", "positive", ".", "Diagnosis", "With", "the", "findings", "described", "above", ",", "the", "diagnosis", "of", "Buruli", "ulcer", "was", "made", ".", "Treatment", "and", "evolution", "After", "the", "diagnosis", "was", "confirmed", ",", "she", "received", "treatment", "with", "rifampicin", "and", "streptomycin", ".", "Currently", "on", "this", "treatment", ".", "She", "is", "also", "being", "monitored", "jointly", "by", "Plastic", "Surgery", ",", "which", "carries", "out", "debridement", "and", "care", "of", "the", "ulcer", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 24, "end": 29 }, { "text": "vaccinated", "label": "SPECIES", "start": 256, "end": 266 }, { "text": "animals", "label": "SPECIES", "start": 204, "end": 211 }, { "text": "insects", "label": "SPECIES", "start": 228, "end": 235 }, { "text": "bats", "label": "SPECIES", "start": 222, "end": 226 }, { "text": "Leishmania", "label": "SPECIES", "start": 1694, "end": 1704 }, { "text": "Hepatitis A", "label": "SPECIES", "start": 1706, "end": 1717 }, { "text": "Hepatitis A, B", "label": "SPECIES", "start": 1706, "end": 1720 }, { "text": "Hepatitis A, B and C", "label": "SPECIES", "start": 1706, "end": 1726 }, { "text": "Lues", "label": "SPECIES", "start": 1767, "end": 1771 }, { "text": "Leishmania", "label": "SPECIES", "start": 2396, "end": 2406 }, { "text": "mycobacteria", "label": "SPECIES", "start": 2470, "end": 2482 }, { "text": "M. Ulcerans", "label": "SPECIES", "start": 2498, "end": 2509 }, { "text": "M. Ulcerans", "label": "SPECIES", "start": 2519, "end": 2530 } ]

[ "Personal", "history", "29-year-old", "male", "patient", ",", "with", "no", "known", "drug", "allergies", "or", "medical", "or", "surgical", "history", "of", "interest", ".", "Epidemiological", "history", "Born", "in", "India", ",", "he", "has", "lived", "in", "Angola", "for", "15", "years", "and", "travels", "frequently", "to", "Hong", "Kong", "for", "work", ".", "Present", "illness", "He", "came", "to", "the", "emergency", "room", "of", "a", "Spanish", "hospital", "because", "while", "he", "was", "on", "a", "cruise", "with", "his", "wife", "in", "Greece", "and", "Turkey", ",", "on", "the", "8th", "day", "of", "the", "trip", ",", "he", "began", "to", "suffer", "from", "fever", ",", "jaundice", ",", "abdominal", "pain", "and", "diarrhoea", "without", "pathological", "products", ".", "He", "went", "to", "a", "medical", "centre", "in", "Turkey", ",", "where", "he", "underwent", "a", "blood", "test", "showing", "GOT", "132", "U", "/", "L", ";", "GPT", "244", "U", "/", "L", ";", "GGT", "199", "U", "/", "L", ",", "negative", "HBV", "and", "HCV", "serology", ",", "negative", "thick", "drop", "and", "smear", "test", ".", "Three", "days", "later", ",", "on", "the", "12th", "day", "of", "the", "cruise", ",", "once", "the", "cruise", "was", "over", ",", "he", "continued", "with", "the", "same", "clinical", "picture", ".", "He", "had", "previously", "been", "in", "Hong", "Kong", "for", "20", "days", "and", "during", "the", "7", "days", "prior", "to", "the", "trip", "in", "Angola", ".", "Physical", "examination", "and", "complementary", "tests", "At", "the", "emergency", "department", ",", "he", "presented", "fever", "(", "39o", ")", ",", "BP", "93", "/", "54", "mmHg", ",", "HR", "93lpm", ",", "and", "on", "physical", "examination", "he", "presented", "hepatomegaly", "of", "2", "crosses", ",", "with", "no", "other", "significant", "alterations", ".", "Laboratory", "tests", "showed", "18000", "platelets", ",", "creatinine", "1", ".", "74", "mg", "/", "dL", ",", "total", "bilirubin", "12", ".", "14", "mg", "/", "dL", "(", "direct", "bilirubin", "8", ".", "63", "mg", "/", "dL", ",", "indirect", "bilirubin", "3", ".", "51mg", "/", "dL", ")", ",", "GOT", "141", "U", "/", "l", ",", "GPT", "163", "U", "/", "L", ".", "ECG", "and", "chest", "X-ray", "with", "no", "significant", "alterations", ";", "abdominal", "ultrasound", "showed", "discrete", "hepatomegaly", ".", "The", "rapid", "malaria", "diagnostic", "test", "was", "repeated", "and", "was", "positive", ",", "smear", "and", "thick", "blood", "smear", "with", "parasitaemia", "17", "%", ".", "Evolution", "during", "admission", "A", "diagnosis", "of", "severe", "malaria", "was", "made", ",", "with", "hyperparasitaemia", ",", "jaundice", "/", "transaminasemia", "and", "thrombocytopenia", "as", "poor", "prognostic", "criteria", ".", "Admission", "to", "the", "ICU", "and", "treatment", "was", "started", "with", "artesunate", "i", ".", "v", ".", "for", "3", "days", "during", "his", "stay", "in", "the", "ICU", ".", "Subsequently", ",", "with", "recovery", "of", "renal", "function", ",", "thrombocytopenia", ",", "tolerance", "of", "the", "oral", "route", "and", "haemodynamic", "stability", ",", "it", "was", "decided", "to", "transfer", "him", "to", "the", "conventional", "hospital", "ward", ",", "continuing", "treatment", "with", "artemether-lumefantrine", "(", "Riamet", ")", ",", "4", "tablets", "every", "12", "hours", "for", "3", "days", ".", "During", "the", "following", "days", "he", "presented", "haemodynamic", "stability", ",", "progressive", "reduction", "of", "fever", "and", "transaminases", ".", "On", "day", "+", "7", "of", "admission", "he", "again", "had", "a", "fever", "peak", "(", "38", ".", "7oC", ")", ",", "and", "the", "blood", "test", "showed", "haemoglobin", "10", ".", "7", "mg", "/", "dL", "(", "at", "admission", "12", ".", "2mg", "/", "dL", ")", "and", "LDH", "1157", "U", "/", "L", "(", "at", "admission", "570", "U", "/", "L", ")", ".", "During", "the", "following", "days", "he", "continued", "with", "fever", ",", "decreased", "haemoglobin", "and", "elevated", "LDH", ",", "reaching", "the", "nadir", "of", "haemoglobin", "(", "8", ".", "3", "mg", "/", "dL", ")", "and", "elevated", "LDH", "1582", "U", "/", "L", "on", "day", "+", "14", "of", "admission", ".", "Haemolytic", "anaemia", "was", "studied", "and", "the", "following", "complementary", "tests", "were", "performed", ":", "-", "Study", "of", "haemolysis", ":", "elevated", "reticulocytes", ",", "decreased", "Hb", ",", "elevated", "LDH", ",", "normal", "haptoglobin", "and", "study", "of", "ferrokinetics", "within", "the", "limits", "of", "normality", ".", "-", "Autoimmunity", ":", "ANAs", "and", "cryoglobulins", "within", "normal", "limits", ".", "-", "Coombs", "negative", "-", "No", "G6PD", "deficiency", "-", "Immunophenotype", "within", "normal", "limits", ".", "-", "Cholangioresonance", ":", "no", "significant", "alterations", ".", "-", "With", "no", "change", "in", "clinical", "attitude", ",", "13", "days", "later", "he", "presented", "haemoglobin", "levels", "of", "10", ".", "2", "mg", "/", "dL", ",", "LDH", "647", "U", "/", "L", ",", "total", "bilirubin", "2", ".", "91mg", "/", "dL", "with", "normalisation", "of", "transaminases", ",", "and", "it", "was", "therefore", "decided", "to", "discharge", "him", "home", "from", "hospital", "with", "subsequent", "follow-up", "in", "outpatient", "clinics", ".", "Clinical", "judgement", "Severe", "malaria", ".", "Haemolytic", "anaemia", "secondary", "to", "treatment", "with", "artesunate", ".", "Good", "clinical", "evolution", "until", "normalisation", "of", "the", "different", "analytical", "parameters", "." ]

[ 1, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Personal", "label": "HUMAN", "start": 0, "end": 8 }, { "text": "male patient", "label": "HUMAN", "start": 29, "end": 41 }, { "text": "HBV", "label": "SPECIES", "start": 632, "end": 635 }, { "text": "HCV", "label": "SPECIES", "start": 640, "end": 643 }, { "text": "wife", "label": "HUMAN", "start": 349, "end": 353 }, { "text": "parasitaemia", "label": "SPECIES", "start": 1523, "end": 1535 }, { "text": "hyperparasitaemia", "label": "SPECIES", "start": 1614, "end": 1631 } ]

[ "The", "patient", ",", "a", "23", "year", "old", "male", ",", "HIV", "seropositive", ",", "acquired", "by", "vertical", "transmission", ",", "was", "admitted", "on", "12", "/", "06", "/", "2010", ",", "with", "headache", "of", "one", "week", "'", "s", "evolution", ".", "He", "presented", "on", "computed", "tomography", "(", "CT", ")", "of", "the", "brain", "(", "without", "contrast", ")", "a", "hypodense", "image", "in", "the", "right", "frontal", "lobe", "and", "a", "left", "paraventricular", "image", ".", "Empirical", "treatment", "for", "toxoplasmosis", "was", "started", ".", "He", "had", "a", "history", "of", "Isospora", "belli", "diarrhoea", "and", "negative", "serology", "for", "syphilis", ",", "toxoplasmosis", ",", "Chagas", "disease", "and", "primary", "hepatotropic", "viruses", ".", "He", "had", "stopped", "antiretroviral", "treatment", "(", "ART", ")", "2", "years", "earlier", ",", "after", "completing", "multiple", "regimens", "with", "non-adherence", ".", "He", "is", "not", "an", "iv", "drug", "user", "and", "lives", "in", "a", "house", "made", "of", "construction", "material", "with", "complete", "toilets", ".", "He", "travelled", "to", "the", "endemic", "area", "at", "18", "years", "of", "age", ".", "Abdominal", "ultrasound", "revealed", "hepatosplenomegaly", ",", "left", "kidney", "with", "increased", "medullary", "echogenicity", ",", "isoechoic", "retroperitoneal", "lymphadenopathy", "and", "mild", "pericardial", "effusion", ".", "Fundus", "examination", "was", "normal", "and", "CD4", "+", "T-cell", "count", "was", "198", "cells", "/", "mm3", ".", "Chest", "X-ray", "was", "normal", ".", "He", "presented", "with", "seizures", ",", "sensory", "impairment", ",", "headache", "and", "paraesthesia", "in", "the", "right", "upper", "limb", ",", "which", "led", "to", "a", "lumbar", "puncture", ",", "from", "which", "rock", "crystal", "cerebrospinal", "fluid", "(", "CSF", ")", "was", "obtained", ",", "with", "47", "g", "/", "dl", "glucose", ",", "0", ".", "5", "g", "/", "dl", "protein", "and", "4", "cells", "/", "mm3", ".", "Parasitological", "study", "revealed", "motile", "(", "flagellated", ")", "elements", "micromorphologically", "compatible", "with", "T", ".", "cruzi", "trypomastigotes", ".", "Serology", "for", "Chagas", "disease", "was", "negative", "by", "particle", "agglutination", "(", "PA", ")", ",", "indirect", "haemagglutination", "(", "HAI", ")", "and", "enzyme", "immunoassay", "(", "ELISA", ")", ".", "Indirect", "immunofluorescence", "assay", "(", "IFA", ")", "was", "positive", "with", "a", "titre", "of", "1", "/", "64", "(", "cut-off", "value", "1", "/", "32", ")", ",", "and", "then", "negative", "in", "3", "subsequent", "successive", "determinations", ",", "performed", "in", "the", "same", "laboratory", ".", "Strout", "'", "s", "technique", "was", "positive", ".", "Treatment", "was", "started", "with", "Beznidazole", "(", "vo", ")", ",", "which", "was", "discontinued", "on", "the", "5th", "day", "due", "to", "the", "appearance", "of", "a", "severe", "pruritic", "skin", "rash", "and", "was", "replaced", "by", "Nifurtimox", "(", "vo", ")", ",", "while", "treatment", "for", "toxoplasmosis", "was", "discontinued", ".", "On", "the", "5th", "day", "he", "presented", "fever", "and", "sinus", "tachycardia", "with", "transient", "haemodynamic", "decompensation", ".", "The", "echocardiogram", "showed", "a", "slight", "increase", "in", "the", "size", "of", "the", "left", "ventricle", ",", "with", "preserved", "systolic", "function", ",", "and", "mild", "concentric", "hypertrophy", "and", "pericardial", "effusion", ",", "configuring", "a", "restrictive", "pattern", ".", "At", "14", "days", "he", "presented", "with", "symptoms", "of", "heart", "failure", "and", "chest", "X-ray", "revealed", "acute", "myocardial", "dilatation", "with", "a", "pattern", "of", "pulmonary", "flow", "redistribution", ".", "Electrocardiogram", "showed", "1st", "degree", "A-V", "block", "and", "a", "new", "echocardiogram", "showed", "decreased", "systolic", "function", "and", "acute", "myocardial", "dilatation", "with", "signs", "of", "failure", ".", "He", "was", "treated", "with", "enalapril", ",", "spironolactone", ",", "furosemide", "and", "corticosteroids", "as", "myocardial", "anti-inflammatory", "drugs", ",", "with", "which", "he", "improved", ".", "After", "26", "days", "of", "hospitalisation", ",", "he", "started", "treatment", "with", "vancomycin", "for", "a", "methicillin-resistant", "Staphylococcus", "aureus", "infection", "linked", "to", "a", "catheter", ".", "ART", "was", "restarted", "with", "Zidovudine", ",", "Lamivudine", ",", "Saquinavir", "and", "Ritonavir", ".", "On", "ECG", "the", "A-V", "block", "remitted", ".", "The", "patient", "presented", "with", "nausea", ",", "vomiting", ",", "abdominal", "pain", ",", "increased", "blood", "urea", "and", "potassium", ".", "Vancomycin", ",", "ART", "and", "diuretics", "were", "discontinued", "and", "daptomycin", "was", "continued", ".", "After", "55", "days", "of", "hospitalisation", "he", "was", "discharged", ",", "continuing", "treatment", "with", "Nifurtimox", "." ]

[ 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 33, "end": 36 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 4, "end": 11 }, { "text": "toxoplasmosis", "label": "SPECIES", "start": 328, "end": 341 }, { "text": "Isospora belli", "label": "SPECIES", "start": 376, "end": 390 }, { "text": "primary hepatotropic viruses", "label": "SPECIES", "start": 471, "end": 499 }, { "text": "syphilis", "label": "SPECIES", "start": 427, "end": 435 }, { "text": "toxoplasmosis", "label": "SPECIES", "start": 437, "end": 450 }, { "text": "Chagas disease", "label": "SPECIES", "start": 452, "end": 466 }, { "text": "Chagas", "label": "SPECIES", "start": 452, "end": 458 }, { "text": "ART", "label": "SPECIES", "start": 543, "end": 546 }, { "text": "antiretroviral", "label": "SPECIES", "start": 517, "end": 531 }, { "text": "T. cruzi trypomastigotes", "label": "SPECIES", "start": 1394, "end": 1418 }, { "text": "motile (flagellated) elements", "label": "SPECIES", "start": 1327, "end": 1356 }, { "text": "Chagas disease", "label": "SPECIES", "start": 1434, "end": 1448 }, { "text": "Chagas", "label": "SPECIES", "start": 1434, "end": 1440 }, { "text": "toxoplasmosis", "label": "SPECIES", "start": 1978, "end": 1991 }, { "text": "ART", "label": "SPECIES", "start": 2932, "end": 2935 }, { "text": "methicillin-resistant Staphylococcus aureus", "label": "SPECIES", "start": 2856, "end": 2899 }, { "text": "ART", "label": "SPECIES", "start": 3146, "end": 3149 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3041, "end": 3048 } ]

[ "REASON", "FOR", "CONSULTATION", "-", "A", "14-month-old", "infant", "came", "to", "the", "emergency", "department", "on", "15-03-20", "due", "to", "respiratory", "distress", ".", "-", "He", "had", "been", "suffering", "from", "catarrhal", "symptoms", "for", "a", "week", "with", "associated", "bronchospasm", "on", "treatment", "with", "salbutamol", "4", "puff", "every", "8", "hours", ".", "They", "report", "increased", "difficulty", "in", "the", "last", "few", "hours", ".", "REASON", "FOR", "CONSULTATION", "-", "Fever", "of", "37", ".", "7oC", "with", "isolated", "febrile", "peak", "of", "38oC", "in", "the", "last", "48", "hours", ".", "Some", "vomiting", "of", "mucous", "content", ",", "triggered", "by", "coughing", ".", "Normal", "stools", ".", "-", "Mother", "in", "isolation", "due", "to", "direct", "contact", "with", "COVID-19", ".", "PERSONAL", "HISTORY", "-", "Newborn", "at", "term", ".", "Normal", "neonatal", "period", ".", "-", "Virus-induced", "asthma", "being", "treated", "with", "salbutamol", "on", "demand", ".", "PHYSICAL", "EXAMINATION", "-", "On", "arrival", "at", "the", "emergency", "department", ",", "the", "patient", "'", "s", "O2", "Sat", ".", "O2", "of", "86", "%", "together", "with", "tachypnoea", "and", "universal", "tachypnoea", ".", "Ta", "37", ".", "5oC", ".", "-", "Acceptable", "general", "condition", ".", "Normal", "skin", "and", "mucosa", "colouring", ".", "No", "rash", "or", "petechiae", ".", "-", "AP", ":", "Acceptable", "bilateral", "air", "entry", "with", "scattered", "subcrepitant", ".", "-", "Rest", "of", "physical", "examination", "normal", ".", "COMPLEMENTARY", "EXPLORATIONS", "THORAX", "X-RAY", "Bilateral", "interstitial", "infiltrate", ".", "Retrocardiac", "alveolar", "infiltrate", ".", "Free", "costophrenic", "sinuses", ".", "-", "Venous", "gases", ":", "pH", "7", ".", "36", ",", "pCO2", "40", ".", "4", "mmHg", ",", "pO2", "40", ".", "9", "mmHg", ",", "Bicarbonate", "22", ".", "7", "mmol", "/", "L", ",", "Exc", "Base", "-", "2", ".", "4", "-", "PCR", "Influenza", "Virus", ":", "NEGATIVE", ".", "-", "PCR", "VRS", ":", "POSITIVE", "Due", "to", "COVID-19", "epidemic", "season", "and", "mother", "in", "contact", "with", "positive", "patient", ",", "SARS-CoV-2", "PCR", "is", "requested", ".", "EVOLUTION", "-", "On", "arrival", ",", "oxygen", "therapy", "was", "administered", "with", "a", "venturi", "mask", "at", "a", "flow", "rate", "of", "8", "bpm", "(", "FiO2", "31", "%", ")", ",", "as", "well", "as", "bronchodilator", "treatment", "(", "Salbutamol", "+", "Ipratropium", "Bromide", ")", "+", "Methylprednisolone", "at", "2mg", "/", "kg", "by", "mouth", ".", "-", "Hospitalisation", "was", "decided", "due", "to", "the", "need", "for", "additional", "oxygen", "therapy", "due", "to", "persistent", "hypoxaemia", ".", "-", "On", "admission", ",", "routine", "blood", "tests", "showed", "mild", "leukocytosis", "11310", "(", "5940N", "4160L", ")", ",", "CRP", ":", "8", ".", "7", "mg", "/", "L", ",", "LDH", "284", ",", "CK", "49", ",", "GPT", "12", ",", "glucose", "116", "and", "urea", "31", ".", "In", "the", "first", "24", "hours", "a", "NEGATIVE", "PCR", "result", "was", "obtained", "for", "SARS-CoV-2", ".", "-", "During", "admission", "he", "remained", "afebrile", ",", "on", "treatment", "with", "Ampicillin", "200mg", "/", "kg", "/", "day", "due", "to", "middle", "lobe", "infiltrate", ",", "as", "well", "as", "bronchodilator", "treatment", "(", "Salbutamol", "and", "Ipratropium", "bromide", ")", "in", "chamber", "together", "with", "methylprednisolone", "in", "a", "descending", "pattern", ".", "-", "He", "required", "high-flow", "oxygen", "therapy", "(", "maximum", "12", "l", ".", "p", ".", "m", ".", "with", "FiO2", "55", "%", ")", "to", "maintain", "saturations", "in", "range", ",", "which", "could", "be", "progressively", "lowered", "until", "discontinued", "48", "hours", "before", "discharge", ".", "Discharge", "on", "the", "third", "day", "of", "admission", "due", "to", "good", "evolution", ".", "DIAGNOSIS", "-", "Moderate", "asthmatic", "crisis", "secondary", "to", "RSV", "infection", ".", "-", "JMD", "pneumonia", ".", "TREATMENT", "-", "Salbutamol", ",", "with", "spacer", "chamber", "and", "mask", ",", "on", "demand", ".", "-", "Paracetamol", ",", "if", "fever", ".", "-", "Amoxicillin", "80mg", "/", "kg", "/", "day", "until", "completing", "7", "days", "of", "treatment", ".", "-", "Alarm", "guidelines", "and", "information", "sheet", "with", "recommendations", "are", "given", ".", "-", "Telephone", "monitoring", "of", "the", "evolution", "of", "the", "disease", "by", "the", "primary", "care", "paediatrician", "is", "indicated", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "infant", "label": "HUMAN", "start": 41, "end": 47 }, { "text": "Mother", "label": "HUMAN", "start": 490, "end": 496 }, { "text": "PERSONAL", "label": "HUMAN", "start": 548, "end": 556 }, { "text": "Newborn", "label": "HUMAN", "start": 567, "end": 574 }, { "text": "neonatal", "label": "HUMAN", "start": 591, "end": 599 }, { "text": "Virus", "label": "SPECIES", "start": 610, "end": 615 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 740, "end": 747 }, { "text": "Influenza Virus", "label": "SPECIES", "start": 1263, "end": 1278 }, { "text": "Virus", "label": "SPECIES", "start": 1273, "end": 1278 }, { "text": "VRS", "label": "SPECIES", "start": 1296, "end": 1299 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 1346, "end": 1352 }, { "text": "SARS-CoV-2", "label": "SPECIES", "start": 1387, "end": 1397 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1378, "end": 1385 }, { "text": "SARS-CoV-2", "label": "SPECIES", "start": 1954, "end": 1964 } ]

[ "Three", "and", "a", "half", "year", "old", "girl", "known", "to", "the", "clinic", "since", "birth", ".", "She", "has", "no", "family", "or", "perinatal", "history", "of", "note", ".", "Psychomotor", "and", "weight-bearing", "development", "within", "the", "normal", "range", ".", "Well", "vaccinated", "according", "to", "the", "official", "calendar", "of", "her", "Autonomous", "Community", ".", "She", "has", "also", "been", "vaccinated", "against", "pneumococcus", "c", "and", "rotavirus", ".", "Reason", "for", "consultation", "She", "presented", "in", "May", "2012", "with", "a", "fever", "of", "39o", "of", "24", "hours", "of", "evolution", ".", "The", "mother", "commented", "that", "her", "throat", "was", "sore", ".", "No", "other", "clinical", "manifestations", "were", "reported", ".", "-", "Doctor", ",", "the", "child", "suffers", "a", "lot", "from", "angina", ".", "I", "think", "she", "should", "be", "seen", "by", "a", "specialist", "\"", ",", "says", "the", "mother", ".", "The", "examination", "of", "the", "patient", "in", "consultation", "is", "that", "of", "a", "girl", "in", "good", "general", "condition", ",", "with", "no", "rashes", "or", "joint", "involvement", ",", "acp", ":", "normal", ",", "abdomen", "without", "visceromegaly", ",", "negative", "meningeal", "signs", ".", "The", "girl", "had", "painful", "subangulomandibular", "adenopathies", "and", "marked", "tonsillar", "hyperemia", "without", "clear", "exudation", ".", "No", "petechiae", "on", "the", "palate", ".", "No", "mouth", "ulcers", "are", "seen", ".", "-", "It", "'", "s", "always", "the", "throat", ",", "isn", "'", "t", "it", ",", "\"", "asks", "the", "mother", ".", "-", "Given", "the", "clinical", "and", "examination", "findings", "and", "doubts", "about", "the", "possible", "aetiology", "of", "the", "condition", ",", "it", "was", "decided", "to", "carry", "out", "a", "rapid", "Streptococcus", "pyogenes", "test", ",", "which", "was", "negative", ".", "-", "The", "mother", "was", "informed", "of", "the", "result", "and", "the", "attitude", "to", "follow", ":", "symptomatic", "treatment", "with", "antipyretic", "drugs", "and", "to", "notify", "her", "if", "the", "culture", "was", "positive", ".", "-", "She", "always", "tells", "me", "the", "same", "thing", ",", "but", "the", "child", "has", "had", "a", "very", "bad", "fever", "for", "4", "days", "without", "taking", "anything", ",", "when", "an", "antibiotic", "would", "cut", "these", "infections", "once", "and", "for", "all", ",", "\"", "complains", "the", "mother", ".", "We", "reviewed", "the", "patient", "'", "s", "medical", "history", "and", "found", "that", "since", "October", "2011", "she", "had", "consulted", "every", "month", "for", "the", "same", "symptoms", "and", "the", "same", "examination", "had", "been", "noted", "in", "the", "history", ",", "and", "the", "same", "throat", "test", "had", "been", "carried", "out", "at", "all", "the", "consultations", ",", "with", "negative", "results", ".", "It", "was", "decided", "at", "this", "point", "to", "assess", "these", "very", "regular", "consultations", "and", "doubts", "arose", "as", "to", "the", "possible", "underlying", "cause", ".", "The", "clinical", "history", "was", "reviewed", "to", "check", "that", "the", "child", "had", "not", "consulted", "for", "other", "conditions", ".", "She", "has", "not", "been", "admitted", "for", "infectious", "conditions", "or", "any", "other", "cause", ".", "NADA", ",", "these", "are", "the", "typical", "symptoms", "of", "children", "in", "the", "first", "year", "of", "school", ".", "A", "complete", "study", "of", "immunity", "in", "case", "it", "is", "an", "immunodeficiency", ".", "And", "a", "self-inflammatory", "disease", "?", "Refer", "to", "the", "ENT", "specialist", "as", "it", "is", "a", "clear", "candidate", "for", "surgery", ".", "It", "was", "decided", "at", "this", "consultation", "to", "carry", "out", "basic", "laboratory", "tests", "and", "a", "urine", "culture", ".", "At", "the", "mother", "'", "s", "insistence", ",", "she", "was", "referred", "to", "the", "ENT", "specialist", ".", "An", "appointment", "was", "made", "to", "review", "the", "history", "and", "see", "the", "results", ".", "Coinciding", "with", "the", "review", "of", "the", "analysis", "and", "the", "response", "from", "the", "ENT", "specialist", ",", "the", "girl", "presented", "a", "new", "case", "of", "fever", "with", "a", "focus", "in", "the", "throat", "similar", "to", "that", "of", "the", "last", "visit", ".", "A", "month", "has", "passed", ".", "Laboratory", "tests", "showed", "no", "significant", "alterations", "except", "for", "a", "slightly", "elevated", "TSH", ".", "Urine", "culture", "was", "negative", ".", "The", "mother", "reports", "the", "ENT", "response", ":", "these", "are", "normal", "processes", "and", "do", "not", "meet", "surgical", "criteria", ".", "The", "mother", "has", "already", "requested", "the", "antibiotic", "that", "she", "will", "need", "for", "the", "definitive", "cure", ".", "This", "time", "she", "will", "not", "leave", "without", "it", ".", "It", "was", "decided", "at", "this", "consultation", "to", "indicate", "treatment", "with", "prednisolone", "suspension", ":", "2", "mg", "/", "kg", "single", "dose", "and", "review", "of", "the", "child", "in", "24", "hours", ".", "The", "following", "day", ",", "the", "child", "was", "seen", "in", "the", "clinic", "and", "was", "found", "to", "be", "afebrile", "after", "treatment", "and", "in", "good", "general", "condition", ".", "This", "response", "to", "corticosteroids", "led", "us", "to", "reflect", "on", "the", "clinical", "picture", "and", "the", "management", "of", "this", "patient", "and", "the", "mother", "was", "informed", ".", "It", "was", "decided", "not", "to", "perform", "further", "tests", ".", "The", "girl", "fulfils", "the", "clinical", "criteria", "for", "the", "diagnosis", "known", "as", "PFAPA", "-", "syndrome", ".", "She", "consulted", "again", "for", "similar", "processes", "until", "January", "2013", ".", "There", "were", "still", "monthly", "episodes", "in", "which", "a", "Streptococcus", "pyogenes", "test", "was", "performed", ",", "which", "was", "negative", "in", "all", "cases", ".", "Prednisolone", "was", "prescribed", "with", "a", "similar", "response", ":", "fever", "remission", "in", "24", "hours", ".", "She", "did", "not", "present", "other", "intercurrent", "clinical", "processes", ".", "The", "child", "consulted", "during", "2013", "for", "three", "febrile", "episodes", "similar", "to", "those", "of", "2012", ",", "which", "were", "12", "in", "total", "(", "one", "per", "month", "after", "reviewing", "the", "history", ")", ".", "The", "mother", "agrees", "to", "perform", "a", "throat", "test", "when", "the", "examination", "is", "compatible", "with", "an", "ENT", "focus", ".", "She", "continues", "to", "be", "asymptomatic", "between", "processes", ".", "The", "mother", "'", "s", "pressure", "to", "request", "antibiotherapy", "has", "disappeared", "due", "to", "the", "child", "'", "s", "good", "response", "to", "treatment", "with", "corticosteroids", "in", "the", "febrile", "episodes", "of", "throat", "origin", "and", "negative", "cultures", "of", "tonsillar", "exudates", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "girl", "label": "HUMAN", "start": 26, "end": 30 }, { "text": "family", "label": "HUMAN", "start": 75, "end": 81 }, { "text": "pneumococcus c", "label": "SPECIES", "start": 299, "end": 313 }, { "text": "rotavirus", "label": "SPECIES", "start": 318, "end": 327 }, { "text": "vaccinated", "label": "SPECIES", "start": 187, "end": 197 }, { "text": "vaccinated", "label": "SPECIES", "start": 280, "end": 290 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 430, "end": 436 }, { "text": "specialist", "label": "HUMAN", "start": 599, "end": 609 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 621, "end": 627 }, { "text": "child", "label": "HUMAN", "start": 534, "end": 539 }, { "text": "girl", "label": "HUMAN", "start": 689, "end": 693 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 652, "end": 659 }, { "text": "girl", "label": "HUMAN", "start": 833, "end": 837 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 1038, "end": 1044 }, { "text": "Streptococcus pyogenes", "label": "SPECIES", "start": 1186, "end": 1208 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 1241, "end": 1247 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 1587, "end": 1593 }, { "text": "child", "label": "HUMAN", "start": 1441, "end": 1446 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1612, "end": 1619 }, { "text": "child", "label": "HUMAN", "start": 2055, "end": 2060 }, { "text": "children", "label": "HUMAN", "start": 2215, "end": 2223 }, { "text": "specialist", "label": "HUMAN", "start": 2369, "end": 2379 }, { "text": "ENT", "label": "HUMAN", "start": 2365, "end": 2368 }, { "text": "specialist", "label": "HUMAN", "start": 2571, "end": 2581 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 2522, "end": 2528 }, { "text": "ENT", "label": "HUMAN", "start": 2567, "end": 2570 }, { "text": "girl", "label": "HUMAN", "start": 2741, "end": 2745 }, { "text": "specialist", "label": "HUMAN", "start": 2725, "end": 2735 }, { "text": "ENT", "label": "HUMAN", "start": 2721, "end": 2724 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 2979, "end": 2985 }, { "text": "ENT", "label": "HUMAN", "start": 2998, "end": 3001 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 3080, "end": 3086 }, { "text": "child", "label": "HUMAN", "start": 3336, "end": 3341 }, { "text": "child", "label": "HUMAN", "start": 3379, "end": 3384 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 3603, "end": 3609 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3587, "end": 3594 }, { "text": "girl", "label": "HUMAN", "start": 3675, "end": 3679 }, { "text": "Streptococcus pyogenes", "label": "SPECIES", "start": 3862, "end": 3884 }, { "text": "child", "label": "HUMAN", "start": 4085, "end": 4090 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 4239, "end": 4245 }, { "text": "ENT", "label": "HUMAN", "start": 4321, "end": 4324 }, { "text": "mother", "label": "HUMAN", "start": 4390, "end": 4396 }, { "text": "child", "label": "HUMAN", "start": 4461, "end": 4466 } ]

[ "A", "61-year-old", "patient", "with", "the", "following", "personal", "history", ":", "infiltrating", "epidermoid", "carcinoma", "of", "the", "tonsil", "treated", "with", "chemotherapy", "and", "radiotherapy", ",", "currently", "free", "of", "disease", ",", "stroke", "without", "sequelae", ",", "mild", "carotid", "stenosis", "and", "active", "drinker", ".", "He", "came", "to", "the", "emergency", "department", "for", "diffuse", "abdominal", "pain", "and", "general", "malaise", "accompanied", "by", "a", "cough", "with", "rusty", "secretions", "of", "several", "days", "'", "duration", ".", "No", "fever", "or", "dysthermic", "sensation", "was", "reported", ".", "Examination", ":", "BP", ":", "70", "/", "40", "mmHg", ",", "HR", ":", "110", "bpm", ",", "SpO2", ":", "93", "%", "(", "FiO2", "0", ".", "6", ")", ",", "afebrile", ";", "poor", "general", "condition", ",", "cutaneomucous", "pallor", "with", "signs", "of", "poor", "distal", "perfusion", ";", "septic", "mouth", "with", "dental", "caries", "and", "bacterial", "plaque", "on", "the", "gums", ".", "Tachypnoea", "at", "rest", ",", "with", "shallow", "breathing", "with", "crackles", "in", "the", "right", "hemithorax", "and", "decreased", "vesicular", "murmur", "in", "the", "left", "base", ".", "Abdomen", "with", "no", "pathological", "findings", "despite", "being", "the", "initial", "reason", "for", "consultation", ".", "The", "rest", "of", "the", "examination", "was", "unremarkable", ".", "The", "electrocardiogram", "showed", "generalised", "concave", "ST", "elevation", ".", "In", "view", "of", "these", "findings", "and", "the", "poor", "haemodynamic", "improvement", "despite", "the", "administration", "of", "goal-guided", "fluid", "therapy", ",", "admission", "to", "the", "ICU", "for", "stabilisation", "was", "decided", ".", "A", "central", "venous", "line", "was", "cannulated", "and", "vasoactive", "therapy", "was", "started", "with", "noradrenaline", "at", "a", "dose", "of", "0", ".", "04", "ug", "/", "kg", "/", "min", ".", "A", "transthoracic", "echocardiogram", "was", "performed", "showing", "severe", "pericardial", "effusion", "with", "diastolic", "collapse", "of", "the", "right", "ventricle", ",", "compatible", "with", "tamponade", ".", "Differential", "diagnosis", "Generalised", "ST", "elevation", "of", "concave", "morphology", ",", "accompanied", "by", "infectious", "symptoms", ",", "should", "alert", "us", "to", "the", "presence", "of", "possible", "pericarditis", ".", "These", "ECG", "alterations", "together", "with", "the", "presence", "of", "pericardial", "effusion", "establish", "the", "diagnosis", "of", "pericarditis", "by", "fulfilling", "two", "of", "the", "four", "criteria", "proposed", "by", "the", "guidelines1", ".", "Non-infectious", "aetiologies", "of", "pericarditis", "include", "autoimmune", "diseases", ",", "inflammatory", "diseases", ",", "metabolic", "disorders", ",", "thoracic", "trauma", ",", "drugs", "and", "neoplasms", ",", "among", "the", "most", "frequent", ".", "The", "latter", "is", "important", "to", "take", "into", "consideration", "in", "our", "patient", ",", "in", "the", "context", "of", "possible", "metastatic", "disease", ",", "given", "the", "history", "of", "locally", "advanced", "squamous", "cell", "carcinoma", ".", "However", ",", "the", "rest", "of", "the", "a", "priori", "aetiologies", "could", "be", "ruled", "out", "in", "view", "of", "the", "clinical", "manifestations", "and", "the", "absence", "of", "personal", "and", "pharmacological", "antecedents", "to", "support", "them", ".", "The", "presence", "of", "infectious", "respiratory", "symptoms", ",", "as", "the", "most", "striking", "finding", ",", "associated", "with", "haemodynamic", "instability", ",", "makes", "us", "lean", "towards", "the", "group", "of", "infectious", "aetiologies", ".", "Within", "this", "group", "we", "highlight", ":", "-", "Viruses", ":", "Coxsackie", "virus", "B", "is", "known", "as", "the", "most", "common", "cause", "in", "the", "literature", ",", "especially", "in", "the", "paediatric", "population", ".", "However", ",", "according", "to", "the", "latest", "series", ",", "in", "adults", ",", "cytomegalovirus", ",", "herpes", "virus", "and", "HIV", "should", "be", "considered", "as", "the", "most", "common", "aetiologies2", ".", "Viruses", "are", "often", "associated", "with", "mild", "pericardial", "effusions", ",", "including", "HIV", "in", "the", "current", "era", "of", "new", "antiretroviral", "therapies", ".", "In", "addition", ",", "most", "of", "them", "have", "characteristic", "additional", "symptoms", "/", "signs", "(", "skin", "rashes", ",", "alterations", "in", "liver", "markers", "in", "hepatotropic", "viruses", ",", "gastrointestinal", "symptoms", ",", "etc", ".", ")", ",", "which", "could", "point", "to", "a", "specific", "aetiology", ".", "-", "Bacteria", ":", "Mycobacterium", "tuberculosis", "is", "one", "of", "the", "most", "frequent", "pathogens", "in", "this", "group", ".", "Although", "it", "accounts", "for", "only", "4", "%", "of", "all", "cases", "of", "pericarditis", "in", "developed", "countries", ",", "Spain", "is", "one", "of", "the", "countries", "with", "the", "highest", "incidence", "of", "tuberculosis", "in", "Europe", ".", "This", ",", "together", "with", "the", "high", "mortality", "that", "pericardial", "involvement", "by", "this", "microorganism", "would", "entail", "(", "25", "%", "at", "6", "months", "in", "the", "absence", "of", "HIV", "co-infection", ")", ",", "makes", "it", "necessary", "to", "take", "it", "into", "consideration", "in", "the", "differential", "diagnosis", ".", "Other", "less", "common", "bacteria", "(", "<", "1", "%", "of", "cases", ")", "causing", "purulent", "pericarditis", "include", "Staphylococcus", "sp", ",", "S", ".", "pneumoniae", ",", "Streptococcus", "sp", "and", "Haemophilus", "sp", ".", "They", "usually", "present", "as", "an", "acute", "illness", "characterised", "by", "high", "fever", ",", "present", "in", "most", "patients", ",", "tachycardia", ",", "cough", "and", "chest", "pain", "(", "regardless", "of", "the", "pathogen", "involved", "or", "the", "pathogenesis", "of", "the", "infection", ")", ".", "Patients", "are", "usually", "severely", "ill", ",", "although", "they", "may", "have", "an", "initially", "indolent", "course", ".", "Other", "pathogens", "are", "associated", "with", "more", "representative", "data", "that", "support", "the", "diagnosis", ",", "as", "is", "the", "case", "of", "cardiac", "involvement", "by", "Borrelia", "burgdorferi", ",", "in", "which", "case", "we", "would", "characteristically", "find", "alterations", "of", "the", "cardiac", "conduction", "system", "as", "an", "accompanying", "manifestation", "of", "pericarditis", ".", "In", "recurrent", "or", "prolonged", "pericarditis", ",", "Coxiella", "burnetii", "infection", "should", "be", "taken", "into", "account", "in", "the", "differential", "diagnosis", ",", "as", "it", "can", "characteristically", "present", "chronically", "as", "well", "as", "acutely", ".", "-", "Fungi", ":", "Aspergillus", "sp", ",", "Candida", "sp", ",", "among", "others", ",", "usually", "occur", "in", "severely", "immunosuppressed", "patients", "and", "are", "very", "rare", "even", "in", "this", "context", ".", "-", "Parasites", ":", "practically", "exceptional", ",", "to", "be", "taken", "into", "account", "depending", "on", "the", "patient", "'", "s", "epidemiology", ".", "Evolution", "Parasternal", "pericardiocentesis", "was", "performed", "and", "a", "total", "of", "1450", "ml", "of", "purulent", "material", "came", "out", ",", "and", "samples", "were", "collected", "for", "pathological", "anatomy", ",", "microbiology", "and", "clinical", "analysis", ".", "In", "view", "of", "these", "findings", ",", "after", "drawing", "blood", "and", "urine", "cultures", ",", "Meropenem", "1", "gram", "/", "8", "hours", "+", "linezolid", "600", "mg", "/", "12", "hours", "was", "started", ",", "taking", "into", "account", "the", "clinical", "instability", "with", "little", "improvement", "to", "the", "measures", "initially", "established", ".", "After", "these", "measures", ",", "he", "improved", "clinically", "and", "haemodynamically", "in", "the", "following", "hours", ",", "allowing", "the", "reduction", "of", "vasoactive", "therapy", ".", "The", "results", "of", "the", "laboratory", "tests", "taken", "in", "the", "emergency", "department", "were", "received", ",", "highlighting", ":", "a", ")", "Biochemistry", ":", "CRP", "312", ".", "1", "mg", "/", "L", ",", "Procalcitonin", "35", ".", "86", "ng", "/", "mL", ",", "NT-proBNP", "12", ",", "620", "pg", "/", "mL", ",", "Troponin", "I", "(", "high", "sensitivity", ")", "50", ".", "2", "pg", "/", "mL", ",", "creatinine", "2", ".", "03", "mg", "/", "dL", ",", "electrolytes", "without", "significant", "alterations", ";", "b", ")", "Haemocytes", ":", "31", ",", "900", "leukocytes", "/", "μL", "with", "91", ".", "5", "%", "neutrophils", ",", "haemoglobin", "8", ".", "8", "g", "/", "dL", ",", "546", ",", "000", "platelets", "/", "μL", ";", "c", ")", "Coagulation", ":", "prothrombin", "time", "56", ".", "4", "%", ",", "INR", "1", ".", "42", ",", "TPTA", "38", ".", "2s", "and", "fibrinogen", "538", ".", "2", "mg", "/", "dL", ";", "e", ")", "Venous", "blood", "gases", ":", "pH", "7", ".", "22", "pCO2", "59", "HCO3", "24", ".", "1", "lactic", "acid", "7", ".", "5", ";", "f", ")", "Pericardial", "fluid", ":", "300", ",", "000", "red", "blood", "cells", "/", "μL", ",", "92", ",", "360", "leukocytes", "/", "μL", "(", "polymorphonuclear", "90", "%", ";", "mononuclear", "10", "%", ")", ",", "glucose", "0", "mg", "/", "dL", ",", "total", "protein", "4", ".", "2", "g", "/", "dL", ".", "Chest", "X-ray", "showed", "evidence", "of", "cardiomegaly", "with", "no", "masses", "or", "condensation", "in", "the", "lung", "parenchyma", ".", "These", "findings", "supported", "the", "diagnosis", "of", "septic", "shock", "with", "purulent", "pericarditis", ".", "After", "21", "hours", "of", "admission", "to", "the", "ICU", ",", "and", "despite", "initial", "improvement", ",", "the", "patient", "presented", "cardiorespiratory", "arrest", "in", "asystole", "after", "extreme", "bradycardia", ".", "Advanced", "life", "support", "manoeuvres", "were", "started", "and", "control", "echocardiography", "was", "performed", "during", "the", "same", ",", "which", "ruled", "out", "new", "tamponade", "and", "post-puncture", "complications", ",", "without", "showing", "blood-tinged", "drainage", "or", "greater", "purulent", "debit", ".", "The", "patient", "finally", "died", ".", "Subsequently", ",", "blood", "cultures", "isolated", "multisensitive", "Streptococcus", "constellatus", "and", "the", "pericardial", "fluid", "culture", "was", "negative", ".", "However", ",", "the", "anatomopathological", "results", "of", "the", "fluid", "show", "abundant", "polymorphous", "leukocytes", ",", "mainly", "mature-looking", "lymphocytes", "and", "neutrophils", ",", "with", "no", "signs", "of", "malignancy", ",", "which", "would", "support", "the", "diagnosis", "of", "bacterial", "aetiology", "of", "the", "process", ".", "Final", "diagnosis", "Purulent", "pericarditis", "probably", "secondary", "to", "Streptococcus", "constellatus", "." ]

[ 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 0, 3, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 14, "end": 21 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 41, "end": 49 }, { "text": "bacterial", "label": "SPECIES", "start": 640, "end": 649 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2032, "end": 2039 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 2274, "end": 2282 }, { "text": "Coxsackie virus B", "label": "SPECIES", "start": 2555, "end": 2572 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 2753, "end": 2756 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 2883, "end": 2886 }, { "text": "adults", "label": "HUMAN", "start": 2711, "end": 2717 }, { "text": "antiretroviral", "label": "SPECIES", "start": 2913, "end": 2927 }, { "text": "cytomegalovirus", "label": "SPECIES", "start": 2719, "end": 2734 }, { "text": "herpes virus", "label": "SPECIES", "start": 2736, "end": 2748 }, { "text": "population", "label": "HUMAN", "start": 2655, "end": 2665 }, { "text": "virus", "label": "SPECIES", "start": 2565, "end": 2570 }, { "text": "virus", "label": "SPECIES", "start": 2743, "end": 2748 }, { "text": "hepatotropic viruses", "label": "SPECIES", "start": 3057, "end": 3077 }, { "text": "Bacteria", "label": "SPECIES", "start": 3158, "end": 3166 }, { "text": "bacteria", "label": "SPECIES", "start": 3673, "end": 3681 }, { "text": "Borrelia burgdorferi", "label": "SPECIES", "start": 4230, "end": 4250 }, { "text": "Coxiella burnetii", "label": "SPECIES", "start": 4434, "end": 4451 }, { "text": "Haemophilus sp", "label": "SPECIES", "start": 3790, "end": 3804 }, { "text": "Mycobacterium tuberculosis", "label": "SPECIES", "start": 3168, "end": 3194 }, { "text": "Staphylococcus sp", "label": "SPECIES", "start": 3735, "end": 3752 }, { "text": "Streptococcus sp", "label": "SPECIES", "start": 3769, "end": 3785 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 3556, "end": 3559 }, { "text": "Parasites", "label": "SPECIES", "start": 4736, "end": 4745 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 6383, "end": 6390 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 6703, "end": 6710 }, { "text": "Streptococcus constellatus", "label": "SPECIES", "start": 6778, "end": 6804 } ]

[ "A", "47-year-old", "woman", "with", "a", "history", "of", "severe", ",", "colicky", ",", "hypogastric", "abdominal", "pain", ",", "of", "approximately", "18", "days", "'", "duration", ",", "consulted", "for", "a", "history", "of", "colicky", ",", "hypogastric", "abdominal", "pain", ".", "She", "was", "studied", "with", "stool", "culture", ",", "faecal", "leucocytes", ",", "serology", "for", "yersinia", ",", "and", "colonoscopy", ",", "all", "within", "normal", "limits", ".", "Computed", "tomography", "(", "CT", ")", "of", "the", "abdomen", "and", "pelvis", "showed", "findings", "compatible", "with", "distal", "ileitis", "associated", "with", "dilatation", "of", "proximal", "bowel", "loops", "and", "uterine", "fibroids", ";", "given", "the", "good", "clinical", "evolution", ",", "she", "was", "discharged", "with", "symptomatic", "management", "and", "antibiotic", "treatment", ".", "Patient", "consults", "again", "10", "days", "later", ",", "for", "a", "picture", "of", "similar", "characteristics", "to", "the", "previous", "one", ",", "with", "more", "intense", "pain", ",", "associated", "with", "marked", "abdominal", "distension", ",", "decreased", "gas", "elimination", "and", "constipation", "of", "2", "days", "of", "evolution", ",", "so", "new", "CT", "scan", "of", "abdomen", "and", "pelvis", "is", "performed", ".", "Diagnosis", ":", "Endometriosis", "of", "the", "distal", "ileum", ",", "a", "rare", "cause", "of", "intestinal", "obstruction", ".", "The", "CT", "scan", "showed", "parietal", "thickening", "of", "the", "distal", "ileum", ",", "compatible", "with", "ileitis", ",", "with", "greater", "secondary", "dilatation", "of", "the", "proximal", "small", "intestine", ".", "The", "abdominal", "pain", "coincided", "with", "the", "onset", "of", "the", "menstrual", "cycle", "in", "both", "consultations", ".", "When", "assessed", "by", "gynaecology", ",", "the", "patient", "reported", "severe", "dysmenorrhoea", ",", "disabling", "dyspareunia", ",", "chronic", "cyclical", "pelvic", "pain", "in", "relation", "to", "menstruation", "and", "the", "existence", "of", "a", "sister", "diagnosed", "with", "endometriosis", ".", "Given", "this", "history", "and", "the", "findings", "of", "the", "radiological", "studies", ",", "the", "diagnosis", "of", "intestinal", "endometriosis", "was", "suggested", "and", "it", "was", "decided", "to", "complement", "the", "study", "with", "computed", "tomography", "enteroclysis", "(", "CT", ")", ",", "which", "showed", "eccentric", "massive", "thickening", "at", "the", "level", "of", "the", "distal", "ileum", ",", "associated", "with", "an", "adjacent", "cystic", "lesion", ",", "with", "haemorrhagic", "content", "and", "signs", "of", "partial", "obstruction", "of", "the", "small", "intestine", ",", "which", "corresponds", "as", "a", "first", "possibility", "to", "a", "focus", "of", "endometriosis", ".", "Given", "these", "findings", ",", "surgical", "resolution", "was", "decided", ",", "which", "consisted", "of", "laparoscopic", "resection", "of", "the", "terminal", "ileum", "and", "cecum", ",", "with", "subsequent", "entero-colic", "anastomosis", ".", "Pathological", "anatomy", "showed", "a", "segment", "of", "ileum", "with", "multifocal", "endometriosis", "in", "the", "tunica", "muscularis", "propria", "and", "subserosa", ",", "associated", "with", "peri-ileal", "endometriomas", "." ]

[ 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 14, "end": 19 }, { "text": "yersinia", "label": "SPECIES", "start": 251, "end": 259 }, { "text": "Patient", "label": "HUMAN", "start": 584, "end": 591 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1237, "end": 1244 }, { "text": "sister", "label": "HUMAN", "start": 1379, "end": 1385 } ]

[ "A", "53", "year", "old", "man", "was", "admitted", "to", "the", "Cardiac", "Intensive", "Care", "Unit", "(", "CICU", ")", "after", "recovering", "from", "cardiorespiratory", "arrest", "in", "the", "street", ".", "Personal", "history", "Arterial", "hypertension", "under", "treatment", "with", "enalapril", "20", "mg", ".", "Type", "2", "diabetes", "mellitus", "being", "treated", "with", "metformin", ".", "Hyperuricaemia", "with", "several", "episodes", "of", "gouty", "arthritis", ".", "On", "treatment", "with", "allopurinol", ".", "Present", "illness", "Witnesses", "report", "that", ",", "while", "working", "(", "cook", ")", "and", "without", "reporting", "any", "previous", "symptoms", ",", "he", "fainted", "with", "loss", "of", "consciousness", ".", "After", "the", "initial", "approach", "by", "the", "witnesses", ",", "112", "was", "contacted", ",", "the", "absence", "of", "breathing", "or", "signs", "of", "life", "was", "detected", "and", "basic", "cardiopulmonary", "resuscitation", "manoeuvres", "were", "started", ".", "After", "7", "minutes", ",", "following", "the", "arrival", "of", "Basic", "Life", "Support", "(", "112", ")", ",", "a", "defibrillable", "rhythm", "is", "detected", "by", "AED", ".", "Up", "to", "4", "shocks", "with", "the", "corresponding", "30", ":", "2", "cycles", "were", "applied", "together", "with", "2", "boluses", "of", "adrenaline", "and", "300", "mg", "of", "amiodarone", ".", "After", "the", "fourth", "shock", "the", "patient", "recovered", "sinus", "rhythm", "at", "92", "bpm", "and", "was", "transferred", "to", "the", "CICU", "sedated", ",", "intubated", "and", "connected", "to", "mechanical", "ventilation", ".", "Physical", "examination", "Sedoanalgesia", ".", "RASS", "-", "4", ".", "Pupils", "isochoric", ",", "miotic", "and", "reactive", ".", "BP", "95", "/", "45", ";", "HR", "125", "bpm", ";", "peripheral", "O2", "saturation", "100", "%", "with", "FiO2", "of", "100", "%", ".", "Rhythmic", ",", "tachycardic", "heart", "sounds", "without", "murmurs", ".", "Bladder", "murmur", "preserved", "bilaterally", ".", "Abdomen", "slightly", "distended", "and", "tympanic", ".", "Bowel", "sounds", "present", ".", "Lower", "limbs", "without", "oedema", "and", "bilateral", "pulses", "present", "and", "symmetrical", ".", "COMPLEMENTARY", "TESTS", "CBC", ":", "haemoglobin", "14", ".", "5", "g", "/", "dl", ";", "leucocytes", "12", ",", "900", "(", "36", "%", "N", ")", ";", "platelets", "191", ".", "000", ";", "prothrombin", "activity", "100", "%", ";", "creatinine", "1", ".", "2", "mg", "/", "dl", ";", "GFR", "(", "MDRD-4", ")", "67", "ml", "/", "min", ";", "glucose", "293", "mg", "/", "dl", ";", "BUN", "17", "U", "/", "L", ";", "sodium", "142", "mee", "/", "l", ";", "potassium", "3", ".", "9", "meq", "/", "l", ";", "GOT", "197", "U", "/", "l", ";", "GPT", "159", "U", "/", "L", ";", "troponin", "I", "0", ".", "045", "ng", "/", "ml", ";", "NT-proBNP", "636", "pg", "/", "ml", ";", "CRP", "<", "5", "mg", "/", "l", ".", "Peak", "troponin", "I", ":", "3", "ng", "/", "ml", ".", "Urine", "toxicity", ":", "cocaine", ",", "amphetamines", ",", "cannabis", "negative", ".", "Chest", "X-ray", ":", "slight", "increase", "in", "cardiothoracic", "index", ".", "No", "evidence", "of", "infiltrates", ".", "Endotracheal", "tube", "is", "centred", "and", "normally", "positioned", ".", "A-B", "balance", "on", "arrival", ":", "pH", "7", ".", "34", ";", "pO2", "427", ";", "pCO2", "48", ";", "HCO3", "25", ".", "9", ";", "lactic", "7", ".", "6", "mmol", "/", "l", ".", "Transthoracic", "echocardiography", ":", "slightly", "hypertrophic", "left", "ventricle", "with", "segmental", "alterations", "of", "contractility", ".", "Moderately", "reduced", "left", "ventricular", "systolic", "function", ".", "Prolonged", "relaxation", "of", "the", "normal", "ventricle", "with", "normal", "systolic", "function", ".", "Cranial", "CT", ":", "no", "significant", "alterations", "in", "brain", "parenchymal", "density", ".", "Ventricular", "system", "of", "normal", "size", "and", "morphology", ",", "without", "displacements", "with", "respect", "to", "the", "midline", ".", "No", "signs", "of", "intracranial", "bleeding", "were", "observed", ".", "Cardiac", "magnetic", "resonance", ":", "non-dilated", "left", "ventricle", "with", "moderate", "left", "ventricular", "dysfunction", ".", "Intramyocardial", "patchy", "intramyocardial", "enhancement", "in", "anterior", "and", "posterior", "mid-apical", "face", ".", "Findings", "compatible", "with", "acute", "myocarditis", ".", "EVOLUTION", "The", "patient", "was", "admitted", "to", "the", "CICU", "and", "femoral", "venous", "access", "was", "channelled", "for", "induced", "hypothermia", "for", "the", "first", "24", "hours", "at", "33", "°", "C", ".", "He", "was", "kept", "sedated", "and", "anaesthetised", ".", "He", "remained", "sedated", "and", "relaxed", ",", "with", "a", "tendency", "to", "bradycardia", "and", "arterial", "hypotension", ".", "Internal", "environment", "is", "corrected", ",", "achieving", "normalisation", "of", "lactacidemia", "and", "pH", ".", "After", "24", "hours", "of", "hypothermia", ",", "progressive", "rewarming", ",", "withdrawal", "of", "relaxation", "and", "gradual", "suspension", "of", "sedation", "was", "started", ".", "Seventy-two", "hours", "after", "admission", ",", "the", "patient", "presented", "with", "abnormal", "movements", ",", "such", "as", "shivering", ",", "coinciding", "with", "an", "increase", "in", "temperature", "(", "38", "°", "C", ")", ",", "for", "which", "reason", "an", "EEG", "was", "requested", ",", "which", "ruled", "out", "the", "presence", "of", "status", "convulsus", ".", "Antibiotic", "therapy", "was", "intensified", "(", "ceftriaxone", "+", "clindamycin", ")", "after", "finding", "a", "right", "basal", "infiltrate", "on", "X-ray", ",", "probably", "related", "to", "aspiration", "during", "intubation", ".", "Weaning", "progressed", "to", "extubation", "on", "the", "5th", "day", ".", "The", "cranial", "CT", "scan", "after", "extubation", "showed", "no", "alterations", "of", "interest", ".", "Monitoring", "in", "the", "CICU", "detected", "the", "presence", "of", "ventricular", "extrasystoles", "without", "sustained", "arrhythmias", ".", "Coronary", "angiography", "showed", "coronary", "arteries", "free", "of", "significant", "obstructive", "lesions", ".", "Once", "on", "the", "hospital", "ward", ",", "he", "remained", "in", "asymptomatic", "rehabilitation", ".", "Cardiac", "magnetic", "resonance", "imaging", "showed", "patchy", "intramyocardial", "uptake", "compatible", "with", "myocarditis", "and", "left", "ventricular", "function", "was", "moderately", "depressed", "(", "38", "%", ")", ".", "Two", "weeks", "after", "admission", ",", "a", "single-chamber", "ICD", "was", "implanted", ",", "without", "incident", ",", "for", "secondary", "prevention", "of", "sudden", "death", "secondary", "to", "cardiomyopathy", "due", "to", "myocarditis", ".", "DIAGNOSIS", "Cardiorespiratory", "arrest", "recovered", ".", "Aspirative", "pneumonia", ".", "Cardiomyopathy", "secondary", "to", "myocarditis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Personal", "label": "HUMAN", "start": 136, "end": 144 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 950, "end": 957 }, { "text": "cook", "label": "HUMAN", "start": 411, "end": 415 }, { "text": "Witnesses", "label": "HUMAN", "start": 373, "end": 382 }, { "text": "witnesses", "label": "HUMAN", "start": 535, "end": 544 }, { "text": "cannabis", "label": "SPECIES", "start": 1856, "end": 1864 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2809, "end": 2816 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3317, "end": 3324 } ]

[ "", "A", "69-year-old", "patient", "attended", "the", "emergency", "department", "of", "the", "main", "hospital", "of", "a", "town", "in", "the", "\"", "red", "zone", "\"", "in", "Lombardy", "(", "Italy", ")", ".", "He", "reported", "worsening", "dyspnoea", ",", "persistent", "cough", "and", "weakness", ",", "of", "four", "days", "'", "evolution", ".", "A", "chest", "CT", "scan", "showed", "diffuse", "bilateral", "interstitial", "inflammation", "with", "subpleural", "consolidations", ".", "Nasopharyngeal", "swab", "was", "positive", "for", "COVID-19", "by", "real-time", "RT-PCR", "assay", ".", "Laboratory", "tests", "showed", "high", "inflammatory", "markers", "and", "lymphocytopenia", "(", "white", "blood", "cell", "count", "23080", "/", "mm3", ",", "neutrophils", "91", ".", "4", "%", ",", "lymphocytes", "1", ".", "4", "%", ",", "C-reactive", "protein", "52", ".", "7", "mg", "/", "L", ")", "and", "increased", "hs-TnI", "(", "4332", "ng", "/", "L", ")", ".", "Arterial", "blood", "gases", "showed", "severe", "metabolic", "acidosis", ",", "with", "hyperlactoacidemia", "(", "pH", "7", ".", "2", ";", "base", "excess", "-", "6", "mEq", "/", "L", ",", "lactate", "9", "mmol", "/", "dL", ")", "and", "hypoxemia", ".", "Non-invasive", "ventilation", "was", "started", ".", "First", "echocardiography", "showed", "left", "ventricular", "dilatation", "(", "LV", "end-diastolic", "diameter", "56", "mm", ")", ",", "severe", "and", "diffuse", "LV", "hypokinesia", "(", "LV", "ejection", "fraction", "34", "%", ")", ".", "Three", "hours", "later", ",", "the", "LV", "ejection", "fraction", "dropped", "to", "25", "%", "and", "the", "cardiac", "index", "was", "1", ".", "4", "L", "/", "min", "/", "m2", ".", "Coronary", "angiography", "findings", "were", "unremarkable", ".", "An", "aortic", "counterpulsation", "balloon", "was", "placed", ",", "in", "addition", "to", "adrenaline", "(", "0", ".", "07", "microgram", "/", "kg", "/", "min", ")", ",", "and", "noradrenaline", "(", "0", ".", "1", "microgram", "/", "kg", "/", "min", ")", "was", "added", "because", "of", "worsening", "hypotension", "(", "systolic", "blood", "pressure", ":", "80", "/", "67", "/", "60", "mmHg", ")", ".", "The", "mobile", "team", "of", "our", "third", "level", "centre", "with", "extracorporeal", "membrane", "oxygenation", "(", "ECMO", ")", "was", "activated", "for", "application", "of", "ECMO-VA", "and", "transfer", "of", "the", "patient", "to", "our", "hospital", ".", "After", "application", "of", "ECMO", ",", "the", "patient", "presented", "clear", "and", "sudden", "desaturation", "requiring", "orotracheal", "intubation", ".", "On", "admission", "to", "our", "ICU", ",", "due", "to", "the", "maintenance", "of", "minimal", "ventricular", "ejection", "and", "aortic", "orifice", ",", "inotropic", "support", "was", "gradually", "decreased", "and", "finally", "withdrawn", "to", "avoid", "myocardial", "adrenergic", "stimulation", ".", "EMB", "was", "performed", "and", "a", "venous", "catheter", "was", "placed", "in", "the", "right", "jugular", "vein", "because", "of", "persistent", "severe", "hypoxaemia", ",", "thus", "switching", "from", "ECMO-VA", "to", "ECMO-VAV", ".", "LV", "activity", "progressively", "returned", "to", "normal", "values", "on", "day", "5", ",", "when", "ECMO", "and", "aortic", "balloon", "counterpulsation", "were", "removed", ".", "Twelve", "days", "after", "ECMO", "removal", ",", "the", "patient", "suddenly", "developed", "gram-negative", "pneumonia", "(", "Pseudomonas", "aeruginosa", "and", "Klebsiella", "pneumoniae", ")", "and", "died", "of", "septic", "shock", "within", "a", "few", "hours", ",", "without", "any", "alteration", "of", "LV", "activity", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 4, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Klebsiella pneumoniae", "label": "SPECIES", "start": 2195, "end": 2216 }, { "text": "Pseudomonas aeruginosa", "label": "SPECIES", "start": 2168, "end": 2190 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 15, "end": 22 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1453, "end": 1460 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1509, "end": 1516 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2116, "end": 2123 }, { "text": "gram-negative", "label": "SPECIES", "start": 2143, "end": 2156 } ]

[ "Anamnesis", "A", "61-year-old", "male", "smoker", "of", "1", "pack", "/", "day", "(", "he", "has", "smoked", "up", "to", "3", "packs", "/", "day", ")", "for", "more", "than", "40", "years", "and", "an", "occasional", "drinker", ",", "with", "a", "history", "of", ":", "dyslipidaemia", ",", "glaucoma", "for", "the", "last", "two", "years", "being", "followed", "up", "by", "Ophthalmology", ",", "and", "cervical", "and", "lumbar", "hernias", "treated", "conservatively", ",", "with", "discharge", "by", "Neurosurgery", ".", "He", "was", "admitted", "urgently", "to", "prioritise", "studies", "from", "the", "Internal", "Medicine", "Outpatient", "Clinic", "after", "being", "diagnosed", "with", "a", "probable", "Masquerade", "Syndrome", "in", "Ophthalmology", ",", "having", "to", "rule", "out", "as", "a", "first", "option", "that", "this", "was", "a", "neoplastic", "manifestation", "of", "a", "primary", "tumour", ".", "In", "June", "2013", ",", "the", "patient", "lost", "part", "of", "the", "vision", "in", "his", "right", "eye", ",", "without", "being", "assessed", "until", "January", "2014", ",", "at", "which", "time", "he", "was", "referred", "to", "the", "retina", "specialist", ",", "who", "diagnosed", "him", "with", "probable", "Masked", "Syndrome", "in", "February", "of", "the", "current", "year", "with", "VA", "of", "the", "OD", "of", "0", ".", "7", "out", "of", "1", ".", "During", "this", "entire", "period", "of", "time", ",", "his", "vision", "has", "not", "changed", "with", "respect", "to", "the", "loss", "during", "the", "month", "of", "June", ".", "It", "is", "noteworthy", "that", "the", "patient", "is", "totally", "asymptomatic", "from", "any", "point", "of", "view", ".", "No", "asthenia", ",", "hyporexia", "or", "weight", "loss", "in", "recent", "months", ".", "No", "B", "symptoms", ".", "He", "does", "not", "report", "travelling", "abroad", ",", "new", "drug", "intake", ",", "contact", "with", "animals", "or", "risky", "sexual", "relations", ".", "Physical", "examination", "Good", "general", "condition", ".", "Vigilant", ",", "oriented", "and", "cooperative", ".", "Eupneic", "at", "rest", ".", "Tolerates", "decubitus", ".", "Brown", "skin", "colour", ".", "Normohydrated", "and", "normoperfused", ".", "BP", "120", "/", "70", ".", "HR", "60", "bpm", ".", "Basal", "O2", "sat", "98", "%", ".", "Afebrile", ".", "Weight", "73", ".", "4", "kg", ".", "Height", "1", ".", "83", "m", "(", "BMI", "25", ".", "86", ")", ".", "CYC", "and", "oropharynx", "without", "findings", ".", "Cardiopulmonary", "auscultation", ":", "normal", ".", "Abdomen", ":", "no", "findings", ".", "Lower", "extremities", ":", "no", "findings", ".", "Neurological", "examination", ":", "no", "focality", "or", "other", "pathological", "findings", ".", "In", "conclusion", ":", "examination", "within", "the", "normal", "range", ".", "Complementary", "tests", "The", "study", "began", "with", "the", "following", "tests", ":", "-", "Blood", "count", ":", "normal", ".", "Normal", "ESR", ".", "CRP", "7", ".", "8", "mg", "/", "l", "(", "normal", "between", "0-5", ")", ".", "-", "Blood", "smear", ":", "no", "significant", "morphological", "alterations", ".", "-", "Coagulation", ":", "within", "normal", "limits", ".", "-", "Biochemistry", ":", "creatinine", "1", ".", "62", "mg", "/", "dl", "(", "normal", "between", "0", ".", "6-1", ".", "4", ")", ";", "filtration", "46", "ml", "/", "min", "(", "normal", "sup", "60", ")", ";", "rest", "of", "hepatorenal", "profile", "within", "normality", ".", "Cortisol", "normal", ".", "Normal", "PSA", ".", "ACE", "60", "IU", "/", "l", "(", "0-50", "normal", ")", ".", "-", "Immunoglobulins", ":", "Ig", "A", "78", ".", "4", "mg", "/", "dl", "(", "normal", "between", "90-410", ")", "and", "Ig", "M", "717", "mg", "/", "dl", "(", "normal", "between", "55-350", ")", ".", "Ig", "G", "normal", ".", "Proteinogram", ":", "normal", ".", "-", "Serology", ":", "RPR", "negative", ".", "Toxoplasma", "gondii", "Ig", "G", "32", ".", "8", "IU", "/", "ml", "(", "positive", "sup", "9", ".", "9", ")", "and", "IgM", "negative", ".", "HIV", ",", "B", "and", "C", "viruses", "negative", ".", "EBV", "Ig", "G", "232", "U", "/", "ml", "(", "positive", "sup", "20", ")", "and", "Ig", "M", "negative", ".", "CMV", "IgG", "positive", "47", ".", "8", "U", "/", "ml", "(", "positive", "sup", "14", ")", "and", "Ig", "M", "negative", ".", "-", "Autoimmunity", ":", "ANA", ",", "antiDNA", ",", "antiSm", ",", "antiRo", "and", "antiLa", "negative", ".", "Rheumatoid", "factor", ":", "normal", ".", "-", "24-hour", "urine", ":", "creatinine", "clearance", "54", ".", "75", "ml", "/", "min", ".", "Calcium", "29", ".", "90", "mg", "/", "24h", ".", "Calcium", "/", "creatinine", "24", ".", "47", "mgCa", "/", "gCre", "(", "both", "low", ")", ".", "Urine", "culture", "and", "urine", "fungal", "culture", ":", "negative", ".", "-", "Chest", "X-ray", ":", "emphysematous", "chest", ".", "Cardiothoracic", "index", "normal", ".", "Normal", "hilae", ".", "Free", "costophrenic", "sinuses", ".", "No", "obvious", "pathological", "parenchymal", "parenchymal", "images", ".", "-", "Mantoux", ":", "negative", ".", "-", "Abdominal", "CT", "scan", ":", "mass-conglomerate", "of", "adenomegaly", "in", "the", "subcarinal", "region", "-", "oesophageal", "pleuroacic", "recess", ",", "hilar", "adenomegaly", "and", "in", "the", "right", "basal", "pyramid", ".", "Spiculated", ",", "solid", "nodule", "in", "the", "right", "middle", "lobe", ".", "Largest", "diameter", "21", "mm", ".", "Bilateral", "hepatic", "punctate", "hypodensities", ".", "Possible", "millimetric", "cysts", ".", "Image", "compatible", "with", "angioma", "of", "10", "mm", "in", "segment", "seven", ".", "Images", "of", "adenomas", "in", "both", "adrenals", ".", "Normal", "right", "kidney", ".", "Left", "renal", "hydronephrosis", "with", "very", "thinned", "cortical", "cortex", "produced", "by", "intraureteral", "mass", "of", "6", "cm", "in", "length", ".", "Pulmonary", "neoplasm", "with", "mediastinal", "adenomegaly", "and", "/", "or", "metastasis", "of", "a", "duct", "tumour", "should", "be", "ruled", "out", ".", "-", "Abdominal", "ultrasound", ":", "Left", "kidney", "with", "high-grade", "hydronephrosis", ",", "with", "great", "dilatation", "of", "the", "proximal", "ureter", ",", "calcific", "hydronephrotic", "balls", "and", "parenchymal", "atrophy", ".", "No", "free", "fluid", ".", "Rest", "of", "structures", "within", "normality", ".", "-", "Cranial", "MRI", ":", "midline", "preserved", ".", "A", "multitude", "of", "rounded", "lesions", "of", "high", "intensity", "T2", "and", "low", "T1", "can", "be", "seen", ".", "The", "largest", "of", "them", "has", "a", "diameter", "of", "9mm", ".", "They", "are", "located", "in", "both", "cerebral", "hemispheres", ",", "cerebellar", "vermis", ",", "right", "cerebellar", "hemisphere", "and", "brainstem", ".", "Many", "of", "them", "show", "minimal", "perilesional", "oedema", "in", "the", "FLAIR", "sequence", ".", "Notable", "thickening", "(", "3", ".", "8mm", ")", "of", "the", "posterior", "pole", "of", "the", "right", "eyeball", "in", "probable", "relation", "to", "the", "chorio-retinitis", "mentioned", ".", "Findings", "suggestive", "of", "multiple", "brain", "metastases", ",", "especially", "after", "thoraco-abdominal", "CT", "scan", ".", "Diagnosis", "Mascarada", "syndrome", "(", "diffuse", "choroiditis", "+", "papillitis", ")", "as", "the", "first", "manifestation", "of", "a", "tumour", "of", "the", "left", "urinary", "tract", "with", "pulmonary", "and", "CNS", "metastases", ".", "Treatment", "and", "evolution", "After", "more", "than", "10", "days", "in", "Internal", "Medicine", ",", "with", "the", "hydronephrosis", "caused", "by", "the", "ureteral", "lesion", "visualised", "by", "ultrasound", "and", "in", "view", "of", "the", "deterioration", "of", "renal", "function", ",", "it", "was", "decided", "to", "transfer", "him", "to", "Urology", ".", "Urology", "performed", "ureteroscopy", "and", "biopsies", ".", "She", "was", "discharged", "a", "week", "after", "being", "in", "charge", "of", "Urology", ",", "with", "a", "permeable", "nephrostomy", "catheter", ",", "with", "persistence", "and", "even", "slight", "worsening", "of", "renal", "failure", "(", "Cr", "1", ".", "86", "and", "FG", "39", ")", ",", "being", "haemodynamically", "stable", ",", "afebrile", "and", "with", "clear", "urine", ".", "Ten", "days", "after", "discharge", ",", "the", "results", "of", "the", "pathological", "anatomy", "were", "obtained", ",", "which", "reported", "compatibility", "of", "the", "samples", "with", "a", "tumour", "of", "urothelial", "origin", "through", "ureteral", "lavage", ".", "One", "month", "later", "the", "patient", "was", "referred", "to", "medical", "oncology", ",", "where", "palliative", "chemotherapy", "with", "Carboplatin", "and", "Gemcitabine", "was", "prescribed", ",", "given", "the", "extent", "of", "the", "disease", "and", "its", "poor", "prognosis", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "male", "label": "HUMAN", "start": 24, "end": 28 }, { "text": "animals", "label": "SPECIES", "start": 1207, "end": 1214 }, { "text": "retina specialist", "label": "HUMAN", "start": 739, "end": 756 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 609, "end": 616 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1012, "end": 1019 }, { "text": "CMV", "label": "SPECIES", "start": 2510, "end": 2513 }, { "text": "Toxoplasma gondii", "label": "SPECIES", "start": 2353, "end": 2370 }, { "text": "EBV", "label": "SPECIES", "start": 2455, "end": 2458 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 2424, "end": 2427 }, { "text": "B and C viruses", "label": "SPECIES", "start": 2429, "end": 2444 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 5333, "end": 5340 } ]

[ "A", "72-year-old", "man", "with", "an", "aortic", "bioprosthesis", "implanted", "in", "2010", "was", "diagnosed", "with", "prosthetic", "endocarditis", "due", "to", "Enterococcus", "faecalis", "5", "years", "after", "the", "operation", ".", "Transesophageal", "echocardiogram", "showed", "an", "abscess", "at", "the", "level", "of", "the", "mitroaortic", "junction", ",", "11", "mm", "in", "diameter", ",", "with", "a", "9", "mm", "vegetation", "attached", "to", "the", "ventricular", "side", "of", "the", "non-coronary", "leaflet", ".", "A", "computed", "axial", "tomography", "(", "CT", ")", "scan", "revealed", "a", "large", "abscess", "with", "gas", "inside", ",", "at", "the", "level", "of", "the", "aortic", "root", ",", "extending", "into", "the", "right", "ventricular", "outflow", "tract", ".", "Gas", "bubbles", "were", "also", "present", "within", "the", "pulmonary", "artery", "trunk", ".", "A", "positron", "emission", "tomography", "(", "PET", ")", "/", "CT", "scan", "with", "18F-fluoro-2-deoxyglucose", "(", "18F-FDG", ")", "confirmed", "the", "extension", "of", "the", "infection", "in", "both", "locations", ".", "At", "surgery", ",", "the", "infected", "prosthesis", "was", "replaced", "with", "a", "cryopreserved", "aortic", "valve", "homograft", ",", "sutured", "subcoronary", ".", "Surgical", "samples", "were", "positive", "for", "the", "same", "microorganism", "isolated", "from", "the", "blood", ".", "No", "macroscopic", "involvement", "of", "the", "main", "pulmonary", "artery", "was", "found", ".", "The", "free", "wall", "of", "the", "right", "ventricular", "outflow", "tract", "was", "explored", ",", "and", "although", "it", "was", "compacted", ",", "its", "puncture", "did", "not", "yield", "any", "pathological", "product", ",", "ruling", "out", "frank", "collections", "at", "that", "level", ".", "The", "postoperative", "period", "was", "uneventful", ".", "The", "control", "18F-FDG", "PET", "/", "CT", "scan", "showed", "no", "evidence", "of", "residual", "gas", "or", "significant", "18F-FDG", "uptake", ".", "Control", "blood", "cultures", "were", "similarly", "negative", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "Enterococcus faecalis", "label": "SPECIES", "start": 115, "end": 136 } ]

[ "This", "is", "a", "38-year-old", "patient", "admitted", "to", "internal", "medicine", "for", "diarrhoea", "and", "oedema", ".", "As", "AP", ":", "morbid", "obesity", "operated", "in", "2001", "by", "Scopinaro", "technique", "(", "modified", "DBP", ")", "in", "private", "(", "initial", "weight", "145", "Kg", ",", "BMI", "47", ".", "3", "Kg", "/", "m2", ")", ",", "reaching", "a", "weight", "of", "75", "Kg", ",", "follow-up", "in", "private", "clinic", "with", "erratic", "supplementation", ",", "in", "January", "2017", "he", "was", "reintervened", "(", "weight", "104", "Kg", ",", "BMI", "34", "Kg", "/", "m2", ")", "due", "to", "weight", "gain", "and", "malabsorption", "undergoing", "gastric", "bypass", ",", "with", "weight", "loss", "over", "the", "course", "of", "a", "year", "and", "a", "half", "of", "about", "30", "Kg", ",", "weight", "loss", "percentage", "(", "WLP", ")", "28", ".", "8", "%", ".", "Smoker", "of", "half", "a", "packet", "a", "day", "and", "moderate", "alcohol", "consumption", ".", "No", "known", "drug", "allergies", ".", "No", "habitual", "treatment", ".", "He", "has", "not", "been", "supplemented", "with", "water-soluble", "vitamins", "or", "iron", "at", "any", "time", ".", "Trip", "to", "the", "coast", "of", "Indonesia", "in", "April", "/", "18", "in", "a", "non-rural", "area", ",", "on", "a", "scheduled", "cruise", ",", "a", "week", "later", "he", "began", "with", "liquid", "diarrhoea", "that", "did", "not", "respect", "rest", ",", "he", "was", "treated", "with", "antibiotics", "that", "he", "did", "not", "remember", "and", "the", "symptoms", "self-limited", ",", "but", "in", "June", "/", "18", "he", "began", "with", "progressive", "oedema", "of", "the", "lower", "extremities", ",", "scrotum", "and", "face", ".", "Weight", "loss", "of", "5", "kg", "in", "5-6", "months", ".", "Intake", "and", "appetite", "preserved", ",", "no", "nausea", "or", "vomiting", ",", "3-4", "daily", "steatorrheic", "stools", ",", "without", "pathological", "products", ".", "On", "27", "/", "11", "/", "18", "assessment", "by", "the", "nutrition", "unit", "was", "requested", ",", "and", "the", "examination", "revealed", ":", "current", "weight", "72", ".", "4", "kg", "(", "without", "oedema", "67", ".", "3", "kg", ")", ",", "height", "1", ".", "75", "m", ",", "BMI", "23", ".", "6", "kg", "/", "m2", ".", "PP", "in", "one", "year", "and", "4", "months", "28", ".", "8", "%", "and", "in", "the", "last", "5", "months", "6", "%", ".", "General", "condition", "preserved", ".", "Pallor", "of", "skin", "and", "mucous", "membranes", ".", "Oedema", "up", "to", "the", "knees", "without", "fovea", ".", "Laboratory", "tests", ":", "renal", "function", "normal", ",", "total", "protein", "3", ".", "7", "g", "/", "dl", ",", "albumin", "2", ".", "2", "g", "/", "dl", ",", "prealbumin", "8", "mg", "/", "dl", ",", "low", "sideremia", ",", "vitamin", "B12", "and", "folic", "acid", "normal", ",", "selenium", ",", "vitamin", "A", ",", "D", "and", "E", "deficiency", ".", "Haemoglobin", "9", ".", "8", "g", "/", "dl", ",", "total", "lymphocytes", "2700", "and", "prothrombin", "time", "prolongation", ".", "In", "our", "patient", "we", "requested", "a", "stool", "parasite", "test", "(", "Cryptosporidium", "and", "Giardia", ")", ",", "stool", "culture", "and", "Clostridium", "difficile", "toxin", ",", "all", "of", "which", "were", "negative", ".", "Celiac", "disease", "was", "ruled", "out", "by", "performing", "anti-transglutaminase", "and", "anti-endomysial", "antibodies", ",", "which", "were", "negative", ".", "A", "urease", "test", "was", "performed", ",", "which", "suggested", "Helicobacter", "pylori", "gastritis", ".", "An", "abdominal", "ultrasound", "scan", "showed", "a", "liver", "of", "normal", "size", ",", "chortonicity", "and", "echogenicity", ",", "with", "areas", "of", "focal", "steatosis", "and", "several", "simple", "cysts", "in", "the", "LHI", ".", "A", "thoraco-abdominal-pelvic", "CT", "scan", "showed", "post-surgical", "changes", "after", "Billroth", "II", "gastrectomy", ".", "Numerous", "mesenteric", "lymph", "nodes", "of", "oval", "morphology", "and", "up", "to", "7", "mm", "short", "axis", ",", "non-specific", ".", "Small", "bowel", "loops", "and", "colic", "frame", "of", "normal", "calibre", "and", "parietal", "thickness", ".", "No", "notable", "alterations", "in", "the", "mesointestinal", "tract", ".", "Small", "amount", "of", "free", "peritoneal", "fluid", "in", "the", "pelvis", ".", "The", "rest", "of", "the", "examination", "showed", "no", "significant", "alterations", ".", "An", "oesophago-gastro-duodenal", "transit", "with", "barium", "was", "requested", ":", "subtotal", "gastrectomy", "with", "good", "passage", "of", "contrast", "through", "the", "anastomotic", "mouth", "without", "visualising", "G-E", "reflux", ".", "Dilatation", "of", "the", "jejunum", "and", "ileum", "loops", "with", "fragmentation", "and", "flocculation", "of", "the", "contrast", ",", "all", "in", "accordance", "with", "an", "inflammatory", "intestinal", "process", "and", "intestinal", "malabsorption", ".", "In", "addition", ",", "upper", "and", "lower", "gastrointestinal", "endoscopy", "was", "performed", ":", "-", "Gastroscopy", ":", "reduced", "size", "stomach", "(", "approx", ".", "1", "/", "3", "remaining", ")", "due", "to", "previous", "bariatric", "surgery", ",", "without", "lesions", ".", "Gastrointestinal", "surgical", "anastomosis", "of", "reduced", "calibre", ",", "but", "sufficient", "for", "passage", "of", "the", "endoscope", "without", "difficulty", "and", "without", "lesions", ".", "About", "25", "cm", "of", "small", "intestine", "of", "normal", "appearance", "is", "explored", ",", "from", "which", "biopsies", "are", "taken", ":", "small", "intestine", "mucosa", "without", "alterations", ",", "negative", "for", "coeliac", "disease", ".", "-", "Colonoscopy", ":", "small", "intestine", "(", "ileum", ")", "mucosa", "without", "significant", "morphological", "alterations", ".", "Colon", ":", "colonic", "mucosa", "with", "minimal", "non-specific", "inflammatory", "changes", "in", "the", "lamina", "propria", ".", "Rectum", ":", "rectal", "mucosa", "with", "minimal", "non-specific", "inflammatory", "changes", "in", "lamina", "propria", ".", "Finally", ",", "a", "hydrogen", "(", "H2", ")", "and", "methane", "(", "CH4", ")", "breath", "test", "was", "performed", "for", "the", "study", "of", "bacterial", "overgrowth", "(", "SCBI", ")", "with", "lactulose", "/", "lactitol", "with", "a", "positive", "result", ".", "The", "patient", "was", "discharged", "in", "December", "/", "18", ".", "Our", "patient", "received", "treatment", "for", "SCBI", "with", "an", "excellent", "response", "to", "rifaximin", "600", "mg", "every", "8", "hours", "for", "14", "days", ",", "and", "for", "H", ".", "pylori", "he", "required", "an", "initial", "eradication", "therapy", "with", "OCAM", "quadruple", "therapy", "(", "omeprazole", "/", "clarithromycin", "/", "amoxicillin", "and", "metronidazole", ")", "without", "achieving", "eradication", "and", "subsequently", "with", "Pylera", "140", "/", "125", "/", "125", "mg", "(", "potassium", "bismuth", "subcitrate", "/", "metronidazole", "and", "tetracycline", "hydrochloride", ")", "achieving", "eradication", ".", "Therapy", "was", "completed", "on", "an", "outpatient", "basis", "in", "March", "/", "19", ".", "In", "our", "case", ",", "from", "admission", ",", "nutritional", "support", "adjusted", "to", "his", "daily", "energy-protein", "requirements", "(", "1900", "Kcal", "and", "98", "g", "of", "protein", ")", "was", "established", "with", "hyperproteic", "and", "normocaloric", "oligomeric", "oral", "nutritional", "supplements", "and", "a", "protein", "module", "/", "12h", ",", "which", "provided", "400", "Kcal", "and", "95", "g", "of", "protein", "in", "addition", "to", "the", "oral", "diet", ".", "In", "addition", ",", "supplementation", "with", "iron", "proteinsuccinylate", "800", "mg", "/", "12h", ",", "calcifediol", "0", ".", "266", "mg", "/", "15", "days", ",", "phytomenadione", "10", "mg", "oral", "/", "3", "days", "until", "correction", "of", "vitamin", "K", "deficiency", "(", "normalisation", "of", "prothrombin", "time", ")", ",", "vitamin", "A", "5000", "IU", "(", "retinol", "palmitate", ")", "and", "vitamin", "E", "10", "mg", "(", "dl-alpha-tocopheryl", "acetate", ")", "daily", "and", "then", "3", "days", "a", "week", "until", "correction", "of", "serum", "vitamin", "A", "and", "E", "deficiencies", ".", "In", "addition", "to", "a", "multivitamin", "and", "mineral", "complex", ".", "After", "6", "months", ",", "the", "anthropometric", "evolution", ",", "nutritional", "parameters", "and", "micronutrients", "have", "been", "excellent", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 22, "end": 29 }, { "text": "Clostridium difficile", "label": "SPECIES", "start": 1927, "end": 1948 }, { "text": "Cryptosporidium", "label": "SPECIES", "start": 1879, "end": 1894 }, { "text": "Giardia", "label": "SPECIES", "start": 1899, "end": 1906 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1835, "end": 1842 }, { "text": "parasite", "label": "SPECIES", "start": 1864, "end": 1872 } ]

[ "Anamnesis", "A", "27-year-old", "woman", "with", "a", "history", "of", "episodic", "migraine", "without", "aura", ".", "She", "was", "admitted", "to", "the", "Neurology", "Department", "in", "May", "2009", "for", "left", "periocular", "pain", "with", "decreased", "vision", "in", "the", "outermost", "area", "of", "the", "temporal", "hemifield", "associated", "with", "a", "subjective", "sensation", "of", "hypoaesthesia", "of", "the", "left", "hemifield", ".", "The", "neurological", "examination", "was", "normal", ".", "The", "patient", "was", "admitted", "with", "the", "following", "tests", ":", "normal", "blood", "system", ",", "normal", "coagulation", ",", "biochemistry", "(", "including", "hepatic", ",", "renal", ",", "nutritional", "profile", ",", "normal", "antinuclear", "antibodies", "and", "thyroid", "hormones", ")", ",", "serology", "for", "hepatitis", "A", ",", "B", "and", "C", "viruses", ",", "human", "immunodeficiency", "virus", ",", "cytomegalovirus", ",", "rubella", ",", "syphilis", ",", "toxoplasma", ",", "varicella-zoster", "virus", ",", "mumps", "and", "measles", "were", "negative", ".", "Lumbar", "puncture", "(", "cytobiochemistry", ",", "culture", ",", "negative", "serology", ",", "an", "oligoclonal", "band", ")", ",", "imaging", "tests", "(", "computed", "tomography", "[", "CT", "]", "and", "magnetic", "resonance", "imaging", "[", "MRI", "]", "of", "the", "brain", "were", "normal", ".", "In", "view", "of", "the", "patient", "'", "s", "symptoms", ",", "a", "diagnosis", "of", "retrobulbar", "optic", "neuritis", "was", "made", "and", "treatment", "was", "started", "with", "megadoses", "of", "steroids", ",", "with", "which", "the", "patient", "improved", "and", "was", "discharged", "home", ".", "Visual", "evoked", "potentials", "were", "performed", "on", "an", "outpatient", "basis", ",", "which", "showed", "mild", "involvement", "of", "the", "right", "eye", "(", "probable", "optic", "neuritis", ")", ".", "The", "patient", "was", "admitted", "again", "to", "the", "Neurology", "Department", "in", "November", "2009", "for", "right", "retroocular", "pain", "that", "increased", "on", "lateroversion", ",", "with", "decreased", "visual", "acuity", "and", "very", "subtle", "blurring", "in", "the", "temporal", "hemifield", "of", "the", "right", "eye", ".", "Physical", "examination", "Hydrated", ",", "nourished", ",", "perfused", ".", "Good", "skin", "and", "mucous", "membrane", "colouring", ",", "overweight", ".", "Head", "and", "neck", ":", "no", "jugular", "ingurgitation", ".", "Carotids", "rhythmic", ",", "symmetrical", ",", "no", "murmurs", ".", "No", "adenopathies", ".", "Cardiac", "auscultation", ":", "rhythmic", ",", "no", "murmurs", ".", "Pulmonary", "auscultation", ":", "preserved", "vesicular", "murmur", ".", "Higher", "cerebral", "functions", ":", "conscious", ",", "oriented", ",", "no", "dysphasia", ".", "PPCC", ":", "normal", "fundus", ",", "isochoric", "and", "normoreactive", "pupils", ",", "normal", "eye", "movements", "with", "pain", "on", "left", "gaze", ".", "Decreased", "acuity", "afferent", "pupillary", "defect", ".", "Rest", "of", "pairs", "preserved", ".", "Strength", "5", "/", "5", "bilateral", "and", "symmetrical", ",", "normal", "tone", ".", "Osteotendinous", "reflexes", ":", "+", "+", "+", "/", "+", "+", "+", "+", "global", ",", "bilateral", "skin-plantar", "flexor", "reflex", ".", "Sensibility", ":", "superficial", "and", "vibratory", "sensibility", "preserved", ".", "Cerebellum", ":", "no", "dysmetria", "or", "dysdiadochokinesias", ".", "Normal", "gait", ",", "tandem", "gait", ",", "Romberg", "negative", ".", "No", "nuchal", "rigidity", "or", "meningeal", "signs", ".", "Complementary", "tests", "-", "Blood", "count", ":", "normal", ".", "-", "Coagulation", ":", "normal", ".", "-", "Biochemistry", "including", "basic", ",", "renal", ",", "nutritional", ",", "hepatic", "and", "thyroid", "profile", "normal", ".", "Proteinogram", ":", "normal", ".", "Anti-streptolysin", "antibodies", ",", "C-reactive", "protein", ",", "normal", "RF", ".", "Antinuclear", "antibodies", ":", "negative", ".", "-", "Vitamin", "B12", "and", "folic", "acid", ":", "normal", ".", "-", "Consultation", "with", "ophthalmology", ":", "concentric", "alteration", "of", "the", "visual", "fields", ".", "-", "Lumbar", "puncture", ":", "cerebrospinal", "fluid", "(", "CSF", ")", "opening", "pressure", "340", "mm", "H2O", ".", "Cytobiochemistry", ",", "serology", "and", "cultures", "were", "normal", ".", "Diagnosis", "Idiopathic", "intracranial", "hypertension", "syndrome", "without", "papilledema", ".", "Treatment", "Acetazolamide", "progressively", "increased", "to", "one", "tablet", "every", "12", "hours", ".", "Active", "lifestyle", "and", "attempted", "weight", "loss", ".", "Evolution", "The", "patient", "has", "been", "stable", "since", "admission", ",", "with", "a", "single", "increase", "of", "half", "an", "acetazolamide", "tablet", "to", "control", "her", "intracranial", "hypertension", ".", "In", "February", "2010", "she", "presented", "a", "worsening", "of", "her", "visual", "acuity", "together", "with", "oppressive", "holocranial", "headache", ",", "nausea", "and", "vomiting", ",", "for", "which", "the", "patient", "was", "admitted", "and", "her", "medication", "was", "reinforced", "with", "topiramate", "up", "to", "a", "dose", "of", "50", "mg", "/", "12h", ".", "Given", "the", "persistence", "of", "the", "symptoms", ",", "intracranial", "pressure", "measurements", "were", "taken", ",", "obtaining", "figures", "greater", "than", "260", "mm", "H2O", "throughout", "the", "recording", ".", "The", "neurosurgery", "department", "was", "consulted", "and", ",", "given", "the", "persistence", "of", "the", "symptoms", ",", "decided", "to", "perform", "surgery", "with", "a", "lumboperitoneal", "shunt", ".", "As", "a", "result", "of", "this", "intervention", ",", "the", "patient", "has", "ostensibly", "improved", ":", "there", "has", "been", "a", "significant", "qualitative", "and", "quantitative", "improvement", "in", "the", "headache", ",", "she", "continues", "to", "have", "outpatient", "check-ups", "in", "Neurology", "and", "Ophthalmology", ",", "with", "preserved", "visual", "acuity", "and", "visual", "fields", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 4, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 24, "end": 29 }, { "text": "cytomegalovirus", "label": "SPECIES", "start": 631, "end": 646 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 356, "end": 363 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 939, "end": 946 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1079, "end": 1086 }, { "text": "mumps", "label": "SPECIES", "start": 703, "end": 708 }, { "text": "syphilis", "label": "SPECIES", "start": 657, "end": 665 }, { "text": "toxoplasma", "label": "SPECIES", "start": 667, "end": 677 }, { "text": "human immunodeficiency virus", "label": "SPECIES", "start": 601, "end": 629 }, { "text": "varicella-zoster virus", "label": "SPECIES", "start": 679, "end": 701 }, { "text": "hepatitis A, B and C viruses", "label": "SPECIES", "start": 571, "end": 599 }, { "text": "rubella", "label": "SPECIES", "start": 648, "end": 655 }, { "text": "measles", "label": "SPECIES", "start": 713, "end": 720 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1263, "end": 1270 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3089, "end": 3096 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3373, "end": 3380 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 3806, "end": 3813 } ]

[ "Anamnesis", "A", "28-year-old", "male", "dancer", "from", "Israel", ",", "with", "a", "personal", "history", "of", "human", "immunodeficiency", "virus", "(", "HIV", ")", "infection", "in", "2008", "without", "current", "treatment", ",", "occasional", "cocaine", "and", "alcohol", "user", ".", "He", "was", "admitted", "to", "Internal", "Medicine", "for", "a", "clinical", "picture", "of", "paraesthesias", "in", "the", "right", "hemibody", "together", "with", "visual", "alteration", "after", "previous", "consumption", "of", "1", "g", "of", "cocaine", ".", "A", "cranial", "computed", "tomography", "(", "CT", ")", "scan", "and", "magnetic", "resonance", "imaging", "(", "MRI", ")", "of", "the", "brain", "showed", "an", "acute", "ischaemic", "lesion", "in", "the", "posterior", "territory", "(", "left", "thalamus", ")", ".", "The", "study", "was", "completed", "with", "a", "cerebral", "MRI", "angiography", ",", "which", "showed", "no", "findings", ".", "Viral", "load", "was", "200", ",", "000", "copies", "and", "CD", "4", "647", "cells", ".", "He", "was", "discharged", "with", "right", "upper", "quadrantanopsia", "as", "a", "sequela", "and", "treatment", "with", "statin", ".", "Two", "weeks", "later", "he", "came", "to", "the", "emergency", "department", "for", "a", "new", "episode", "of", "right", "facial", "and", "hemicorporal", "haemihypoaesthesia", ".", "Physical", "examination", "On", "arrival", "at", "the", "ED", ",", "blood", "pressure", "120", "/", "80mmHg", ",", "heart", "rate", "80", "bpm", ",", "afebrile", ".", "The", "general", "examination", "by", "apparatus", "was", "normal", ".", "The", "neurological", "examination", "showed", "the", "presence", "of", "right", "upper", "quadrantanopsia", "(", "sequelae", ")", ",", "right", "hemifacial", "algesic", "hypoaesthesia", "in", "the", "second", "and", "third", "trigeminal", "branches", "and", "in", "the", "right", "hemibody", ",", "and", "dysmetria", "in", "the", "finger-nose", "test", "in", "the", "right", "upper", "extremity", ".", "The", "rest", "of", "the", "examination", "was", "normal", ".", "Complementary", "tests", "-", "Haemogram", ":", "normal", "with", "adequate", "leukocyte", "formula", ",", "erythrocyte", "sedimentation", "rate", "46", "mm", "/", "h", ".", "-", "Biochemistry", ":", "lactate", "dehydrogenase", "722", "IU", "/", "l", "(", "230-460", ")", ",", "transferrin", "decreased", ",", "thyroid", "hormones", "altered", "(", "TSH", "5", ".", "36", "μIUI", "(", "0", ".", "5-4", ".", "7", ")", ",", "T3l", "2", ".", "73", "pg", "/", "ml", "(", "2", ".", "77-5", ".", "27", ")", ".", "Proteinogram", ":", "weak", "monoclonal", "peak", "in", "the", "gamma", "zone", ".", "-", "Coagulation", "and", "thrombophilia", "study", ":", "minimal", "elevation", "of", "fibrinogen", "and", "free", "protein", "S", "deficiency", ",", "the", "rest", "being", "normal", "(", "including", "protein", "C", ",", "lupus", "anticoagulant", ",", "Leyden", "'", "s", "factor", "V", "and", "antithrombin", ")", ".", "-", "Autoimmunity", ":", "weakly", "positive", "IgG", "anticardiolipin", "antibodies", "(", "22", ".", "6", "UGPL", "/", "ml", ")", ",", "negative", "IgM", "ANCA", ",", "rheumatoid", "factor", ",", "circulating", "immunocomplexes", ",", "ANA", ",", "anti-DNA", ",", "negative", "anti-B2", "glycoprotein", ".", "-", "Serology", ":", "EBV", "IgG", "positive", ",", "hepatitis", "A", "IgG", "positive", ";", "Treponema", ",", "toxoplasma", ",", "cytomegalovirus", ",", "hepatitis", "B", "and", "C", "negative", ".", "HIV-1", "viral", "load", ":", "177", ",", "930", "copies", ";", "CD", "4", "432", "cells", "/", "μl", ",", "no", "genotypic", "resistance", "to", "antiretrovirals", ".", "-", "Electrocardiogram", "and", "monitoring", "48", "hours", ":", "sinus", "rhythm", ",", "known", "right", "bundle", "branch", "block", ".", "-", "Chest", "X-ray", "and", "transthoracic", "echocardiogram", "normal", ".", "-", "Cranial", "CT", "scan", "showed", "irregular", "hypodense", "lesions", "in", "the", "left", "parasagittal", "occipital", "region", "and", "in", "the", "white", "matter", "of", "the", "left", "temporal", "lobe", ",", "compatible", "with", "subacute-chronic", "ischaemic", "lesions", ".", "-", "The", "new", "brain", "MRI", "shows", "the", "appearance", "of", "a", "new", "focal", "lesion", "in", "the", "left", "thalamus", "hyperintense", "in", "long", "TR", "and", "marked", "diffusion", "restriction", ",", "suggesting", "acute-subacute", "ischaemia", ".", "Brain", "MRI", ",", "diffusion", "enhanced", "sequence", ":", "acute", "ischaemic", "lesion", "in", "the", "left", "thalamus", ".", "-", "Intracranial", "MRI", "angiography", "was", "repeated", ",", "which", "showed", "no", "visualisation", "of", "the", "left", "PCA", "from", "its", "origin", ",", "the", "right", "one", "being", "patent", ".", "Angio-MRI", ":", "no", "visualisation", "of", "the", "left", "PCA", "from", "its", "origin", ".", "The", "right", "PCA", "was", "patent", ".", "-", "Lumbar", "puncture", ":", "glucose", "49", "mg", "/", "dl", ",", "protein", "66", "mg", "/", "dl", ",", "40", "leukocytes", "/", "mm3", "(", "80", "%", "mononuclear", ")", "and", "90", "red", "blood", "cells", "/", "mm3", ".", "Culture", ":", "negative", "for", "bacteria", "and", "mycobacteria", ",", "negative", "for", "enterovirus", "polymerase", "chain", "reaction", "and", "herpes", "simplex", "1", "and", "2", ";", "VDRL", "negative", ";", "cytology", ":", "acellular", "specimen", ".", "Diagnosis", "Recurrent", "cerebral", "ischaemia", "probably", "related", "to", "HIV-associated", "vasculopathy", ".", "Hypergammaglobulinaemia", ",", "protein", "S", "deficiency", ",", "weakly", "positive", "IgG", "anticardiolipin", "antibodies", ".", "Treatment", "and", "evolution", "Antiretroviral", "therapy", "was", "started", "with", "darunavir", ",", "ritonavir", "and", "tenofovir", "plus", "emtricitabine", "and", "antiaggregation", "with", "acetylsalicylic", "acid", "100", "mg", ",", "after", "which", "no", "new", "episodes", "have", "occurred", ",", "with", "mild", "ataxia", "of", "the", "right", "upper", "limb", "persisting", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 0, 3, 4, 4, 4, 0, 0, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 4, 4, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 106, "end": 109 }, { "text": "male", "label": "HUMAN", "start": 24, "end": 28 }, { "text": "personal", "label": "HUMAN", "start": 56, "end": 64 }, { "text": "Viral", "label": "SPECIES", "start": 620, "end": 625 }, { "text": "human immunodeficiency virus", "label": "SPECIES", "start": 76, "end": 104 }, { "text": "Treponema", "label": "SPECIES", "start": 2124, "end": 2133 }, { "text": "EBV", "label": "SPECIES", "start": 2080, "end": 2083 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 2192, "end": 2195 }, { "text": "HIV-1", "label": "SPECIES", "start": 2192, "end": 2197 }, { "text": "antiretrovirals", "label": "SPECIES", "start": 2272, "end": 2287 }, { "text": "cytomegalovirus", "label": "SPECIES", "start": 2147, "end": 2162 }, { "text": "toxoplasma", "label": "SPECIES", "start": 2135, "end": 2145 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 2198, "end": 2203 }, { "text": "hepatitis A", "label": "SPECIES", "start": 2098, "end": 2109 }, { "text": "hepatitis B", "label": "SPECIES", "start": 2164, "end": 2175 }, { "text": "hepatitis B and C", "label": "SPECIES", "start": 2164, "end": 2181 }, { "text": "VDRL", "label": "SPECIES", "start": 3368, "end": 3372 }, { "text": "bacteria", "label": "SPECIES", "start": 3262, "end": 3270 }, { "text": "enterovirus", "label": "SPECIES", "start": 3302, "end": 3313 }, { "text": "herpes simplex 1 and 2", "label": "SPECIES", "start": 3344, "end": 3366 }, { "text": "mycobacteria", "label": "SPECIES", "start": 3275, "end": 3287 }, { "text": "herpes simplex 1", "label": "SPECIES", "start": 3344, "end": 3360 }, { "text": "HIV", "label": "SPECIES", "start": 3473, "end": 3476 }, { "text": "Antiretroviral", "label": "SPECIES", "start": 3622, "end": 3636 } ]

[ "", "A", "35-year-old", "woman", "with", "no", "relevant", "past", "history", "attended", "the", "emergency", "department", "of", "the", "Hospital", "de", "la", "Fundación", "Jiménez", "Díaz", "(", "Madrid", ")", "on", "14", "April", "with", "acral", "purpuric", "lesions", "of", "three", "weeks", "'", "evolution", ".", "They", "had", "appeared", "as", "oedematous", "and", "erythematous", "areas", "concurrent", "with", "fever", "and", "cough", ",", "which", "lasted", "only", "two", "days", ".", "There", "was", "no", "history", "of", "diarrhoea", ",", "ageusia", ",", "hyposmia", "or", "dyspnoea", ".", "The", "patient", "reported", "that", ",", "after", "standing", "for", "a", "while", ",", "the", "skin", "on", "her", "feet", "became", "bluish", "in", "colour", ".", "On", "examination", ",", "the", "pedial", "pulse", "was", "not", "palpable", "and", "purplish", "areas", "could", "be", "seen", "on", "the", "dorsum", "of", "several", "toes", "of", "both", "feet", ".", "An", "ultrasound", "ruled", "out", "vascular", "thrombosis", ".", "An", "RT-PCR", "assay", "for", "SARS-CoV-2", "from", "nasopharyngeal", "swab", "and", "an", "immunochromatographic", "assay", "for", "serum", "IgG", "and", "IgM", "antibodies", ",", "performed", "on", "the", "same", "day", ",", "were", "negative", ".", "A", "skin", "biopsy", "obtained", "in", "the", "emergency", "department", "showed", "mild", "perivascular", "and", "periannexal", "lymphocytic", "inflammation", "and", "focal", "microvascular", "thrombosis", ".", "Mild", "erythrocytic", "extravasation", "and", "ancillary", "evidence", "of", "endothelial", "injury", "was", "seen", ",", "but", "no", "overt", "vasculitis", "was", "observed", ".", "Using", "a", "commercial", "kit", "(", "SARS-CoV", "/", "SARS-CoV-2", "spicule", "1A9", ",", "GeneTex", "Inc", ".", ",", "Irvine", ",", "California", ",", "USA", ")", ",", "optimised", "in", "our", "laboratory", ",", "proteins", "of", "the", "viral", "spicule", "were", "clearly", "detected", "by", "conventional", "immunohistochemistry", "as", "fine", "to", "coarse", ",", "bright", "red", "granular", "deposits", "in", "the", "cytoplasm", "of", "eccrine", "(", "excretory", "and", "secretory", ")", "cells", "and", "cutaneous", "dermal", "vessels", ".", "Relevant", "negative", "and", "positive", "controls", "were", "performed", ":", "adult", "tonsil", ",", "a", "sample", "of", "erythema", "pernio", "from", "early", "2019", ",", "biopsies", "of", "inflammatory", "dermatoses", "not", "associated", "with", "COVID-19", "and", "antibody", "replacement", "with", "saline", "as", "negative", "controls", ",", "as", "well", "as", "a", "postmortem", "lung", "sample", "from", "a", "COVID-19", "patient", "as", "a", "positive", "control", ".", "Perivascular", "deposits", "of", "C5b9", ",", "C3", "and", "C1q", "were", "observed", "in", "an", "immunofluorescence", "study", "of", "formalin-fixed", "paraffin-embedded", "tissue", ".", "Treatment", "with", "low", "molecular", "weight", "heparin", "and", "low", "dose", "aspirin", "was", "started", ";", "the", "lesions", "healed", "and", "at", "the", "time", "of", "the", "last", "follow-up", "(", "7", "June", ")", ",", "the", "patient", "had", "fully", "recovered", "and", "the", "pedial", "pulse", "was", "palpable", ".", "A", "second", "serological", "study", "(", "two", "months", "after", "onset", "of", "illness", ")", ",", "this", "time", "by", "enzyme-linked", "immunosorbent", "assay", "(", "ELISA", ")", ",", "was", "negative", "for", "SARS-CoV-2", "IgG", "and", "IgM", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0 ]

[ { "text": "SARS-CoV-2", "label": "SPECIES", "start": 681, "end": 691 }, { "text": "SARS-CoV-2", "label": "SPECIES", "start": 1139, "end": 1149 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 392, "end": 399 }, { "text": "viral", "label": "SPECIES", "start": 1248, "end": 1253 }, { "text": "woman", "label": "HUMAN", "start": 15, "end": 20 }, { "text": "SARS-CoV", "label": "SPECIES", "start": 681, "end": 689 }, { "text": "SARS-CoV", "label": "SPECIES", "start": 1130, "end": 1138 }, { "text": "SARS-CoV", "label": "SPECIES", "start": 1139, "end": 1147 }, { "text": "SARS-CoV-2", "label": "SPECIES", "start": 2262, "end": 2272 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 1751, "end": 1758 }, { "text": "patient", "label": "HUMAN", "start": 2062, "end": 2069 }, { "text": "SARS-CoV", "label": "SPECIES", "start": 2262, "end": 2270 } ]